ИБС2
Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
ИБС2
Идентификаторы
ПсевдонимыCHD2 , EEOC, хромодоменный геликаза ДНК-связывающий белок 2, DEE94
Внешние идентификаторыОМИМ : 602119; МГИ : 2448567; гомологен : 37462; Генные карты : CHD2; OMA :CHD2 — ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез

1106

244059

Ансамбль

ENSG00000173575

ENSMUSG00000078671

UniProt

О14647

Е9ПЗМ4

RefSeq (мРНК)

NM_001271
NM_001042572

NM_001081345

RefSeq (белок)

NP_001036037
NP_001262

NP_001074814

Местоположение (UCSC)Хр 15: 92.9 – 93.03 МбХр 7: 73.08 – 73.19 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Хромодомен-хеликаза-ДНК-связывающий белок 2 — это фермент , который у людей кодируется геном CHD2 . [ 5] [6]

Функция

Семейство белков CHD характеризуется наличием доменов хромо (модификатор организации хроматина) и доменов геликазы/ АТФазы, связанных с SNF2 . Гены CHD изменяют экспрессию генов, возможно, путем модификации структуры хроматина , тем самым изменяя доступ транскрипционного аппарата к его шаблону хромосомной ДНК. CHD2 катализирует сборку хроматина в периодические массивы; а N-концевая область CHD2, которая содержит тандемные хромодомены, выполняет аутоингибиторную роль как в ДНК-связывающей, так и в АТФазной активности CHD2. [7] Для этого гена были обнаружены альтернативно сплайсированные варианты транскриптов, кодирующие различные изоформы . [6]

Клиническое значение

Мутации и делеции de novo в этом гене были связаны со случаями эпилептических энцефалопатий. [8] [9] [10] [11] [12]

Эпилепсия CHD2 все чаще определяется как субпопуляция синдрома Леннокса-Гасто . [13] [14]

Миоклоническая энцефалопатия CHD2 — это состояние, характеризующееся рецидивирующими припадками (эпилепсией), аномальной функцией мозга (энцефалопатией) и умственной отсталостью. Эпилепсия начинается в детстве, как правило, в возрасте от 6 месяцев до 4 лет. У каждого человека могут быть различные типы припадков, чаще всего миоклонические припадки. [15]

Недавно мутации de novo или делеции в CHD2 были связаны с умственной отсталостью [16] и аутизмом. [17] [18] [19] Исследователи обнаружили 27 генов, которые отменяют функцию соответствующего белка — по крайней мере у двух людей с аутизмом, и 6 генов мутируют у трех или более людей с аутизмом. Эти шесть генов — CHD8 , DYRK1A , ANK2 , GRIN2B , DSCAM и CHD2 — являются самыми сильными кандидатами на аутизм, выявленными на сегодняшний день.

Поддержка семьи

Синдромы, связанные с мутациями или делециями в CHD2, могут быть разрушительными. Семьи людей с мутациями или делециями CHD2 могут присоединиться к группе поддержки и исследований CHD2 на Facebook [20] или найти информацию и поддержку через некоммерческую организацию Coalition to Cure CHD2. [21]

