Белок, содержащий домен DEP, взаимодействующий с mTOR ( DEPTOR ), также известный как белок 6, содержащий домен DEP ( DEPDC6 ), представляет собой белок , который у людей кодируется геном DEPTOR . [ 5]
Структура
Ген DEPTOR можно найти только у позвоночных. У человека ген DEPTOR расположен на хромосоме 8, 8q24.12 с размером белка 409 aa [6] Человеческий DEPTOR содержит два N-концевых домена DEP и C-концевой домен PDZ . [7]
Функция
DEPTOR участвует в сигнальном пути mTOR как эндогенный регулятор. Было показано прямое взаимодействие между DEPTOR и mTOR. [7] Сверхэкспрессия DEPTOR подавляет активность mTORC1 и mTORC2 in vitro . mTORC1 и mTORC2 могут оба ингибировать DEPTOR посредством фосфорилирования . [7]
Метаболизм
Клетка DEPTOR автономно регулирует адипогенез . [8] В мышцах Baf60c способствует переключению с окислительного на гликолитический тип миофибрилл посредством активации Akt/PKB , опосредованной DEPTOR . [9] В мозге DEPTOR высоко экспрессируется в гиппокампе , медиобазальном гипоталамусе и циркумвентрикулярных органах . [10] Повышенная экспрессия DEPTOR в медиобазальном гипоталамусе защищает мышей от ожирения , вызванного диетой с высоким содержанием жиров, путем модуляции сигнализации Akt/PKB . [11]
Клинический рак
Хотя при большинстве видов рака путь mTOR постоянно активируется, а экспрессия DEPTOR низкая, одно исследование показало, что DEPTOR сверхэкспрессируется в клетках множественной миеломы и необходим для их выживания. [7]
Ссылки
^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000155792 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000022419 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ abcd Peterson TR, Laplante M, Thoreen CC, Sancak Y, Kang SA, Kuehl WM, Gray NS, Sabatini DM (май 2009 г.). «DEPTOR — это ингибитор mTOR, который часто сверхэкспрессируется в клетках множественной миеломы и необходим для их выживания». Cell . 137 (5): 873–86. doi :10.1016/j.cell.2009.03.046. PMC 2758791 . PMID 19446321.
^ Laplante M, Horvat S, Festuccia WT, Birsoy K, Prevorsek Z, Efeyan A, Sabatini DM (август 2012 г.). «DEPTOR cell-autonomously promotes adipogenesis, and its expression is associated with obesity» (Дептор клеточно-автономно способствует адипогенезу, и его экспрессия связана с ожирением). Cell Metabolism . 16 (2): 202–12. doi :10.1016/j.cmet.2012.07.008. PMC 3463374. PMID 22883231 .
^ Meng ZX, Li S, Wang L, Ko HJ, Lee Y, Jung DY, Okutsu M, Yan Z, Kim JK, Lin JD (май 2013 г.). «Baf60c управляет гликолитическим метаболизмом в мышцах и улучшает системный гомеостаз глюкозы посредством активации Akt, опосредованной Deptor». Nature Medicine . 19 (5): 640–5. doi :10.1038/nm.3144. PMC 3650110 . PMID 23563706.
^ Caron A, Baraboi ED, Laplante M, Richard D (январь 2015 г.). «Белок, содержащий домен DEP и взаимодействующий с mTOR, в мозге крысы: распределение экспрессии и потенциальное значение». Журнал сравнительной неврологии . 523 (1): 93–107. doi : 10.1002/cne.23668 . PMID 25159114. S2CID 205683672.
^ Caron, Alexandre; Labbé, Sébastien M.; Lanfray, Damien; Blanchard, Pierre-Gilles; Villot, Romain; Roy, Christian; Sabatini, David M.; Richard, Denis; Laplante, Mathieu (2016). «Медиобазальная гипоталамическая сверхэкспрессия Deptor защищает от ожирения, вызванного диетой с высоким содержанием жиров». Молекулярный метаболизм . 5 (2): 102–112. doi :10.1016/j.molmet.2015.11.005. PMC 4735664. PMID 26909318 .
Дальнейшее чтение
Маруяма К, Сугано С (январь 1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Gene . 138 (1–2): 171–4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (октябрь 1997 г.). «Конструирование и характеристика библиотеки ДНК с полной длиной и обогащенной 5'-концом». Gene . 200 (1–2): 149–56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (ноябрь 2000 г.). «Клонирование ДНК с использованием in vitro сайт-специфической рекомбинации». Genome Research . 10 (11): 1788–95. doi :10.1101/gr.143000. PMC 310948. PMID 11076863 .
Виманн С., Вейль Б., Велленройтер Р., Гассенхубер Дж., Глассль С., Ансорж В., Бёхер М., Блёкер Х., Бауэрсакс С., Блюм Х., Лаубер Дж., Дюстерхёфт А., Бейер А., Кёрер К., Штрак Н., Мьюс Х.В., Оттенвальдер Б. , Обермайер Б., Тампе Дж., Хойбнер Д., Вамбутт Р., Корн Б., Кляйн М., Пустка А. (март 2001 г.). «К каталогу человеческих генов и белков: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Геномные исследования . 11 (3): 422–35. дои : 10.1101/gr.GR1547R. ПМК 311072 . ПМИД 11230166.
Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, Pepperkok R, Wiemann S (сентябрь 2000 г.). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, идентифицированных с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК». EMBO Reports . 1 (3): 287–92. doi :10.1093/embo-reports/kvd058. PMC 1083732. PMID 11256614 .
Виманн С., Арльт Д., Хубер В., Велленройтер Р., Шлигер С., Мерле А., Бектель С., Зауэрманн М., Корф У., Пепперкок Р., Зюльтманн Х., Пустка А. (октябрь 2004 г.). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Геномные исследования . 14 (10Б): 2136–44. дои : 10.1101/гр.2576704. ПМК 528930 . ПМИД 15489336.
Мерле А., Розенфельдер Х., Шупп И., дель Валь С., Арльт Д., Хане Ф., Бектель С., Симпсон Дж., Хофманн О., Хиде В., Глаттинг К.Х., Хубер В., Пепперкок Р., Пустка А., Виманн С. (январь 2006 г.). «База данных LIFEdb в 2006 году». Исследования нуклеиновых кислот . 34 (Проблема с базой данных): D415–8. дои : 10.1093/nar/gkj139. ПМЦ 1347501 . ПМИД 16381901.
