База данных генов рака шейки матки

CCDB
Содержание
Описание	Гены, участвующие в развитии рака шейки матки .
Дата выпуска	2010
Доступ
Веб-сайт	http://crdd.osdd.net/raghava/ccdb
Инструменты
Веб	ВЗРЫВ

База данных генов рака шейки матки (CCDB) — это база данных генов, участвующих в канцерогенезе шейки матки . ^[1] База данных рака шейки матки — первая база данных, которая была вручную курирована. ^[2] База данных служит для врачей и исследователей в качестве объекта для изучения базовой информации, а также расширенной информации о генах, которые дифференцируются в рак шейки матки. ^[3] В CCBD каталогизировано 537 генов. Гены, которые были каталогизированы на основе полиморфизма, метилирования, амплификации генов и изменения способа экспрессии гена. Научные исследователи изучили данные, которые сравнивали нормальные клетки шейки матки со злокачественными клетками шейки матки, что использовалось для изучения различных экспрессий генов, которые приводят к раку шейки матки. Из 500 000 женщин, которые стали жертвами рака шейки матки, большинство из них из развивающихся стран, а также из стран с низким социально-экономическим уровнем в развитых странах. CCBD предназначен для предоставления информации, которая будет способствовать созданию новых терапевтических методов лечения основной причины рака среди женщин. ^[4]

Компоненты

миРНК гена
отчет PubMed о гене
ген хозяина и целевого гена
расположение, а также кратность изменения белка
экспрессия или изменение гена.

Использует

База данных рака шейки матки состоит из данных, которые пользователи (исследователи и клиницисты) системы могут узнать, приводит ли ген к экспрессии рака шейки матки. Клиницисты и исследователи также смогут собирать данные, касающиеся генов, которые могут дифференцироваться в рак шейки матки. Существует несколько форм рака шейки матки, которые гиперметилируются. ^[5] CCDB предоставляет соответствующие данные о том, какой ген-супрессор опухоли подавляет экспрессию гена рака шейки матки. ^{[ требуется ссылка ]}

Доступ

Врачи или исследователи могут искать ген, используя номер хромосомы гена, идентификатор гена или название гена. ^[6] Исследователи могут добавлять информацию о генах, которые кодируют рак шейки матки, но перед добавлением данных в базу данных они должны быть проверены научным сообществом. ^[7]

Смотрите также

Рак шейки матки

Ссылки

^ Агарвал, Субхаш М; Рагхав Дхвани; Сингх Хариндер; Рагхава GPS (январь 2011 г.). «CCDB: курируемая база данных генов, вовлеченных в рак шейки матки». Nucleic Acids Res . 39 (выпуск базы данных). Англия: D975–9. doi :10.1093/nar/gkq1024. PMC 3013652. PMID 21045064 .
^ Агарвал, SM; Агарвал, SM; Рагхав, D.; Сингх, H.; Рагхава, GPS (2010). "CCDB: курируемая база данных генов, участвующих в исследовании нуклеиновых кислот рака шейки матки". GPS .
^ Хаким, AA; Лин PS; Вильчински S; Нгуен K; Лайнс B; Вакабаяши MT. (2010). «Показания и эффективность вакцины против вируса папилломы человека». Curr. Treat Options Oncol . 8 (6): 393–401. doi :10.1007/s11864-007-0050-0. PMID 18172770. S2CID 207322276.
^ Phongsavan, Keokedthong; Phengsavanh, Alongkone; Wahlström, Rolf; Marions, Lena (июнь 2010 г.). «Восприятие женщинами рака шейки матки и его профилактика в сельских районах Лаоса». Международный журнал гинекологического рака . 20 (5): 821–826. doi :10.1111/IGC.0b013e3181daaefb. PMID 20606529. S2CID 27963086.
^ Хагеманн Т, Т.; Бозанович Т; Хупер С; Любич А; Слеттенаар В.И.; Уилсон Дж.Л.; Сингх Н; Гейтер С.А.; и др. (2007). «Молекулярное профилирование прогрессирования рака шейки матки». Br. J. Cancer . 96 (2): 321–328. doi :10.1038/sj.bjc.6603543. PMC 2360010 . PMID 17242701.
^ Sayers, EW; Barrett T; Benson DA; Bolton E; Bryant SH; Canese K; Chetvernin V; Church DM; Dicuccio M; et al. (2010). «Ресурсы базы данных Национального центра биотехнологической информации». Nucleic Acids Res . 38 (выпуск базы данных): D5–D16. doi :10.1093/nar/gkp967. PMC 2808881. PMID 19910364 .
^ Онгенарт, М.; Ван Несте Л.; Де Мейер Т.; Меншарт Г.; Бекарт С.; Ван Крикинге В. (2008). «PubMeth: база данных метилирования рака, объединяющая интеллектуальный анализ текста и экспертные аннотации». Nucleic Acids Res . 36 (выпуск базы данных): D842–D846. doi :10.1093/nar/gkm788. PMC 2238841. PMID 17932060 .

Внешние ссылки

http://crdd.osdd.net/raghava/ccdb

[1] Агарвал, Субхаш М; Рагхав Дхвани; Сингх Хариндер; Рагхава GPS (январь 2011 г.). «CCDB: курируемая база данных генов, вовлеченных в рак шейки матки». Nucleic Acids Res . 39 (выпуск базы данных). Англия: D975–9. doi :10.1093/nar/gkq1024. PMC 3013652. PMID 21045064 .

[2] Агарвал, SM; Агарвал, SM; Рагхав, D.; Сингх, H.; Рагхава, GPS (2010). "CCDB: курируемая база данных генов, участвующих в исследовании нуклеиновых кислот рака шейки матки". GPS .

[3] Хаким, AA; Лин PS; Вильчински S; Нгуен K; Лайнс B; Вакабаяши MT. (2010). «Показания и эффективность вакцины против вируса папилломы человека». Curr. Treat Options Oncol . 8 (6): 393–401. doi :10.1007/s11864-007-0050-0. PMID 18172770. S2CID 207322276.

[4] Phongsavan, Keokedthong; Phengsavanh, Alongkone; Wahlström, Rolf; Marions, Lena (июнь 2010 г.). «Восприятие женщинами рака шейки матки и его профилактика в сельских районах Лаоса». Международный журнал гинекологического рака . 20 (5): 821–826. doi :10.1111/IGC.0b013e3181daaefb. PMID 20606529. S2CID 27963086.

[5] Хагеманн Т, Т.; Бозанович Т; Хупер С; Любич А; Слеттенаар В.И.; Уилсон Дж.Л.; Сингх Н; Гейтер С.А.; и др. (2007). «Молекулярное профилирование прогрессирования рака шейки матки». Br. J. Cancer . 96 (2): 321–328. doi :10.1038/sj.bjc.6603543. PMC 2360010 . PMID 17242701.

[6] Sayers, EW; Barrett T; Benson DA; Bolton E; Bryant SH; Canese K; Chetvernin V; Church DM; Dicuccio M; et al. (2010). «Ресурсы базы данных Национального центра биотехнологической информации». Nucleic Acids Res . 38 (выпуск базы данных): D5–D16. doi :10.1093/nar/gkp967. PMC 2808881. PMID 19910364 .

[7] Онгенарт, М.; Ван Несте Л.; Де Мейер Т.; Меншарт Г.; Бекарт С.; Ван Крикинге В. (2008). «PubMeth: база данных метилирования рака, объединяющая интеллектуальный анализ текста и экспертные аннотации». Nucleic Acids Res . 36 (выпуск базы данных): D842–D846. doi :10.1093/nar/gkm788. PMC 2238841. PMID 17932060 .