Белок чибби гомолог 1

CBY1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	4WRQ
Идентификаторы
Псевдонимы	CBY1 , C22orf2, CBY, HS508I15A, PGEA1, PIGEA-14, PIGEA14, arb1, гомолог chibby 1 (Drosophila), член семейства chibby 1, антагонист бета-катенина, Chibby1
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 607757; МГИ : 1920989; гомологен : 12514; Генные карты : CBY1; OMA :CBY1 — ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 22 (человек)
Конец	38,673,854 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 15 (мышь)
Конец	79,551,861 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верх выражен в
	ооцит; ; вторичный ооцит; ; правая маточная труба; ; сухожилие двуглавой мышцы плеча; ; эпителий бронхов; ; бронхиальная эпителиальная клетка; ; мышечный слой сигмовидной кишки; ; верхушка сердца; ; желудочковая зона; ; правое предсердие;
	Верх выражен в
	сперматоцит; ; межжелудочковая перегородка; ; желудочковая зона; ; медиальное ганглиозное возвышение; ; семенной каналец; ; нервная трубка; ; зубчатая извилина гиппокампа гранулярная клетка образования; ; нервный слой сетчатки; ; зрительная кора; ; гранулоцит;
	Больше данных по справочным выражениям
	Больше данных по справочным выражениям
Генная онтология
Молекулярная функция	связывание бета-катенина; связывание белков; идентичное связывание белков; активность гомодимеризации белка;
Клеточный компонент	цитозоль; транс-сеть Гольджи; аппарат Гольджи; ядерная пылинка; ядро; нуклеоплазма; цитоплазма; центриоль; цитоскелет; проекция клетки; цилиарное базальное тело;
Биологический процесс	локализация белка; дифференциация клеток сердечной мышцы; негативная регуляция сигнального пути Wnt; дифференциация клеток; негативная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; дифференциация жировых клеток; организация проекции клеток; гомотетрамеризация белка; сборка ресничек; сборка цилиарной переходной зоны;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	25776
	73739
	ENSG00000100211
	ENSMUSG00000022428
	Q9Y3M2
	Q9D1C2
	NM_015373 ; NM_001002880
	NM_028634
	NP_001002880 ; NP_056188
	NP_082910
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Белок chibby homolog 1 — это белок , который у людей кодируется геном CBY1 . [ ^5]^[6]^[7]

Функция

Бета-катенин — это транскрипционный активатор и онкопротеин, участвующий в развитии нескольких видов рака. Белок, кодируемый этим геном, напрямую взаимодействует с С-концевой областью бета-катенина, ингибируя онкогенную транскрипционную активацию, опосредованную бета-катенином, конкурируя с факторами транскрипции за связывание с бета-катенином. Для этого гена были обнаружены два варианта транскрипта, кодирующие различные изоформы. ^[7]

Взаимодействия

Было показано, что CBY1 взаимодействует с бета-катенином . ^[8] Было также показано, что CBY1 взаимодействует с CEP164 , CIBAR1 (FAM92A1) и RAB8A . ^[9]

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000100211 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000022428 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Dunham I, Shimizu N, Roe BA, Chissoe S, Hunt AR, Collins JE, Bruskiewich R, Beare DM, Clamp M, Smink LJ, Ainscough R, Almeida JP, Babbage A, Bagguley C, Bailey J, Barlow K, Bates KN, Beasley O, Bird CP, Blakey S, Bridgeman AM, Buck D, Burgess J, Burrill WD, O'Brien KP (декабрь 1999 г.). "Последовательность ДНК человеческой хромосомы 22". Nature . 402 (6761): 489–95. Bibcode :1999Natur.402..489D. doi : 10.1038/990031 . PMID 10591208.
^ Хидака С., Кёнекке В., Остен Л., Вицгалл Р. (август 2004 г.). «PIGEA-14, новый спирально-спиральный белок, влияющий на внутриклеточное распределение полицистина-2». J Biol Chem . 279 (33): 35009–16. doi : 10.1074/jbc.M314206200 . PMID 15194699.
^ ab "Ген Entrez: гомолог 1 CBY1 chibby (дрозофила)".
^ Takemaru K, Yamaguchi S, Lee YS, Zhang Y, Carthew RW, Moon RT (апрель 2003 г.). «Chibby, ядерный бета-катенин-ассоциированный антагонист пути Wnt/Wingless». Nature . 422 (6934): 905–9. Bibcode :2003Natur.422..905T. doi :10.1038/nature01570. PMID 12712206. S2CID 4418716.
^ Li FQ, Chen X, Fisher C, Siller SS, Zelikman K, Kuriyama R, Takemaru KI (ноябрь 2016 г.). «BAR-содержащие белки FAM92 взаимодействуют с Chibby1 для облегчения цилиогенеза». Молекулярная и клеточная биология . 36 (21): 2668–2680. doi :10.1128/MCB.00160-16. PMC 5064215. PMID 27528616 .

Внешние ссылки

Расположение генома человека CBY1 и страница с подробностями гена CBY1 в браузере геномов UCSC .