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000173575 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000078671 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Woodage T, Basrai MA, Baxevanis AD, Hieter P, Collins FS (октябрь 1997 г.). «Характеристика семейства белков CHD». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 94 (21): 11472– 7. Bibcode : 1997PNAS...9411472W. doi : 10.1073 /pnas.94.21.11472 . PMC 23509. PMID  9326634. 
  6. ^ ab "Ген Entrez: ДНК-связывающий белок 2 хромодоменной геликазы CHD2".
  7. ^ Liu JC, Ferreira CG, Yusufzai T (январь 2015 г.). «Человеческий CHD2 — это АТФаза сборки хроматина, регулируемая его хромо- и ДНК-связывающими доменами». Журнал биологической химии . 290 (1): 25–34 . doi : 10.1074/jbc.M114.609156 . PMC 4281729. PMID  25384982 . 
  8. ^ Carvill GL, Heavin SB, Yendle SC, McMahon JM, O'Roak BJ, Cook J, Khan A, Dorschner MO, Weaver M, Calvert S, Malone S, Wallace G, Stanley T, Bye AM, Bleasel A, Howell KB, Kivity S, Mackay MT, Rodriguez-Casero V, Webster R, Korczyn A, Afawi Z, Zelnick N, Lerman-Sagie T, Lev D, Møller RS, Gill D, Andrade DM, Freeman JL, Sadleir LG, Shendure J, Berkovic SF, Scheffer IE, Mefford HC (июль 2013 г.). "Целевое повторное секвенирование при эпилептических энцефалопатиях выявляет мутации de novo в CHD2 и SYNGAP1". Nature Genetics . 45 (7): 825–30 . doi : 10.1038/ng.2646. ПМК 3704157 . ПМИД  23708187. 
  9. ^ Chénier S, Yoon G, Argiropoulos B, Lauzon J, Laframboise R, Ahn JW, Ogilvie CM, Lionel AC, Marshall CR, Vaags AK, Hashemi B, Boisvert K, Mathonnet G, Tihy F, So J, Scherer SW, Lemyre E, Stavropoulos DJ (2014). "Гаплонедостаточность CHD2 связана с задержкой развития, интеллектуальной инвалидностью, эпилепсией и нейроповеденческими проблемами". Журнал нарушений нейроразвития . 6 (1): 9. doi : 10.1186/1866-1955-6-9 . PMC 4022362. PMID  24834135 . 
  10. ^ Сулс А, Джаэн Дж.А., Кечкес А., Вебер Ю., Векхуйсен С., Крайу Д.С., Секиерска А., Джемье Т., Африканова Т., Гормли П., фон Спичак С., Клюгер Г., Илиеску CM, Тальвик Т., Тальвик I, Мерал С., Каглаян Х.С., Хиральдес Б.Г., Серратоса Дж., Лемке Дж.Р., Хоффман-Захарска Д., Щепаник Е., Баришич Н., Комарек В., Ялгрим Х., Мёллер Р.С., Линнанкиви Т., Димова П., Стриано П., Зара Ф, Марини К., Геррини Р., Депьен К., Баулак С., Куленбоймер Г., Кроуфорд. А.Д., Лехесйоки А.Е., де Витте П.А., Палотие А., Лерш Х, Esguerra CV, De Jonghe P, Helbig I (ноябрь 2013 г.). «Мутации потери функции de novo в CHD2 вызывают чувствительную к лихорадке миоклоническую эпилептическую энцефалопатию, имеющую общие черты с синдромом Драве». Американский журнал генетики человека . 93 (5) : 967– 75. doi :10.1016/j.ajhg.2013.09.017. PMC 3824114. PMID  24207121 . 
  11. ^ Консорциум EuroEPINOMICS-RES (октябрь 2014 г.). «Мутации de novo в генах синаптической передачи, включая DNM1, вызывают эпилептические энцефалопатии». Американский журнал генетики человека . 95 (4): 360–70 . doi :10.1016/j.ajhg.2014.08.013. PMC 4185114. PMID  25262651 . 
  12. ^ Courage C, Houge G, Gallati S, Schjelderup J, Rieubland C (сентябрь 2014 г.). «Микроделеция 15q26.1, охватывающая только CHD2 и RGMA у двух взрослых с умеренной интеллектуальной недостаточностью, эпилепсией и ожирением туловища». European Journal of Medical Genetics . 57 (9): 520– 3. doi :10.1016/j.ejmg.2014.06.003. PMID  24932903.
  13. ^ Лунд С., Бродкорб Э., Ойе А.М., Рёсби О., Селмер К.К. (апрель 2014 г.). «Мутации CHD2 при синдроме Леннокса-Гасто». Эпилепсия и поведение . 33 : 18–21 . doi :10.1016/j.yebeh.2014.02.005. PMID  24614520. S2CID  140207920.
