EEF1D

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
EEF1D
Доступные структуры
ПДБПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыEEF1D , EF-1D, EF1D, FP1047, эукариотический фактор удлинения трансляции 1 дельта
Внешние идентификаторыОМИМ : 130592; МГИ : 1913906; гомологен : 23404; GeneCards : EEF1D; OMA :EEF1D — ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез

1936

66656

Ансамбль

ENSG00000104529
ENSG00000273594

ENSMUSG00000055762

UniProt

P29692

Р57776

РефСек (мРНК)
RefSeq (белок)
Местоположение (UCSC)Хр 8: 143,58 – 143,6 МбХр 15: 75.77 – 75.78 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Фактор элонгации 1-дельта — это белок , который у людей кодируется геном EEF1D . [ 5]

Функция

Этот ген кодирует субъединицу комплекса фактора элонгации-1, который отвечает за ферментативную доставку аминоацил-тРНК в рибосому. Эта субъединица функционирует как фактор обмена гуаниновых нуклеотидов. Сообщается, что эта субъединица взаимодействует с ВИЧ-1 Tat и, таким образом, подавляет трансляцию мРНК клетки-хозяина, но не ВИЧ-1. Для этого гена было обнаружено несколько альтернативно сплайсированных вариантов транскриптов, однако была определена полноразмерная природа только двух вариантов. [6]

Взаимодействия

Было показано, что EEF1D взаимодействует с глицил-тРНК-синтетазой [7] , EEF1G [8] [9] и KTN1 [10] , а также, как предполагается, взаимодействует с TMEM63A [11] .

Ссылки

  1. ^ abc ENSG00000273594 GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000104529, ENSG00000273594 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000055762 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Sanders J, Raggiaschi R, Morales J, Möller W (июль 1993 г.). "Человеческий фактор удлинения гуанин-нуклеотидного обмена лейциновой молнии-1 дельта". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Структура и экспрессия генов . 1174 (1): 87–90. doi :10.1016/0167-4781(93)90097-W. PMID  8334168.
  6. ^ "Ген Entrez: EEF1D эукариотический фактор удлинения трансляции 1 дельта (белок обмена гуаниновых нуклеотидов)".
  7. ^ Sang Lee J, Gyu Park S, Park H, Seol W, Lee S, Kim S (февраль 2002 г.). «Сеть взаимодействия человеческих аминоацил-тРНК-синтетаз и субъединиц комплекса фактора элонгации 1». Biochemical and Biophysical Research Communications . 291 (1): 158–64. doi :10.1006/bbrc.2002.6398. PMID  11829477.
  8. ^ Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозан-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С., Лламосас Е., Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхауте Дж., Зогби Х.И., Смоляр А., Босак С. , Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Е., Хилл Д.Э., Рот Ф.П., Видал М. (октябрь 2005 г.). «К карте белково-белкового взаимодействия человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Bibcode : 2005Natur.437.1173R. doi : 10.1038/nature04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
  9. ^ Стельцль Ю, Ворм Ю, Лаловски М, Хениг С, Брембек Ф.Х., Гёлер Х, Стродике М, Ценкнер М, Шенхерр А, Кеппен С, Тимм Дж, Минцлафф С, Абрахам С, Бок Н, Китцманн С, Гёдде А, Токсёз Э., Дроге А., Кробич С., Корн Б., Бирчмайер В., Лерах Х., Ванкер Э.Э. (сентябрь 2005 г.). «Сеть белок-белкового взаимодействия человека: ресурс для аннотирования протеома». Клетка . 122 (6): 957–68. дои : 10.1016/j.cell.2005.08.029. hdl : 11858/00-001M-0000-0010-8592-0 . PMID  16169070. S2CID  8235923.
  10. ^ Ong LL, Er CP, Ho A, Aung MT, Yu H (август 2003 г.). «Кинектин прикрепляет фактор удлинения трансляции-1 дельта к эндоплазматическому ретикулуму». Журнал биологической химии . 278 (34): 32115–23. doi : 10.1074/jbc.M210917200 . PMID  12773547.
  11. ^ "База данных строк" . Получено 16 мая 2014 г.

