Синтия Берроуз

американский химик
Синтия Джейн Берроуз
Интервью Синтии Берроуз для Chemical Heritage Foundation в июле 2009 года.
Альма-матерБакалавр искусств Университета Колорадо (1975) Доктор философии
Корнелльского университета (1982)
Научная карьера
ТезисВлияние заместителей на алифатическую перегруппировку Кляйзена: синтез и кинетические исследования цианозамещенных аллилвиниловых эфиров  (1982)
научный руководительБарри Карпентер
Другие научные консультантыСтэнли Кристол, Жан-Мари Лен

Синтия Дж. Берроуз — американский химик, в настоящее время выдающийся профессор кафедры химии в Университете Юты , где она также является заведующей кафедрой биологической химии, финансируемой президентом Тэтчер. Берроуз была старшим редактором журнала органической химии (2001-2013) и стала главным редактором Accounts of Chemical Research в 2014 году. [1] , [2] , [3]

Образование и обучение

Берроуз получила степень бакалавра по химии в Университете Колорадо (1975). Там она работала над диаграммами Штерна-Фольмера в лаборатории Стэнли Кристола в течение своего последнего года обучения. Она продолжила изучать физическую органическую химию в Корнеллском университете , где она получила степень доктора философии по химии в 1982 году, работая в лаборатории Барри Карпентера. Ее докторская диссертация была сосредоточена на цианозамещенных аллилвиниловых эфирах. Затем Берроуз провела короткую постдокторскую исследовательскую работу с Жаном-Мари Леном в Страсбурге , Франция . [4] [5] [6]

Карьера и исследования

ДНК может быть повреждена из-за нарушения пар оснований.

Лаборатория Берроуз интересуется химией нуклеиновых кислот, технологией секвенирования ДНК и повреждением ДНК. Ее исследовательская группа (состоящая из химиков-органиков, биологов, аналитиков и неоргаников) фокусируется на химических процессах, которые приводят к образованию мутаций, которые могут привести к заболеваниям (таким как рак). Ее работа включает изучение сайт-специфически модифицированных цепей ДНК и РНК и перекрестных связей ДНК-белок . Берроуз и ее группа широко известны тем, что расширили исследования технологии нанопор, разработав метод обнаружения повреждения ДНК с использованием нанопоры. [1] , [3]

Одной из задач лаборатории Берроуза является применение технологии нанопор для идентификации, количественной оценки и анализа повреждений ДНК, вызванных окислительными стрессами. Берроуз фокусируется на повреждениях, обнаруженных в человеческих теломерных последовательностях, важных хромосомных регионах, которые обеспечивают защиту от деградации и подвержены проблемам во время репликации ДНК . [7] Кроме того, исследования Берроуза по изменению состава нуклеиновых кислот могут предоставить ценную информацию о генетических заболеваниях, а также манипулировании функцией ДНК и РНК в клетках.

Нанопоровое обнаружение повреждений ДНК

Исследовательская лаборатория Берроуза фокусируется на обнаружении реакции окисления гуанина, как показано на рисунке.
Цепь ДНК проходит через нанопору a-гемолизина и позволяет исследователям обнаружить поврежденный участок одного основания. Цель этой системы обнаружения нанопор — обнаружить поврежденные участки и понять, как повреждение в определенном участке приводит к заболеванию.

Технология нанопор важна для анализа биологических макромолекул, таких как ДНК и РНК, поскольку она позволяет обнаруживать мельчайшие количества образцов и обходит необходимость ПЦР- амплификации. ПЦР-амплификация и другие методы секвенирования ДНК не могут обнаружить повреждение ДНК в одиночку, поскольку их основа опирается на четыре классических немодифицированных основания: цитозин , аденин , гуанин и тимин . Одной из наиболее распространенных и преобладающих причин повреждения ДНК является окисление остатков гуанина до 8-оксогуанина, вызванное окислительными стрессами. 8-оксогуанин вызывает несоответствие пар с аденином, а не с цитозином, что в конечном итоге может вызвать точечные мутации во время репликации ДНК. [8] В контексте сшивания ДНК-белок 8-оксогуанин подвержен образованию аддуктов с аминокислотами, содержащими реактивные группы, такие как фенольная часть тирозина или терминальный амин лизина. [9] , [10] Обнаружение и количественное определение содержания 8-оксогуанина в теломерных последовательностях важно, поскольку его содержание увеличивается при стрессе, поскольку теломеры избегают клеточных механизмов восстановления ДНК. [11] Берроуз помог обнаружить специфические ДНК-гликозилазы, которые преимущественно восстанавливают окислительные повреждения на теломерных участках. [12]

Технология нанопор основана на пропускании постоянного электрического тока через наноразмерное отверстие, погруженное в электролитический раствор. Молекулы, которые проходят через пору или нарушают ток, блокируя ее, генерируют обнаружимый сигнал при измерении тока в зависимости от времени. Нанопоры могут быть как твердотельными конструкциями, так и небольшими белками. Чтобы изучить степень повреждения G-квадруплексов теломер, Берроуз использовал белок α-гемолизин, который содержит наноразмерное трубчатое ядро ​​и встроен в клеточную мембрану. [11] Поврежденные основания окислительно маркируются краун-эфиром для усиления сигнала тока, а также для уменьшения смягчающего воздействия 8-оксогуанина на нативную складку. [11] Когда цепь ДНК проходит через нее, отмеченное поврежденное основание производит характерный сигнал, поскольку оно нарушает приложенный ток.