  14. ^ Capelli LP, Krepischi AC, Gurgel-Giannetti J, Mendes MF, Rodrigues T, Varela MC, Koiffmann CP, Rosenberg C (февраль 2012 г.). «Удаление генов RMGA и CHD2 у ребенка с эпилепсией и умственной отсталостью». European Journal of Medical Genetics . 55 (2): 132– 4. doi :10.1016/j.ejmg.2011.10.004. PMID  22178256.
  15. ^ Миоклоническая энцефалопатия CHD2 на MedlinePlus
  16. ^ Хамдан Ф.Ф., Срур М., Капо-Чичи Дж.М., Дауд Х., Нассиф С., Патри Л., Массикотт С., Амбалаванан А., Шпигельман Д., Диалло О., Генрион Е., Дионн-Лапорт А., Фужера А., Пшежецкий А.В., Венкатешваран С., Руло Г.А., Мишо Ж.Л. (октябрь 2014 г.). «Мутации de novo при умеренной или тяжелой умственной отсталости». ПЛОС Генетика . 10 (10): e1004772. дои : 10.1371/journal.pgen.1004772 . ПМЦ 4214635 . ПМИД  25356899. 
  17. ^ Иосифов И, О'Роак Б.Дж., Сандерс С.Дж., Ронемус М., Крумм Н., Леви Д., Стессман Х.А., Уизерспун К.Т., Вивес Л., Паттерсон К.Е., Смит Д.Д., Пейпер Б., Никерсон Д.А., Деа Дж., Донг С., Гонсалес Л.Е., Манделл Д.Д., Мане С.М., Мурта М.Т., Салливан К.А., Уокер М.Ф., Вакар З., Вэй Л., Уиллси А.Дж., Ямром Б., Ли Ю.Х., Грабовска Э., Далкич Э., Ван З., Маркс С., Эндрюс П., Леотта А., Кендалл Дж., Хаккер И., Розенбаум Дж., Ма Б., Роджерс Л., Троге Дж., Нарциси Г., Юн С., Шац М.К., Йе К., Маккомби В.Р., Шендуре Дж., Эйхлер Э.Э., Стейт М.В., Виглер М. (ноябрь 2014). «Вклад мутаций кодирования de novo в расстройства аутистического спектра». Nature . 515 (7526): 216– 21. Bibcode :2014Natur.515..216I. doi :10.1038/nature13908. PMC 4313871 . PMID  25363768. 
  18. ^ Де Рубейс С., Хе X, Голдберг А.П., Поултни К.С., Самоча К., Чичек А.Е., Коу Ю, Лю Л, Фромер М., Уокер С., Сингх Т., Клей Л., Космицки Дж., Ши-Чен Ф., Алексич Б., Бискальди. М, Болтон П.Ф., Браунфельд Дж.М., Кай Дж., Кэмпбелл Н.Г., Карраседо А., Чахрур М.Х., Чиоккетти А.Г., Кун Х., Кроуфорд Э.Л., Карран С.Р., Доусон Г., Дукетис Е., Фернандес Б.А., Галлахер Л., Геллер Э., Гутер С.Дж., Хилл Р.С., Ионита-Лаза Дж., Хименц Гонсалес П., Килпинен Х., Клаук С.М., Колевзон А., Ли И, Лей И, Лей Дж, Лехтимяки Т, Лин КФ, Мааян А, Маршалл CR, Макиннес А.Л., Нил Б, Оуэн М.Дж., Одзаки Н., Пареллада М., Парр Дж.Р., Перселл С., Пуура К., Раджагопалан Д., Ренстрём К., Райхенберг А., Сабо А., Саксе М., Сандерс С.Дж., Шафер С., Шульте-Рютер М., Скузе Д., Стивенс С, Сатмари П, Таммимис К, Валладарес О, Воран А, Ли-Сан В, Вайс Л.А., Уиллси А.Дж., Ю Т.В., Юэнь Р.К., Кук Э.Х., Фрейтаг СМ, Гилл М., Хультман СМ, Ленер Т., Палоти А., Шелленберг Г.Д., Склар П., Стэйт М.В., Сатклифф Дж.С., Уолш К.А., Шерер С.В., Цвик М.Е. , Баретт Дж.С., Катлер Дж.Д., Родер К., Девлин Б., Дейли М.Дж., Буксбаум Дж.Д. (ноябрь 2014). «Синаптические, транскрипционные и хроматиновые гены, нарушенные при аутизме». Nature . 515 (7526): 209– 15. Bibcode :2014Natur.515..209.. doi :10.1038/nature13772. PMC 4402723 . PMID  25363760. 
  19. ^ O'Roak BJ, Stessman HA, Boyle EA, Witherspoon KT, Martin B, Lee C, Vives L, Baker C, Hiatt JB, Nickerson DA, Bernier R, Shendure J, Eichler EE (2014). «Рекуррентные мутации de novo указывают на новые гены, лежащие в основе риска простого аутизма». Nature Communications . 5 : 5595. Bibcode :2014NatCo...5.5595O. doi :10.1038/ncomms6595. PMC 4249945 . PMID  25418537. 
  20. ^ https://www.facebook.com/groups/1462485137354985/ [ источник, созданный пользователем ]
  21. ^ "Главная". curechd2.org .

