ЭИФ2С2

ЭИФ2С2
Идентификаторы
Псевдонимы	EIF2S2 , EIF2, EIF2B, EIF2beta, PPP1R67, eIF-2-beta, субъединица бета эукариотического фактора инициации трансляции 2
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 603908; МГИ : 1914454; гомологен : 2904; Генные карты : EIF2S2; OMA :EIF2S2 — ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 20 (человек)
Конец	34,112,243 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 2 (мышь)
Конец	154,734,855 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верх выражен в
	хрящевая ткань; ; полость рта; ; ягодичные мышцы; ; правый желудочек; ; трабекулярная кость; ; дельтовидная мышца; ; мышца руки; ; двуглавая мышца плеча; ; слизистая оболочка сигмовидной кишки; ; трехглавая мышца плеча;
	Верх выражен в
	морула; ; бластоциста; ; желточный мешок; ; хвост эмбриона; ; эмбрион; ; генитальный бугорок; ; мышца бедра; ; эмбрион; ; сперматоцит; ; желудочковая зона;
	Больше данных по справочным выражениям
	; ;
	Больше данных по справочным выражениям
Генная онтология
Молекулярная функция	активность фактора трансляции, связывание РНК; связывание белков; активность фактора инициации трансляции; связывание ионов металлов; Связывание РНК; связывание мРНК; связывание фактора инициации трансляции;
Клеточный компонент	цитоплазма; цитозоль; ядро; комплекс фактора инициации трансляции эукариот 2;
Биологический процесс	трансляционная инициация; пролиферация мужских половых клеток; развитие мужских половых желез; внутриутробное эмбриональное развитие; трансмембранный транспорт; биосинтез белка; формирование трансляционного преинициативного комплекса; образование цитоплазматического комплекса инициации трансляции;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	8894
	67204
	ENSG00000125977
	ENSMUSG00000074656
	P20042
	Q99L45
	НМ_003908 ; НМ_001316363 ; НМ_001316364
	NM_026030
	НП_001303292 ; НП_001303293 ; НП_003899
	NP_080306
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Субъединица 2 эукариотического фактора инициации трансляции 2 (eIF2β) — это белок , который у человека кодируется геном EIF2S2 . ^[5]^[6]

Функция

Фактор инициации трансляции эукариот 2 ( eIF2 ) функционирует на ранних этапах синтеза белка, образуя тройной комплекс с GTP и инициирующей тРНК и связываясь с рибосомной субъединицей 40S . eIF2 состоит из трех субъединиц: альфа (α) , бета (β, эта статья) и гамма (γ) , причем белок, кодируемый этим геном, представляет собой бета-субъединицу. Бета-субъединица катализирует обмен GDP на GTP , что повторно использует комплекс eIF2 для следующего раунда инициации. ^[6]

Регулирование

Экспрессия как eIF2α, так и eIF2β регулируется фактором транскрипции NRF1 . ^[7]

Смотрите также

eIF2

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000125977 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000074656 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Pathak VK, Nielsen PJ, Trachsel H, Hershey JW (сентябрь 1988 г.). «Структура бета-субъединицы фактора инициации трансляции eIF-2». Cell . 54 (5): 633– 9. doi :10.1016/S0092-8674(88)80007-2. PMID 3044606. S2CID 54414457.
^ ab "Ген Entrez: фактор инициации эукариотической трансляции EIF2S2 2, субъединица 2 бета, 38 кДа".
^ Chiorini JA, Miyamoto S, Harkin SJ, Safer B (февраль 1999). «Геномное клонирование и характеристика промотора человеческого эукариотического фактора инициации-2бета». J. Biol. Chem . 274 (7): 4195– 201. doi : 10.1074/jbc.274.7.4195 . PMID 9933616.

