Крис Сандер (ученый)
Крис Сандер | |
|---|---|
.jpg/1280px-Chris_Sander_at_ISMB_2010_(4819025776).jpg) Крис Сандер выступает на ISMB в 2010 году | |
| Рожденный | |
| Альма-матер | Берлинский университет Калифорнийский университет в Беркли [5] |
| Известный | Биоинформатика Вычислительная биология Геномика рака [6] |
| Родственники | Отто Сандер (брат) |
| Награды | |
| Научная карьера | |
| Учреждения | Институт рака Даны Фарбера [2] Мемориальный онкологический центр имени Слоуна-Кеттеринга Рокфеллеровский университет Корнельский университет Институт науки Вейцмана [3] |
| Тезис | Аналитические свойства волновых функций связанного состояния (1975) |
| Докторанты |
|
| Веб-сайт | www.sanderlab.org#/people/chrissander |
.jpg){kind=link}
Крис Сандер — вычислительный биолог, работающий в онкологическом центре Дана-Фарбер и Гарвардской медицинской школе. Ранее он был председателем Программы вычислительной биологии в Мемориальном онкологическом центре Слоуна–Кеттеринга в Нью-Йорке . [7] [8] [9] [10] [11] [12] [13] В 2015 году он переместил свою лабораторию в Институт онкологии Дана–Фарбер [14] и на кафедру клеточной биологии в Гарвардской медицинской школе . [15]
Образование
Первоначально Сандер получил образование физика, получив степень бакалавра в Берлинском университете в 1967 году. [2] После периода обучения в Калифорнийском университете в Беркли и Институте Нильса Бора в Копенгагене [2] [16] он получил степень доктора философии по теоретической физике в Государственном университете Нью-Йорка в 1975 году. Его диссертация называлась «Аналитические свойства волновых функций связанного состояния» . [17]
Исследовать
Зандер приписывает свой переход от теоретической физики к вычислительной биологии эпохальной статье Фреда Сэнгера 1977 года в журнале Nature [18] , в которой была опубликована нуклеотидная последовательность бактериофага φX174 . [2] Зандер внес большой вклад в область структурной биоинформатики, включая разработку таких инструментов, как база данных Families of Structurally Similar Proteins (FSSP) [19] и алгоритм DSSP для назначения вторичной структуры аминокислотам белка с учетом координат этого белка с атомным разрешением. [20]
Сандер был основателем программы биокомпьютинга в Европейской лаборатории молекулярной биологии в Гейдельберге, прежде чем перенести программу в Европейский институт биоинформатики в Кембридже. Он занимал должность главного информационного директора в биофармацевтической компании Millennium Pharmaceuticals и был консультантом IBM 's Deep Computing Initiative, которая выпустила шахматный компьютер Deep Blue . [21]
Награды и почести
Сандер — бывший исполнительный редактор журнала Bioinformatics . В 2014 году он был назначен одним из первых почетных редакторов журнала Bioinformatics . [22]
В 2010 году Сандеру была присуждена премия ISCB за достижения в области науки. [16] В 2018 году он был удостоен премии DeLano Award for Computational Biosciences . [23]
Личная жизнь
Зандер — брат немецкого актёра Отто Зандера . [24]
Ссылки
- ^ Маккей, Б. М.; Сэнсом, К. (2010). «Премия Овертона ISCB 2010 года присуждена Стивену Э. Бреннеру». PLOS Computational Biology . 6 (6): e1000831. Bibcode : 2010PLSCB...6E0831M. doi : 10.1371/journal.pcbi.1000831 . PMC 2891695. PMID 20585610 .
- ^ abcd "Лаборатория Сандера".
- ^ Лифсон, Шнейор; Сандер, Кристиан (1979). «Антипараллельные и параллельные β-цепи различаются по предпочтениям аминокислотных остатков». Nature . 282 (5734): 109– 111. Bibcode :1979Natur.282..109L. doi :10.1038/282109a0. PMID 503185. S2CID 4284088.
