Авайс Хан (генетик растений)
Пакистанско-американский генетик растений

Авайс Хан
Рожденный1977 (47–48 лет)
Палландри , Азад Джамму и Кашмир , Пакистан
Альма-матерУниверситет Георга-Августа, Гёттинген , Германия
Швейцарский федеральный технологический институт (ETH) , Цюрих , Швейцария
ИзвестныйГенетика растений ,
Геномика растений ,
Улучшение сельскохозяйственных культур ,
Генетика и геномика яблок
Научная карьера
ПоляСельское хозяйство
УчрежденияМеждународный центр картофеля (CIP)
Корнелльский университет

Авайс Хан (родился в 1977 году) — пакистано-американский генетик растений и доцент Колледжа сельского хозяйства и наук о жизни Корнелльского университета . [1] [2]

Его исследования сосредоточены на генетике устойчивости к болезням у яблок , [1] улучшении сельскохозяйственных культур, устойчивом сельском хозяйстве и продовольственной безопасности. [2] До того, как занять эту должность, он руководил глобальной исследовательской программой по генетике адаптации и устойчивости к абиотическому стрессу у картофеля и батата в Международном центре картофеля (CIP) , Лима , Перу [3] [4] .

Биография

Хан родился в небольшой деревне под названием Талиан в Палландри , Азад Кашмир (управляемая Пакистаном часть спорного региона Джамму и Кашмир) и был из скромной финансовой семьи. Его начальное образование проходило в «школе таат», где ученики сидели на джутовой циновке (таат) на земле, а также он помогал своим родителям выращивать урожай и скот. [2]

Он получил докторскую степень в Швейцарском федеральном технологическом институте (ETH) в Цюрихе , Швейцария , по бактериальному ожогу яблок , и степень магистра в Университете Георга-Августа в Гёттингене , Германия , а также продолжил исследовательскую работу в Университете Йорка , Великобритания , и Университете Иллинойса, Урбана-Шампейн , США. [1] [2]

Он публиковался в нескольких влиятельных научных журналах, включая Science , Nature Genetics и Genome Research . [5] Его исследования быстрого снижения численности яблонь , бактериального ожога , генетики и геномики яблок также освещались в популярных журналах, включая Science Magazine , The Economist , New York Times и Forbes . [6] [7] [8] [2] В 2022 году доктор Хан стал одним из руководителей исследования и завершил сборку последовательности генома в масштабе хромосом яблок сорта Honeycrisp . [9] [10]

