CLDN4

CLDN4
Идентификаторы
Псевдонимы	CLDN4 , CPE-R, CPER, CPETR, CPETR1, WBSCR8, hCPE-R, клаудин 4
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 602909; МГИ : 1313314; Гомологен : 1000; GeneCards : CLDN4; OMA :CLDN4 — ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 7 (человек)
Конец	73,832,690 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 5 (мышь)
Конец	134,975,788 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верх выражен в
	слизистая оболочка поперечно-ободочной кишки; ; правая маточная труба; ; обонятельная зона слизистой оболочки носа; ; кожа живота; ; кожа ноги; ; малые слюнные железы; ; прямая кишка; ; левая доля щитовидной железы; ; слизистая оболочка сигмовидной кишки; ; правая доля щитовидной железы;
	Верх выражен в
	бластоциста; ; переходный эпителий мочевого пузыря; ; губа; ; строма роговицы; ; мешочек; ; слуховая плакода; ; слуховой пузырек; ; подчелюстная железа; ; пищевод; ; двенадцатиперстная кишка;
	Больше данных по справочным выражениям
	Больше данных по справочным выражениям
Генная онтология
Молекулярная функция	структурная молекулярная активность; трансмембранная сигнальная активность рецептора; идентичное связывание белков; активность хлоридного канала; связывание белков;
Клеточный компонент	неотъемлемый компонент мембраны; соединение клеток; базальная плазматическая мембрана; апиколатеральная плазматическая мембрана; неотъемлемый компонент плазматической мембраны; апикальная плазматическая мембрана; боковая плазматическая мембрана; двуклеточный плотный контакт; мембрана; плазматическая мембрана; комплекс хлоридных каналов;
Биологический процесс	реакция на прогестерон; женская беременность; кальций-независимая межклеточная адгезия посредством молекул клеточной адгезии плазматической мембраны; циркадный ритм; создание кожного барьера; передача сигнала; транспорт хлорида; почечная абсорбция; хлорид трансмембранный транспорт; транспорт ионов;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	1364
	12740
	ENSG00000189143
	ENSMUSG00000047501
	О14493
	О35054
	NM_001305
	NM_009903
	NP_001296
	NP_034033
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Клаудин 4 , также известный как CLDN4 , — это белок , который у человека кодируется геном CLDN4 . Он относится к группе клаудинов .

Этот ген кодирует интегральный мембранный белок , который принадлежит к семейству клаудинов . Белок является компонентом нитей плотных контактов и может играть роль в развитии и функционировании внутренних органов в пренатальном и постнатальном периодах жизни. Этот ген удаляется при синдроме Уильямса-Бойрена , нейроразвивающем расстройстве, затрагивающем несколько систем. ^[5]

Клаудин 4 также может использоваться в качестве маркера для дифференциации злокачественной мезотелиомы от рака легких и серозной карциномы матки . ^[6] В качестве маркера рака поджелудочной железы в клеточных блоках образцов выпота он также показал более высокую эффективность, чем окрашивание BerEp4 . ^[7]

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000189143 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000047501 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Ген Энтреза: CLDN4 клаудин 4".
^ Ohta Y, Sasaki Y, Saito M, Kushima M, Takimoto M, Shiokawa A, Ota H (2013). «Клаудин-4 как маркер для различения злокачественной мезотелиомы от рака легких и серозной аденокарциномы». Int J Surg Pathol . 21 (5): 493–501. doi :10.1177/1066896913491320. PMID 23775021. S2CID 6840615.
^ Vojtek M, Walsh MD, Papadimos DJ, Shield PW (2019). «Иммуногистохимия клаудина-4 является полезным панкарциномным маркером для образцов серозного выпота» (PDF) . Цитопатология . 30 (6): 614–619. doi :10.1111/cyt.12765. PMID 31390089. S2CID 199468828.

Внешние ссылки

Расположение генома человека CLDN4 и страница с подробностями гена CLDN4 в браузере геномов UCSC .

