Б3ГАТ1

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Б3ГАТ1
Доступные структуры
ПДБПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыB3GAT1 , CD57, GLCATP, GLCUATP, HNK1, LEU7, NK-1, NK1, бета-1,3-глюкуронилтрансфераза 1
Внешние идентификаторыОМИМ : 151290; МГИ : 1924148; гомологен : 49551; Генные карты : B3GAT1; OMA :B3GAT1 — ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез
Ансамбль
UniProt
РефСек (мРНК)

НМ_018644
НМ_054025
НМ_001367973

NM_029792
NM_001310766

RefSeq (белок)

НП_061114
НП_473366
НП_001354902

NP_001297695
NP_084068

Местоположение (UCSC)Хр 11: 134.38 – 134.41 МбХр 9: 26.65 – 26.67 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

3-бета-глюкуронозилтрансфераза 1 (B3GAT1) — это фермент , который у людей кодируется геном B3GAT1 , чья ферментативная активность создает эпитоп CD57 на других белках клеточной поверхности. [5] В иммунологии антиген CD57 (CD означает кластер дифференциации ) также известен как HNK1 (человеческий естественный киллер-1) или LEU7. Он экспрессируется как углеводный эпитоп , который содержит остаток сульфоглюкуронила в нескольких молекулах адгезии нервной системы . [6]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства генов глюкуронилтрансферазы. Эти ферменты проявляют строгую акцепторную специфичность, распознавая невосстанавливающие терминальные сахара и их аномерные связи. Этот генный продукт функционирует как ключевой фермент в реакции переноса глюкуронила во время биосинтеза углеводного эпитопа HNK-1 (человеческий естественный киллер-1, также известный как CD57 и LEU7). Были охарактеризованы альтернативные транскрипционные варианты сплайсинга. [5]

Иммуногистохимия

В анатомической патологии CD57 (иммуноокрашивание) аналогичен CD56 для использования в дифференциации нейроэндокринных опухолей от других. [7] С помощью иммуногистохимии молекула CD57 может быть обнаружена примерно в 10-20% лимфоцитов , а также в некоторых эпителиальных , нейральных и хромаффинных клетках . Среди лимфоцитов CD57-положительные клетки обычно являются либо Т-клетками , либо NK-клетками и чаще всего встречаются в зародышевых центрах лимфатических узлов , миндалин и селезенки. [8]

Наблюдается увеличение числа циркулирующих CD57-положительных клеток в крови пациентов, недавно перенесших трансплантацию органов или тканей, особенно костного мозга, и у пациентов с ВИЧ . Повышенное количество CD57+ также было зарегистрировано при ревматоидном артрите и синдроме Фелти , среди других состояний. [8] Высокий уровень экспрессии CD57 среди циркулирующих CD8+ T-клеток связан с другими маркерами иммунного старения (иммуносенесценция) и может быть связан с повышенным риском рака у реципиентов почечного трансплантата. [9]

Неопластические CD57-позитивные клетки наблюдаются при таких разнообразных состояниях, как крупнозернистый лимфоцитарный лейкоз , мелкоклеточная карцинома , карцинома щитовидной железы , а также невральные и карциноидные опухоли. Хотя антиген особенно распространен в карциноидных опухолях, он обнаруживается в таком широком диапазоне других состояний, что он менее полезен для различения этих опухолей от других, чем более специфические маркеры, такие как хромогранин и NSE . [8]

