Центры биоинформатических ресурсов
Центры биоинформатики ( BRC ) представляют собой группу из пяти исследовательских центров на базе Интернета , созданных в 2004 году и финансируемых NIAID ( Национальным институтом аллергии и инфекционных заболеваний ). [1] BRC были сформированы в ответ на угрозы, создаваемые новыми и повторно появляющимися патогенами , в частности, патогенами категорий A, B и C Центров по контролю и профилактике заболеваний (CDC), [2] и их потенциальным использованием в биотерроризме . Целью NIAID при финансировании этих биоинформатических центров является оказание помощи исследователям, занимающимся экспериментальной характеристикой таких патогенов и созданием лекарств , вакцин или диагностических инструментов для борьбы с ними.
Основными целями BRC являются:
1) Создать комплексные базы данных надежных, актуальных биоинформационных данных ( генетических , протеомных , биохимических или микробиологических ), связанных с интересующими патогенами;
2) Предоставить исследователям легкий доступ к этим данным с помощью пользовательских интерфейсов поиска и извлечения данных в Интернете ;
3) Предоставить исследователям соответствующие современные вычислительные инструменты для биоинформатического анализа этих данных.
В настоящее время заключено два контракта BRC: один по бактериям и вирусам, а другой по переносчикам, эукариотическим простейшим и грибковым патогенам, а также реакции хозяина на патогенные инфекции.
| Имя | Имя Акроно | Организация(и)-спонсор(ы) | Охваченные организмы | Примеры организмов (категория CDC) |
|---|---|---|---|---|
| Информационные ресурсы по эукариотическим патогенам, векторам и хозяевам | VEuPathDB | Университет Пенсильвании Университет Нотр-Дам | Все соответствующие патогенные простейшие, грибы, переносчики патогенов и выбранные организмы-хозяева. Кроме того, важные непатогенные организмы включены для филогенетических выводов. | Критидия (Другое) Cryptosporidium (B) |
| Центр ресурсов бактериальной и вирусной биоинформатики | BV-BRC | Институт Дж. Крейга Вентера | Все патогенные бактерии и вирусы | Вирус гриппа (С) Arenaviridae (A) |
Смотрите также
- Национальные институты здравоохранения
- Национальный институт аллергии и инфекционных заболеваний
- Биоинформатика
- Категории биологических агентов
Ссылки
- ↑ Обзор, Центры ресурсов биоинформатики. Архивировано 15 мая 2008 г., в Wayback Machine , Национальный институт аллергии и инфекционных заболеваний (NIAID), 10 января 2008 г.
- ^ Биотеррористические агенты и заболевания CDC (по категориям). Архивировано 22 июля 2014 г. на Wayback Machine , Центры по контролю и профилактике заболеваний (Департамент здравоохранения и социальных служб), дата обращения 8 июля 2008 г.
Внешние ссылки
- Домашняя страница NIAID
- Центры биоинформатических ресурсов Страница NIAID, описывающая цели и деятельность BRC
- VEuPathDB Информационные ресурсы по эукариотическим патогенам, векторам и хозяевам
- Центр ресурсов бактериальной и вирусной биоинформатики BV-BRC
