Delftia acidovorans
Виды бактерий

Delftia acidovorans
Научная классификация Редактировать эту классификацию
Домен:Бактерии
Тип:Псевдомонадоты
Сорт:Бетапротеобактерии
Заказ:Буркхольдериевые
Семья:Комамоновые
Род:Дельфтия
Разновидность:
D. acidovorans
Биномиальное имя
Delftia acidovorans
(ден Доорен де Йонг, 1926)
Вен и др. 1999 год
Тип штамма
АТСС 15668Т
Синонимы

Comamonas acidovorans (den Dooren de Jong 1926) Tamaoka et al. 1987
Pseudomonas indoloxydans Grey 1928
Pseudomonas desmolytica Gray and Thornton 1928
Pseudomonas acidovorans den Dooren de Jong 1926

Delftia acidovorans — грамотрицательная , подвижная, неспорообразующая, палочковидная бактерия [1], известная своей способностью к биоминерализации золота [2] и биоремедиационными свойствами. [3] Впервые она была выделена из почвы в Делфте, Нидерланды. [1] Первоначально бактерия была отнесена к категориям Pseudomonas acidovorans и Comamonas acidovorans, а затем была переклассифицирована в Delftia acidovorans . [4]

История

Delftia acidovorans изначально была известна как Comamonas acidovorans . [1] Она была переименована из-за родства рРНК [5] и отличий от других микробов семейства Comamonadaceae. [1] Эти отличия подтверждаются филогенетическими и фенотипическими данными. [1] Новое название, Delftia acidovorans , является ссылкой на город Делфт , где она была впервые обнаружена и зарегистрирована. [1]

Биология и биохимия

Тип и морфология

Delftia acidovorans — сапрофит , [6] грамотрицательная , неспорообразующая, неденитрифицирующая, неферментирующая палочковидная бактерия. [1] Она существует в виде одной клетки или парами, ширина которых составляет 0,4–0,8 мкм, а длина — 2,5–4,1 мкм. [1] Она подвижна благодаря полярным или биполярным пучкам жгутиков. [1] Пучки могут иметь от одного до пяти жгутиков. [1]

Штаммы и филогения

Delftia acidovorans существует как часть линии Betaproteobacteria в пределах семейства Comamonadaceae . Штаммы D. acidovorans SPH1, ATCC 1 15668 и Cs 1-4 тесно связаны. Хотя штаммы CCUG 247B и CCUG 15835 относятся к Delftia acidovorans , они больше похожи на Delftia tsuruhatensis . CCUG 247B и CCUG 15835 часто группируют с D. tsuruhatensis , а не с D. acidovorans. [7]

Метаболизм

Delftia acidovorans является мезофильным бактерием , и его оптимальная температура роста составляет 30 °C. [7] Он не выживает в психрофильных условиях. [1] D. acidovorans является негалофилом, который предпочитает среду с минимальной концентрацией соли или без нее для роста. [1] Штаммы D. acidovorans Cs1-4 и SPH-1 являются аэробными бактериями. [7]

Штаммы Delftia acidovorans Cs1-4 и SPH-1 могут использовать фенантрен, пируват, ваниль, сукцинат, муравьиную кислоту , глюконовую кислоту , гидроксимасляную кислоту , молочную кислоту и пропионовую кислоту в качестве источников углерода. [7] D. acidovorans не продуцирует уреазу, является каталазо- и оксидазоположительным и окисляет фруктозу и маннит. [5]

Биоминерализация

Delftia acidovorans — одна из немногих бактерий, наряду с Cupriavidus metallidurans , которая может метаболизировать золото. [8] [2] Au 3+ восстанавливается внеклеточно нерибосомальным вторичным метаболитом делфтибактином. Делфтибактин — уникальный метаболит, поскольку он может защищать бактерии от токсичности золота, а также восстанавливать ионы золота до твердой формы. [2] Делфтибактин может удалять золото из шламов, содержащих морскую воду и карбонат кальция , а также способен извлекать золото из электронных отходов . [9] [10] Методы биогидрометаллургии с использованием D. acidovorans повышают рентабельность переработки и являются устойчивой альтернативой выщелачиванию цианидом. [11] Свинец также можно извлекать из выброшенных электронных устройств с помощью D. acidovorans . [3] Попытки вызвать экспрессию делфтибактина в Escherichia coli не увенчались успехом из-за токсичности белка DelH. [10]