Дальнейшее чтение

Виманн С., Вейль Б., Велленройтер Р., Гассенхубер Дж., Глассль С., Ансорж В., Бёхер М., Блёкер Х., Бауэрсакс С., Блюм Х., Лаубер Дж., Дюстерхёфт А., Бейер А., Кёрер К., Штрак Н., Мьюс Х.В., Оттенвальдер Б. , Обермайер Б, Тампе Дж, Хойбнер Д, Вамбутт Р, Корн Б., Кляйн М., Пустка А. (2001). «К каталогу человеческих генов и белков: секвенирование и анализ 500 новых кДНК человека, кодирующих полные белки». Геном Рез . 11 (3): 422–35. дои : 10.1101/гр.GR1547R. ПМК 311072 . PMID 11230166.
Suzuki Y, Tsunoda T, Sese J, Taira H, Mizushima-Sugano J, Hata H, Ota T, Isogai T, Tanaka T, Nakamura Y, Suyama A, Sakaki Y, Morishita S, Okubo K, Sugano S (2001). «Идентификация и характеристика потенциальных промоторных регионов 1031 вида человеческих генов». Genome Res . 11 (5): 677–84. doi :10.1101/gr.gr-1640r. PMC 311086. PMID 11337467 .
Collins JE, Goward ME, Cole CG, Smink LJ, Huckle EJ, Knowles S, Bye JM, Beare DM, Dunham I (2003). «Повторная оценка аннотации генов человека: анализ второго поколения хромосомы 22». Genome Res . 13 (1): 27–36. doi :10.1101/gr.695703. PMC 430954. PMID 12529303 .
Takemaru K, Yamaguchi S, Lee YS, Zhang Y, Carthew RW, Moon RT (2003). «Chibby, ядерный бета-катенин-ассоциированный антагонист пути Wnt/Wingless». Nature . 422 (6934): 905–9. Bibcode :2003Natur.422..905T. doi :10.1038/nature01570. PMID 12712206. S2CID 4418716.
Gad S, Teboul D, Lièvre A, Goasguen N, Berger A, Beaune P, Laurent-Puig P (2004). «Вовлечен ли ген, кодирующий Chibby, в качестве супрессора опухолей при колоректальном раке?». BMC Cancer . 4 : 31. doi : 10.1186/1471-2407-4-31 . PMC 471554. PMID 15245581 .
Collins JE, Wright CL, Edwards CA, Davis MP, Grinham JA, Cole CG, Goward ME, Aguado B, Mallya M, Mokrab Y, Huckle EJ, Beare DM, Dunham I (2005). "Подход к клонированию человеческого ORFeome на основе аннотации генома". Genome Biol . 5 (10): R84. doi : 10.1186/gb-2004-5-10-r84 . PMC 545604. PMID 15461802 .
Schuierer MM, Graf E, Takemaru K, Dietmaier W, Bosserhoff AK (2006). «Сниженная экспрессия ингибитора бета-катенина Chibby в клеточных линиях карциномы толстой кишки». World J. Gastroenterol . 12 (10): 1529–35. doi : 10.3748/wjg.v12.i10.1529 . PMC 4124284. PMID 16570344 .
Lim J, Hao T, Shaw C, Patel AJ, Szabó G, Rual JF, Fisk CJ, Li N, Smolyar A, Hill DE, Barabási AL, Vidal M, Zoghbi HY (2006). "Сеть взаимодействия белок-белок при наследственных атаксиях человека и расстройствах дегенерации клеток Пуркинье". Cell . 125 (4): 801–14. doi : 10.1016/j.cell.2006.03.032 . PMID 16713569.
Li FQ, Singh AM, Mofunanya A, Love D, Terada N, Moon RT, Takemaru K (2007). «Chibby способствует дифференциации адипоцитов посредством ингибирования сигнализации β-катенина». Mol. Cell. Biol . 27 (12): 4347–54. doi :10.1128/MCB.01640-06. PMC 1900052. PMID 17403895 .

Эта статья о гене на 22-й хромосоме человека — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000100211 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000022428 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid10591208-5] Dunham I, Shimizu N, Roe BA, Chissoe S, Hunt AR, Collins JE, Bruskiewich R, Beare DM, Clamp M, Smink LJ, Ainscough R, Almeida JP, Babbage A, Bagguley C, Bailey J, Barlow K, Bates KN, Beasley O, Bird CP, Blakey S, Bridgeman AM, Buck D, Burgess J, Burrill WD, O'Brien KP (декабрь 1999 г.). "Последовательность ДНК человеческой хромосомы 22". Nature . 402 (6761): 489–95. Bibcode :1999Natur.402..489D. doi : 10.1038/990031 . PMID 10591208.

[pmid15194699-6] Хидака С., Кёнекке В., Остен Л., Вицгалл Р. (август 2004 г.). «PIGEA-14, новый спирально-спиральный белок, влияющий на внутриклеточное распределение полицистина-2». J Biol Chem . 279 (33): 35009–16. doi : 10.1074/jbc.M314206200 . PMID 15194699.

[entrez-7] "Ген Entrez: гомолог 1 CBY1 chibby (дрозофила)".

[pmid12712206-8] Takemaru K, Yamaguchi S, Lee YS, Zhang Y, Carthew RW, Moon RT (апрель 2003 г.). «Chibby, ядерный бета-катенин-ассоциированный антагонист пути Wnt/Wingless». Nature . 422 (6934): 905–9. Bibcode :2003Natur.422..905T. doi :10.1038/nature01570. PMID 12712206. S2CID 4418716.

[pmid27528616-9] Li FQ, Chen X, Fisher C, Siller SS, Zelikman K, Kuriyama R, Takemaru KI (ноябрь 2016 г.). «BAR-содержащие белки FAM92 взаимодействуют с Chibby1 для облегчения цилиогенеза». Молекулярная и клеточная биология . 36 (21): 2668–2680. doi :10.1128/MCB.00160-16. PMC 5064215. PMID 27528616 .