Дальнейшее чтение

  • Venema RC, Peters HI, Traugh JA (июль 1991 г.). «Фосфорилирование фактора элонгации 1 (EF-1) и валил-тРНК-синтетазы протеинкиназой C и стимуляция активности EF-1». Журнал биологической химии . 266 (19): 12574–80. doi : 10.1016/S0021-9258(18)98937-4 . PMID  2061327.
  • Ван Дамм Х.Т., Амонс Р., Карссис Р., Тиммерс К.Дж., Янссен Г.М., Мёллер В. (август 1990 г.). «Фактор элонгации 1 бета артемии: локализация функциональных участков и гомология с фактором элонгации 1 дельта». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) – Структура и экспрессия генов . 1050 (1–3): 241–7. дои : 10.1016/0167-4781(90)90174-z. ПМИД  2207149.
  • Bec G, Kerjan P, Zha XD, Waller JP (декабрь 1989 г.). «Валил-тРНК-синтетаза из печени кролика. I. Очистка как гетеротипический комплекс в ассоциации с фактором удлинения 1». Журнал биологической химии . 264 (35): 21131–7. doi : 10.1016/S0021-9258(19)30056-0 . PMID  2556394.
  • Вольфсон АД, Орловский АФ, Гладилин КЛ (октябрь 1988 г.). "Валил-тРНК-синтетаза млекопитающих образует комплекс с первым фактором удлинения". FEBS Letters . 238 (2): 262–4. doi : 10.1016/0014-5793(88)80492-7 . PMID  3169261. S2CID  45934458.
  • Mulner-Lorillon O, Minella O, Cormier P, Capony JP, Cavadore JC, Morales J, Poulhe R, Bellé R (август 1994 г.). «Фактор удлинения EF-1 delta, новая цель для фактора, способствующего созреванию, в ооцитах Xenopus». Журнал биологической химии . 269 (31): 20201–7. doi : 10.1016/S0021-9258(17)32146-4 . PMID  8051108.
  • Маруяма К, Сугано С (январь 1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Gene . 138 (1–2): 171–4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
  • Bec G, Kerjan P, Waller JP (январь 1994). "Восстановление in vitro комплекса фактора элонгации валил-тРНК-синтетазы (EF) 1 бета-гамма-дельта. Основные роли NH2-концевого расширения валил-тРНК-синтетазы и субъединицы EF-1-дельта в образовании комплекса". Журнал биологической химии . 269 (3): 2086–92. doi : 10.1016/S0021-9258(17)42139-9 . PMID  8294461.
  • Sanders J, Brandsma M, Janssen GM, Dijk J, Möller W (май 1996 г.). «Исследования иммунофлуоресценции фибробластов человека демонстрируют наличие комплекса фактора удлинения-1 бета гамма дельта в эндоплазматическом ретикулуме». Journal of Cell Science . 109 (5): 1113–7. doi :10.1242/jcs.109.5.1113. PMID  8743958.
  • Chang YW, Traugh JA (ноябрь 1997 г.). «Фосфорилирование фактора удлинения 1 и рибосомального белка S6 мультипотенциальной киназой S6 и стимуляция инсулином трансляционного удлинения». Журнал биологической химии . 272 ​​(45): 28252–7. doi : 10.1074/jbc.272.45.28252 . PMID  9353277.
  • Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (октябрь 1997 г.). «Конструирование и характеристика библиотеки ДНК с полной длиной и обогащенной 5'-концом». Gene . 200 (1–2): 149–56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID  9373149.
  • Sheu GT, Traugh JA (декабрь 1997 г.). «Рекомбинантные субъединицы фактора удлинения млекопитающих 1, экспрессируемые в Escherichia coli. Взаимодействие субъединиц, активность удлинения и фосфорилирование протеинкиназой CKII». Журнал биологической химии . 272 ​​(52): 33290–7. doi : 10.1074/jbc.272.52.33290 . PMID  9407120.
  • Xiao H, Neuveut C, Benkirane M, Jeang KT (март 1998 г.). «Взаимодействие второго кодирующего экзона Tat с дельта-белком EF-1 человека обрисовывает механизм опосредованного ВИЧ-1 отключения трансляции мРНК хозяина». Biochemical and Biophysical Research Communications . 244 (2): 384–9. doi :10.1006/bbrc.1998.8274. PMID  9514931.
  • Kolettas E, Lymboura M, Khazaie K, Luqmani Y (1998). «Модуляция экспрессии фактора удлинения-1 дельта (EF-1 дельта) онкогенами в эпителиальных клетках человека». Anticancer Research . 18 (1A): 385–92. PMID  9568107.
  • Scanlan MJ, Chen YT, Williamson B, Gure AO, Stockert E, Gordan JD, Türeci O, Sahin U, Pfreundschuh M, Old LJ (май 1998 г.). «Характеристика антигенов рака толстой кишки человека, распознаваемых аутологичными антителами». International Journal of Cancer . 76 (5): 652–8. doi :10.1002/(SICI)1097-0215(19980529)76:5<652::AID-IJC7>3.0.CO;2-P. PMID  9610721. S2CID  916155.
  • Chacko G, Ling Q, Hajjar KA (июль 1998 г.). "Индукция генов острого трансляционного ответа гомоцистеином. Факторы удлинения-1альфа, -бета и -дельта". Журнал биологической химии . 273 (31): 19840–6. doi : 10.1074/jbc.273.31.19840 . PMID  9677419.
  • Sheu GT, Traugh JA (январь 1999). "Структурная модель фактора удлинения 1 (EF-1) и фосфорилирования протеинкиназой CKII". Молекулярная и клеточная биохимия . 191 (1–2): 181–6. doi :10.1023/A:1006802125856. PMID  10094407. S2CID  775166.
  • Furusawa T, Moribe H, Kondoh H, Higashi Y (декабрь 1999 г.). «Идентификация CtBP1 и CtBP2 как корепрессоров цинкового пальца-гомеодоменного фактора deltaEF1». Молекулярная и клеточная биология . 19 (12): 8581–90. doi :10.1128/mcb.19.12.8581. PMC  84984. PMID  10567582 .
  • Sang Lee J, Gyu Park S, Park H, Seol W, Lee S, Kim S (февраль 2002 г.). «Сеть взаимодействия человеческих аминоацил-тРНК-синтетаз и субъединиц комплекса фактора элонгации 1». Biochemical and Biophysical Research Communications . 291 (1): 158–64. doi :10.1006/bbrc.2002.6398. PMID  11829477.
  • Lei YX, Chen JK, Wu ZL (2002). «Блокирование фактора удлинения трансляции-1 дельта с помощью его антисмысловой мРНК приводит к значительному изменению его онкогенного потенциала». Тератогенез, канцерогенез и мутагенез . 22 (5): 377–83. doi :10.1002/tcm.10034. PMID  12210501.


Значок заглушки

Эта статья о гене на 8-й хромосоме человека — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=EEF1D&oldid=1191336400"