BCL11B

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
BCL11B
Идентификаторы
ПсевдонимыBCL11B , ATL1, ATL1-альфа, ATL1-бета, ATL1-дельта, ATL1-гамма, CTIP-2, CTIP2, RIT1, ZNF856B, hRIT1-альфа, В-клеточный ХЛЛ/лимфома 11B, IMD49, В-клеточный ХЛЛ/лимфома 11B, IDDFSTA, компонент комплекса BAF, субъединица комплекса ремоделирования хроматина BAF SMARCM2
Внешние идентификаторыОМИМ : 606558; МГИ : 1929913; гомологен : 10974; Генные карты : BCL11B; OMA :BCL11B – ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез

64919

58208

Ансамбль

ENSG00000127152

ENSMUSG00000048251

UniProt

Q9C0K0

Q99PV8

РефСек (мРНК)

НМ_001282237
НМ_001282238
НМ_022898
НМ_138576

НМ_001079883
НМ_001286343
НМ_021399

RefSeq (белок)

НП_001269166
НП_001269167
НП_075049
НП_612808

НП_001073352
НП_001273272
НП_067374

Местоположение (UCSC)Хр 14: 99.17 – 99.27 МбХр 12: 107.88 – 107.97 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

В-клеточная лимфома/лейкемия 11B — это белок , который у людей кодируется геном BCL11B . [5] [6] [7]

Расположение гена

BCL11B расположен на человеческой хромосоме 14p32.2 . [8] Мышиный аналог называется Rit1 или Bcl11b и расположен на мышиной хромосоме 12. [9]

Функция

Этот ген кодирует белок цинкового пальца типа C2H2 и тесно связан с BCL11A , геном, транслокация которого может быть связана с В-клеточными злокачественными новообразованиями. Конкретная функция этого гена пока не определена, но он также может быть вовлечен в некоторые злокачественные новообразования. Сообщалось о двух альтернативно сплайсированных вариантах транскрипта, которые кодируют различные изоформы. [7]

Исследования показывают, что BCL11B имеет решающее значение для правильного формирования и функционирования амелобластов (клеток, которые производят зубную эмаль ). [10]

Взаимодействия

Было показано, что BCL11B взаимодействует с COUP-TFI . [11]

Патология

BCL11B тесно связан с иммунной регуляцией, и поэтому его мутация может привести к фенотипу SCID . Этот так называемый иммунодефицит 49 (OMIM #617237) классифицируется как T-B+NK+ SCID . [12] Он характеризуется отсутствием Т-лимфоцитов и его нарушением, особенно в пролиферативном ответе. С другой стороны, количество и функции В-клеток и NK-клеток не нарушены. [13] Симптомы SCID, вызванные мутацией BCL11B , — помимо дефектов иммунитета — обычно включают аномалии зубов , краниофациальный диморфизм, различные типы дерматита . Также значительно нарушается интеллектуальное развитие. Заболевание имеет очень раннее начало, и единственным известным методом лечения является трансплантация гемопоэтических стволовых клеток от здорового донора. [14] [13] Иммунодефицит имеет доминантно-негативный тип наследования , поскольку все до сих пор описанные пациенты с ним были после секвенирования идентифицированы как гетерозиготы по гену BCL11B . [13] [14]

Научно-исследовательские проекты

Исследование на основе мышиной модели показало, что Bcl11b также играет важную роль в патогенезе воспалительного заболевания кишечника . Выключение гена Bcl11b в определенной популяции Т-клеток привело к развитию ВЗК . Предполагается, что механизмы, лежащие в основе этого, заключаются в снижении супрессорной активности регуляторных Т-клеток и изменении цитокиновой среды. Предполагается, что Bcl11b взаимодействует с промоторами генов Foxp3 и IL10 и, таким образом, нарушает его супрессорную функцию в кишечнике . [15]

Bcl11b ( мышиный аналог человеческого BCL11B) доказано способствует злокачественному росту , например, в случае лимфом у мышей . Предполагается, что это вызвано взаимодействием с p53 , известным геном-супрессором опухолей . [9]

