РНК roX дрозофилы
| Drosophila roX1 нкРНК | |
|---|---|
 Сохраненная вторичная структура РНК roX1 | |
| Идентификаторы | |
| Символ | roX1 |
| Рфам | РФ01667 |
| Другие данные | |
| Тип РНК | Цис -регуляторный элемент |
| Домены | Дрозофила |
| Структуры PDB | ПДБе |
RoX РНК — это некодирующая РНК (нкРНК), присутствующая в комплексе самцов-специфических леталей (MSL) и необходимая для компенсации дозировки пола у дрозофилы . Поскольку самцы содержат только одну Х-хромосому , самцы мух компенсируют дозировку Х-хромосомы путем гипертранскрибации Х-хромосомы. Это достигается путем связывания комплекса MSL с Х-хромосомой и индукции ацетилирования лизина 16 гистона H4 и позволяет формировать эухроматин . [1] [2] Эти нкРНК были впервые обнаружены в РНК, выделенной из нейрональных клеток. [3] [4]
Две roX РНК были идентифицированы в комплексе MSL из Drosophila melanogaster и, как было показано, сохраняются у разных видов Drosophila . Было показано, что две roX РНК, известные как roX1 и roX2, различаются по первичной последовательности и длине последовательности, но, несмотря на эти различия, они обе содержат сайт связывания MSL и являются функционально избыточными. [5] [6] Клонирование генов roX и последующее выравнивание последовательностей из ряда разных видов Drosophila выявило несколько консервативных областей , и было также отмечено, что roX РНК присутствует только у самцов мух. [7]
Прогнозы вторичной структуры предсказывали наличие петли стебля на 3'- конце транскриптов РНК roX. Мутагенез в этой области, который либо изменял последовательность, либо предотвращал образование петли стебля, оказался летальным для самцов мух, поскольку они не могли компенсировать дозировку, поскольку эти мутации предотвращали связывание MSL с X-хромосомой. Было также показано, что в присутствии мутантной РНК roX комплекс MSL не мог локализоваться на X-хромосоме и неправильно локализовался в гетерохроматиновом хромоцентре. Это говорит о том, что РНК roX играет роль в направлении комплекса MSL на X-хромосому. [7] Выравнивание последовательности roX2 выявило несколько областей сохранения последовательности, известных как области Gub, и отсутствует в roX1. Многие из этих областей Gub считаются избыточными, поскольку мутация не оказывает никакого эффекта, однако Gub1, который присутствует в области петли стебля 3', считается ключевым мотивом, необходимым для roX2, поскольку было показано, что мутации Gub1 являются летальными. Эти исследования показывают, что РНК roX необходима для компенсации дозировки, а область 3'- петли в РНК roX имеет решающее значение для локализации MSL, и считается, что именно этот мотив позволяет двум РНК roX быть функционально избыточными.
Смотрите также
Ссылки
- ^ Meller, V.; Gordadze, P.; Park, Y.; Chu, X.; Stuckenholz, C.; Kelley, R.; Kuroda, M. (февраль 2000 г.). «Упорядоченная сборка roX РНК в комплексы MSL на дозово-компенсированной X-хромосоме у Drosophila». Current Biology . 10 (3): 136–143. doi : 10.1016/S0960-9822(00)00311-0 . ISSN 0960-9822. PMID 10679323.
- ^ Хамада, Н.; Парк, Дж.; Гордадзе, Р.; Курода, И. (октябрь 2005 г.). "Глобальная регуляция генов X-хромосомы комплексом MSL у Drosophila melanogaster" (бесплатный полный текст) . Гены и развитие . 19 (19): 2289–2294. doi :10.1101/gad.1343705. ISSN 0890-9369. PMC 1240037. PMID 16204180 .
- ^ Меллер В.; Ву К.; Роман Г.; Курода М.; Дэвис Р. (1997). «РНК roX1 окрашивает Х-хромосому самцов дрозофилы и регулируется системой компенсации дозировки». Cell . 88 (4): 445–457. doi : 10.1016/S0092-8674(00)81885-1 . PMID 9038336.
- ^ Амрейн Х, Аксель Р (1997). «Гены, экспрессируемые в нейронах взрослых самцов дрозофилы». Cell . 88 (4): 459–469. doi : 10.1016/S0092-8674(00)81886-3 . PMID 9038337.
- ^ Franke, A.; Baker, B. (июль 1999). «РНК rox1 и rox2 являются важными компонентами компенсасомы, которая опосредует компенсацию дозировки у дрозофилы». Molecular Cell . 4 (1): 117–122. doi : 10.1016/S1097-2765(00)80193-8 . ISSN 1097-2765. PMID 10445033.
- ^ Meller, H.; Rattner, P. (март 2002 г.). «Гены roX кодируют избыточные мужские специфичные летальные транскрипты, необходимые для нацеливания комплекса MSL». The EMBO Journal (бесплатный полный текст). 21 (5): 1084–1091. doi :10.1093/emboj/21.5.1084. ISSN 0261-4189. PMC 125901 . PMID 11867536.
- ^ ab Park, W.; Kang, E.; Sypula, G.; Choi, J.; Oh, H.; Park, Y. (ноябрь 2007 г.). «Эволюционно консервативный домен РНК roX2 достаточен для индукции ацетилирования H4-Lys16 на X-хромосоме дрозофилы» (бесплатный полный текст) . Genetics . 177 (3): 1429–1437. doi :10.1534/genetics.107.071001. ISSN 0016-6731. PMC 2147973. PMID 18039876 .
Внешние ссылки