Биоремедиация и биопроизводство

Delftia acidovorans способна преобразовывать токсичные металлы, включая ионы селена и хрома, в безвредные продукты. [3] Она также может разлагать фенантрен , который является источником углерода из полициклических ароматических углеводородов. Фенантрен является распространенным загрязнителем окружающей среды. [7]

D. acidovorans может использоваться для производства полигидроксиалканоатов (PHA), благоприятной альтернативы традиционному пластиковому оборудованию, используемому в медицинских учреждениях. Традиционное производство пластика является ресурсоемким и загрязняющим, в то время как производство PHA с помощью D. acidovorans является более устойчивым решением. [12]

Роль в заболевании

D. acidovorans — это появляющийся условно-патогенный микроорганизм, демонстрирующий устойчивость к антибиотикам. [6] [13] Инфекция может вызывать бактериемию , [14] кератит , [15] [16] пневмонию , [17] эмпиему , [18] отит , [19] и перитонит . [20] Известные источники инфекции включают загрязненную воду [19] и катетеры . [13] [14] D. acidovorans следует считать возбудителем у пациентов, когда есть подозрение на загрязнение воды или почвы. [5] D. acidovorans также был выделен из клинических условий, таких как системы обратного осмоса, [21] хирургические пылесосы [22] и раковины операционных. [23] Некоторые штаммы могут переносить хлоргексидин , [24] распространенное хирургическое дезинфицирующее средство.

Инфекции D. acidovorans можно подтвердить с помощью оранжевого индольного теста. [18] Распространена устойчивость к антибиотикам, аминогликозидам. [6] [13] [18] [17] [20]

