Коммерчески полезные ферменты
Коммерчески полезные ферменты (CUE) — это ферменты , которые применяются в различных отраслях промышленности. Микробные ферменты широко используются в качестве биокатализаторов в таких областях, как биотехнология , сельское хозяйство и фармацевтика. Метагеномные данные служат ценным ресурсом для идентификации новых CUE из ранее неизвестных микробов, присутствующих в сложных микробных сообществах в различных экосистемах. [1]
Классификация
Разработанный набор из 510 CUE с использованием общедоступной информации был категоризирован по девяти широким областям применения на основе их функциональных ролей. Благодаря гомологичному анализу десяти общедоступных метагеномных наборов данных было обнаружено несколько новых CUE с гомологией с курируемым набором.
Этот подход привел к созданию Metagenomic BioMining Engine (MetaBioME), платформы, разработанной для вычислительной идентификации гомологов известных CUE из метагеномных данных. MetaBioME предоставляет ресурс для обнаружения новых гомологов существующих CUE и идентификации ранее неизвестных ферментов, которые могут служить зацепками для экспериментальной проверки. Платформа доступна онлайн на MetaBioME. [2]
Ссылки
- ^ Шарма, Винит К.; Кумар, Навин; Пракаш, Тулика; Тейлор, Тодд Д. (январь 2010 г.). «MetaBioME: база данных для исследования коммерчески полезных ферментов в метагеномных наборах данных». Nucleic Acids Research . 10 (выпуск базы данных): D468 – D472 . doi :10.1093/nar/gkp1001. PMC 2808964. PMID 19906710 .
- ^ «MetaBioME — комплексный метагеномный биомайнинговый движок».
- Sharma, VK; Kumar, N; Prakash, T; Taylor, TD (январь 2010 г.). «MetaBioME: база данных для изучения коммерчески полезных ферментов в метагеномных наборах данных». Nucleic Acids Res . 38 (выпуск базы данных): D468–72. doi :10.1093/nar/gkp1001. PMC 2808964. PMID 19906710 .
 | Эта статья по микробиологии — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее. |
