CRMP1

CRMP1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	4B3Z
Идентификаторы
Псевдонимы	CRMP1 , CRMP-1, DPYSL1, DRP-1, DRP1, ULIP-3, белок-медиатор реакции коллапсин 1
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 602462; МГИ : 107793; гомологен : 20347; Генные карты : CRMP1; OMA :CRMP1 — ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 4 (человек)
Конец	5,893,086 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 5 (мышь)
Конец	37,449,477 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верх выражен в
	ганглионарное возвышение; ; желудочковая зона; ; латеральная группа ядер таламуса; ; правое полушарие мозжечка; ; средняя височная извилина; ; префронтальная кора; ; дорсолатеральная префронтальная кора; ; правая лобная доля; ; парафлоккулус мозжечка; ; передняя доля гипофиза;
	Верх выражен в
	ганглионарное возвышение; ; верхний шейный ганглий; ; стволовая кора; ; обонятельная луковица; ; энторинальная кора; ; поле CA3; ; околоносовая кора; ; зубчатая извилина гиппокампа гранулярная клетка образования; ; медиальное ганглиозное возвышение; ; нервная трубка;
	Больше данных по справочным выражениям
	Больше данных по справочным выражениям
Генная онтология
Молекулярная функция	связывание белков; гидролазная активность; гидролазная активность, действующая на углеродно-азотные (но не пептидные) связи; связывание филамина;
Клеточный компонент	шпиндель; цитоскелет; центр организации микротрубочек; цитоплазма; цитозоль; середина тела; центросома; ядро;
Биологический процесс	развитие нейронов; метаболический процесс соединения, содержащего азотистое основание; организация цитоскелета микротрубочек; развитие нервной системы; аксонное руководство; негативная регуляция связывания актиновых филаментов; негативная регуляция развития нейронных проекций;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	1400
	12933
	ENSG00000072832
	ENSMUSG00000029121
	Q14194
	Р97427
	NM_001313 ; NM_001014809 ; NM_001288661 ; NM_001288662
	NM_001136058 ; NM_007765
	NP_001014809 ; NP_001275590 ; NP_001275591 ; NP_001304
	NP_001129530 ; NP_031791
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Белок-медиатор реакции коллапсина 1 , кодируемый геном CRMP1 , является человеческим белком семейства CRMP . ^[5]

Этот ген кодирует член семейства цитозольных фосфопротеинов, экспрессируемых исключительно в нервной системе . Считается, что кодируемый белок является частью пути передачи сигнала семафорина , вовлеченного в вызванный семафорином коллапс конуса роста во время развития нервной системы . Альтернативный сплайсинг приводит к появлению множественных вариантов транскриптов. ^[5]

CRMP1 опосредует передачу сигналов рилина при миграции корковых нейронов. ^[6] У мышей с дефицитом CRMP1 наблюдается нарушение долговременной потенциации и нарушение пространственного обучения и памяти . ^[7]

Ген CRMP1 перекрывается с другим геном, называемым EVC . ^[8]

Взаимодействия

Было показано, что CRMP1 взаимодействует с DPYSL2 . ^[9]