Награды и почести

Награды и почести включают в себя: [1]

  • Стипендия NSF-CNRS по обмену учеными, 1981–82 гг.
  • Научный сотрудник Японского общества содействия развитию науки, 1989–90 гг.
  • Премия NSF за креативность, 1993–95
  • Премия NSF за продвижение по службе, 1993–94
  • Секция изучения биоорганических и натуральных продуктов, NIH, 1990–94
  • Консультативный комитет по математике и физическим наукам NSF, 2005–2008 гг.
  • Заместитель редактора, Organic Letters, 1999–2002
  • Старший редактор журнала «Органическая химия», 2001–2013 гг.
  • Премия Роберта У. Перри за преподавание, 2002 г.
  • Премия ACS Юта, 2000 г.
  • Премия имени Беа Сингер, 2004 г.
  • Член Американской ассоциации специалистов по акустике (AAAS), 2004 г.
  • Премия за выдающиеся научные и творческие исследования, Университет Юты, 2005 г.
  • Премия имени Коупа, Американское химическое общество, 2008 г.
  • Директор, Управляющий орган USTAR, 2009-2017
  • Член Американской академии искусств и наук, 2009 г.
  • Член Американского химического общества, 2010 г.
  • Премия за выдающиеся достижения в преподавании, 2011 г.
  • Главный редактор журнала «Accounts of Chemical Research», 2014 г.
  • Премия Линды К. Амос за выдающиеся заслуги перед женщинами Университета Юты, 2014 г.
  • Член Национальной академии наук, 2014 г.
  • Премия имени Джеймса Флэка Норриса от Американского химического общества в области физической органической химии, 2018 г.
  • Премия Уилларда Гиббса , 2018 г.

Ссылки

  1. ^ abc "Синтия Дж. Берроуз - Химический факультет - Университет Юты". chem.utah.edu . Получено 26.05.2017 .
  2. ^ "Синтия Берроуз, доктор философии - Подробности факультета - Медицинский факультет U of U - | Университет Юты". medicine.utah.edu . Получено 2017-06-02 .
  3. ^ ab "Синтия Берроуз". www.nasonline.org . Получено 2017-06-02 .
  4. ^ Берроуз, Синтия Дж.; Карпентер, Барри К. (1981-11-01). «Влияние заместителей на алифатическую перегруппировку Кляйзена. 1. Синтез и перегруппировка цианозамещенных аллилвиниловых эфиров». Журнал Американского химического общества . 103 (23): 6983– 6984. doi :10.1021/ja00413a045. ISSN  0002-7863.
  5. ^ Центр устной истории. "Синтия Дж. Берроуз". Институт истории науки .
  6. ^ Домуш, Хилари Л. (16 июля 2009 г.). Синтия Дж. Берроуз, Стенограмма интервью, проведенного Хилари Л. Домуш в Университете Юты, Солт-Лейк-Сити, штат Юта, 15 и 16 июля 2009 г. (PDF) . Филадельфия, Пенсильвания: Фонд химического наследия .
  7. ^ An, Na; Fleming, Aaron M.; Burrows, Cynthia J. (2016-02-19). "Человеческие теломеры G-квадруплексы с пятью повторами аккомодируют 8-оксо-7,8-дигидрогуанин, вычленяя повреждение ДНК". ACS Chemical Biology . 11 (2): 500– 507. doi :10.1021/acschembio.5b00844. ISSN  1554-8929. PMC 4828913 . PMID  26686913. 
  8. ^ Cheng, KC; Cahill, DS; Kasai, H.; Nishimura, S.; Loeb, LA (1992-01-05). "8-Гидроксигуанин, распространенная форма окислительного повреждения ДНК, вызывает замены G----T и A----C". Журнал биологической химии . 267 (1): 166– 172. doi : 10.1016/S0021-9258(18)48474-8 . ISSN  0021-9258. PMID  1730583.
  9. ^ Xu, Xiaoyun; Fleming, Aaron M.; Muller, James G.; Burrows, Cynthia J. (2008-08-06). «Формирование трициклических [4.3.3.0] аддуктов между 8-оксогуанозином и тирозином в условиях окислительного сшивания ДНК-белок». Журнал Американского химического общества . 130 (31): 10080– 10081. doi :10.1021/ja803896d. ISSN  1520-5126. PMID  18611013.
  10. ^ Xu, Xiaoyun; Muller, James G.; Ye, Yu; Burrows, Cynthia J. (2008-01-16). «ДНК-белковые поперечные связи между гуанином и лизином зависят от механизма окисления для образования аддуктов гуанозина C5 против C8». Журнал Американского химического общества . 130 (2): 703– 709. doi :10.1021/ja077102a. ISSN  1520-5126. PMID  18081286.
  11. ^ abc An, Na; Fleming, Aaron M.; White, Henry S.; Burrows, Cynthia J. (2015). «Обнаружение нанопорами 8-оксогуанина в последовательности повторов теломер человека». ACS Nano . 9 (4): 4296– 4307. doi : 10.1021 /acsnano.5b00722. ISSN  1936-086X. PMC 4790916. PMID  25768204. 
  12. ^ Чжоу, Цзя; Лю, Миньмин; Флеминг, Аарон М.; Берроуз, Синтия Дж.; Уоллес, Сьюзан С. (2013-09-20). «Гликозилазы ДНК Neil3 и NEIL1 удаляют окислительные повреждения из квадруплексной ДНК и проявляют предпочтения к повреждениям в контексте теломерной последовательности». Журнал биологической химии . 288 (38): 27263– 27272. doi : 10.1074/jbc.M113.479055 . ISSN  1083-351X. PMC 3779722. PMID  23926102 . 
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Синтия_Берроуз&oldid=1162591019"