Избранные публикации

  • Тегтмейер Р., Помпили В., Сингх Дж., Мичелетти Д., Сильва Дж. К., Малной М., Хан МА. 2020. Картирование генов-кандидатов выявляет геномные вариации в генах восприимчивости к бактериальному ожогу HIPM и DIPM в зародышевой плазме Malus . Научные отчеты, 10, 16317.
  • Папп Д., Гао Л., Тапа Р., Олмстед Д., Хан МА. 2020. Восприимчивость к парше полевых яблонь разнообразной коллекции зародышевой плазмы Malus определяет потенциальные источники устойчивости для селекции яблонь. CABI Agriculture and Bioscience, в печати .
  • Thapa R, Zhang K, Snavely N, Belongie S, Khan MA. 2020. Набор данных для классификации болезней листьев яблок в рамках проекта «Патология растений 2020». Приложения в растениеводстве, 8 (9), e11390.
  • Сингх Дж., Кобб-Смит Д., Хиггинс Э., Хан МА. 2020. Сравнительная оценка иммуноферментного анализа с латеральным потоком, LAMP и количественной ПЦР для диагностики бактериального ожога в яблоневых садах. Журнал патологии растений, doi : 10.1007/s42161-020-00644-w.
  • Yu M, Singh J, Khan MA, Sundin GW, Zhao Y. 2020. Полная последовательность генома возбудителя бактериального ожога Erwinia amylovora штамма Ea1189. Молекулярные взаимодействия растений и микробов, doi : 10.1094/MPMI-06-20-0158-A.
  • Перейра Г., Геменет Д., Моллинари М., Олуколу Б., Вуд Дж., Диас Ф., Москера В., Грюнеберг В., Хан МА., Буэлл Р., Йенчо К., Зенг З.Б. 2020. Картирование множественных QTL в автополиплоидах: подход модели случайных эффектов с применением в популяции полных сибсов гексаплоидного батата. Генетика, 215 (3), 579-595.
  • Yang HW, Yu M, Liu J, Khan MA, Zhao Y. 2020. Характеристика генов, участвующих в биосинтезе предшественников (p)ppGpp в Erwinia amylovora . Журнал патологии растений, doi : 10.1007/s42161-020-00583-6.
  • Папп Д., Сингх Дж., Гадури Д., Хан М.А. 2020. Новые североамериканские изоляты Venturia inaequalis способны преодолеть устойчивость Malus floribunda 821 к парше яблони. Болезни растений, 104 (3), 649-655.
  • Singh J, Fabrizio J, Desnoues E, Pereira Silva J, Busch W, Khan MA. 2020. Характеристики корневой системы влияют на раннюю восприимчивость к бактериальному ожогу у яблони ( Malus× domestica ). BMC Plant Biology, 19 (1), 1-14.
  • Моллинари М., Олуколу Б., Перейра Г., Хан МА., Геменет Д., Йенчо К. и Зенг З.Б. 2019. Раскрытие наследования гексаплоидного батата с использованием сверхплотного мультилокусного картирования. G3: Гены|Геномы|Генетика, 10 (1), 281-292.
  • Сингх Дж. и Хан МА. 2019. Различные закономерности естественного отбора определяют структуру субпопуляции возбудителя бактериального ожога Erwinia amylovora . Научные отчеты, 9 (1), 1-13.
  • Gemenet D, Pereira G, Boeck D, Wood J, Mollinari M, Olukolu B, Diaz F, Mosquera V, Ssali R, David M, Kitavi M, Burgos G, Zum Felde T, Ghislain M, Carey E, Swanckaert J, Coin L, Fei Z, Hamilton J, Yada B, Yencho C, Zeng ZB, Mwanga R, Khan MA, Gruneberg W, Buell R. 2019. Количественный анализ локусов признаков и дифференциальной экспрессии генов раскрывает генетическую основу отрицательно связанного содержания β-каротина и крахмала в гексаплоидном батате [ Ipomoea batatas (L.) Lam.]. Теоретическая и прикладная генетика, 133, 23-36.
  • Li X, Singh J, Qin M, Li X, Zhang X, Zhang M, Khan MA, Zhang S, Wu J. 2019. Разработка интегрированного массива генотипирования 200K SNP и его применение для генетического картирования, улучшения сборки генома и GWAS у груши (Pyrus) . Журнал биотехнологии растений, 17 (8), 1582-1594.
  • Перейра Силва К.Дж., Сингх Дж., Беднарек Р., Фей З., Хан МА. 2019. Дифференциальные регуляторные реакции генов на заражение бактериальным ожогом у двух сортов яблони ( Malus× domestica ). Horticulture Research, 6 (1), 35.
  • Сингх Дж., Перейра Силва К.Дж., Фукс М. и Хан МА. 2019. Потенциальная роль погоды, почвы и растительных микробных сообществ в быстром упадке яблонь. PloSONE, 14 (3), doi :10.1371/journal.pone.0213293.
  • Ву С, Лау К.Х., Цао Q, Гамильтон Дж.П., Сунь Х., Чжоу С., Эсерман Л., Геменет Д.С., Олуколу Б.А., Ван Х, Крисован Е., Годден Дж., Цзяо К., Ван Икс, Китави Н., Манрике-Карпинтеро Н., Вайланкур Б., Вигерт-Ринингер К., Ян Х, Бао К., Шафф Дж., Кройце Дж., Грюнеберг В., Хан. М.А., Гислен М., Ма Д., Цзян Дж., Мванга Р., Либенс-Мак Дж., Коин Л., Йенчо С., Бьюэлл Р., Фей З. 2018. Последовательности генома двух диплоидных диких родственников культивируемого сладкого картофеля обнаруживают цели для генетического улучшения. Природные коммуникации, 9 (1), 4580.
  • Lau KH, del Rosario Herrera M, Crisovan E, Wu S, Fei Z, Khan MA, Buell CR, Gemenet DC. 2018. Транскриптомный анализ батата в условиях стресса от обезвоживания выявляет гены-кандидаты на устойчивость к засухе. Plant Direct, 2 (10), doi :10.1002/pld3.92.
  • Zhou C, Duarte T, Silvestre R, Rossel G, Mwanga RO, Khan MA, George AW, Fei Z, Yencho GC, Ellis D, Coin LJ. 2018. Взгляд на структуру популяции сортов батата Восточной Африки на основе гибридной сборки хлоропластных геномов. Gates Open Research, 5 (2).
  • Виллордон А., Грегори Дж. К., Лабонте Д., Хан МА, Сельварадж М. 2018. Изменение длины корней батата сортов «Байу Бель» и «Борегард» в ответ на экспериментальный дефицит фосфора и обработку уплотненным слоем. HortScience, 53 (10), 1534-1540.
  • Wu J, Wang Y, Xu J, Korban SS, Fei Z, Tao S, Ming R, Tai S, Khan MA, Postman JD, Gu C. 2018. Диверсификация и независимое одомашнивание азиатских и европейских груш. Геномная биология, 19 (1), 77.