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000109956 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000045994 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ ab "Ген Entrez: B3GAT1 бета-1,3-глюкуронилтрансфераза 1 (глюкуронозилтрансфераза P)".
  6. ^ Мицумото Y, Ока S, Сакума H, Инадзава J, Кавасаки T (апрель 2000 г.). «Клонирование и хромосомное картирование человеческой глюкуронилтрансферазы, участвующей в биосинтезе углеводного эпитопа HNK-1». Геномика . 65 (2): 166–173 . doi :10.1006/geno.2000.6152. PMID  10783264.
  7. ^ Wick MR (2010). «Глава 11 – Иммуногистохимия средостения». В Dabbs DJ (ред.). Диагностическая иммуногистохимия: тераностические и геномные приложения (3-е изд.). Филадельфия, Пенсильвания: Saunders/Elsevier. стр.  345–6 . doi :10.1016/B978-1-4160-5766-6.00015-7. ISBN 978-1-4160-5766-6.
  8. ^ abc Leong AS, Cooper K, Leong FJ (2003). Руководство по диагностическим антителам для иммуногистологии (2-е изд.). Лондон: Greenwich Medical Media. стр.  131–134 . ISBN 978-1-84110-100-2.
  9. ^ Bottomley MJ, Harden PN, Wood KJ (май 2016 г.). «CD8+ иммуностарение предсказывает посттрансплантационный плоскоклеточный рак кожи у пациентов с высоким риском». Журнал Американского общества нефрологии . 27 (5): 1505–1515 . doi :10.1681/ASN.2015030250. PMC 4849821. PMID  26563386 . 