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000127152 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000048251 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Satterwhite E, Sonoki T, Willis TG, Harder L, Nowak R, Arriola EL и др. (декабрь 2001 г.). «Семейство генов BCL11: участие BCL11A в лимфоидных злокачественных новообразованиях». Blood . 98 (12): 3413– 20. doi : 10.1182/blood.V98.12.3413 . PMID  11719382.
  6. ^ Topark-Ngarm A, Golonzhka O, Peterson VJ, Barrett B, Martinez B, Crofoot K и др. (октябрь 2006 г.). «CTIP2 ассоциируется с комплексом NuRD на промоутере p57KIP2, недавно идентифицированного целевого гена CTIP2». Журнал биологической химии . 281 (43): 32272– 83. doi : 10.1074/jbc.M602776200 . PMC 2547407. PMID  16950772 . 
  7. ^ ab "Ген Энтреза: BCL11B В-клеточный ХЛЛ/лимфома 11B (белок цинкового пальца)".
  8. ^ "Запись OMIM - * 606558 - B-КЛЕТОЧНЫЙ ХЛЛ/ЛИМФОМА 11B; BCL11B". www.omim.org . Получено 29.07.2019 .
  9. ^ аб Вакабаяши Ю., Иноуэ Дж., Такахаши Ю., Мацуки А., Косуги-Окано Х., Шинбо Т. и др. (февраль 2003 г.). «Гомозиготные делеции и точечные мутации гена Rit1 / Bcl11b при лимфомах тимуса мышей, индуцированных гамма-лучами». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 301 (2): 598–603 . doi :10.1016/S0006-291X(02)03069-3. ПМИД  12565905.
  10. ^ Golonzhka O, Metzger D, Bornert JM, Bay BK, Gross MK, Kioussi C, Leid M (март 2009). «Ctip2/Bcl11b контролирует образование амелобластов во время одонтогенеза млекопитающих». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 106 (11): 4278– 83. Bibcode : 2009PNAS..106.4278G. doi : 10.1073/pnas.0900568106 . PMC 2657370. PMID  19251658 . *Резюме: «Ген может позволить выращивать зубы в лабораторных условиях». BBC News . 24 февраля 2009 г.
  11. ^ Avram D, Fields A, Pretty On Top K, Nevrivy DJ, Ishmael JE, Leid M (апрель 2000 г.). «Выделение нового семейства белков цинковых пальцев C(2)H(2), вовлеченных в транскрипционную репрессию, опосредованную куриным овальбумином восходящего промотора транскрипционного фактора (COUP-TF) сиротских ядерных рецепторов». Журнал биологической химии . 275 (14): 10315– 22. doi : 10.1074 /jbc.275.14.10315 . PMC 2819356. PMID  10744719. 
  12. ^ Alt F (2018). Достижения в иммунологии . Кембридж, Массачусетс: Academic Press. ISBN 978-0-12-815529-5. OCLC  1035016036.
  13. ^ abc Punwani D, Zhang Y, Yu J, Cowan MJ, Rana S, Kwan A и др. (декабрь 2016 г.). «Мультисистемные аномалии при тяжелом комбинированном иммунодефиците с мутантным BCL11B». The New England Journal of Medicine . 375 (22): 2165– 2176. doi :10.1056/nejmoa1509164. PMC 5215776. PMID  27959755 . 
  14. ^ ab Lessel D, Gehbauer C, Bramswig NC, Schluth-Bolard C, Venkataramanappa S, van Gassen KL и др. (август 2018 г.). «Мутации BCL11B у пациентов, страдающих расстройством нейроразвития с уменьшенным количеством врожденных лимфоидных клеток 2-го типа». Brain . 141 (8): 2299– 2311. doi :10.1093/brain/awy173. PMC 6061686 . PMID  29985992. 
  15. ^ Vanvalkenburgh J, Albu DI, Bapanpally C, Casanova S, Califano D, Jones DM и др. (сентябрь 2011 г.). «Критическая роль Bcl11b в супрессорной функции регуляторных Т-клеток и профилактике воспалительных заболеваний кишечника». Журнал экспериментальной медицины . 208 (10): 2069– 81. doi :10.1084/jem.20102683. PMC 3182057. PMID  21875956 . 

