Энтони Джон Уильямс
Британский химик

Энтони Уильямс
Рожденный
Энтони Джон Уильямс

Сент-Асаф , Денбишир , Уэльс
Национальностьбританский
Альма-матер
Известный
НаградыПремия Джима Грея в области электронной науки (2012)
Научная карьера
Поля
Учреждения
ТезисИсследования ЯМР высокого давления и релаксации систем алкильных цепей  (1988)
научный руководительДункан Г. Джиллис [ необходима ссылка ]
голос Уильяма
записано в декабре 2014 г.
Веб-сайтwww.chemconnector.com

Энтони Джон Уильямс — британский химик и эксперт в области спектроскопии ядерного магнитного резонанса (ЯМР) и хемоинформатики в Агентстве по охране окружающей среды США . [2] [3] Он является основателем веб-сайта ChemSpider , который был куплен Королевским химическим обществом в мае 2009 года. Он научный блоггер [4] и автор. [5] [6] [7] [8] [9] [10] [11]

Ранняя жизнь и образование

Энтони Уильямс родился в Сент-Асафе , Уэльс , в июне 1964 года в семье Эрнеста Эдварда Уильямса, владельца строительной подрядной фирмы, и Эйрлис Элизабет Уильямс. У него есть старшая сестра Рэй. Он вырос в небольшой деревне недалеко от Кэрвиса .

До 1975 года Уильямс посещал начальную школу в Холиуэлле и Наннерхе. С одиннадцати лет он посещал школу Алан , где получил аттестат зрелости по математике , географии и химии .

Уильямс получил степень бакалавра наук по химии в Ливерпульском университете в 1985 году, защитив диссертацию на тему «Спектроскопические исследования систем, связанных с витамином Е », в которой он применил как электронный парамагнитный резонанс (ЭПР), так и спектроскопию ядерного магнитного резонанса (ЯМР) для изучения молекул, сходных по структуре с витамином Е.

Уильямс получил докторскую степень по химии, финансируемую Royal Dutch Shell , в Royal Holloway, University of London в 1988 году и написал диссертацию под названием «Исследования ЯМР высокого давления и релаксации систем алкильных цепей». [12] За эту работу он получил медаль Борна от London University и разработал унифицированную теорию моделирования данных релаксации ЯМР для изучения молекулярных движений алкильных цепей. [13] Он также использовал химический сдвиг ЯМР кобальта-59 для гексацианида кобальта (III) в качестве зонда как температуры, так и давления. [14] Во время обучения в докторской степени он проявил интерес к персональным компьютерам и написал программы для подгонки данных релаксации ЯМР.

Уильямс продолжил свою работу в области спектроскопии в Национальном исследовательском совете (Канада), используя спектроскопию ЭПР для проведения исследований монокристаллов металлоорганических соединений.

Карьера

В 1991 году Уильямс присоединился к Оттавскому университету в качестве менеджера по ЯМР-установкам. Он продолжил свои личные интересы в области многоядерного ЯМР, чтобы провести эксперименты 2D-ЯМР , изучающие обмен селена в смешанных галогенных системах. [15] Он также провел исследования ЯМР кремния-29 и теллура-125 .

В 1992 году Уильямс уехал из Канады в Рочестер, штат Нью-Йорк , чтобы работать в компании Eastman Kodak Company в качестве руководителя по технологиям ЯМР. В Kodak он использовал свой предыдущий опыт в изучении систем, связанных с алкильными цепями, для изучения мицелл . [16] Он участвовал в раннем внедрении жидкостной хроматографии - ЯМР в компании и в разработке лаборатории открытого доступа для химиков, чтобы использовать роботизированные аналитические приборы для генерации данных. В Kodak он был частью команды из трех человек, которая разработала веб- систему управления лабораторной информацией (LIMS), называемую WIMS, [17] веб-систему управления информацией, и это была первая веб-система LIMS в мире для управления химическими структурами и спектральными данными. Он получил два патента, работая в Kodak, [18] [19]