Ссылки

  1. ^ abcdefghijkl Wen, Aimin; Fegan, Mark; Hayward, Chris; Chakraborty, Sukumar; Sly, Lindsay (1999). "Филогенетические отношения между членами Comamonadaceae и описание Delftia acidovorans (den Dooren de Jong 1926 и Tarnoaka et al. 1987) gen. nov., comb. nov". Международный журнал систематической бактериологии . 49 (2): 567– 576. doi : 10.1099/00207713-49-2-567 . PMID  10319477.
  2. ^ abc Джонстон, Чад В.; Уайетт, Морган А.; Ли, Сян; Ибрагим, Ашраф; Шустер, Джеремия; Саутэм, Гордон; Магарви, Натан А. (2013). «Биоминерализация золота металлофором из микроба, ассоциированного с золотом». Nature Chemical Biology . 9 (4): 241– 243. doi :10.1038/nchembio.1179. ISSN  1552-4469. PMID  23377039.
  3. ^ abc Убальде, Марта С.; Бранья, Виктория; Суэйро, Фабиана; Морель, Мария А.; Мартинес-Росалес, Сесилия; Маркес, Каролина; Кастро-Совински, Сусана (2012). «Универсальность изолятов Delftia sp. как инструментов для технологий биоремедиации и биоудобрения». Современная микробиология . 64 (6): 597–603 . doi : 10.1007/s00284-012-0108-5. ISSN  0343-8651. PMID  22476956. S2CID  1464049.
  4. ^ Рема, Тара; Лоуренс, Джон Р.; Дайнс, Джеймс Дж.; Хичкок, Адам П.; Корбер, Даррен Р. (2014-10-01). «Микроскопический и спектроскопический анализ переносимости хлоргексидина в биопленках Delftia acidovorans». Антимикробные агенты и химиотерапия . 58 (10): 5673– 5686. doi :10.1128/AAC.02984-14. ISSN  0066-4804. PMC 4187954. PMID 25022584  . 
  5. ^ abc Mahmood, S.; Taylor, KE; Overman, TL; McCormick, MI (2012-11-01). «Острый инфекционный эндокардит, вызванный Delftia acidovorans, редким патогеном, осложняющим внутривенное употребление наркотиков». Журнал клинической микробиологии . 50 (11): 3799– 3800. doi :10.1128/JCM.00553-12. ISSN  0095-1137. PMC 3486206. PMID 22933597  . 
  6. ^ abc Кавамура, Ичиро; Яги, Тецуя; Хатакеяма, Кадзухито; Хасэгава, Ёсинори; Окура, Теруко; Окусу, Киёфуми; Такахаси, Ёсиюки; Кодзима, Сэйдзи (2011). «Рецидивирующая сосудистая катетер-связанная бактериемия, вызванная Delftia acidovorans с различным профилем чувствительности к противомикробным препаратам». Журнал инфекции и химиотерапии . 17 (1): 111–113 . doi :10.1007/s10156-010-0089-x. PMID  20628778. S2CID  41936424.
  7. ^ abcde Shetty, Ameesha R.; de Gannes, Vidya; Obi, Chioma C.; Lucas, Susan; Lapidus, Alla; Cheng, Jan-Fang; Goodwin, Lynne A.; Pitluck, Samuel; Peters, Linda; Mikhailova, Natalia; Teshima, Hazuki (2015). "Полная последовательность генома фенантрен-деградирующей почвенной бактерии Delftia acidovorans Cs1-4". Стандарты в геномных науках . 10 : 55. doi : 10.1186/s40793-015-0041-x . ISSN  1944-3277. PMC 4572682. PMID 26380642  . 
  8. ^ Rea, Maria Angelica; Zammit, Carla M.; Reith, Frank (2016-06-01). «Бактериальные биопленки на золотых зернах — последствия для геомикробных преобразований золота». FEMS Microbiology Ecology . 92 (6): fiw082. doi : 10.1093/femsec/fiw082 . ISSN  0168-6496. PMID  27098381.
  9. ^ Юсофф, AHM; Надинг, ME; Салими, MN (2017). «Извлечение частиц золота (Au) из морской воды микробами Delftia Acidovorans». Журнал физики: Серия конференций . 908 (1): 012045. Bibcode : 2017JPhCS.908a2045Y. doi : 10.1088/1742-6596/908/1/012045 . ISSN  1742-6588.
  10. ^ ab "Переработка золота. Использование делфибактина для переработки золота из электронных отходов". iGEM .
  11. ^ Каксонен, Анна Х.; Боксалл, Наоми Дж.; Гумуля, Йозефина; Халеке, Химель Н.; Моррис, Кристина; Боху, Цинг; Ченг, Ка Ю; Ашер, Кейли М.; Лаканиеми, Айно-Майя (01 сентября 2018 г.). «Последние достижения в биогидрометаллургии и микробной характеристике». Гидрометаллургия . 180 : 7– 25. Бибкод : 2018HydMe.180....7K. doi :10.1016/j.гидромет.2018.06.018. ISSN  0304-386X. S2CID  103359824.
  12. ^ Романелли, Мария Джованна; Поволо, Сильвана; Фаваро, Лоренцо; Фонтана, Федерико; Базалья, Марина; Каселла, Серджио (2014). «Инженерия Delftia acidovorans DSM39 для получения полигидроксиалканоатов из отходов скотобойни». Международный журнал биологических макромолекул . 71 : 21– 27. doi :10.1016/j.ijbiomac.2014.03.049. PMID  24704165.