Дальнейшее чтение

Книзель У., Вольбург Х. (2000). «Плотные соединения гематоэнцефалического барьера». Cell. Mol. Neurobiol . 20 (1): 57–76. doi :10.1023/A:1006995910836. PMID 10690502. S2CID 26473781.
Heiskala M, Peterson PA, Yang Y (2001). «Роли белков суперсемейства клаудинов в параклеточном транспорте». Traffic . 2 (2): 93–8. doi :10.1034/j.1600-0854.2001.020203.x. PMID 11247307. S2CID 12132159.
Tsukita S, Furuse M, Itoh M (2001). «Многофункциональные нити в плотных соединениях». Nat. Rev. Mol. Cell Biol . 2 (4): 285–93. doi :10.1038/35067088. PMID 11283726. S2CID 36524601.
Tsukita S, Furuse M (2003). «Барьер на основе клаудина в простых и стратифицированных клеточных слоях». Curr. Opin. Cell Biol . 14 (5): 531–6. doi :10.1016/S0955-0674(02)00362-9. PMID 12231346.
Гонсалес-Марискаль Л., Бетансос А., Нава П., Харамильо Б.Е. (2003). «Белки с плотными соединениями». Прог. Биофиз. Мол. Биол . 81 (1): 1–44. дои : 10.1016/S0079-6107(02)00037-8. ПМИД 12475568.
Katahira J, Inoue N, Horiguchi Y и др. (1997). «Молекулярное клонирование и функциональная характеристика рецептора энтеротоксина Clostridium perfringens». J. Cell Biol . 136 (6): 1239–47. doi :10.1083/jcb.136.6.1239. PMC 2132509. PMID 9087440 .
Katahira J, Sugiyama H, Inoue N и др. (1997). «Энтеротоксин Clostridium perfringens использует два структурно связанных мембранных белка в качестве функциональных рецепторов in vivo». J. Biol. Chem . 272 (42): 26652–8. doi : 10.1074/jbc.272.42.26652 . PMID 9334247.
Paperna T, Peoples R, Wang YK и др. (1999). «Гены рецептора CPE (CPETR1) и человеческого гомолога RVP1 (CPETR2) локализованы в пределах делеции синдрома Уильямса-Бойрена». Genomics . 54 (3): 453–9. doi : 10.1006/geno.1998.5619 . PMID 9878248.
Morita K, Furuse M, Fujimoto K, Tsukita S (1999). "Семейство мультигенов Claudin, кодирующих компоненты белков с четырьмя трансмембранными доменами в цепях плотных контактов". Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 96 (2): 511–6. Bibcode :1999PNAS...96..511M. doi : 10.1073/pnas.96.2.511 . PMC 15167 . PMID 9892664.
Itoh M, Furuse M, Morita K и др. (2000). «Прямое связывание трех MAGUK, связанных с плотными контактами, ZO-1, ZO-2 и ZO-3, с COOH-концами клаудинов». J. Cell Biol . 147 (6): 1351–63. doi : 10.1083 /jcb.147.6.1351. PMC 2168087. PMID 10601346.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH и др. (2003). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
Colegio OR, Van Itallie C, Rahner C, Anderson JM (2003). «Внеклеточные домены клаудина определяют селективность и сопротивление параклеточного заряда, но не архитектуру фибрилл плотного соединения». Am. J. Physiol., Cell Physiol . 284 (6): C1346–54. doi :10.1152/ajpcell.00547.2002. PMID 12700140.
Katoh M, Katoh M (2004). «Ген CLDN23, часто подавляемый при раке желудка кишечного типа, является новым членом семейства генов CLAUDIN». Int. J. Mol. Med . 11 (6): 683–9. doi :10.3892/ijmm.11.6.683. PMID 12736707.
Hillier LW, Fulton RS, Fulton LA и др. (2003). «Последовательность ДНК человеческой хромосомы 7». Nature . 424 (6945): 157–64. Bibcode :2003Natur.424..157H. doi : 10.1038/nature01782 . PMID 12853948.
Michl P, Barth C, Buchholz M и др. (2003). «Экспрессия клаудина-4 снижает инвазивность и метастатический потенциал рака поджелудочной железы». Cancer Res . 63 (19): 6265–71. PMID 14559813.
Liu F, Koval M, Ranganathan S, Fanayan S, Hancock WS, Lundberg EK, Beavis RC, Lane L, Duek P, McQuade L, Kelleher NL, Baker MS (2015). «Системный протеомный взгляд на семейство эндогенных белков клаудина человека». J Proteome Res . 15 (2): 339–59. doi :10.1021/acs.jproteome.5b00769. PMC 4777318. PMID 26680015 .
Ohta Y, Sasaki Y, Saito M, Kushima M, Takimoto M, Shiokawa A, Ota H (2013). «Клаудин-4 как маркер для различения злокачественной мезотелиомы от рака легких и серозной аденокарциномы». Int J Surg Pathol . 21 (5): 493–501. doi :10.1177/1066896913491320. PMID 23775021. S2CID 6840615.
Vojtek M, Walsh MD, Papadimos DJ, Shield PW (2019). «Иммуногистохимия клаудина-4 — полезный панкарциномный маркер для образцов серозного выпота» (PDF) . Цитопатология . 30 (6): 614–619. doi :10.1111/cyt.12765. PMID 31390089. S2CID 199468828.

Эта статья о гене на человеческой хромосоме 7 — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000189143 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000047501 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] "Ген Энтреза: CLDN4 клаудин 4".

[pmid23775021-6] Ohta Y, Sasaki Y, Saito M, Kushima M, Takimoto M, Shiokawa A, Ota H (2013). «Клаудин-4 как маркер для различения злокачественной мезотелиомы от рака легких и серозной аденокарциномы». Int J Surg Pathol . 21 (5): 493–501. doi :10.1177/1066896913491320. PMID 23775021. S2CID 6840615.

[VojtekWalsh2019-7] Vojtek M, Walsh MD, Papadimos DJ, Shield PW (2019). «Иммуногистохимия клаудина-4 является полезным панкарциномным маркером для образцов серозного выпота» (PDF) . Цитопатология . 30 (6): 614–619. doi :10.1111/cyt.12765. PMID 31390089. S2CID 199468828.