В 1997 году он начал работать в канадской начинающей компании Advanced Chemistry Development (ACD/Labs) в качестве старшего менеджера по продуктам. Он отвечал за управление всеми спектроскопическими , структурными чертежами и номенклатурой IUPAC [ 20] [21] . Находясь на этой должности, программное обеспечение для управления аналитическими данными было расширено и теперь включает поддержку масс-спектрометрии , инфракрасной спектроскопии , УФ-видимой спектроскопии , хроматографии и других форм аналитических наук. В то время его исследовательские интересы включали разработку алгоритмов для прогнозирования ЯМР ( [22] и [23] ) и, в частности, разработку программных подходов к компьютерному выяснению структуры , так называемых систем CASE. [24] [25] [26] [27] [28] [29] Инструменты CASE использовались для пересмотра структуры, при этом было продемонстрировано, что алгоритмы превосходят интерпретацию спектральных данных человеком. [30] Работая в ACD/Labs, Уильямс принимал участие в ряде новаторских проектов в отрасли [ необходима ссылка ], в том числе

  1. создание химического словаря на Palm Computer и Pocket PC, [31]
  2. работая с Гэри Э. Мартином и другими коллегами над разработкой новых методов обработки ЯМР с использованием подходов, основанных на ковариации , [32] [33] [34] [35]
  3. введение подходов на основе нечеткой логики для компьютерного выяснения структуры и 4) подходов для автоматизированной проверки структуры. [36]

Работая в компании, он инициировал хобби-проект по объединению баз данных по химии в Интернете. Этот проект назывался ChemSpider . ChemSpider был официально анонсирован на встрече ACS в Чикаго в марте 2007 года с базой данных, содержащей более 10 миллионов соединений, полученных из PubChem . В 2007 году, когда он ушел из ACD/Labs, он был главным научным сотрудником. Он стал независимым консультантом, работающим с рядом компаний-разработчиков программного обеспечения в области химинформатики, таких как SimBioSys , и с исследовательскими организациями для поддержки их усилий в области химинформатики. Параллельно он продолжал разрабатывать платформу ChemSpider с небольшой группой единомышленников, заинтересованных в разработке веб-систем для обслуживания химиков [37] [38] Сайт представляет собой краудсорсинговое сообщество для химиков, в котором химики размещают свои коллекции структур, спектральные данные и молекулярные свойства. Уильямс сосредоточен на обучении сообщества вопросам качества данных, связанных с базами данных по химии в Интернете. [39] [40]

В мае 2009 года Королевское химическое общество объявило о приобретении ChemSpider. [41] Уильямс присоединился к RSC в качестве вице-президента по стратегическому развитию ChemSpider.

В мае 2015 года он присоединился к Агентству по охране окружающей среды США , чтобы работать над разработкой веб-сайтов, предоставляющих публичный доступ к данным Агентства по охране окружающей среды [42] и инструментам для масс-спектрометрии . [43]

Уильямс внес свой вклад в мир «мобильной химии» [44], приняв участие в разработке ChemMobi, приложения для iPhone для доступа к миллионам химических соединений и связанным с ними данным.

Уильямс является сторонником Open Notebook Science и судьей Open Notebook Science Challenge . Он работал с Жан-Клодом Брэдли над созданием веб-игры для обучения интерпретации спектральных данных с использованием краудсорсинговых спектроскопических данных, размещенных на ChemSpider . [45]

Открытая научная пропаганда

Уильямс представил журнал открытого доступа ChemSpider Journal of Chemistry, а команда разработчиков предоставила новую технологию онлайн-разметки (ChemMANTIS – Markup And Nomenclature Transformation Integrated System), позволяющую краудсорсинговую разметку терминов, связанных с химией, связанных, где это возможно, с базой данных ChemSpider. Уильямс является судьей Open Notebook Science Challenge . Он продвигает использование открытых данных , в частности спектральных данных, публикуется в журналах открытого доступа и выступает за Open Notebook Science . [46] Уильямс выступает за предоставление доступа к доклиническим данным фармацевтической промышленности в Интернете. [47] [48] [49] Уильямс тесно сотрудничал с Шоном Экинсом , выступая за предоставление сообществу предконкурентных фармацевтических данных. Он также принимал участие в анализе и обзоре открытых фармацевтических данных, предоставленных сообществу. [50] [51] [52]

