Ундекапренил-дифосфатаза
| ундекапренил-дифосфатаза | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||
| Номер ЕС | 3.6.1.27 | ||||||||
| Номер CAS | 9077-80-9 | ||||||||
| Базы данных | |||||||||
| ИнтЭнз | IntEnz вид | ||||||||
| БРЕНДА | запись BRENDA | ||||||||
| ExPASy | NiceZyme вид | ||||||||
| КЕГГ | запись KEGG | ||||||||
| МетаЦик | метаболический путь | ||||||||
| ПРИАМ | профиль | ||||||||
| Структуры PDB | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| Генная онтология | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
| Белок устойчивости к бацитрацину | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | ? | ||||||||
| Пфам | ПФ02673 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR003824 | ||||||||
| суперсемейство OPM | 479 | ||||||||
| белок ОПМ | 5oon | ||||||||
| |||||||||
В энзимологии ундекапренилдифосфатаза ( EC 3.6.1.27) — это фермент , катализирующий химическую реакцию
- ундекапренилдифосфат + H 2 O ундекапренилфосфат + фосфат
Таким образом, два субстрата этого фермента — ундекапренилдифосфат и H 2 O , тогда как два его продукта — ундекапренилфосфат и фосфат . Ферментативная активность усиливается двухвалентными катионами, в частности Ca 2+ .
У многих бактерий этот фермент является мембранным белком , который участвует в биосинтезе пептидогликана . Фермент участвует в формировании устойчивости к антибиотику бацитрацину . [1]
Номенклатура
Этот фермент принадлежит к семейству гидролаз , в частности, тех, которые действуют на ангидриды кислот в фосфорсодержащих ангидридах. Систематическое название этого класса ферментов — ундекапренил-дифосфатфосфогидролаза. Другие общеупотребительные названия включают ундекапренил-пирофосфатфосфатазу (Uppp), UPP-фосфатазу, BacA, C55-изопренилдифосфатазу, C55-изопренилпирофосфатазу и изопренилпирофосфатазу. [2]
Примечание: Фермент Uppp/BacA (EC 3.6.1.27) иногда ошибочно называют « ундекапренолкиназой ». [3] Однако это название следует зарезервировать для отдельного фермента (EC 2.7.1.66), который катализирует добавление фосфатной группы от АТФ к ундекапренолу (C55-изопрениловому спирту).
Структура
Доступны рентгеновские кристаллические структуры мембранной формы фермента из E. coli [4] [5] (идентификаторы PDB: 5OON, [6] 6CB2 [7] ).
Ссылки
- ^ Chalker AF, Ingraham KA, Lunsford RD, Bryant AP, Bryant J, Wallis NG, Broskey JP, Pearson SC, Holmes DJ (июль 2000 г.). «Ген bacA, который определяет восприимчивость к бацитрацину у Streptococcus pneumoniae и Staphylococcus aureus, также необходим для вирулентности». Microbiology . 146 (Pt 7): 1547– 53. doi : 10.1099/00221287-146-7-1547 . PMID 10878119.
- ^ "ундекапренилдифосфат (YMDB00637) - База данных метаболома дрожжей". www.ymdb.ca . Получено 2023-09-07 .
- ^ El Ghachi M, Bouhss A, Blanot D, Mengin-Lecreulx D (июль 2004 г.). «Ген bacA Escherichia coli кодирует активность ундекапренилпирофосфатфосфатазы». Журнал биологической химии . 279 (29): 30106– 13. doi : 10.1074/jbc.M401701200 . PMID 15138271.
- ^ El Ghachi M, Howe N, Huang CY, Olieric V, Warshamanage R, Touzé T, Weichert D, Stansfeld PJ, Wang M, Kerff F, Caffrey M (март 2018 г.). «Кристаллическая структура ундекапренилпирофосфатфосфатазы и ее роль в биосинтезе пептидогликана». Nature Communications . 9 (1): 1078. doi :10.1038/s41467-018-03477-5. PMC 5852022 . PMID 29540682.
- ^ Workman SD, Worrall LJ, Strynadka NC (март 2018 г.). «Кристаллическая структура внутримембранной фосфатазы, играющей центральную роль в биосинтезе пептидогликана бактериальной клеточной стенки и рециркуляции липидов». Nature Communications . 9 (1): 1159. doi :10.1038/s41467-018-03547-8. PMC 5861054 . PMID 29559664.
- ^ "5OON - Структура ундекапренилпирофосфатфосфатазы, BacA". Банк данных белков RCSB .
- ^ "6CB2 - Кристаллическая структура Escherichia coli UppP". Банк данных белков RCSB .
Дальнейшее чтение
- Goldman R, Strominger JL (август 1972). «Очистка и свойства C 55 -изопренилпирофосфатфосфатазы из Micrococcus lysodeikticus». Журнал биологической химии . 247 (16): 5116–22 . PMID 4341539.