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000072832 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000029121 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ ab "Ген Энтреза: белок-медиатор реакции коллапсина CRMP1 1".
^ Yamashita N, Uchida Y, Ohshima T, Hirai S, Nakamura F, Taniguchi M, Mikoshiba K, Honnorat J, Kolattukudy P, Thomasset N, Takei K, Takahashi T, Goshima Y (декабрь 2006 г.). «Белок-медиатор реакции коллапсина 1 опосредует передачу сигналов рилина при миграции нейронов коры». J. Neurosci. 26 (51): 13357– 62. doi : 10.1523/JNEUROSCI.4276-06.2006 . PMC 6674993 . PMID 17182786.
^ Su KY, Chien WL, Fu WM, Yu IS, Huang HP, Huang PH, Lin SR, Shih JY, Lin YL, Hsueh YP, Yang PC, Lin SW (март 2007 г.). «У мышей с дефицитом белка-медиатора коллапсина-1 наблюдается нарушение долговременной потенциации и нарушение пространственного обучения и памяти». J. Neurosci. 27 (10): 2513– 24. doi : 10.1523/JNEUROSCI.4497-06.2007 . PMC 6672508 . PMID 17344389.
^ Руис-Перес В.Л., Иде С.Э., Стром ТМ, Лоренц Б., Уилсон Д., Вудс К., Кинг Л., Франкомано С., Фрейзингер П., Спрангер С., Марино Б., Даллапиккола Б., Райт М., Мейтингер Т., Полимеропулос М.Х., Гудшип Дж. (март 2000 г.). «Мутации в новом гене при синдроме Эллиса-ван Кревельда и акродентальном дизостозе Вейерса». Нат. Жене. 24 (3): 283–6 . дои : 10.1038/73508. PMID 10700184. S2CID 1391136.
^ Leung, Thomas; Ng Yvonne; Cheong Albert; Ng Chong Han; Tan Ivan; Hall Christine; Lim Louis (декабрь 2002 г.). "Связывающий белок p80 ROKalpha является новым вариантом сплайсинга CRMP-1, который ассоциируется с CRMP-2 и модулирует морфологию нейронов, вызванную RhoA". FEBS Lett . 532 (3): 445– 9. doi : 10.1016/S0014-5793(02)03736-5 . ISSN 0014-5793. PMID 12482610. S2CID 45499981.

Внешние ссылки

Расположение генома человека CRMP1 и страница с подробностями гена CRMP1 в браузере геномов UCSC .

Дальнейшее чтение

Shih JY, Lee YC, Yang SC и др. (2003). «Белок-медиатор реакции коллапсин-1: новый ген-супрессор инвазии». Clin. Exp. Metastasis . 20 (1): 69– 76. doi :10.1023/A:1022598604565. PMID 12650609. S2CID 25005489.
Хамадзима Н., Мацуда К., Саката С. и др. (1997). «Новое семейство генов, определяемое человеческой дигидропиримидиназой и тремя родственными белками с дифференциальным распределением в тканях». Gene . 180 ( 1– 2): 157– 63. doi :10.1016/S0378-1119(96)00445-3. PMID 8973361.
Torres R, Polymeropoulos MH (1999). «Геномная организация и локализация гена CRMP-1 человека». DNA Res . 5 (6): 393– 5. doi : 10.1093/dnares/5.6.393 . PMID 10048489.
Shih JY, Yang SC, Hong TM и др. (2001). «Белок-медиатор реакции коллапсин-1 и инвазия и метастазирование раковых клеток». J. Natl. Cancer Inst . 93 (18): 1392– 400. doi : 10.1093/jnci/93.18.1392 . PMID 11562390.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH и др. (2003). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
Leung T, Ng Y, Cheong A и др. (2003). "Связывающий белок p80 ROKalpha является новым вариантом сплайсинга CRMP-1, который ассоциируется с CRMP-2 и модулирует морфологию нейронов, индуцированную RhoA". FEBS Lett . 532 (3): 445– 9. doi : 10.1016/S0014-5793(02)03736-5 . PMID 12482610. S2CID 45499981.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных человеческих кДНК». Nat. Genet . 36 (1): 40– 5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039.
Chang CC, Shih JY, Jeng YM и др. (2004). «Фактор роста соединительной ткани и его роль в инвазии и метастазах аденокарциномы легких». J. Natl. Cancer Inst . 96 (5): 364–75 . doi : 10.1093/jnci/djh059 . PMID 14996858.
Ballif BA, Villén J, Beausoleil SA и др. (2005). «Фосфопротеомный анализ развивающегося мозга мыши». Mol. Cell. Proteomics . 3 (11): 1093– 101. doi : 10.1074/mcp.M400085-MCP200 . PMID 15345747.
Goehler H, Lalowski M, Stelzl U и др. (2004). «Сеть взаимодействия белков связывает GIT1, усилитель агрегации хантингтина, с болезнью Хантингтона». Mol. Cell . 15 (6): 853– 65. doi : 10.1016/j.molcel.2004.09.016 . PMID 15383276.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH по полноразмерной ДНК: коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res . 14 (10B): 2121– 7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 .
Sivakumaran TA, Lesperance MM (2005). "Анализ гаплотипа и неравновесия сцепления генов CRMP1 и EVC". Int. J. Mol. Med . 14 (5): 903– 7. doi :10.3892/ijmm.14.5.903. PMID 15492864.
Stelzl U, Worm U, Lalowski M и др. (2005). «Сеть взаимодействия белок-белок человека: ресурс для аннотирования протеома». Cell . 122 (6): 957– 68. doi :10.1016/j.cell.2005.08.029. hdl : 11858/00-001M-0000-0010-8592-0 . PMID 16169070. S2CID 8235923.
Cole AR, Causeret F, Yadirgi G, et al. (2006). «Различные прайминговые киназы способствуют дифференциальной регуляции белков-медиаторов реакции коллапсина киназой-3 гликогенсинтазы in vivo». J. Biol. Chem . 281 (24): 16591– 8. doi : 10.1074/jbc.M513344200 . PMC 1805471. PMID 16611631 .
Weidemann W, Stelzl U, Lisewski U и др. (2007). «Белок-медиатор реакции коллапсин 1 (CRMP-1) и белок цинкового пальца промиелоцитарного лейкоза (PLZF) связываются с UDP-N-ацетилглюкозамин 2-эпимеразой/N-ацетилманнозамин киназой (GNE), ключевым ферментом биосинтеза сиаловой кислоты». FEBS Lett . 580 ( 28– 29): 6649– 54. doi : 10.1016/j.febslet.2006.11.015 . PMID 17118363. S2CID 25369336.