Уильямс, который сам является давним участником Википедии, открыто ставил под сомнение требования к известности самой Википедии, сравнивая порнозвезд и ученых. [53] [54]

Награды и почести

Уильямс стал обладателем премии Джима Грея в области электронной науки в 2012 году [55] и премии «Выдающийся оратор года» Американского химического общества Северной Каролины в 2016 году. [56]

Ссылки

  1. ^ Уильямс, А. Дж.; Харланд, Л.; Грот, П.; Петтифер, С .; Чичестер, К.; Виллигхаген, Э. Л.; Эвело, КТ; Бломберг, Н.; Экер, Г.; Гобл , К .; Монс, Б. (2012). «Открытые PHACTS: семантическая совместимость для открытия лекарств». Drug Discovery Today . 17 ( 21– 22): 1188– 1198. doi : 10.1016/j.drudis.2012.05.016 . PMID  22683805.
  2. ^ Публикации Энтони Джона Уильямса, проиндексированные Google Scholar
  3. ^ Сотрудники. "2014-BIT-Brochure" (PDF) . 2014 Bio-IT World Expo . Cambridge Healthtech Institute. стр. 3 (столбец 2) . Получено 15 июня 2016 г. Энтони Уильямс, доктор философии, вице-президент по стратегическому развитию; руководитель отдела хемоинформатики Королевского химического общества (RSC)
  4. ^ Сайт ChemConnector
  5. ^ Практическая интерпретация спектров ЯМР P-31 и компьютерная проверка структуры, Луис Куин и Энтони Уильямс, ISBN 978-0-9735913-0-9 
  6. ^ Совместные вычислительные технологии для биомедицинских исследований, Шон Экинс, Мэгги Хапчи и Энтони Уильямс, ISBN 978-0-470-63803-3 
  7. ^ Публикации Энтони Джона Уильямса из Европы PubMed Central
  8. ^ Энтони Уильямс на LinkedIn.com
  9. ^ Профиль Mendeley Уильямса
  10. ^ Блог Энтони Уильямса ChemConnector Архивировано 28 января 2011 г. на Wayback Machine
  11. ^ Публикации Энтони Джона Уильямса, проиндексированные в библиографической базе данных Scopus . (требуется подписка)
  12. ^ Уильямс, Энтони Джон (1988). ЯМР высокого давления и релаксационные исследования алкильных цепных систем (диссертация). Ливерпульский университет.(требуется подписка)
  13. ^ Bratt, PJ; Gillies, DG; Sutcliffe, LH; Williams, AJ (1990). "Исследования релаксации ЯМР внутренних движений: сравнение мицелл и родственных систем". Журнал физической химии . 94 (7): 2727. doi :10.1021/j100370a001.
  14. ^ Gillies, DG; Sutcliffe, LH; Williams, AJ (2002). "Исследование ЯМР-спектроскопии кобальта-59 при переменных температурах и высоких давлениях водного раствора K3\Co(CN)6]". Магнитный резонанс в химии . 40 : 57–64 . doi :10.1002/mrc.955. S2CID  98518973.
  15. ^ Милн, Дж.; Уильямс, А.Дж. (1992). "Обменные процессы в диселеновых и селен-серных дигалогенидах, Se2X2 и SeSX2 (X = Br, Cl). Исследование селена-77 2D-EXSY". Неорганическая химия . 31 (22): 4534. doi :10.1021/ic00048a018.
  16. ^ Анталек, Б.; Уильямс, А.Дж.; Гарсия, Э.; Текстер, Дж. (1994). «ЯМР-анализ переходов интерфейсной структуры, сопровождающих пороговый переход электронного переноса в обратных микроэмульсиях». Langmuir . 10 (12): 4459. doi :10.1021/la00024a014.
  17. ^ Браун, Д.; Уильямс, А.; Маклафлин, Д. (1997). «Система управления информацией на основе Интернета». TrAC Trends in Analytical Chemistry . 16 (7): 370. doi :10.1016/S0165-9936(97)00046-0.
  18. ^ Фотографическая эмульсия с улучшенной скоростью. Патент США 6,040,129
  19. ^ Способ производства дигидропиримидинов, патент США 5,576,432
