Кристофер Э. Мейсон
американский генетик

Кристофер Э. Мейсон
Кристофер Э. Мейсон на конференции MAQC
Апрель 2019 г.
Альма-матерУниверситет Висконсин-Мэдисон (бакалавр наук), Йельский университет (доктор философии)
Научная карьера
ПоляБиология
УчрежденияВейл Корнелл Медицина
ДокторантыЛенор Пайпс
Веб-сайтhttps://физиология.med.cornell.edu/people/christopher-mason-ph-d/

Кристофер Э. Мейсон — профессор геномики, физиологии и биофизики в Weill Cornell Medicine . Он также является одним из основателей WorldQuant Initiative for Quantitative Prediction вместе с Оливье Элементо. [1] Мейсон стал соучредителем четырех биотехнологических стартапов, включая Onegevity Health, Biotia, BridgeOmics и Nurture Genomics. [2] [3] [4] Он имеет четыре патента, связанных с его исследованиями. [5]

Образование

Мейсон получил степень бакалавра наук по генетике и биохимии в Университете Висконсин-Мэдисон в 2001 году. [6] Он получил докторскую степень по генетике в Йельском университете в 2006 году. [7] Он прошел постдокторскую стажировку по клинической генетике в Йельской медицинской школе, а также работал приглашенным научным сотрудником по геномике, этике и праву в проекте «Информационное общество» в Йельской юридической школе . [8] Мейсон начал работать в Медицинском колледже Вейла Корнелла в 2009 году . [9] [6] [10] [11]

Карьера

Исследования пилотируемых космических полетов

Мейсон был главным исследователем в NASA Twins Study. [12] [13] Он также руководил первой демонстрацией секвенирования в условиях невесомости и разработал методы геномики и биоинформатики и экспериментальные протоколы, которые использовались на Международной космической станции (МКС) для миссии по секвенированию ДНК в космосе впервые. Результаты выглядят многообещающими для миссии на Марс. [14] Эта работа также привела к избранию Мейсона на должность председателя руководящего комитета NASA GeneLab Data and Sample Archive (2018-2022) и выдвинула Weill Cornell Medicine на первый план в двух миссиях NASA. [15] Мейсон также был выбран Национальной академией наук для Десятилетнего обзора для NASA.

Микробные исследования

В 2013 году Мейсон запустил проект PathoMap для создания первой генетической карты города. [16] [17] Это исследование привело к созданию Международного консорциума MetaSUB. [18] [19] [20] Группа Мейсона дополнительно выяснила основные микробные механизмы розового цвета озера Хиллер . [21] [22]

Программное обеспечение для исследований

Помимо выпуска журнальных статей, лаборатория Мейсона также выпустила 12 пакетов программного обеспечения с открытым исходным кодом в области геномики, эпигеномики, метагеномики и машинного обучения ( methylKit, r-make, MeRiPPeR, eDMR, methclone, mCaller, genomation, DISCO, UNFOG, CNVision, TWG Browser, Metagenscope). [23] [24] [25] [ необходим неосновной источник ]

Библиография

  • Мейсон, Кристофер Э. (2021). Следующие 500 лет: инженерия жизни для достижения новых миров. MIT Press. ISBN 9780262360067.[26]
  • Тульчинский, Игорь; Мейсон, Кристофер Э. (2023). Эпоха предсказаний: алгоритмы, ИИ и меняющиеся тени риска. MIT Press. ISBN 9780262047739.