Дальнейшее чтение

  • Feys T, Poppe B, De Preter K, Van Roy N, Verhasselt B, De Paepe P, De Paepe A, Speleman F (июль 2007 г.). «Подробный перечень изменений числа копий ДНК в четырех часто используемых линиях клеток лимфомы Ходжкина». Haematologica . 92 (7): 913– 20. doi : 10.3324/haematol.11073 . hdl : 1854/LU-376639 . PMID  17606441.
  • Кимура К, Вакамацу А, Сузуки Ю, Ота Т, Нисикава Т, Ямашита Р, Ямамото Дж, Секине М, Цуритани К, Вакагури Х, Исии С, Сугияма Т, Сайто К, Исоно Ю, Ириэ Р, Кушида Н, Ёнеяма Т , Оцука Р., Канда К., Ёкои Т., Кондо Х., Вагацума М., Муракава К., Исида С., Исибаши Т., Такахаси-Фудзи А., Танасе Т., Нагай К., Кикучи Х., Накаи К., Исогай Т., Сугано С. (январь 2006 г.). «Диверсификация транскрипционной модуляции: крупномасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Геномные исследования . 16 (1): 55– 65. doi :10.1101/gr.4039406. PMC  1356129. PMID  16344560 .
  • Хиллер М., Хузе К., Платцер М., Бакофен Р. (2005). «Прогнозирование пропуска экзонов и событий удержания интронов без использования EST с использованием информации Pfam». Nucleic Acids Research . 33 (17): 5611– 21. doi :10.1093/nar/gki870. PMC  1243800 . PMID  16204458.
  • Brandenberger R, Wei H, Zhang S, Lei S, Murage J, Fisk GJ, Li Y, Xu C, Fang R, Guegler K, Rao MS, Mandalam R, Lebkowski J, Stanton LW (июнь 2004 г.). «Характеристика транскриптома проливает свет на сигнальные сети, которые контролируют рост и дифференцировку эмбриональных стволовых клеток человека». Nature Biotechnology . 22 (6): 707– 16. doi : 10.1038/nbt971. PMID  15146197. S2CID  27764390.
  • Johnson JM, Castle J, Garrett-Engele P, Kan Z, Loerch PM, Armour CD, Santos R, Schadt EE, Stoughton R, Shoemaker DD (декабрь 2003 г.). «Обзор генома альтернативного сплайсинга пре-мРНК человека с использованием микроматриц экзонных соединений». Science . 302 (5653): 2141– 4. Bibcode :2003Sci...302.2141J. doi :10.1126/science.1090100. PMID  14684825. S2CID  10007258.
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=CHD2&oldid=1252994754"