Транскрипционный репрессор CTCFL, также известный как BORIS (брат регулятора импринтированных участков), представляет собой белок , который у людей кодируется геном CTCFL . [4]
Функция
Фактор связывания CCCTC ( CTCF ), фактор с 11 цинковыми пальцами , участвующий в регуляции генов, использует различные цинковые пальцы для связывания различных целевых участков ДНК. CTCF образует чувствительные к метилированию инсуляторы, которые регулируют инактивацию Х-хромосомы . Транскрипционный репрессор CTCFL (этот белок) является паралогом CTCF и, по-видимому, экспрессируется в основном в цитоплазме сперматоцитов , в отличие от CTCF, который экспрессируется в основном в ядре соматических клеток. CTCF и CTCFL обычно экспрессируются во взаимоисключающем паттерне, который коррелирует с переустановкой меток метилирования во время дифференциации мужских половых клеток. [4]
Ссылки
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000070495 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ ab "Ген Энтреза: CTCFL CCCTC-связывающий фактор (белок цинкового пальца)-подобный".
Дальнейшее чтение
Кленова EM, Морс HC, Ольссон R, Лобаненков VV (2003). «Новое семейство генов BORIS + CTCF уникально вовлечено в эпигенетику нормальной биологии и рака». Семин. Cancer Biol . 12 (5): 399– 414. doi :10.1016/S1044-579X(02)00060-3. PMID 12191639.
D'Arcy V, Pore N, Docquier F и др. (2008). "BORIS, паралог фактора транскрипции CTCF, аберрантно экспрессируется в опухолях молочной железы". Br. J. Cancer . 98 (3): 571– 9. doi :10.1038/sj.bjc.6604181. PMC 2243163 . PMID 18195709.
Воложинска-Рид А., Джеймс СР., Линк ПА. и др. (2008). «Регуляция экспрессии BORIS/CTCFL при раке яичников, зависящая от метилирования ДНК». Cancer Immun . 7 : 21. PMC 2935752. PMID 18095639 .
Renaud S, Pugacheva EM, Delgado MD и др. (2008). «Экспрессия паралогичного гена рака-яичка CTCF, брата регулятора импринтированных сайтов (BORIS), регулируется тремя альтернативными промоторами, модулируемыми метилированием CpG и факторами транскрипции CTCF и p53». Nucleic Acids Res . 35 (21): 7372– 88. doi :10.1093/nar/gkm896. PMC 2175345. PMID 17962299 .
Холманских О., Лорио А., Брассер Ф. и др. (2008). «Экспрессия BORIS в меланоме: отсутствие связи с активацией MAGE-A1». Int. J. Cancer . 122 (4): 777– 84. doi : 10.1002/ijc.23140 . PMID 17957795. S2CID 28681146.
Risinger JI, Chandramouli GV, Maxwell GL и др. (2007). «Глобальный анализ экспрессии генов рака/яичек при раке матки выявляет высокую частоту экспрессии BORIS». Clin. Cancer Res . 13 (6): 1713– 9. doi : 10.1158/1078-0432.CCR-05-2569 . PMID 17363524.
D'Arcy V, Abdullaev ZK, Pore N и др. (2006). «Потенциал BORIS, обнаруженного в лейкоцитах пациентов с раком молочной железы, как раннего маркера опухолеобразования». Clin. Cancer Res . 12 (20 Pt 1): 5978– 86. doi :10.1158/1078-0432.CCR-05-2731. PMID 17062669. S2CID 38340446.
Хоффманн М.Дж., Мюллер М., Энгерс Р., Шульц ВА (2007). «Эпигенетический контроль экспрессии CTCFL/BORIS и OCT4 при урогенитальных злокачественных новообразованиях». Biochem. Pharmacol . 72 (11): 1577– 88. doi :10.1016/j.bcp.2006.06.020. PMID 16854382.
Hong JA, Kang Y, Abdullaev Z, et al. (2005). «Взаимное связывание CTCF и BORIS с промотором NY-ESO-1 совпадает с дерепрессией этого гена рака-яичек в клетках рака легких». Cancer Res . 65 (17): 7763– 74. doi :10.1158/0008-5472.CAN-05-0823. PMID 16140944.
Rodriguez M, Yu X, Chen J, Songyang Z (2004). "Специфичность связывания фосфопептидов доменов COOH-терминала BRCA1 (BRCT)". J. Biol. Chem . 278 (52): 52914– 8. doi : 10.1074/jbc.C300407200 . PMID 14578343.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH и др. (2003). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
Лукинов ДИ, Пугачева Е, Ватолин С и др. (2002). "BORIS, новый мужской зародышевый специфичный белок, связанный с событиями эпигенетического репрограммирования, имеет тот же домен из 11 цинковых пальцев, что и CTCF, инсуляторный белок, участвующий в считывании импринтинговых меток в соме". Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (10): 6806– 11. Bibcode :2002PNAS...99.6806L. doi : 10.1073/pnas.092123699 . PMC 124484 . PMID 12011441.
Deloukas P, Matthews LH, Ashurst J, et al. (2002). «Последовательность ДНК и сравнительный анализ человеческой хромосомы 20». Nature . 414 (6866): 865–71 . Bibcode :2001Natur.414..865D. doi : 10.1038/414865a . PMID 11780052.