Полная геномика
Китайская биотехнологическая компания
Полная геномика
Тип компанииЧастный
ПромышленностьБиотехнология
Основан2006
Штаб-квартира
Сан-Хосе, Калифорния
,
НАС
Обслуживаемая территория
Во всем мире
РодительМГИ
Веб-сайтwww.completegenomics.com

Complete Genomics — это компания в области естественных наук, которая разработала и вывела на рынок платформу секвенирования ДНК для секвенирования и анализа генома человека. Компания является дочерней компанией MGI, полностью принадлежащей ей .

История

Complete Genomics была основана в июне 2005 года Клиффордом Ридом, Радое (Рейд) Дрманачем и Джоном Керсоном. Клиффорд Рид был председателем, президентом и главным исполнительным директором Complete Genomics до того, как в 2015 году он ушел, чтобы основать Genos, ответвление потребительского подразделения Complete Genomics. [1] [2]

В феврале 2009 года Complete Genomics объявила, что она секвенировала свой первый геном человека и отправила полученные данные о вариантах в базу данных Национального центра биотехнологической информации . В ноябре 2009 года Complete Genomics опубликовала данные о последовательностях трех геномов человека в журнале Science . [3]

Полученные данные поддерживают исследования в различных областях, таких как скрининг эмбрионов , [4] обнаружение генетических связей, [5] [6] неврология , [7] старение , [8] новое менделевское заболевание с поражением нервно-мышечной и сердечной системы, [9] расстройства пищевого поведения , [10] синдром Прадера-Вилли и аутизм, [11] офтальмология , [12] и онкология . [13] [14] [15] [16] [17] В 2014 году сотрудничество между Университетом Радбауда (Нидерланды), Медицинским центром Маастрихтского университета (Нидерланды), Центральным южным университетом (Китай) и Complete Genomics выявило основные причины интеллектуальной инвалидности с помощью секвенирования всего генома. [18]

В 2016 году Complete Genomics предоставила более 184 фазированных человеческих геномов для проекта Джорджа Чёрча « Персональный геном» . [19] В 2019 году они опубликовали свою новую технологию чтения длинных фрагментов в одной трубке (stLFR), позволяющую конструировать длинные молекулы ДНК из коротких считываний с использованием комбинаторного процесса штрихкодирования ДНК. Она позволяет проводить фазирование, обнаружение SV, создание каркасов и экономически эффективную сборку диплоидного генома de novo с помощью технологии секвенирования второго поколения . [20]

В марте 2013 года Complete Genomics была приобретена BGI Group , компанией по предоставлению услуг в области геномики в Шэньчжэне , провинция Гуандун , Китай. [21] После приобретения Complete Genomics переехала в Сан-Хосе и в июне 2018 года стала частью MGI. [22] MGI была дочерней компанией BGI Group до того, как она была выделена и размещена на Шанхайской фондовой бирже в 2022 году. [23]