  20. ^ Уильямс, А.; Йерин, А. (1999). «Необходимость в программных средствах систематического именования для обмена химической информацией». Molecules . 4 (9): 255. doi : 10.3390/40900255 .
  21. ^ Уильямс, А.; Йерин, А. (2008). «Автоматизированная идентификация и преобразование химических названий в структурно-поисковую информацию». Chemical Information Mining. стр. 21. doi :10.1201/9781420076509.pt2 (неактивен 11 ноября 2024 г.). ISBN 978-1-4200-7649-3.{{cite book}}: CS1 maint: DOI неактивен по состоянию на ноябрь 2024 г. ( ссылка )
  22. ^ Уильямс, А. (2000). «Последние достижения в области прогнозирования ЯМР и программного обеспечения для автоматизированного определения структуры». Current Opinion in Drug Discovery & Development . 3 (3): 298–305 . PMID  19649862.
  23. ^ Блинов, КА; Смурный, ЮД; Эляшберг, МЭ; Чуранова, ТС; Кваша, М.; Стейнбек, К.; Лефевр, Б.А.; Уильямс, А.Дж. (2008). «Проверка производительности прогнозирования ЯМР 13С на основе нейронных сетей с использованием общедоступного источника данных». Журнал химической информации и моделирования . 48 (3): 550– 555. doi :10.1021/ci700363r. PMID  18293952.
  24. ^ Эляшберг, ME; Блинов, KA; Молодцов, SG; Уильямс, AJ; Мартин, GE (2007). «Генерация нечеткой структуры: новый эффективный инструмент для компьютерного определения структуры (CASE)». Журнал химической информации и моделирования . 47 (3): 1053– 1066. doi :10.1021/ci600528g. PMID  17385849.
  25. ^ Элиашберг, ME; Уильямс, AJ; Мартин, GE (2008). «Компьютерные инструменты проверки и выяснения структуры в ЯМР-ориентированном выяснении структуры». Прогресс в области ядерно-магнитной резонансной спектроскопии . 53 ( 1– 2): 1– 104. doi :10.1016/j.pnmrs.2007.04.003.
  26. ^ Смурный, YD; Эляшберг, ME; Блинов, KA; Лефевр, BA; Мартин, GE; Уильямс, AJ (2005). "Компьютерное определение относительной стереохимии и трехмерных моделей сложных органических молекул из двумерных спектров ЯМР". Tetrahedron . 61 (42): 9980. doi :10.1016/j.tet.2005.08.022.
  27. ^ Мартин, GE; Хадден, CE; Рассел, DJ; Калузный, BD; Гвидо, JE; Духольке, WK; Стимсма, BA; Таманн, TJ; Крауч, RC; Блинов, K.; Эляшберг, M.; Мартиросян, ER; Молодцов, SG; Уильямс, AJ; Шифф, PL (2002). "Идентификация деградантов сложного алкалоида с использованием технологии криозонда ЯМР и ACD/структурного элюцидатора". Журнал гетероциклической химии . 39 (6): 1241. doi :10.1002/jhet.5570390619.
  28. ^ Блинов, К.; Эляшберг, М.; Мартиросян, Э.Р.; Молодцов, С.Г.; Уильямс, А.Дж.; Таки, А.Н.; Шараф, М.М.Х.; Шифф, П.Л.; Крауч, Р.К.; Мартин, Г.Е.; Хадден, К.Э.; Гвидо, Дж.Э.; Миллс, К.А. (2003). "Квиндолинокриптотакиин: выяснение структуры нового индолохинолинового алкалоида с помощью компьютерного выяснения структуры и двумерного ЯМР". Магнитный резонанс в химии . 41 (8): 577. doi : 10.1002/mrc.1227 .
  29. ^ Эляшберг, ME; Блинов, KA; Мартиросян, ER; Молодцов, SG; Уильямс, AJ; Мартин, GE (2003). «Автоматизированное определение структуры — преимущества симбиотических отношений между спектроскопистом и экспертной системой». Журнал гетероциклической химии . 40 (6): 1017. doi :10.1002/jhet.5570400610.
  30. ^ Эляшберг, М.; Уильямс, А.Дж.; Блинов, К. (2010). «Структурные пересмотры природных продуктов с помощью систем компьютерного определения структуры (CASE)». Natural Product Reports . 27 (9): 1296– 1328. doi :10.1039/C002332a. PMID  20480119. S2CID  37849167.
