EFCAB6

EFCAB6
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	1ВЛЗ, 5Д67
Идентификаторы
Псевдонимы	EFCAB6 , DJBP, HSCBCIP1, dJ185D5.1, EF-hand кальций-связывающий домен 6
Внешние идентификаторы	MGI : 1924877; HomoloGene : 11259; GeneCards : EFCAB6; OMA :EFCAB6 - ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 22 (человек)
Конец	43,812,337 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 15 (мышь)
Конец	83,949,580 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верх выражен в
	левое яичко; ; правое яичко; ; сперма; ; клетка слизистой оболочки щеки; ; правая маточная труба; ; бронхиальная эпителиальная клетка; ; ооцит; ; яичко; ; обонятельная зона слизистой оболочки носа; ; гонада;
	Верх выражен в
	сперматид; ; семенной каналец; ; сперматоцит; ; зигота; ; первичный ооцит; ; вторичный ооцит; ; мышца бедра; ; височная мышца; ; роговица; ; скелетная мышечная ткань;
	Больше данных по справочным выражениям
	Больше данных по справочным выражениям
Генная онтология
Молекулярная функция	связывание ионов металлов; связывание ионов кальция;
Клеточный компонент	ядро; нуклеоплазма;
Биологический процесс	регуляция транскрипции, ДНК-шаблонная; транскрипция, ДНК-шаблон;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	64800
	77627
	ENSG00000186976
	ENSMUSG00000022441
	Q5THR3
	Q6P1E8
	NM_022785 ; NM_198856
	НМ_001161628 ; НМ_001161629 ; НМ_029946
	NP_073622 ; NP_942153
	НП_001155100 ; НП_001155101 ; НП_084222
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Белок 6, содержащий домен связывания кальция EF-hand, представляет собой белок , который у людей кодируется геном EFCAB6 . ^[5]^[6]^[7]

Взаимодействия

Было показано, что EFCAB6 взаимодействует с PARK7 ^[6] и рецептором андрогена . ^[6]

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000186976 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000022441 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Хиросава М., Нагасе Т., Мурахаши Ю., Кикуно Р., Охара О. (март 2001 г.). «Идентификация новых транскрибируемых последовательностей на хромосоме 22 человека путем картирования экспрессируемых последовательностей». ДНК Рез . 8 (1): 1–9 . doi : 10.1093/dnares/8.1.1 . ПМИД 11258795.
^ abc Niki T, Takahashi-Niki K, Taira T, Iguchi-Ariga SM, Ariga H (март 2003 г.). «DJBP: новый белок, связывающий DJ-1, отрицательно регулирует рецептор андрогена, привлекая комплекс гистондеацетилазы, а DJ-1 противодействует этому ингибированию, отменяя этот комплекс». Mol Cancer Res . 1 (4): 247– 61. PMID 12612053.
^ "Ген Entrez: FLJ23588 CAP-связывающий белковый комплекс, взаимодействующий с белком 1".

Дальнейшее чтение

Маруяма К, Сугано С (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Gene . 138 ( 1– 2): 171– 4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K и др. (1997). «Конструирование и характеристика библиотеки кДНК с полной длиной и обогащенной 5'-концом». Gene . 200 ( 1– 2): 149– 56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
Dunham I, Shimizu N, Roe BA и др. (1999). «Последовательность ДНК человеческой хромосомы 22». Nature . 402 (6761): 489– 95. Bibcode :1999Natur.402..489D. doi : 10.1038/990031 . PMID 10591208.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH и др. (2003). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
Collins JE, Goward ME, Cole CG и др. (2003). «Повторная оценка аннотации генов человека: анализ второго поколения хромосомы 22». Genome Res . 13 (1): 27– 36. doi :10.1101/gr.695703. PMC 430954. PMID 12529303 .
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных человеческих кДНК». Nat. Genet . 36 (1): 40– 5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA и др. (2004). «Состояние, качество и расширение проекта NIH по полноразмерной ДНК: коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res . 14 (10B): 2121– 7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 .

Эта статья о гене на 22-й хромосоме человека — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000186976 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000022441 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid11258795-5] Хиросава М., Нагасе Т., Мурахаши Ю., Кикуно Р., Охара О. (март 2001 г.). «Идентификация новых транскрибируемых последовательностей на хромосоме 22 человека путем картирования экспрессируемых последовательностей». ДНК Рез . 8 (1): 1–9 . doi : 10.1093/dnares/8.1.1 . ПМИД 11258795.

[pmid12612053-6] Niki T, Takahashi-Niki K, Taira T, Iguchi-Ariga SM, Ariga H (март 2003 г.). «DJBP: новый белок, связывающий DJ-1, отрицательно регулирует рецептор андрогена, привлекая комплекс гистондеацетилазы, а DJ-1 противодействует этому ингибированию, отменяя этот комплекс». Mol Cancer Res . 1 (4): 247– 61. PMID 12612053.

[entrez-7] "Ген Entrez: FLJ23588 CAP-связывающий белковый комплекс, взаимодействующий с белком 1".