  • Desnoues E, Norelli JL, Aldwinckle HS, Wisniewski ME, Evans KM, Malnoy M, Khan MA. 2018. Идентификация новых штаммоспецифичных и зависящих от окружающей среды минорных QTL, связанных с устойчивостью к бактериальному ожогу у яблок. Plant Molecular Biology Reporter, 36 (2), 247-256.
  • Bai J, Mao J, Yang H, Khan MA, Fan A, Liu S, Zhang J, Wang D, Gao H и Zhang J. 2017. Гены протеинкиназы 2, не ферментирующей сахарозу 1 ( SnRK 2), могут опосредовать стрессовые реакции у картофеля ( Solanum tuberosum L.). BMC Genetics, 18 (1), 41.
  • Ramírez DA, Yactayo W, Rens LR, Rolando JL, Palacios S, De Mendiburu F, Mares V, Barreda C, Loayza H, Monneveux P, Zotarelli L, Khan MA, Quiroz R. 2016. Определение биологических порогов, связанных с водным статусом растений, для мониторинга эффектов ограничения воды: устьичная проводимость и восстановление фотосинтеза как ключевые показатели у картофеля. Управление водными ресурсами в сельском хозяйстве, 177, 369-378.
  • Саравия Д., Фарфан Э., Гутьеррес Р., Мендибуру Ф., Шафлейтнер Р., Боньербале М., Хан МА. 2016. Урожайность и физиологическая реакция картофеля указывают на различные стратегии борьбы со стрессом, вызванным засухой, и азотным удобрением. Американский журнал исследований картофеля, 93 (3), 288-295.
  • Линдквист Кройз Х., Хан МА, Салас Э., Мейялаган С., Томсон С., Гомес Р., Боньербале М. 2015. Форма клубня и изменчивость глубины глазка в диплоидном семействе андского картофеля. BMC Genetics, 16 (1), 57.
  • Хан МА, Олсен КМ, Соверо В, Кушад ММ, Корбан СС. 2014. Качественные признаки плодов могли сыграть решающую роль в одомашнивании яблони. Геном растений, 7 (3), doi :10.3835/plantgenome2014.04.0018.
  • Поттс SM, Хан MA, Хан Y, Кушад MM, Корбан SS. 2014. Идентификация локусов количественных признаков (QTL) для признаков качества плодов у яблони. Plant Molecular Biology Reporter, 32 (1), 109-116.
  • Хан МА, Чжао ЙФ, Корбан СС. 2013. Идентификация генетических локусов, связанных с устойчивостью к бактериальному ожогу у Malus, путем комбинированного использования QTL и картирования ассоциаций. Physiologia Plantarum, 148 (3), 344-53.
  • Ву Дж, Ван З, Ши З, Чжан С, Мин Р, З Шилин, Хан М. А., Тао С, Корбан СС, Ван Х, Чен Н. Дж., Нишио Т, ​​Сюй X, Цун Л, Ци К, Хуан И, Ван Ю, Чжао X, Ву Дж, Дэн С, Гоу С, Чжоу В, Инь Х, Цинь Г, Ша И, Тао Ю, Чэнь Х, Ян Ю, Сун Ю, Чжань D, Ван Дж, Ли Л, Дай М, Гу С, Ван Ю, Ши Д, Ван Х, Чжан Х, Цзэн Л, Чжэн Д, Ван С, Чен М, Ван Г, Се Л, Соверо В, Ша С, Хуан В, Чжан С, Чжан М, Сунь Дж, Сюй Л, Ли Ю, Лю X, Ли Q, Шэнь Дж, Ван Дж, Полл РЭ, Беннетцен Дж. Л., Ван Дж, Чжан С. 2012. Геном груши ( Pyrus bretschneideri Rehd.). Genome Research, 23 (2), 396-408.
  • Хан МА, Хан Й, Чжао ЙФ, Троджио М, Корбан СС. 2012. Генетическая карта консенсуса нескольких популяций выявляет непоследовательный порядок маркеров среди карт, вероятно, приписываемый структурным вариациям в геноме яблони. PloSONE, 7 (11), doi :10.1371/journal.pone.0047864.
  • Chen Jun, Khan MA, Qiu WM, Li J, Zhou H, Zhang Q, Guo W, Zhu T, Peng J, Sun F, Li S, Korban SS, Han Y. 2012. Диверсификация генов, кодирующих синтазу крахмала, связанного с гранулами (GBSS), у однодольных и двудольных растений отмечена множественными событиями дупликации по всему геному. PloSONE, 7 (1), doi :10.1371/journal.pone.0030088.
  • Хан МА, Хан Й, Корбан СС. 2012. Высокопроизводительный анализ генотипирования SNP яблок с использованием платформы GoldenGateTM. GENE (Elsevier), 494, 196-201.
  • Potts SM., Han Y, Khan MA, Kushad MM, Rayburn AL и Korban SS. 2011. Генетическое разнообразие и характеристика основной коллекции зародышевой плазмы Malus с использованием простых повторов последовательностей (SSR). Plant Molecular Biology Reporter, 30 (4), 827-837.
  • Han Y, Zheng D, Vimolmangkang S, Khan MA, Beever JE, Korban SS. 2011. Интеграция физических и генетических карт в яблоне подтверждает полногеномные и сегментные дупликации в геноме яблони. Журнал экспериментальной ботаники, 62 (14), 5117-5130.
  • Graham IA, Besser K, Blumer S, Branigan CA, Czechowski T, Elias L, Guterman I, Harvey D, Isaac PG, Khan MA, Larson TR, Li Y, Owens S, Pawson T, Penfield T, Rae AM, Rathbone DA, Ross J, Smallwood MF, Segura V, Townsend T, Vyas D, Winzer T и Bowles D. 2010. Генетическая карта Artemisia annua L. идентифицирует множественные локусы, влияющие на урожайность противомалярийного препарата артемизинина, Science, 327, 328-331.
  • Le Roux PM, Khan MA, Duffy B, Patocchi A, Broggini GAL и Gessler C. 2010. Количественное картирование локусов признаков устойчивости к бактериальному ожогу у сортов яблони «Florina» и «NovaEasygro». Геном, 53, 710-722.
  • Хан MA, Дюрел CE, Даффи B, Друэ D, Келлерхалс M, Гесслер C и Патокки A. 2008. Идентификация и валидация QTL, связанных с устойчивостью к бактериальному ожогу у Malus , и их применимость в селекции с использованием маркеров. Двенадцатый (12-й) симпозиум EUCARPIA по селекции и генетике плодовых культур. Acta Horticulture (ISHS), 814, 753-758.
  • Хан МА, Дюрел CE, Даффи Б, Друэ Д, Келлерхалс М, Гесслер К и Патокки А. 2007. Разработка молекулярных маркеров, связанных с группой сцепления 7 «Фиеста» основного QTL для устойчивости к бактериальному ожогу, и их применение для селекции с помощью маркеров. Геном, 50, 568-577.
  • Хан МА, Даффи Б, Гесслер К и Патокки А. 2006. Картирование QTL устойчивости к бактериальному ожогу у яблони. Молекулярная селекция, 17, 299-306.

