Домен холодового шока
| ЦДЦБ | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 структура раствора одноцепочечной ДНК-связывающей домена холодового шока (csd) человеческого белка y-box 1 (yb1), определенная с помощью ЯМР (10 структур с самой низкой энергией) | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | ЦДЦБ | ||||||||
| Пфам | ПФ00313 | ||||||||
| Клан ПФАМ | CL0021 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR002059 | ||||||||
| ПРОСИТ | PDOC00304 | ||||||||
| СКОП2 | 1mjc / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
| CDD | cd04458 | ||||||||
| |||||||||
В молекулярной биологии домен холодового шока ( CSD ) представляет собой белковый домен , состоящий примерно из 70 аминокислот , который был обнаружен в прокариотических и эукариотических ДНК -связывающих белках . [1] [2] [3] Часть этого домена очень похожа на мотив связывания РНК RNP-1 . [4]
Когда Escherichia coli подвергается воздействию понижения температуры с 37 до 10 градусов по Цельсию, наступает 4–5-часовая лаг-фаза, после которой рост возобновляется с пониженной скоростью . [5] Во время лаг-фазы экспрессия около 13 белков, которые содержат домены холодового шока, увеличивается в 2–10 раз. [6] Считается, что эти так называемые белки холодового шока, индуцируемые в ответ на холодовой шок, помогают клетке выживать при температурах ниже оптимальной температуры роста, в отличие от белков теплового шока, индуцируемых в ответ на тепловой шок , которые помогают клетке выживать при температурах выше оптимальных, возможно, за счет конденсации хромосомы и организации прокариотического нуклеоида . [ 5]
Ссылки
- ^ Doniger J, Landsman D, Gonda MA, Wistow G (апрель 1992 г.). «Продукт unr, высококонсервативного гена, расположенного выше N-ras, содержит множественные повторы, похожие на домен холодового шока (CSD), предполагаемый мотив связывания ДНК». New Biol . 4 (4): 389–95 . PMID 1622933.
- ^ Wistow G (апрель 1990). «Холодный шок и связывание ДНК». Nature . 344 (6269): 823– 4. doi :10.1038/344823c0. PMID 2184368. S2CID 4307500.
- ^ Jones PG, Inouye M (март 1994). «Реакция на холодовой шок — горячая тема». Mol. Microbiol . 11 (5): 811– 8. doi :10.1111/j.1365-2958.1994.tb00359.x. PMID 8022259.
- ^ Landsman D (июнь 1992 г.). "RNP-1, РНК-связывающий мотив сохраняется в ДНК-связывающем домене холодового шока". Nucleic Acids Res . 20 (11): 2861– 4. doi :10.1093/nar/20.11.2861. PMC 336933. PMID 1614871 .
- ^ ab Obokata J, Ohme M, Hayashida N (октябрь 1991 г.). "Нуклеотидная последовательность клона кДНК, кодирующего предполагаемый богатый глицином белок массой 19,7 кДа в Nicotiana sylvestris". Plant Mol. Biol . 17 (4): 953– 5. doi :10.1007/bf00037080. PMID 1912512. S2CID 11927654.
- ^ Tafuri SR, Wolffe AP (ноябрь 1990 г.). «Транскрипционные факторы Y-box Xenopus: молекулярное клонирование, функциональный анализ и регуляция развития». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 87 (22): 9028– 32. doi : 10.1073 /pnas.87.22.9028 . PMC 55094. PMID 2247479.
