Малороссийская коллегия — административный орган Российской империи в Гетманщине, созданный впервые указом Петра I 27 мая 1722 года вместо Малороссийского приказа .
Создана при жизни гетмана Скоропадского как высшее апелляционное учреждение и административно-контролирующий орган русской государственной системы в Гетманщине. После смерти Ивана Скоропадского 14 июля 1722 года коллегия приняла на себя прерогативы гетмана, что было подтверждено императорскими указами от 27 апреля и 3 июля 1723 года.
В ее состав входили президент (бригадир), шесть членов присутствия, прокурор и ряд канцлеров (до 1724 г. — 31, после — 62). Все члены коллегии назначались императором всероссийским или Правительствующим Сенатом из числа российских военных или государственных служащих.
В отличие от Малороссийского приказа , он находился не в Москве, а в Глухове . В гражданских делах коллегия подчинялась Правительствующему Сенату , в военных — Главнокомандующему русскими вооружёнными силами в Гетманщине. Работа коллегии регламентировалась законами, постановлениями и деловыми обычаями Российской империи.
Став главой государственной власти в Гетманщине, коллегия провела ряд реформ государственного устройства, направленных на подчинение всех частей Гетманщины российской администрации, внедрение в Гетманщине российских законов и правовых норм, унификацию ее порядков к общеимперским стандартам. Малороссийская коллегия впервые в полном объеме привлекла в царскую казну казацкие финансы. Кроме того, коллегия реформировала налоговую систему, что позволило увеличить размер годовых доходов (более чем в два раза за два года) с 45 527 рублей в 1722 году до 114 495 рублей в 1724 году. Большая часть собранных средств вывозилась из Украины в Москву и Петербург. В целом деятельность Малороссийской коллегии положила начало фактическому процессу ликвидации автономии казацкого Гетманщины . Попытки наказного гетмана Павла Полуботка и ряда старших офицеров противодействовать этому процессу привели к их аресту и заключению в Петропавловской крепости ( Санкт-Петербург ).
После восшествия на российский престол Петра II политический курс коллегии был пересмотрен и приостановлен на некоторое время 12 сентября 1727 года. Коллегия не была полностью ликвидирована, а скорее включена в состав гетманской администрации в качестве «полномочных представителей правительства при гетмане». Должность гетмана Войска Запорожского была восстановлена, и миргородский полковник Даниил Апостол был избран гетманом вскоре после своего освобождения из-под стражи в Петропавловской крепости в 1725 году. С 1733 года некоторые «полномочные представители» исполняли обязанности гетмана, что привело к приостановлению выборов гетмана до 1750 года и введению Временной администрации гетманского правительства во главе с назначенным гетманом, генерал-квартирмейстером Яковом Лизогубом. Фактически все управление находилось в руках главнокомандующего русскими вооруженными силами в Малороссии, или в Гетманщине.