Эта статья о гене на человеческой хромосоме 4 — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000072832 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000029121 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] "Ген Энтреза: белок-медиатор реакции коллапсина CRMP1 1".

[pmid17182786-6] Yamashita N, Uchida Y, Ohshima T, Hirai S, Nakamura F, Taniguchi M, Mikoshiba K, Honnorat J, Kolattukudy P, Thomasset N, Takei K, Takahashi T, Goshima Y (декабрь 2006 г.). «Белок-медиатор реакции коллапсина 1 опосредует передачу сигналов рилина при миграции нейронов коры». J. Neurosci. 26 (51): 13357– 62. doi : 10.1523/JNEUROSCI.4276-06.2006 . PMC 6674993 . PMID 17182786.

[pmid17344389-7] Su KY, Chien WL, Fu WM, Yu IS, Huang HP, Huang PH, Lin SR, Shih JY, Lin YL, Hsueh YP, Yang PC, Lin SW (март 2007 г.). «У мышей с дефицитом белка-медиатора коллапсина-1 наблюдается нарушение долговременной потенциации и нарушение пространственного обучения и памяти». J. Neurosci. 27 (10): 2513– 24. doi : 10.1523/JNEUROSCI.4497-06.2007 . PMC 6672508 . PMID 17344389.

[pmid10700184-8] Руис-Перес В.Л., Иде С.Э., Стром ТМ, Лоренц Б., Уилсон Д., Вудс К., Кинг Л., Франкомано С., Фрейзингер П., Спрангер С., Марино Б., Даллапиккола Б., Райт М., Мейтингер Т., Полимеропулос М.Х., Гудшип Дж. (март 2000 г.). «Мутации в новом гене при синдроме Эллиса-ван Кревельда и акродентальном дизостозе Вейерса». Нат. Жене. 24 (3): 283–6 . дои : 10.1038/73508. PMID 10700184. S2CID 1391136.

[pmid12482610-9] Leung, Thomas; Ng Yvonne; Cheong Albert; Ng Chong Han; Tan Ivan; Hall Christine; Lim Louis (декабрь 2002 г.). "Связывающий белок p80 ROKalpha является новым вариантом сплайсинга CRMP-1, который ассоциируется с CRMP-2 и модулирует морфологию нейронов, вызванную RhoA". FEBS Lett . 532 (3): 445– 9. doi : 10.1016/S0014-5793(02)03736-5 . ISSN 0014-5793. PMID 12482610. S2CID 45499981.