Дальнейшее чтение

  • Avram D, Fields A, Pretty On Top K, Nevrivy DJ, Ishmael JE, Leid M (апрель 2000 г.). «Выделение нового семейства белков цинковых пальцев C(2)H(2), вовлеченных в транскрипционную репрессию, опосредованную куриным овальбумином восходящего промотора фактора транскрипции (COUP-TF) сиротских ядерных рецепторов». Журнал биологической химии . 275 (14): 10315– 22. doi : 10.1074/jbc.275.14.10315 . PMC  2819356. PMID  10744719 .
  • Avram D, Fields A, Senawong T, Topark-Ngarm A, Leid M (декабрь 2002 г.). "COUP-TF (куриный овальбумин восходящий промоутер транскрипционного фактора)-взаимодействующий белок 1 (CTIP1) является специфичным для последовательности ДНК-связывающим белком". The Biochemical Journal . 368 (Pt 2): 555– 63. doi :10.1042/BJ20020496. PMC  1223006 . PMID  12196208.
  • Вакабаяси Ю., Иноуэ Дж., Такахаши Ю., Мацуки А., Косуги-Окано Х., Шинбо Т. и др. (февраль 2003 г.). «Гомозиготные делеции и точечные мутации гена Rit1 / Bcl11b при лимфомах тимуса мышей, индуцированных гамма-лучами». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 301 (2): 598–603 . doi :10.1016/S0006-291X(02)03069-3. ПМИД  12565905.
  • Rohr O, Lecestre D, Chasserot-Golaz S, Marban C, Avram D, Aunis D и др. (май 2003 г.). «Набор Tat в гетерохроматиновый белок HP1 посредством взаимодействия с CTIP2 ингибирует репликацию вируса иммунодефицита человека типа 1 в микроглиальных клетках». Journal of Virology . 77 (9): 5415– 27. doi :10.1128/JVI.77.9.5415-5427.2003. PMC  153947 . PMID  12692243.
  • Senawong T, Peterson VJ, Avram D, Shepherd DM, Frye RA, Minucci S, Leid M (октябрь 2003 г.). "Участие гистондеацетилазы SIRT1 в транскрипционной репрессии, опосредованной взаимодействием с фактором транскрипции восходящего промотора куриного овальбумина (COUP-TF)". Журнал биологической химии . 278 (44): 43041– 50. doi : 10.1074/jbc.M307477200 . PMC  2819354. PMID  12930829 .
  • Bezrookove V, van Zelderen-Bhola SL, Brink A, Szuhai K, Raap AK, Barge R и др. (февраль 2004 г.). «Новый t(6;14)(q25-q27;q32) при остром миелоцитарном лейкозе включает ген BCL11B». Cancer Genetics and Cytogenetics . 149 (1): 72– 6. doi :10.1016/S0165-4608(03)00302-9. PMID  15104287.
  • MacLeod RA, Nagel S, Drexler HG (август 2004 г.). «Перестройки BCL11B, вероятно, нацелены на неоплазию Т-клеток, а не на острый миелоцитарный лейкоз». Cancer Genetics and Cytogenetics . 153 (1): 88– 9. doi :10.1016/j.cancergencyto.2004.02.020. PMID  15325104.
  • Przybylski GK, Dik WA, Wanzeck J, Grabarczyk P, Majunke S, Martin-Subero JI и др. (февраль 2005 г.). «Нарушение гена BCL11B посредством inv(14)(q11.2q32.31) приводит к экспрессии транскриптов слияния BCL11B-TRDC и связано с отсутствием транскриптов BCL11B дикого типа при T-ALL». Leukemia . 19 (2): 201– 8. doi :10.1038/sj.leu.2403619. PMID  15668700. S2CID  27146016.
  • Cismasiu VB, Adamo K, Gecewicz J, Duque J, Lin Q, Avram D (октябрь 2005 г.). «BCL11B функционально ассоциируется с комплексом NuRD в Т-лимфоцитах для подавления целевого промотора». Oncogene . 24 (45): 6753– 64. doi :10.1038/sj.onc.1208904. PMID  16091750. S2CID  14198939.
  • Marban C, Suzanne S, Dequiedt F, de Walque S, Redel L, Van Lint C и др. (январь 2007 г.). «Набор хроматин-модифицирующих ферментов CTIP2 способствует транскрипционному подавлению ВИЧ-1». The EMBO Journal . 26 (2): 412– 23. doi :10.1038/sj.emboj.7601516. PMC  1783449 . PMID  17245431.
  • Nagel S, Scherr M, Kel A, Hornischer K, Crawford GE, Kaufmann M и др. (февраль 2007 г.). «Активация TLX3 и NKX2-5 при остром лимфобластном лейкозе Т-клеток t(5;14)(q35;q32) удаленными энхансерами 3'-BCL11B и корегуляция PU.1 и HMGA1». Cancer Research . 67 (4): 1461– 71. doi : 10.1158/0008-5472.CAN-06-2615 . PMID  17308084.
  • Камимура К, Мисима Й, Обата М, Эндо Т, Аояги Й, Коминами Р (август 2007 г.). «Отсутствие супрессора опухолей Bcl11b приводит к уязвимости к стрессу репликации ДНК и повреждениям». Онкоген . 26 (40): 5840– 50. doi :10.1038/sj.onc.1210388. PMID  17369851. S2CID  29677572.

В данной статье использован текст из Национальной медицинской библиотеки США , являющийся общественным достоянием .


Значок заглушки

Эта статья о гене на человеческой хромосоме 14 — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=BCL11B&oldid=1193112466"