домен bZIP
| фактор транскрипции bZIP | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 CREB (вверху) — фактор транскрипции , способный связывать ДНК через домен bZIP (внизу) и регулировать экспрессию генов . | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | bZIP_1 | ||||||||
| Пфам | ПФ00170 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR011616 | ||||||||
| ПРОСИТ | PDOC00036 | ||||||||
| СКОП2 | 1ysa / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
| CDD | cd14686 | ||||||||
| Мембранома | 235 | ||||||||
| |||||||||
Домен базовой лейциновой молнии ( домен bZIP ) обнаружен во многих ДНК- связывающих эукариотических белках. Одна часть домена содержит область, которая опосредует свойства связывания ДНК, специфичные для последовательности, и лейциновую молнию , которая необходима для удержания вместе (димеризации) двух ДНК-связывающих областей. ДНК-связывающая область включает ряд основных аминокислот, таких как аргинин и лизин . Белки, содержащие этот домен, являются факторами транскрипции . [1] [2]
факторы транскрипции bZIP
Факторы транскрипции bZIP обнаружены у всех эукариот и образуют одно из крупнейших семейств димеризующихся ТФ. [3] Эволюционное исследование 2008 года показало, что 4 гена bZIP кодируются геномом самого последнего общего предка всех растений. [4] Взаимодействия между факторами транскрипции bZIP многочисленны и сложны [5] [6] [3] и играют важную роль в развитии рака [7] в эпителиальных тканях, синтезе стероидных гормонов клетками эндокринных тканей, [8] факторах, влияющих на репродуктивные функции, [9] и ряде других явлений, которые влияют на здоровье человека.
Домен bZIP, содержащий белки
- Гетеродимер AP-1 fos / jun , который образует фактор транскрипции
- Фактор транскрипции Jun-B
- CREB cAMP ответ элемент транскрипционный фактор
- Фактор транскрипции OPAQUE2 (O2) гена зеина 22 кДа, кодирующего класс запасных белков в эндосперме зерен кукурузы ( Zea mays )
- NFE2L2 или Nrf2
- Факторы транскрипции Bzip Maf
Белки человека, содержащие этот домен
АТФ1 ; АТФ2 ; АТФ4 ; АТФ5 ; АТФ6 ; АТФ7 ; БАХ1 ; БАХ2 ; БАТФ ; БАТФ2 ; СЕБПА ; ЦЕБПБ ; ЦЕБПД ; ЦЕБПЭ ; ЦЕБПГ ; ЦЭБПЗ ; КРЕБ1 ; CREB3 ; CREB3L1 ; CREB3L2; CREB3L3; CREB3L4; CREB5 ; КРЕБЛ1 ; КРЕМ ; Е4BP4 ; ФОСЛ1 ; ФОСЛ2 ; ИЮНЬ ; ДЖУНБ ; ЮНД ; МАФА ; МАФБ ; МАФФ ; МАФГ ; НРЛ; С-МАФ ; МАФК ; НФЕ2 ; НФЕ2L2 ; НФЕ2L3 ; СНФТ; ХВР1
Ссылки
- ^ Элленбергер Т. (1994). «Получение контроля над распознаванием ДНК: структуры основной области лейциновой молнии и основной области спираль-петля-спираль ДНК-связывающих доменов». Curr. Opin. Struct. Biol . 4 (1): 12– 21. doi :10.1016/S0959-440X(94)90054-X.
- ^ Hurst HC (1995). "Транскрипционные факторы 1: белки bZIP". Профиль белка . 2 (2): 101–68 . PMID 7780801.
- ^ ab Амуциас, Григорис Д.; Робертсон, Дэвид Л.; Ван де Пир, Ив; Оливер, Стивен Г. (2008-05-01). «Выбирайте своих партнеров: димеризация в эукариотических факторах транскрипции». Тенденции в биохимических науках . 33 (5): 220– 229. doi :10.1016/j.tibs.2008.02.002. ISSN 0968-0004. PMID 18406148.
- ^ Corrêa LG, Riaño-Pachón DM, Schrago CG, dos Santos RV, Mueller-Roeber B, Vincentz M (2008). Shiu SH (ред.). "Роль факторов транскрипции bZIP в эволюции зеленых растений: адаптивные особенности, возникающие из четырех генов-основателей". PLOS ONE . 3 (8): e2944. Bibcode : 2008PLoSO...3.2944C. doi : 10.1371 /journal.pone.0002944 . PMC 2492810. PMID 18698409.
- ^ Винсон, Чарльз; Ачарья, Аша; Тапаровски, Элизабет Дж. (2006-01-01). «Расшифровка взаимодействий факторов транскрипции B-ZIP in vitro и in vivo». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Структура и экспрессия генов . 1759 ( 1– 2): 4– 12. doi :10.1016/j.bbaexp.2005.12.005. ISSN 0006-3002. PMID 16580748.
- ^ Ньюман, Джон RS; Китинг, Эми Э. (2003-06-27). «Комплексная идентификация взаимодействий человеческого bZIP с массивами спиральных катушек». Science . 300 (5628): 2097– 2101. Bibcode :2003Sci...300.2097N. doi : 10.1126/science.1084648 . ISSN 1095-9203. PMID 12805554. S2CID 36715183.
- ^ Влахопулос С.А., Логотети С., Микас Д., Гиарика А., Горгулис В., Зумпурлис В. (апрель 2008 г.). «Роль АТФ-2 в онкогенезе». Биоэссе . 30 (4): 314–27 . doi :10.1002/bies.20734. PMID 18348191. S2CID 678541.
- ^ Manna PR, Dyson MT, Eubank DW, Clark BJ, Lalli E, Sassone-Corsi P, Zeleznik AJ, Stocco DM (январь 2002 г.). «Регуляция стероидогенеза и стероидогенного острого регуляторного белка членом семейства белков, связывающих элемент ответа цАМФ». Mol. Endocrinol . 16 (1): 184–99 . doi : 10.1210/mend.16.1.0759 . PMID 11773448.
- ^ Hoare S, Copland JA, Wood TG, Jeng YJ, Izban MG, Soloff MS (май 1999). «Идентификация сайта связывания GABP alpha/beta, участвующего в индукции экспрессии гена рецептора окситоцина в клетках молочной железы человека, потенцирование c-Fos/c-Jun». Эндокринология . 140 (5): 2268–79 . doi : 10.1210/endo.140.5.6710 . PMID 10218980.
Внешние ссылки
- Запись домена bZIP в базе данных SMART
- Семейство bZIP в PlantTFDB: База данных факторов транскрипции растений
- Факторы транскрипции bZIP растений Архивировано 20.03.2012 на Wayback Machine