Источник: [5]

Источники

  • Страница сотрудников Корнелльского университета
  • Статья в Форбс

Ссылки

  1. ^ abc "Awais Khan". CALS . 13 октября 2022 г. Получено 20 февраля 2023 г.
  2. ^ abcde Уайт, Эндрю. «Миссия этого исследователя — помочь фермерам найти более выносливую яблоко». Forbes . Получено 20 февраля 2023 г.
  3. ^ admin (6 июля 2015 г.). «CIP сотрудничает с NC State, Others in Gates Foundation-Funded attempt to acceleration Improvement OFSP». Международный центр картофеля . Получено 20 февраля 2023 г.
  4. ^ admin (17 июня 2016 г.). "ИССЛЕДОВАНИЯ ЗАСУХОУСТОЙЧИВОГО КАРТОФЕЛЯ В РАМКАХ CIP СООТВЕТСТВУЮТ С НАБЛЮДЕНИЯМИ ООН ПО БОРЬБЕ С ОПУСТЫНИВАНИЕМ". Международный центр картофеля . Получено 20 февраля 2023 г.
  5. ^ аб "Авайс Хан". ученый.google.com . Проверено 20 февраля 2023 г.
  6. ^ «Что-то стремительно убивает молодые яблони в североамериканских садах. Ученые в тупике». www.science.org . Получено 20 февраля 2023 г. .
  7. ^ «Молодые яблони умирают, и никто не понимает, почему». The Economist . ISSN  0013-0613 . Получено 20 февраля 2023 г.
  8. ^ Роббинс, Джим (2 декабря 2019 г.). «Огненный ожог распространяется на север, угрожая яблоневым садам». The New York Times . ISSN  0362-4331 . Получено 20 февраля 2023 г.
  9. ^ «Геном Honeycrisp поможет ученым вывести лучшие яблоки». CALS . 13 октября 2022 г. Получено 20 февраля 2023 г.
  10. ^ «Ученые Корнелла строят более сильное яблоко». RochesterFirst . 19 октября 2022 г. Получено 20 февраля 2023 г.
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Авайс_Хан_(генетик_растений)&oldid=1220316204"