CTCFL

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
CTCFL
Идентификаторы
ПсевдонимыCTCFL , BORIS, CT27, CTCF-T, HMGB1L1, dJ579F20.2, фактор связывания CCCTC, подобный
Внешние идентификаторыОМИМ : 607022; МГИ : 3652571; гомологен : 46476; GeneCards : CTCFL; OMA :CTCFL — ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001081387
NM_001355185

RefSeq (белок)

NP_001074856
NP_001342114

Местоположение (UCSC)н/дХр 2: 172.94 – 172.96 Мб
Поиск в PubMed[2][3]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Транскрипционный репрессор CTCFL, также известный как BORIS (брат регулятора импринтированных участков), представляет собой белок , который у людей кодируется геном CTCFL . [4]

Функция

Фактор связывания CCCTC ( CTCF ), фактор с 11 цинковыми пальцами , участвующий в регуляции генов, использует различные цинковые пальцы для связывания различных целевых участков ДНК. CTCF образует чувствительные к метилированию инсуляторы, которые регулируют инактивацию Х-хромосомы . Транскрипционный репрессор CTCFL (этот белок) является паралогом CTCF и, по-видимому, экспрессируется в основном в цитоплазме сперматоцитов , в отличие от CTCF, который экспрессируется в основном в ядре соматических клеток. CTCF и CTCFL обычно экспрессируются во взаимоисключающем паттерне, который коррелирует с переустановкой меток метилирования во время дифференциации мужских половых клеток. [4]

Ссылки

  1. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000070495 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  3. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ ab "Ген Энтреза: CTCFL CCCTC-связывающий фактор (белок цинкового пальца)-подобный".

Дальнейшее чтение

  • Кленова EM, Морс HC, Ольссон R, Лобаненков VV (2003). «Новое семейство генов BORIS + CTCF уникально вовлечено в эпигенетику нормальной биологии и рака». Семин. Cancer Biol . 12 (5): 399– 414. doi :10.1016/S1044-579X(02)00060-3. PMID  12191639.
  • D'Arcy V, Pore N, Docquier F и др. (2008). "BORIS, паралог фактора транскрипции CTCF, аберрантно экспрессируется в опухолях молочной железы". Br. J. Cancer . 98 (3): 571– 9. doi :10.1038/sj.bjc.6604181. PMC  2243163 . PMID  18195709.
  • Воложинска-Рид А., Джеймс СР., Линк ПА. и др. (2008). «Регуляция экспрессии BORIS/CTCFL при раке яичников, зависящая от метилирования ДНК». Cancer Immun . 7 : 21. PMC  2935752. PMID  18095639 .
  • Renaud S, Pugacheva EM, Delgado MD и др. (2008). «Экспрессия паралогичного гена рака-яичка CTCF, брата регулятора импринтированных сайтов (BORIS), регулируется тремя альтернативными промоторами, модулируемыми метилированием CpG и факторами транскрипции CTCF и p53». Nucleic Acids Res . 35 (21): 7372– 88. doi :10.1093/nar/gkm896. PMC  2175345. PMID  17962299 .
  • Холманских О., Лорио А., Брассер Ф. и др. (2008). «Экспрессия BORIS в меланоме: отсутствие связи с активацией MAGE-A1». Int. J. Cancer . 122 (4): 777– 84. doi : 10.1002/ijc.23140 . PMID  17957795. S2CID  28681146.
  • Risinger JI, Chandramouli GV, Maxwell GL и др. (2007). «Глобальный анализ экспрессии генов рака/яичек при раке матки выявляет высокую частоту экспрессии BORIS». Clin. Cancer Res . 13 (6): 1713– 9. doi : 10.1158/1078-0432.CCR-05-2569 . PMID  17363524.
  • D'Arcy V, Abdullaev ZK, Pore N и др. (2006). «Потенциал BORIS, обнаруженного в лейкоцитах пациентов с раком молочной железы, как раннего маркера опухолеобразования». Clin. Cancer Res . 12 (20 Pt 1): 5978– 86. doi :10.1158/1078-0432.CCR-05-2731. PMID  17062669. S2CID  38340446.
  • Хоффманн М.Дж., Мюллер М., Энгерс Р., Шульц ВА (2007). «Эпигенетический контроль экспрессии CTCFL/BORIS и OCT4 при урогенитальных злокачественных новообразованиях». Biochem. Pharmacol . 72 (11): 1577– 88. doi :10.1016/j.bcp.2006.06.020. PMID  16854382.
  • Hong JA, Kang Y, Abdullaev Z, et al. (2005). «Взаимное связывание CTCF и BORIS с промотором NY-ESO-1 совпадает с дерепрессией этого гена рака-яичек в клетках рака легких». Cancer Res . 65 (17): 7763– 74. doi :10.1158/0008-5472.CAN-05-0823. PMID  16140944.
  • Rodriguez M, Yu X, Chen J, Songyang Z (2004). "Специфичность связывания фосфопептидов доменов COOH-терминала BRCA1 (BRCT)". J. Biol. Chem . 278 (52): 52914– 8. doi : 10.1074/jbc.C300407200 . PMID  14578343.
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH и др. (2003). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241. PMID  12477932 .
  • Лукинов ДИ, Пугачева Е, Ватолин С и др. (2002). "BORIS, новый мужской зародышевый специфичный белок, связанный с событиями эпигенетического репрограммирования, имеет тот же домен из 11 цинковых пальцев, что и CTCF, инсуляторный белок, участвующий в считывании импринтинговых меток в соме". Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (10): 6806– 11. Bibcode :2002PNAS...99.6806L. doi : 10.1073/pnas.092123699 . PMC  124484 . PMID  12011441.
  • Deloukas P, Matthews LH, Ashurst J, et al. (2002). «Последовательность ДНК и сравнительный анализ человеческой хромосомы 20». Nature . 414 (6866): 865–71 . Bibcode :2001Natur.414..865D. doi : 10.1038/414865a . PMID  11780052.


Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=CTCFL&oldid=1187643816"