Субъединица 6 фактора специфичности расщепления и полиаденилирования представляет собой белок , который у человека кодируется геном CPSF6 . [ 5] [6] [7]
Функция
Белок, кодируемый этим геном, является одной субъединицей фактора расщепления, необходимого для расщепления 3'-РНК и полиаденилирования. Взаимодействие белка с РНК является одним из самых ранних шагов в сборке комплекса 3'-концевой обработки и облегчает привлечение других факторов обработки. Комплекс фактора расщепления состоит из четырех полипептидов. Этот ген кодирует субъединицу 68kD. Он имеет доменную организацию, напоминающую сплайсосомные белки. [7]
CPSF6 играет важную роль в ядерном импорте и интеграции капсидов ВИЧ-1 . [9]
Ссылки
^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000111605 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000055531 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Rüegsegger U, Blank D, Keller W (январь 1998). "Фактор расщепления пре-мРНК Im человека связан с белками сплайсосомного SR и может быть восстановлен in vitro из рекомбинантных субъединиц". Molecular Cell . 1 (2): 243–53 . doi : 10.1016/S1097-2765(00)80025-8 . PMID 9659921.
^ Cardinale S, Cisterna B, Bonetti P, Aringhieri C, Biggiogera M, Barabino SM (апрель 2007 г.). "Субъядерная локализация и динамика субъединицы 68-кДа фактора обработки пре-мРНК 3'-конца млекопитающего фактора расщепления I". Молекулярная биология клетки . 18 (4): 1282– 92. doi :10.1091/mbc.E06-09-0846. PMC 1838998. PMID 17267687 .
^ ab "Ген Энтреза: специфический фактор расщепления и полиаденилирования CPSF6 6, 68 кДа".
^ ab Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N и др. (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белков человека». Nature . 437 (7062): 1173– 8. Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
^ Müller TG, Zila V, Müller B, Kräusslich HG (29 сентября 2022 г.). «Nuclear Capsid Uncoating and Reverse Transcription of HIV-1». Annual Review of Virology . 9 (1): 261– 284. doi : 10.1146/annurev-virology-020922-110929 . PMID 35704745.
Внешние ссылки
Расположение генома человека CPSF6 и страница с подробностями гена CPSF6 в браузере геномов UCSC .
Дальнейшее чтение
Маруяма К, Сугано С (январь 1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Gene . 138 ( 1– 2): 171– 4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Рюгсеггер У., Бейер К., Келлер В. (март 1996 г.). «Очистка и характеристика человеческого фактора расщепления Im, участвующего в 3'-концевой обработке предшественников информационной РНК». Журнал биологической химии . 271 (11): 6107– 13. doi : 10.1074/jbc.271.11.6107 . PMID 8626397.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (октябрь 1997 г.). «Конструирование и характеристика библиотеки ДНК с полной длиной и обогащенной 5'-концом». Gene . 200 ( 1– 2): 149– 56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
de Vries H, Rüegsegger U, Hübner W, Friedlein A, Langen H, Keller W (ноябрь 2000 г.). «Фактор расщепления пре-мРНК II(m) человека содержит гомологи дрожжевых белков и соединяет два других фактора расщепления». The EMBO Journal . 19 (21): 5895– 904. doi :10.1093/emboj/19.21.5895. PMC 305781 . PMID 11060040.
Awasthi S, Alwine JC (ноябрь 2003 г.). "Связь фактора расщепления полиаденилирования I с U1 snRNP". РНК . 9 (11): 1400– 9. doi :10.1261/rna.5104603. PMC 1287061 . PMID 14561889.
Brown KM, Gilmartin GM (декабрь 2003 г.). «Механизм регуляции обработки пре-мРНК 3' человеческим фактором расщепления Im». Molecular Cell . 12 (6): 1467– 76. doi : 10.1016/S1097-2765(03)00453-2 . PMID 14690600.
Dettwiler S, Aringhieri C, Cardinale S, Keller W, Barabino SM (август 2004 г.). «Отдельные мотивы последовательностей в субъединице 68-кДа фактора расщепления Im опосредуют связывание РНК, белок-белковые взаимодействия и субклеточную локализацию» (PDF) . Журнал биологической химии . 279 (34): 35788– 97. doi : 10.1074/jbc.M403927200 . PMID 15169763. S2CID 39752996.
Venkataraman K, Brown KM, Gilmartin GM (июнь 2005 г.). «Анализ неканонического сайта поли(А) выявляет трехкомпонентный механизм распознавания сайта поли(А) позвоночных». Genes & Development . 19 (11): 1315– 27. doi :10.1101/gad.1298605. PMC 1142555 . PMID 15937220.
Руал Дж.Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрез М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С, Лламосас Е, Чевик С, Бекс С, Ламеш П, Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж, Зогби Х.И., Смоляр А, Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Е., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. ( октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети межбелковых взаимодействий человека». Природа . 437 (7062): 1173– 8. Библиографический код : 2005Natur.437.1173R. doi : 10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Millevoi S, Loulergue C, Dettwiler S, Karaa SZ, Keller W, Antoniou M, Vagner S (октябрь 2006 г.). «Взаимодействие между U2AF 65 и CF I(m) связывает механизмы сплайсинга и обработки 3'-конца». The EMBO Journal . 25 (20): 4854– 64. doi :10.1038/sj.emboj.7601331. PMC 1618107 . PMID 17024186.
Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). "Крупномасштабное картирование взаимодействий белок-белок человека с помощью масс-спектрометрии". Молекулярная системная биология . 3 (1): 89. doi :10.1038/msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931 .
