Хлорацидобактерии
| Хлорацидобактерии | |
|---|---|
Научная классификация  | |
| Домен: | Бактерии |
| Тип: | Ацидобактериота |
| Сорт: | «Ацидобактерии» |
| Заказ: | Ацидобактерии |
| Семья: | Ацидобактерии |
| Род: | «Хлорацидобактерии» Танк и Брайант 2015 [1] |
| Типовой вид | |
| «Хлорацидобактерии термофилы» Танк и Брайант 2015 | |
| Виды [2] | |
| |
| Синонимы | |
| |
Chloracidobacterium — род Acidobacteriota. [4] В настоящее время он отнесен к семейству Acidobacteriaceae , но филогенетические данные свидетельствуют о том, что он принадлежит к Blastocatellia . [5]
Это группа фотосинтезирующих бактерий, открытая в 2007 году, и их идентификация расширяет число бактериальных типов, которые могут осуществлять фотосинтез на основе хлорофилла, с пяти до шести. [3] [6]
"КандидатХлорацидобактерии термофилы"
Организм « Candidatus Chloracidobacterium thermophilum» был первоначально обнаружен с помощью биоинформатического анализа данных метагеномной последовательности из микробных матов, собранных из горячего источника в Йеллоустонском национальном парке. [7] Позднее он был изолирован после ингибирования видов Synechococcus в образцах микробных матов, что привело к совместной культуре C. thermophilum , видов Anoxybacillus и видов Meiothermus . C. thermophilum был высеян на среду Midnight Medium (CTM) для культивирования для чистой изоляции. Геномное секвенирование бактерии показало, что она не содержит генов для ферментов, восстанавливающих сульфат, однако она зависит от восстановленного источника серы. Исследователи, вероятно, предположили, что она разделяет мутуалистические отношения с совместными культурами видов Meiothermus и видов Anoxybacillus для доступа к восстановленным источникам серы. Кроме того, бактерия была определена как аэрофильная, умеренно термофильная, аноксигенная и фотогетеротрофная. В конечном итоге они обнаружили, что для прекультуральной изоляции необходим источник серы, бикарбонат, L-лизин и витамин B12 . [7]
Филогения
Принятая в настоящее время таксономия основана на Списке названий прокариот, имеющих постоянное место в номенклатуре (LPSN) [2] и Национальном центре биотехнологической информации (NCBI) [8].
| LTP на основе 16S рРНК _01_2022 [9] [10] [11] и Dedysh & Yilmaz 2018 [12] | 120 маркерных белков на основе GTDB 07-RS207 [13] [14] [15] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
Смотрите также
Ссылки
- ^ Tank M, Bryant DA. (2015). "Chloracidobacterium thermophilum gen. nov., sp. nov.: Аноксигенная микроаэрофильная хлорофотогетеротрофная ацидобактерия". Int J Syst Evol Microbiol . 65 : 1426– 1430. doi : 10.1099/ijs.0.000113 . PMID 25667398.
- ^ ab AC Parte; et al. "Chloracidobacterium". Список названий прокариот, имеющих место в номенклатуре (LPSN) . Получено 09.09.2022 .
- ^ ab Bryant DA, Costas AM, Maresca JA, Chew AG, Klatt CG, Bateson MM и др. (июль 2007 г.). "" Candidatus Chloracidobacterium thermophilum": аэробная фототрофная ацидобактерия ". Science . 317 (5837): 523– 6. Bibcode :2007Sci...317..523B. doi :10.1126/science.1143236. PMID 17656724. S2CID 20419870.
- ^ См. веб-страницу NCBI о Chloracidobacterium. Данные взяты из "NCBI taxonomy resources". Национальный центр биотехнологической информации . Получено 2007-03-19 .
- ^ Dedysh SN, Yilmaz P. (2018). «Уточнение таксономической структуры типа Acidobacteria». Int J Syst Evol Microbiol . 68 : 3796–3806 . doi : 10.1099/ijsem.0.003062 . PMID 30325293.
- ^ Raymond J (февраль 2008 г.). «Раскрашивание дерева жизни». Trends in Microbiology . 16 (2): 41– 3. doi :10.1016/j.tim.2007.11.003. PMID 18182293.
- ^ ab Tank M, Bryant DA (2015-03-27). " Потребности в питательных веществах и физиология роста фотогетеротрофной Acidobacterium, Chloracidobacterium thermophilum". Frontiers in Microbiology . 6 : 226. doi : 10.3389/fmicb.2015.00226 . PMC 4376005. PMID 25870589.
- ^ Sayers; et al. "Chloracidobacterium". База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Получено 2022-09-09 .
- ^ "The LTP" . Получено 23 февраля 2022 г. .
- ^ "LTP_all tree in newick format". Архивировано из оригинала 4 сентября 2022 г. Получено 23 февраля 2022 г.
- ^ "LTP_01_2022 Release Notes" (PDF) . Получено 23 февраля 2022 г. .
- ^ Dedysh SN, Yilmaz P (2018). «Уточнение таксономической структуры типа Acidobacteria». Int J Syst Evol Microbiol . 68 : 3796–3806 . doi : 10.1099/ijsem.0.003062 . PMID 30325293.
- ^ "GTDB release 07-RS207". База данных таксономии генома . Получено 20 июня 2022 г.
- ^ "bac120_r207.sp_labels". База данных таксономии генома . Получено 20 июня 2022 г.
- ^ "История таксона". База данных таксономии генома . Получено 20 июня 2022 г.
 | Эта статья, связанная с Acidobacteriota, является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее. |
