Антисмысловая РНК AsponA

Антисмысловая РНК AsponA
Антисмысловая РНК AsponA
	Предсказанная вторичная структура и сохранение последовательности антисмысловой РНК AsponA
Идентификаторы
Рфам	РФ02812
Другие данные
Домены	Бактерии
ИДТИ	GO:0046677
ТАК	SO:0000077,SO:0000370
Структуры PDB	ПДБе

РНК-семейство

AsponA — это небольшая транскрибированная антисмысловая asRNA к гену пенициллин-связывающего белка 1A, называемому ponA. Она была идентифицирована с помощью РНК-секвенирования, а ее экспрессия была подтверждена экспериментами 5' и 3' RACE на Pseudomanas aeruginosa . Экспрессия AsponA повышалась или понижалась при различном антибиотиковом стрессе. Благодаря своему расположению она может предотвращать транскрипцию или трансляцию противоположного гена. ^[1] Исследование Wurtzel et al. и Ferrara et al. также выявило ее экспрессию. ^[2]^[3]

Смотрите также

Ссылки

^ Gómez-Lozano M, Marvig RL, Tulstrup MV, Molin S (сентябрь 2014 г.). «Экспрессия антисмысловых малых РНК в ответ на стресс у Pseudomonas aeruginosa». BMC Genomics . 15 (1): 783. doi : 10.1186/1471-2164-15-783 . PMC 4180829 . PMID 25213728.
^ Wurtzel O, Yoder-Himes DR, Han K, Dandekar AA, Edelheit S, Greenberg EP, Sorek R, Lory S (сентябрь 2012 г.). "Транскриптом с разрешением по одному нуклеотиду Pseudomonas aeruginosa, выращенной при температуре тела". PLOS Pathogens . 8 (9): e1002945. doi : 10.1371/journal.ppat.1002945 . PMC 3460626. PMID 23028334 .
^ Ferrara S, Brugnoli M, De Bonis A, Righetti F, Delvillani F, Dehò G, Horner D, Briani F, Bertoni G (2012). "Сравнительное профилирование штаммов Pseudomonas aeruginosa выявляет дифференциальную экспрессию новых уникальных и консервативных малых РНК". PLOS ONE . 7 (5): e36553. Bibcode :2012PLoSO...736553F. doi : 10.1371/journal.pone.0036553 . PMC 3349714 . PMID 22590564.

[1] Gómez-Lozano M, Marvig RL, Tulstrup MV, Molin S (сентябрь 2014 г.). «Экспрессия антисмысловых малых РНК в ответ на стресс у Pseudomonas aeruginosa». BMC Genomics . 15 (1): 783. doi : 10.1186/1471-2164-15-783 . PMC 4180829 . PMID 25213728.

[2] Wurtzel O, Yoder-Himes DR, Han K, Dandekar AA, Edelheit S, Greenberg EP, Sorek R, Lory S (сентябрь 2012 г.). "Транскриптом с разрешением по одному нуклеотиду Pseudomonas aeruginosa, выращенной при температуре тела". PLOS Pathogens . 8 (9): e1002945. doi : 10.1371/journal.ppat.1002945 . PMC 3460626. PMID 23028334 .

[3] Ferrara S, Brugnoli M, De Bonis A, Righetti F, Delvillani F, Dehò G, Horner D, Briani F, Bertoni G (2012). "Сравнительное профилирование штаммов Pseudomonas aeruginosa выявляет дифференциальную экспрессию новых уникальных и консервативных малых РНК". PLOS ONE . 7 (5): e36553. Bibcode :2012PLoSO...736553F. doi : 10.1371/journal.pone.0036553 . PMC 3349714 . PMID 22590564.