Дальнейшее чтение

Welsh GI, Price NT, Bladergroen BA и др. (1994). «Идентификация новых участков фосфорилирования в бета-субъединице фактора инициации трансляции eIF-2». Biochem. Biophys. Res. Commun . 201 (3): 1279– 88. doi :10.1006/bbrc.1994.1843. PMID 8024572.
Brand SR, Kobayashi R, Mathews MB (1997). «Белок Tat вируса иммунодефицита человека типа 1 является субстратом и ингибитором интерферон-индуцированной, активируемой вирусом протеинкиназы, PKR». J. Biol. Chem . 272 (13): 8388– 95. doi : 10.1074/jbc.272.13.8388 . PMID 9079663.
Das S, Maiti T, Das K, Maitra U (1998). "Специфическое взаимодействие эукариотического фактора инициации трансляции 5 (eIF5) с бета-субъединицей eIF2". J. Biol. Chem . 272 (50): 31712– 8. doi : 10.1074/jbc.272.50.31712 . PMID 9395514.
Ting NS, Kao PN, Chan DW и др. (1998). «ДНК-зависимая протеинкиназа взаимодействует с белками, связывающими элемент ответа антигенного рецептора NF90 и NF45». J. Biol. Chem . 273 (4): 2136– 45. doi : 10.1074/jbc.273.4.2136 . PMID 9442054.
Kimball SR, Heinzinger NK, Horetsky RL, Jefferson LS (1998). «Идентификация межбелковых взаимодействий между субъединицами эукариотических факторов инициации eIF2 и eIF2B». J. Biol. Chem . 273 (5): 3039– 44. doi : 10.1074/jbc.273.5.3039 . PMID 9446619.
Chiorini JA, Miyamoto S, Harkin SJ, Safer B (1999). «Геномное клонирование и характеристика промотора человеческого эукариотического фактора инициации-2бета». J. Biol. Chem . 274 (7): 4195– 201. doi : 10.1074/jbc.274.7.4195 . PMID 9933616.
Cai R, Carpick B, Chun RF и др. (2000). «HIV-I TAT ингибирует активность PKR как РНК-зависимыми, так и РНК-независимыми механизмами». Arch. Biochem. Biophys . 373 (2): 361– 7. doi :10.1006/abbi.1999.1583. PMID 10620360.
Ben-Asouli Y, Banai Y, Hauser H, Kaempfer R (2000). «Распознавание 5′-терминальной структуры TAR в мРНК вируса иммунодефицита человека-1 эукариотическим фактором инициации трансляции 2». Nucleic Acids Res . 28 (4): 1011– 8. doi :10.1093/nar/28.4.1011. PMC 102579. PMID 10648795 .
Das S, Maitra U (2000). «Мутационный анализ фактора инициации трансляции 5 млекопитающих (eIF5): роль взаимодействия между β-субъединицей eIF2 и eIF5 в функционировании eIF5 in vitro и in vivo». Mol. Cell. Biol . 20 (11): 3942– 50. doi :10.1128/MCB.20.11.3942-3950.2000. PMC 85746. PMID 10805737 .
Gomez E, Pavitt GD (2000). «Идентификация доменов и остатков в субъединице ɛ эукариотического фактора инициации трансляции 2B (eIF2Bɛ), необходимой для обмена гуаниновыми нуклеотидами, выявила новую функцию активации, стимулируемую образованием комплекса eIF2B». Mol. Cell. Biol . 20 (11): 3965– 76. doi :10.1128/MCB.20.11.3965-3976.2000. PMC 85753. PMID 10805739 .
Das S, Ghosh R, Maitra U (2001). «Эукариотический фактор инициации трансляции 5 функционирует как белок, активирующий ГТФазу». J. Biol. Chem . 276 (9): 6720– 6. doi : 10.1074/jbc.M008863200 . PMID 11092890.
Reichman TW, Muñiz LC, Mathews MB (2002). «РНК-связывающий белок ядерного фактора 90 функционирует как положительный и отрицательный регулятор экспрессии генов в клетках млекопитающих». Mol. Cell. Biol . 22 (1): 343–56 . doi :10.1128/MCB.22.1.343-356.2002. PMC 134226. PMID 11739746 .
Deloukas P, Matthews LH, Ashurst J, et al. (2002). «Последовательность ДНК и сравнительный анализ человеческой хромосомы 20». Nature . 414 (6866): 865–71 . Bibcode :2001Natur.414..865D. doi : 10.1038/414865a . PMID 11780052.
Kebache S, Zuo D, Chevet E, Larose L (2002). "Модуляция трансляции белка с помощью Nck-1". Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (8): 5406– 11. Bibcode :2002PNAS...99.5406K. doi : 10.1073/pnas.082483399 . PMC 122782 . PMID 11959995.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH и др. (2003). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
Llorens F, Roher N, Miró FA и др. (2004). «Эукариотический фактор инициации трансляции eIF2beta связывается с протеинкиназой CK2: влияние на активность CK2alpha». Biochem. J . 375 (Pt 3): 623–31 . doi :10.1042/BJ20030915. PMC 1223719 . PMID 12901717.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH по полноразмерной ДНК: коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res . 14 (10B): 2121– 7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 .
Andersen JS, Lam YW, Leung AK и др. (2005). «Динамика ядрышкового протеома». Nature . 433 (7021): 77– 83. Bibcode :2005Natur.433...77A. doi :10.1038/nature03207. PMID 15635413. S2CID 4344740.
Stelzl U, Worm U, Lalowski M и др. (2005). «Сеть взаимодействия белок-белок человека: ресурс для аннотирования протеома». Cell . 122 (6): 957– 68. doi :10.1016/j.cell.2005.08.029. hdl : 11858/00-001M-0000-0010-8592-0 . PMID 16169070. S2CID 8235923.

Эта статья о гене на человеческой хромосоме 20 является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000125977 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000074656 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid3044606-5] Pathak VK, Nielsen PJ, Trachsel H, Hershey JW (сентябрь 1988 г.). «Структура бета-субъединицы фактора инициации трансляции eIF-2». Cell . 54 (5): 633– 9. doi :10.1016/S0092-8674(88)80007-2. PMID 3044606. S2CID 54414457.

[entrez-6] "Ген Entrez: фактор инициации эукариотической трансляции EIF2S2 2, субъединица 2 бета, 38 кДа".

[pmid9933616-7] Chiorini JA, Miyamoto S, Harkin SJ, Safer B (февраль 1999). «Геномное клонирование и характеристика промотора человеческого эукариотического фактора инициации-2бета». J. Biol. Chem . 274 (7): 4195– 201. doi : 10.1074/jbc.274.7.4195 . PMID 9933616.