- ^ Ouzounis, Christos (1993). Роль сохранения последовательности в предсказании структуры белка (диссертация на соискание ученой степени доктора философии). Йоркский университет. OCLC 53486615. EThOS uk.bl.ethos.387193.
- ^ "На работе: председатель программы вычислительной биологии Крис Сандер | Мемориальный онкологический центр имени Слоуна-Кеттеринга". Архивировано из оригинала 21.02.2013.
- ^ Холм, Л.; Сандер, К. (1993). «Сравнение структуры белка путем выравнивания матриц расстояний». Журнал молекулярной биологии . 233 (1): 123– 138. doi :10.1006/jmbi.1993.1489. PMID 8377180. S2CID 9040631.
- ^ Крис Сандер на сервере библиографии DBLP
- ^ Публикации Криса Сандера, проиндексированные Google Scholar
- ^ Публикации Криса Сандера, проиндексированные Microsoft Academic
- ^ Публикации Сандера, Криса А. проиндексированы в библиографической базе данных Scopus . (требуется подписка)
- ^ Джон, Б.; Энрайт, А.Дж.; Аравин, А.; Тушл, Т.; Сандер, К.; Маркс, Д.С. (2004). «Цели микроРНК человека». PLOS Biology . 2 (11): e363. doi : 10.1371/journal.pbio.0020363 . PMC 521178. PMID 15502875 .
- ^ Рост, Б.; Сандер, К. (1993). «Предсказание вторичной структуры белка с точностью выше 70%». Журнал молекулярной биологии . 232 (2): 584–599 . CiteSeerX 10.1.1.17.1418 . doi :10.1006/jmbi.1993.1413. PMID 8345525.
- ^ Sander, C.; Schulz, GE (1979). «Вырожденность информации, содержащейся в аминокислотных последовательностях: доказательства из наложенных генов». Журнал молекулярной эволюции . 13 (3): 245–252 . Bibcode : 1979JMolE..13..245S. doi : 10.1007/BF01739483. PMID 228047. S2CID 22606882.
- ^ "Крис Сандер, доктор философии - DF/HCC". www.dfhcc.harvard.edu . Получено 01.01.2019 .
- ^ "Крис Сандер | Кафедра КЛЕТОЧНОЙ БИОЛОГИИ". cellbio.med.harvard.edu . Получено 01.01.2019 .
- ^ ab "Премия за достижения старшего научного сотрудника 2010 года - Крис Сандер".
- ^ Сандер, К. (1975). "Поиск в коллекции INIS - Единственный результат". стр. 155. Получено 13 августа 2015 г.
- ^ Sanger, F.; Air, GM; Barrell, BG; Brown, NL; Coulson, AR; Fiddes, JC; Hutchison, CA; Slocombe, PM; Smith, M. (24 февраля 1977 г.). "Нуклеотидная последовательность ДНК бактериофага φX174". Nature . 265 (5596): 687– 695. Bibcode :1977Natur.265..687S. doi :10.1038/265687a0. PMID 870828. S2CID 4206886.
- ^ Holm L, Ouzounis C, Sander C, Tuparev G, Vriend G (1992). "База данных семейств структур белков с общими мотивами сворачивания". Protein Science . 1 (12): 1691– 1698. doi :10.1002/pro.5560011217. PMC 2142138 . PMID 1304898.
- ^ Kabsch, W.; Sander, C. (1983). «Словарь вторичной структуры белка: Распознавание образов водородно-связанных и геометрических особенностей». Биополимеры . 22 (12): 2577– 2637. doi :10.1002/bip.360221211. PMID 6667333. S2CID 29185760.
- ^ "Bio-IT World: Horizons - Chris Sander". Архивировано из оригинала 23 сентября 2015 года . Получено 13 августа 2015 года .
- ^ "15 лет "Биоинформатике"". Биоинформатика . 30 (6): 747. 2014. doi :10.1093/bioinformatics/btu076. PMID 24642573.
- ^ "Премия ДеЛано за вычислительные биологические науки". www.asbmb.org . Получено 15 сентября 2017 г. .
- ↑ Биография Отто Зандера на IMDb . Получено 13 августа 2015 г.