  13. ^ abc Chotikanatis, Kobkul; Bäcker, Martin; Rosas-Garcia, Gabriela; Hammerschlag, Margaret R. (2011). «Рецидивирующая внутрисосудистая катетерная бактериемия, вызванная Delftia acidovorans у пациента, находящегося на гемодиализе». Журнал клинической микробиологии . 49 (9): 3418– 3421. doi :10.1128/JCM.00625-11. ISSN  0095-1137. PMC 3165601. PMID 21775546  . 
  14. ^ ab Lang, KJ; Chinzowu, T.; Cann, KJ (2012). «Delftia acidovorans как необычный возбудитель сепсиса, связанного с линейной принадлежностью». Indian Journal of Microbiology . 52 (1): 102– 103. doi :10.1007/s12088-011-0221-3. ISSN  0046-8991. PMC 3298582 . PMID  23450157. 
  15. ^ Ли, Санг Мок; Ким, Ми Кум; Ли, Джэ Лим; Ви, Вон Рян; Ли, Джин Хак (2008). «Опыт лечения кератита Comamonas Acidovorans с отсроченным началом и ответ на лечение при иммунодефицитной роговице». Корейский журнал офтальмологии . 22 (1): 49– 52. doi :10.3341/kjo.2008.22.1.49. ISSN  1011-8942. PMC 2629953. PMID 18323706  . 
  16. ^ Langman, ME; Dighiero, PL; Gicquel, JJ (2007-10-02). "Comamonas: a not so comon agent in hydrogel contact lens owners". Acta Ophthalmologica Scandinavica . 85 : 0. doi :10.1111/j.1600-0420.2007.01062_3296.x.
  17. ^ аб Йылдыз, Ханифи; Сюннетчиоглу, Айсель; Экин, Селами; Баран, Ирфан; Озгёкче, Месут; Ашкер, Сельви; Юней, Ибрагим; Акюз, Сумейе (10 февраля 2020 г.). Тургут, Энгин (ред.). «Дельфтиевая ацидоворская пневмония с образованием каверн в легких». Колумбия Медика . 50 (3): 215–221 . doi :10.25100/cm.v50i3.4025. ПМЦ 7141147 . ПМИД  32284666. 
  18. ^ abc Khan, Sadia; Sistla, Sujatha; Dhodapkar, Rahul; Parija, Subhash Chandra (2012). «Смертельная инфекция Delftia acidovorans у иммунокомпетентного пациента с эмпиемой». Asian Pacific Journal of Tropical Biomedicine . 2 (11): 923– 924. doi :10.1016/S2221-1691(12)60254-8. PMC 3609244. PMID  23569872 . 
  19. ^ аб Рейна, Джорди; Лломпарт, Изабель; Аломар, Педро (март 1991 г.). «Острый гнойный отит, вызванный Comamonas acidovorans». Информационный бюллетень по клинической микробиологии . 13 (5): 38–39 . doi :10.1016/0196-4399(91)90006-H.
  20. ^ ab Artan, Ayse Serra; Gursu, Meltem; Elcioglu, Omer Celal; Kazancioglu, Rumeyza (2020). «Перитонит, вызванный Delftia Acidovorans, у пациента, проходящего перитонеальный диализ». Турецкий журнал нефрологии . 29 (4): 326– 328. doi : 10.5152/turkjnephrol.2020.4204 .
  21. ^ Яссин, Мохамед Х.; Абрамовиц, Блейз; Харири, Рахман; Маккиббен, Лианна; Пиневич, А. Дж. (2020). «Псевдовспышка Delftia acidovorans в портативных аппаратах обратного осмоса: меры по обеспечению безопасного и экономически эффективного гемодиализа». Американский журнал по контролю инфекций . 48 (3): 304–308 . doi :10.1016/j.ajic.2019.11.027. ISSN  0196-6553. PMID  31952870. S2CID  210708340.
  22. ^ Миньо де Каспар, Эрминия; Грасбон, Томас; Кампик, Ансельм (2000). «Автоматизированное хирургическое оборудование требует регулярной дезинфекции вакуумного контрольного коллектора для предотвращения послеоперационного эндофтальмита». Офтальмология . 107 (4): 685– 690. doi :10.1016/s0161-6420(99)00178-5. ISSN  0161-6420. PMID  10768329.
  23. ^ Ta, C.; Wong, G.; Cole, W.; Медведев, G. (2020-09-01). «Загрязнение раковин и передача инфекции персоналу операционной». Новые микробы и новые инфекции . 37 : 100754. doi : 10.1016/j.nmni.2020.100754. ISSN  2052-2975. PMC 7502367. PMID 32995014  . 
  24. ^ Рема, Тара; Лоуренс, Джон Р.; Дайнс, Джеймс Дж.; Хичкок, Адам П.; Корбер, Даррен Р. (2014). «Микроскопический и спектроскопический анализ переносимости хлоргексидина в биопленках Delftia acidovorans». Антимикробные агенты и химиотерапия . 58 (10): 5673– 5686. doi :10.1128/AAC.02984-14. ISSN  0066-4804. PMC 4187954. PMID 25022584  . 
  • Типовой штамм Delftia acidovorans в BacDive — базе метаданных бактериального разнообразия
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Delftia_acidovorans&oldid=1239841800"