Deferribacteraceae

Deferribacteraceae
Научная классификация
Домен:	Бактерии
Тип:	Deferribacterota ; Гаррити и Холт 2021
Сорт:	Деферрибактерии ; Хубер и Штеттер 2002
Заказ:	Deferribacterales ; Хубер и Штеттер 2002
Семья:	Deferribacteraceae ; Хубер и Штеттер 2002
Генера
	Calditerrivibrio; Деферривибрио; Денитровибрион; Деферрибактерии; Флексистипес; Геовибрион; Limisalsivibrio; Муциспириллы; Петротермобактер; Селенивибрио;
Синонимы
	Деферрибактериоты: «Деферрибактерии» Гаррити и Холт 2001; «Deferribacterota» Уитман и др. 2018 г.; «Деферрибактериота» Орен и др. 2015 год; ; Деферрибактерии: Ферробактерии Кавальер-Смит 2002 г.; «Деферрибактерии» Кавалер-Смит 2020; ; Деферрибактериальные: Geovibriales (так в оригинале) Кавальер-Смит 2002; ;

Семейство бактерий

Deferribacteraceae — это семейство грамотрицательных бактерий , которые вырабатывают энергию путем анаэробного дыхания . ^[2]

Описание

Deferribacteraceae имеют форму палочек , хотя палочки могут быть прямыми или изогнутыми. Они грамотрицательны . Deferribacteraceae осуществляют анаэробное дыхание с использованием железа, марганца или нитрата . Они также могут вырабатывать энергию путем ферментации . Типовой род семейства — Deferribacter . ^[2]

Филогения

Принятая в настоящее время таксономия основана на Списке названий прокариот, имеющих постоянное место в номенклатуре (LSPN) ^[3]^[4]

Тип Deferribacterota Гаррити и Холт 2021
- Класс Deferribacteres Huber & Stetter 2002
  - Заказать Deferribacterales Huber & Stetter 2002
    - Род ? Petrothermobacter Tamazawa и др. 2017
    - Семейство Calditerrivibrionaceae Весна и др. 2022
    - Семейство Deferribacteraceae Huber & Stetter 2002
    - Семейство Deferrivibrionaceae Заварзина и др. 2023
    - Семейство Flexistipitaceae Spring et al. 2022 год
    - Семейство Geovibrionaceae Кавалер-Смит 2020
    - Семейство Mucispirillaceae Весна и др. 2022

LTP на основе 16S рРНК _08_2023 ^[5]^[6]^[7]

120 маркерных белков с одной копией на основе GTDB 08-RS214 ^[8]^[9]^[10]

Deferribacteraceae

	Флекситипес Фиала и др . 2000 г.

	Деферрибэктер Грин и др . 1997

Mucispirillum Робертсон и др . 2005

Calditerrivibrio Iino et al . 2008 год

	Деферривибрио Заварзина и др. 2023

	Петротермобактер Тамазава и др. 2017 год

	Limisalsivibrio Весна и др. 2022

	Геовибрио Каккаво и др . 2000 г.

	Денитровибрио Мир и Торсвик 2000

	Селенивибрио Раушенбах и др. 2013

Деферрибактериальные

Flexistipitaceae	Флексистипес

Calditerrivibrionaceae	Calditerrivibrio

Deferrivibrionaceae	Деферривибрио

Deferribacteraceae	Деферрибактерии

Mucispirillaceae

Муциспириллы

Геовибрионовые

	Limisalsivibrio

	Геовибрион

	Денитровибрион

	Селенивибрио

История

Семейство было впервые описано в 2001 году и включало роды Deferribacter , Flexistipes и Geovibrio . ^[2]

Смотрите также

Ссылки

^ Oren A, Garrity GM (2021). «Действительная публикация названий сорока двух типов прокариот». Int J Syst Evol Microbiol . 71 (10): 5056. doi : 10.1099/ijsem.0.005056 . PMID 34694987. S2CID 239887308.
^ abc Huber, H., and Stetter, KO "Family I. Deferribacteraceae fam. nov." В: Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, 2nd ed., vol. 1 (The Archaea and the deep branching and phototrophic Bacteria) (DR Boone and RW Castenholz, eds.), Springer-Verlag, New York (2001). pp. 465-466.
^ См. Список названий прокариот, имеющих место в номенклатуре . Данные взяты из "Deferribacteres" . Получено 20.03.2013 .
^ См . веб-страницу NCBI о Deferribacteres Данные, извлеченные из "NCBI Taxonomy Browser". Национальный центр биотехнологической информации . Получено 20.03.2013 .
^ "The LTP" . Получено 20 ноября 2023 г. .
^ "Дерево LTP_all в формате newick" . Получено 20 ноября 2023 г. .
^ "LTP_08_2023 Release Notes" (PDF) . Получено 20 ноября 2023 г.
^ "GTDB release 08-RS214". База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 г.
^ "bac120_r214.sp_label". База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 г.
^ "История таксона". База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 г.

Эта статья о бактериях — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[1] Oren A, Garrity GM (2021). «Действительная публикация названий сорока двух типов прокариот». Int J Syst Evol Microbiol . 71 (10): 5056. doi : 10.1099/ijsem.0.005056 . PMID 34694987. S2CID 239887308.

[Bergey-2] Huber, H., and Stetter, KO "Family I. Deferribacteraceae fam. nov." В: Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, 2nd ed., vol. 1 (The Archaea and the deep branching and phototrophic Bacteria) (DR Boone and RW Castenholz, eds.), Springer-Verlag, New York (2001). pp. 465-466.

[3] См. Список названий прокариот, имеющих место в номенклатуре . Данные взяты из "Deferribacteres" . Получено 20.03.2013 .

[4] См . веб-страницу NCBI о Deferribacteres Данные, извлеченные из "NCBI Taxonomy Browser". Национальный центр биотехнологической информации . Получено 20.03.2013 .

[LTP-5] "The LTP" . Получено 20 ноября 2023 г. .

[6] "Дерево LTP_all в формате newick" . Получено 20 ноября 2023 г. .

[7] "LTP_08_2023 Release Notes" (PDF) . Получено 20 ноября 2023 г.

[about-8] "GTDB release 08-RS214". База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 г.

[tree-9] "bac120_r214.sp_label". База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 г.

[taxon_history-10] "История таксона". База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 г.