Ссылки

  1. ^ "Christopher E. Mason". Cornell Research . 10 января 2018 г. Получено 11 июня 2020 г.
  2. ^ cosmeticsdesign.com (15 января 2019 г.). "Компания по изучению потребительского опыта Onegevity Health планирует расширение в сегменте средств по уходу за кожей". cosmeticsdesign.com . Получено 11 июня 2020 г. .
  3. ^ nutraingredients-usa.com (17 января 2019 г.). «Здравоохранение приходит в дома, и компании должны быть готовы предлагать вертикальные решения, — говорит генеральный директор Thorne». nutraingredients-usa.com . Получено 11 июня 2020 г. .
  4. ^ Мейдан, Джем; Афшиннеку, Эбрахим; Рикард, Нейт; Дэниелс, Гай; Кунсес, Лора; Харди, Тереза; Лили, Лукия; Песке, Сара; Якобсон, Пол; Мейсон, Кристофер Э.; Дадли, Джоэл (2020). «Улучшение здоровья желудочно-кишечного тракта при синдроме раздраженного кишечника с помощью вмешательств, управляемых метагеномом». Precision Clinical Medicine . 3 (2): 136–146 . doi : 10.1093/pcmedi/pbaa013 . PMC 7327130. PMID  32685241 . 
  5. ^ "Изобретения, патенты и патентные заявки Кристофера Э. Мейсона". Justia Patents . Justia . Получено 3 июня 2024 г. .
  6. ^ ab "Christopher E. Mason". Vivo . Weill Cornell Medical College . Получено 11 июня 2020 г. .
  7. ^ Мейсон, Кристофер Э. (2006). Эволюция генома между Drosophila melanogaster и Drosophila pseudoobscura (диссертация). Йельский университет. ISBN 9780542995415. ПроКвест  304979300
  8. ^ "Достижения 2008-2009 годов" (PDF) . Проект Йельского информационного общества . Юридическая школа Йельского университета . Получено 3 июня 2024 г. .
  9. ^ «Крис Мейсон об интеграции искусства, права и человечества через метагеномику Земли и за ее пределами». Genes to Genomes . 24 января 2018 г. Получено 11 июня 2020 г.
  10. ^ "The Mason Lab". www.masonlab.net . Получено 11 июня 2020 г. .
  11. ^ Гулд, Скай; Мошер, Дэйв (20 апреля 2017 г.). «Марсианские колонисты столкнутся с уровнем радиации, в 8 раз превышающим установленные правительством пределы — вот с чем им придется столкнуться». Business Insider Australia . Получено 11 июня 2020 г.
  12. ^ Перес, Джейсон (14 апреля 2015 г.). «Исследование близнецов». NASA . Получено 11 июня 2020 г.
  13. ↑ Марс, Келли (1 февраля 2018 г.). «Встречайте исследователей — экспрессия генов». NASA . Получено 11 июня 2020 г.
  14. ^ "Ученый, изучающий близнецов НАСА: результаты выглядят многообещающими для миссии на Марс, но остается много вопросов". Research & Development World . 17 апреля 2019 г. Получено 11 июня 2020 г.
  15. ^ "Текущие члены VWG". NASA GeneLab . Получено 11 июня 2020 г.
  16. ^ Харрис, Элизабет А. (11 ноября 2013 г.). «Среди миллионов пассажиров нью-йоркского метрополитена исследование обнаружило множество загадочных микробов». The New York Times . Получено 15 мая 2022 г.
  17. ^ Хамси, Роксана (11 ноября 2013 г.). «Subway Freeloaders». New York Magazine . Получено 15 мая 2022 г.
  18. ^ О'Грейди, Кэтлин (26 мая 2021 г.). «У городов есть свои собственные отличительные микробные отпечатки пальцев». Science . Получено 5 сентября 2021 г. .
  19. ^ "2017-09-microbiome". corporate.qiagen.com . Получено 11 июня 2020 г. .
  20. ^ «Большие данные и бактерии: картирование ДНК нью-йоркского метрополитена | Онкологический центр Сандры и Эдварда Мейера». meyercancer.weill.cornell.edu . Получено 11 июня 2020 г. .
  21. ^ «Красные и фиолетовые микробы придают таинственному розовому озеру Австралии его оттенок». www.newscientist.com/ . Получено 23 ноября 2023 г. .
  22. ^ Sierra, Maria A.; Ryon, Krista A.; Tierney, Braden T.; Foox, Jonathan; Bhattacharya, Chandrima; Afshin, Evan; Butler, Daniel; Green, Stefan J.; Thomas, W. Kelley; Ramsdell, Jordan; Bivens, Nathan J.; McGrath, Ken; Mason, Christopher E.; Tighe, Scott W. (21 декабря 2022 г.). «Микробиом и метагеномный анализ озера Хиллер в Австралии выявляют полиэкстремофилы, богатые пигментом, и широкомасштабные метаболические адаптации». Environmental Microbiome . 17 (1): 60. Bibcode :2022EMicb..17...60S. doi : 10.1186/s40793-022-00455-9 . PMC 9768965 . PMID  36544228. 
  23. ^ Акалин, Алтуна; Кормакссон, Маттиас; Ли, Шэн; Гарретт-Бейкелман, Франсин Э.; Фигероа, Мария Э.; Мельник, Ари; Мейсон, Кристофер Э. (3 октября 2012 г.). "methylKit: комплексный пакет R для анализа профилей метилирования ДНК по всему геному". Genome Biology . 13 (10): R87. doi : 10.1186/gb-2012-13-10-r87 . ISSN  1474-760X. PMC 3491415 . PMID  23034086. 
  24. ^ Ли, Шэн; Гарретт-Бейкелман, Франсин Э.; Акалин, Алтуна; Зумбо, Пол; Левин, Росс; То, Бик Л.; Льюис, Иэн Д.; Браун, Анна Л.; Д'Андреа, Ричард Дж.; Мельник, Ари; Мейсон, Кристофер Э. (10 апреля 2013 г.). "Оптимизированный алгоритм обнаружения и аннотирования регионального дифференциального метилирования". BMC Bioinformatics . 14 (Suppl 5): S10. doi : 10.1186/1471-2105-14-S5-S10 . ISSN  1471-2105. PMC 3622633 . PMID  23735126. 
  25. ^ Ли, Шэн; Гарретт-Бейкелман, Франсин; Перл, Александр Э.; Люгер, Селина М.; Чжан, Чао; То, Бик Л.; Льюис, Ян Д.; Браун, Анна Л.; Д'Андреа, Ричард Дж.; Росс, М. Элизабет; Левин, Росс (2014). "Динамическая эволюция клональных эпиаллелей, выявленная метклоном". Genome Biology . 15 (9): 472. doi : 10.1186/s13059-014-0472-5 . ISSN  1465-6906. PMC 4242486 . PMID  25260792. 
  26. ^ Обзоры книги «Следующие 500 лет»
    • Спасов, Питер (27 сентября 2021 г.). «Обзор книги: Следующие 500 лет». Национальное космическое общество . Получено 7 января 2023 г. .
    • Ингс, Саймон (12 мая 2021 г.). «Обзор следующих 500 лет: проектирование человечества для жизни после Земли». New Scientist . Получено 5 мая 2023 г.
    • Сэндлер, Майк (10 января 2022 г.). «Следующие 500 лет Кристофера Мейсона: обзор». FEASTA . Получено 5 мая 2023 г. .
  • Публикации Кристофера Э. Мейсона, проиндексированные Google Scholar
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Кристофер_Э._Мейсон&oldid=1238095622"