Ссылки

  1. ^ «Стартап Genos Research в области потребительской геномики планирует позволить клиентам исследовать и делиться своими данными». GenomeWeb . 13 июня 2016 г. Архивировано из оригинала 2019-04-02 . Получено 2019-06-15 .
  2. ^ "Complete Genomics объявляет об обновлении миссии и новых партнерствах в 18-ю годовщину". News-Medical . 15 июня 2023 г. Архивировано из оригинала 2023-07-11 . Получено 2023-06-15 .
  3. ^ Drmanac R; Sparks, AB; Callow, MJ; Halpern, AL; Burns, NL; Kermani, BG; Carnevali, P.; Nazarenko, I.; Nilsen, GB; Yeung, G.; Dahl, F.; Fernandez, A.; Staker, B.; Pant, KP; Baccash, J.; Borcherding, AP; Brownley, A.; Cedeno, R.; Chen, L.; Chernikoff, D.; Cheung, A.; Chirita, R.; Curson, B.; Ebert, JC; Hacker, CR; Hartlage, R.; Hauser, B.; Huang, S.; Jiang, Y.; и др. (ноябрь 2009 г.). «Секвенирование генома человека с использованием несвязанных считываний оснований на самоорганизующихся ДНК-наномассивах». Science . 327 (5961): 78–81. Bibcode :2010Sci...327...78D. doi : 10.1126/science.1181498 . PMID  19892942. S2CID  17309571.
  4. ^ Winard R; et al. (2014). «Скрининг эмбрионов in vitro с помощью секвенирования всего генома: сейчас, в будущем или никогда?». Hum Reprod . 29 (4): 842–851. doi : 10.1093/humrep/deu005 . PMID  24491297.
  5. ^ Ли Х; и др. (2014). «Оценка взаимосвязи на основе данных о последовательностях всего генома». PLOS Genet . 10 (1): e1004144. doi : 10.1371/journal.pgen.1004144 . PMC 3907355. PMID  24497848 . 
  6. ^ Su SY; et al. (2012). «Определение идентичности по происхождению с использованием данных полногеномного секвенирования следующего поколения». BMC Bioinformatics . 13 : 121. doi : 10.1186/1471-2105-13-121 . PMC 3403908. PMID  22672699. 
  7. ^ Bundo M (2014). «Увеличение ретротранспозиции L1 в нейрональном геноме при шизофрении». Neuron . 81 (2): 306–313. doi : 10.1016/j.neuron.2013.10.053 . PMID  24389010.
  8. ^ Kai Y; et al. (2013). «Старение как ускоренное накопление соматических вариантов: секвенирование всего генома пар монозиготных близнецов столетнего и среднего возраста». Twin Research and Human Genetics . 16 (6): 1026–1032. doi : 10.1017/thg.2013.73 . PMID  24182360.
  9. ^ Ван К; и др. (2013). «Полногеномное секвенирование ДНК/РНК выявляет укороченные мутации в RBCK1 при новом менделевском заболевании с нейромышечным и сердечным поражением». Genome Medicine . 5 (7): 67. doi : 10.1186/gm471 . PMC 3971341 . PMID  23889995. 
  10. ^ Cui H; et al. (2013). «Предрасположенность к расстройствам пищевого поведения связана с мутациями ESRRA и HDAC4». J Clin Invest . 123 (11): 4706–4713. doi :10.1172/jci71400. PMC 3809805. PMID  24216484. 
  11. ^ Шааф CP; и др. (2013). «Укороченные мутации MAGEL2 вызывают фенотипы Прадера-Вилли и аутизм». Nature Genetics . 45 (11): 1405–1408. doi :10.1038/ng.2776. PMC 3819162 . PMID  24076603. 
  12. ^ Nishiguchi KM; et al. (2012). «Гены, связанные с пигментным ретинитом и родственными заболеваниями, часто мутируют в общей популяции». PLOS ONE . ​​7 (7): e41902. Bibcode :2012PLoSO...741902N. doi : 10.1371/journal.pone.0041902 . PMC 3407128 . PMID  22848652. 
  13. ^ Ma Y; et al. (2012). «Время развития мутаций, выявленных с помощью секвенирования всего генома близнецов с острым лимфобластным лейкозом». Proc Natl Acad Sci USA . 110 (18): 7429–7433. Bibcode : 2013PNAS..110.7429M. doi : 10.1073 /pnas.1221099110 . PMC 3645544. PMID  23569245. 
  14. ^ Kiel MJ; et al. (2012). «Полногеномное секвенирование выявляет повторяющиеся соматические мутации NOTCH2 при лимфоме маргинальной зоны селезенки». Журнал экспериментальной медицины . 209 (9): 1553–1565. doi :10.1084/jem.20120910. PMC 3428949. PMID  22891276 . 
  15. ^ Molenaar JJ; et al. (2012). «Секвенирование нейробластомы выявляет хромотрипсис и дефекты в генах нейритогенеза». Nature . 483 (7391): 589–593. Bibcode :2012Natur.483..589M. doi : 10.1038/nature10910 . hdl : 1765/57581 . PMID  22367537.
  16. ^ Turajlic S; et al. (2011). «Полногеномное секвенирование соответствующих первичных и метастатических акральных меланом». Genome Res . 22 (2): 196–207. doi :10.1101/gr.125591.111. PMC 3266028. PMID 22183965  . 
  17. ^ Yokoyama S; et al. (2011). «Новая рецидивирующая мутация GA в MITF предрасполагает к семейной и спорадической меланоме». Nature . 480 (7375): 99–103. Bibcode :2011Natur.480...99Y. doi :10.1038/nature10630. PMC 3266855 . PMID  22080950. 
  18. ^ Gilissen C; et al. (2014). «Секвенирование генома выявляет основные причины тяжелой интеллектуальной инвалидности». Nature . 511 (7509): 344–347. Bibcode :2014Natur.511..344G. doi :10.1038/nature13394. hdl : 2066/138095 . PMID  24896178. S2CID  205238886.
  19. ^ Питерс, Брок А.; Дрманац, Радое; Чёрч, Джордж М.; Эстеп, Престон В.; Заранек, Александр Уэйт; Вандевеге, Уорд; Коннелли, Абрам; Клегг, Том; Агарвал, Миша Р. (2016-12-01). "Полные геномные последовательности и экспериментально фазированные гаплотипы более 100 персональных геномов". GigaScience . 5 (1): 42. doi : 10.1186/s13742-016-0148-z . PMC 5057367 . PMID  27724973. 
  20. ^ Peters, Brock A.; Drmanac, Radoje; Xu, Xun; Kristiansen, Karsten; Wang, Jian; Yang, Huanming; Alexeev, Andrei; Zhang, Wenwei; Dong, Yuliang (2019-05-01). «Эффективное и уникальное кобаркодирование прочтений секвенирования второго поколения с длинных молекул ДНК, позволяющее проводить экономически эффективное и точное секвенирование, гаплотипирование и сборку de novo». Genome Research . 29 (5): 798–808. doi :10.1101/gr.245126.118. ISSN  1088-9051. PMC 6499310 . PMID  30940689. 
  21. ↑ Спектер, Майкл (6 января 2014 г.) Генная фабрика Архивировано 28 октября 2014 г. в Wayback Machine The New Yorker, получено 28 октября 2014 г.
  22. ^ brandonvd. "О нас". Complete Genomics . Получено 2019-06-15 .
  23. ^ Смит, Джейми; Севастопуло, Деметрий (18 апреля 2023 г.). «Китайская генетическая компания нацелилась на США, несмотря на политическую напряженность». Financial Times . Архивировано из оригинала 2023-04-18 . Получено 2023-04-18 .
  • Официальный сайт
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Complete_Genomics&oldid=1246625965"