Хелатаза кобальта
| хелатаза кобальта | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Предполагаемый мономер кобальтовой хелатазы из Desulvobrio vulgaris . [1] | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Номер ЕС | 6.6.1.2 | ||||||||
| Номер CAS | 81295-49-0 | ||||||||
| Базы данных | |||||||||
| ИнтЭнз | IntEnz вид | ||||||||
| БРЕНДА | запись BRENDA | ||||||||
| ExPASy | NiceZyme вид | ||||||||
| КЕГГ | запись KEGG | ||||||||
| МетаЦик | метаболический путь | ||||||||
| ПРИАМ | профиль | ||||||||
| Структуры PDB | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| Генная онтология | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
| Хелатаза кобальта, субъединица CobT | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | КобТ | ||||||||
| Пфам | ПФ06213 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR006538 | ||||||||
| |||||||||
Хелатаза кобальта ( EC 6.6.1.2) — фермент , катализирующий химическую реакцию
- АТФ + а,с-диамид гидробириновой кислоты + Co 2+ + H 2 O АДФ + фосфат + а,с-диамид коб(II)ириновой кислоты + H +
Четырьмя субстратами этого фермента являются АТФ , a,c-диамид гидробириновой кислоты, Co2+ и H2O ; его четырьмя продуктами являются АДФ , фосфат , a , c -диамид коб(II)ириновой кислоты и H + .
Аэробная кобальтовая хелатаза (аэробный путь биосинтеза кобаламина) [2] [3] состоит из трех субъединиц: CobT, CobN ( InterPro : IPR003672 ) и CobS ( InterPro : IPR006537 ).
Макроцикл витамина B12 может образовывать комплекс с металлом через АТФ-зависимые реакции в аэробном пути (например, в Pseudomonas denitrificans ) или через АТФ-независимые реакции сирогидрохлорина в анаэробном пути (например, в Salmonella typhimurium ). [4] [5] Соответствующие кобальтовые хелатазы не являются гомологичными. Однако аэробные субъединицы кобальтовой хелатазы CobN и CobS гомологичны субъединицам Mg-хелатазы BchH и BchI соответственно. [5] Также было обнаружено, что CobT отдаленно связан с третьей субъединицей Mg-хелатазы, BchD (участвует в синтезе бактериохлорофилла, например, в Rhodobacter capsulatus). [5]
Этот фермент принадлежит к семейству лигаз , в частности, тех, которые образуют связи азот-D-металл в координационных комплексах. Систематическое название этого класса ферментов — гидрогенобириновая кислота-a,c-диамид:кобальт-кобальт-лигаза (АДФ-образующая) . Другие общеупотребительные названия включают гидрогенобириновая кислота a,c-диамид кобальтохелатаза , CobNST и CobNCobST . Этот фермент является частью биосинтетического пути к кобаламину (витамину B 12 ) в аэробных бактериях .
Смотрите также
Ссылки
- ^ Romão, Célia V.; Ladakis, Dimitrios; Lobo, Susana AL; Carrondo, Maria A.; Brindley, Amanda A.; Deery, Evelyne; Matias, Pedro M.; Pickersgill, Richard W.; Saraiva, Lígia M.; Warren, Martin J. (4 января 2011 г.). «Эволюция в семействе хелатаз, облегченная введением асимметрии активного центра и олигомеризацией белка». Труды Национальной академии наук . 108 (1): 97– 102. doi : 10.1073/pnas.1014298108 . PMC 3017170. PMID 21173279 .
- ^ Crouzet J, Cameron B, Cauchois L, Rigault S, Blanche F, Guilhot C, Levy-schil S, Rouyez MC (1991). «Генетический и секвенирующий анализ фрагмента ДНК Pseudomonas denitrificans, содержащего два гена cob». J. Bacteriol . 173 (19): 6058– 6065. doi :10.1128/jb.173.19.6058-6065.1991. PMC 208352. PMID 1917840 .
- ^ Crouzet J, Cameron B, Blanche F, Thibaut D, Debussche L, Couder M (1992). «Анализ, очистка и характеристика кобальтхелатазы, уникального сложного фермента, катализирующего вставку кобальта в a,c-диамид гидрогенобириновой кислоты во время биосинтеза кофермента B12 в Pseudomonas denitrificans». J. Bacteriol . 174 (22): 7445– 7451. doi :10.1128 / jb.174.22.7445-7451.1992. PMC 207441. PMID 1429466.
- ^ Roth JR, Lawrence JG, Bobik TA (1996). «Кобаламин (коэнзим B12): синтез и биологическое значение» (PDF) . Annu. Rev. Microbiol . 50 : 137–181 . doi :10.1146/annurev.micro.50.1.137. PMID 8905078. S2CID 36290299. Архивировано из оригинала (PDF) 2019-03-07.
- ^ abc Willows RD, Al-Karadaghi S, Hansson M, Fodje MN, Hansson A, Olsen JG, Gough S (2001). «Взаимодействие между модулем AAA и доменом интегрина I может регулировать функцию магниевой хелатазы». J. Mol. Biol . 311 (1): 111– 122. doi :10.1006/jmbi.2001.4834. PMID 11469861.
Дальнейшее чтение
- Debussche L, Couder M, Thibaut D, Cameron B, Crouzet J, Blanche F (1992). "Анализ, очистка и характеристика кобальтохелатазы, уникального сложного фермента, катализирующего вставку кобальта в a,c-диамид гидрогенобириновой кислоты во время биосинтеза кофермента B12 в Pseudomonas denitrificans". J. Bacteriol . 174 (22): 7445– 51. doi : 10.1128/JB.174.22.7445-7451.1992. PMC 207441. PMID 1429466.
- Warren MJ, Raux E, Schubert HL, Escalante-Semerena JC (2002). «Биосинтез аденозилкобаламина (витамина B12)». Nat. Prod. Rep . 19 (4): 390– 412. doi :10.1039/b108967f. PMID 12195810.
