Cas4

Белок, используемый в CRISPR
Семейство белков
CRISPR-ассоциированный белок 4
Идентификаторы
Символcas4
ПфамПФ01930
ИнтерПроIPR022765
Доступные структуры белков:
Пфам  структуры / ECOD  
ПДБRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsumрезюме структуры

Cas4 — это эндонуклеаза, обнаруженная в некоторых системах CRISPR , которая используется на этапе получения спейсера.

Комплекс Cas1-Cas2-Cas4 Geobacter sexualreducens связан с двухцепочечной протоспейсерной смежной ДНК (PAM). Гомодимеры Cas1 (синие) связываются с каждой стороной гомодимера Cas2 (красного) с помощью нуклеазы Cas4 Fe-S (голубой), соединяющей их. 3'-конец каждой цепи ДНК вплетается в активный сайт Cas4. PDB : 7MI4

Cas4 необходим для эффективной обработки преспейсера путем формирования комплекса Cas4- Cas1 - Cas2 . [1] В этом комплексе Cas4 разрезает двухцепочечные субстраты с длинными 3'-выступами посредством сайт-специфического эндонуклеолитического расщепления. [2] Cas4 тесно взаимодействует с активными участками интегразы Cas1 , распознает последовательности PAM в субстрате и расщепляет точно выше их, обеспечивая получение функциональных спейсеров. [2] [1]

Ссылки

  1. ^ ab Lee H, Dhingra Y, Sashital DG (апрель 2019 г.). «Комплекс Cas4-Cas1-Cas2 опосредует точную обработку преспейсера во время адаптации CRISPR». eLife . 8 . doi : 10.7554/eLife.44248 . PMC  6519985 . PMID  31021314.
  2. ^ ab Lee H, Zhou Y, Taylor DW, Sashital DG (апрель 2018 г.). «Cas4-зависимая обработка преспейсера обеспечивает высокоточное программирование массивов CRISPR». Molecular Cell . 70 (1): 48–59.e5. doi : 10.1016/j.molcel.2018.03.003 . PMC 5889325 . PMID  29602742. 
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Cas4&oldid=1165904835"