Дальнейшее чтение

  • Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY, Liu W, Gibbs RA (апрель 1996 г.). «Метод «двойного адаптера» для улучшенного построения библиотеки дробовика». Аналитическая биохимия . 236 (1): 107– 113. doi :10.1006/abio.1996.0138. PMID  8619474.
  • Yu W, Andersson B, Worley KC, Muzny DM, Ding Y, Liu W и др. (апрель 1997 г.). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование ДНК». Genome Research . 7 (4): 353– 358. doi :10.1101/gr.7.4.353. PMC  139146 . PMID  9110174.
  • Tone Y, Kitagawa H, Imiya K, Oka S, Kawasaki T, Sugahara K (октябрь 1999 г.). «Характеристика рекомбинантной человеческой глюкуронилтрансферазы I, участвующей в биосинтезе области связи гликозаминогликан-белок протеогликанов». FEBS Letters . 459 (3): 415– 420. Bibcode : 1999FEBSL.459..415T. doi : 10.1016/S0014-5793(99)01287-9 . PMID  10526176. S2CID  7878952.
  • Мицумото Y, Ока S, Сакума H, Инадзава J, Кавасаки T (апрель 2000 г.). «Клонирование и хромосомное картирование человеческой глюкуронилтрансферазы, участвующей в биосинтезе углеводного эпитопа HNK-1». Геномика . 65 (2): 166– 173. doi :10.1006/geno.2000.6152. PMID  10783264.
  • Pedersen LC, Tsuchida K, Kitagawa H, Sugahara K, Darden TA, Negishi M (ноябрь 2000 г.). «Биосинтез гепаран/хондроитинсульфата. Структура и механизм человеческой глюкуронилтрансферазы I». Журнал биологической химии . 275 (44): 34580– 34585. doi : 10.1074/jbc.M007399200 . PMID  10946001.
  • Cebo C, Durier V, Lagant P, Maes E, Florea D, Lefebvre T и др. (апрель 2002 г.). «Функция и молекулярное моделирование взаимодействия человеческого интерлейкина 6 и его олигосахаридных лигандов HNK-1». Журнал биологической химии . 277 (14): 12246– 12252. doi : 10.1074/jbc.M106816200 . PMID  11788581.
  • Ouzzine M, Gulberti S, Levoin N, Netter P, Magdalou J, Fournel-Gigleux S (июль 2002 г.). «Специфичность донорного субстрата человеческой бета-1,3-глюкуронозилтрансферазы I по отношению к UDP-глюкуроновой кислоте определяется двумя важнейшими остатками гистидина и аргинина». Журнал биологической химии . 277 (28): 25439– 25445. doi : 10.1074/jbc.M201912200 . PMID  11986319.
  • Brenchley JM, Karandikar NJ, Betts MR, Ambrozak DR, Hill BJ, Crotty LE и др. (апрель 2003 г.). «Экспрессия CD57 определяет репликативное старение и антиген-индуцированную апоптотическую смерть CD8+ T-клеток». Blood . 101 (7): 2711– 2720. doi : 10.1182/blood-2002-07-2103 . PMID  12433688.
  • Jirásek T, Hozák P, Mandys V (2003). «Различные паттерны экспрессии хромогранина A и Leu-7 (CD57) в карциноидах желудочно-кишечного тракта: иммуногистохимическое и конфокальное лазерное сканирующее микроскопическое исследование». Neoplasma . 50 (1): 1– 7. PMID  12687271.
  • Jeffries AR, Mungall AJ, Dawson E, Halls K, Langford CF, Murray RM и др. (июль 2003 г.). «ген бета-1,3-глюкуронилтрансферазы-1, вовлеченный в качестве кандидата на шизофреноподобный психоз посредством молекулярного анализа сбалансированной транслокации». Молекулярная психиатрия . 8 (7): 654– 663. doi : 10.1038/sj.mp.4001382 . PMID  12874601.
  • Chochi K, Ichikura T, Majima T, Kawabata T, Matsumoto A, Sugasawa H и др. (2004). «Увеличение количества Т-клеток CD57+ в периферической крови и их нарушенные иммунные функции у пациентов с прогрессирующим раком желудка». Oncology Reports . 10 (5): 1443– 1448. doi :10.3892/or.10.5.1443. PMID  12883721.
  • Kakuda S, Shiba T, Ishiguro M, Tagawa H, Oka S, Kajihara Y и др. (май 2004 г.). «Структурная основа распознавания субстрата акцептора человеческой глюкуронилтрансферазы, GlcAT-P, фермента, играющего решающую роль в биосинтезе углеводного эпитопа HNK-1». Журнал биологической химии . 279 (21): 22693– 22703. doi : 10.1074/jbc.M400622200 . PMID  14993226.
  • Мацубара К., Юра К., Хирата Т., Нигами Х., Харигая Х., Нозаки Х. и др. (2005). «Острый лимфобластный лейкоз с коэкспрессией CD56 и CD57: отчет о случае». Детская гематология и онкология . 21 (7): 677–682 . doi : 10.1080/08880010490501105. PMID  15626024. S2CID  41086927.
  • Ibegbu CC, Xu YX, Harris W, Maggio D, Miller JD, Kourtis AP (май 2005 г.). «Экспрессия лектин-подобного рецептора клеток-киллеров G1 на антигенспецифических человеческих CD8+ T-лимфоцитах во время активной, латентной и разрешенной инфекции и ее связь с CD57». Журнал иммунологии . 174 (10): 6088– 6094. doi : 10.4049/jimmunol.174.10.6088 . PMID  15879103.
  • Ассути М., Виниос Д.Х., Анагностидес С.Т., Пападопулос Г., Георгакопулос К.Д., Гартаганис С.П. (январь 2006 г.). «Коллаген типа IX и эпитоп HNK-1 в слезах пациентов с псевдоэксфолиативным синдромом». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Молекулярные основы болезней . 1762 (1): 54–58 . doi : 10.1016/j.bbadis.2005.09.005 . ПМИД  16257185.
  • Barré L, Venkatesan N, Magdalou J, Netter P, Fournel-Gigleux S, Ouzzine M (август 2006 г.). «Доказательства кальций-зависимого пути в регуляции экспрессии гена человеческой бета1,3-глюкуронозилтрансферазы-1 (GlcAT-I): ключевой фермент в синтезе протеогликана». FASEB Journal . 20 (10): 1692– 1694. doi : 10.1096/fj.05-5073fje . PMID  16807373. S2CID  16549210.
  • Сада-Овалле И, Торре-Бускуле Л, Вальдес-Васкес Р, Мартинес-Каиро С, Зентено Э, Ласкурайн Р (декабрь 2006 г.). «Характеристика цитотоксической субпопуляции Т-клеток CD57+ у пациентов с туберкулезом легких». Клиническая иммунология . 121 (3): 314– 323. doi :10.1016/j.clim.2006.08.011. PMID  17035093.
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=B3GAT1&oldid=1249015103"