  31. ^ "Химические базы данных на ладони и в кармане". Архивировано из оригинала 18 декабря 2010 года . Получено 17 февраля 2011 года .
  32. ^ Блинов, КА; Ларин, НИ; Кваша, МП; Мозер, А.; Уильямс, А.Дж.; Мартин, GE (2005). «Анализ и устранение артефактов в косвенных ковариационных спектрах ЯМР с помощью несимметричной обработки». Магнитный резонанс в химии . 43 (12): 999–1007 . doi :10.1002/mrc.1674. PMID  16144032. S2CID  26808858.
  33. ^ Блинов, KA; Уильямс, AJ; Хилтон, BD; Айриш, PA; Мартин, GE (2007). «Использование несимметричных косвенных ковариационных методов ЯМР для получения эквивалента данных HSQC-NOESY». Магнитный резонанс в химии . 45 (7): 544– 546. doi :10.1002/mrc.1998. PMID  17437315. S2CID  46106410.
  34. ^ Мартин, GE; Айриш, PA; Хилтон, BD; Блинов, KA; Уильямс, AJ (2007). «Использование несимметричной косвенной ковариационной обработки для определения сетей связности 15N-13C». Магнитный резонанс в химии . 45 (8): 624– 627. doi :10.1002/mrc.2029. PMID  17563910. S2CID  34281811.
  35. ^ Мартин, GE; Хилтон, BD; Айриш, PA; Блинов, KA; Уильямс, AJ (2007). «Применение методов несимметричного косвенного ковариационного ЯМР для вычисления спектров корреляции 13C↔15N HSQC-IMPEACH и 13C↔15N HMBC-IMPEACH». Магнитный резонанс в химии . 45 (10): 883– 888. doi :10.1002/mrc.2064. PMID  17729230. S2CID  41359162.
  36. ^ Golotvin, SS; Vodopianov, E.; Pol, R.; Lefebvre, BA; Williams, AJ; Rutkowske, RD; Spitzer, TD (2007). "Автоматизированная проверка структуры на основе комбинации спектров 1D1H NMR и 2D1H-13C HSQC". Magnetic Resonance in Chemistry . 45 (10): 803– 813. doi :10.1002/mrc.2034. PMID  17694570. S2CID  25476827.
  37. ^ Пенс, Х. Э.; Уильямс, А. (2010). «ChemSpider: Онлайновый ресурс химической информации». Журнал химического образования . 87 (11): 1123. Bibcode : 2010JChEd..87.1123P. doi : 10.1021/ed100697w.
  38. ^ Публичные базы данных соединений – Как ChemSpider изменил правила, сделав молекулы в Интернете бесплатными, Энтони Дж. Уильямс в Collaborative Computational Technologies for the Life Sciences, под редакцией Шона Экинса, Мэгги AZ Хапчи и Энтони Дж. Уильямса, отправлено для публикации в Wiley
  39. ^ Уильямс, А. (2008). «Перспектива общедоступных/открытого доступа к химическим базам данных». Drug Discovery Today . 13 ( 11– 12): 495– 501. doi :10.1016/j.drudis.2008.03.017. PMID  18549975.
  40. ^ Уильямс, А. Дж.; Экинс, С. (2011). «Предупреждение о качестве и призыв к улучшению курирования общедоступных баз данных по химии». Drug Discovery Today . 16 ( 17– 18): 747– 750. doi : 10.1016/j.drudis.2011.07.007. PMID  21871970.
  41. ^ «выполнять свою стратегическую цель по распространению знаний среди химического сообщества и развитию химических наук»
  42. ^ Персональный профиль EPA
  43. ^ McEachran, AD; Sobus, JR; Williams, AJ (2017). «Идентификация известных неизвестных с использованием панели инструментов CompTox Chemistry Dashboard Агентства по охране окружающей среды США». Аналитическая и биоаналитическая химия . 409 (7): 1729– 1735. doi :10.1007/s00216-016-0139-z. PMID  27987027. S2CID  31754962.
  44. ^ AJ Williams, Мобильная химия – химия в ваших руках и на вашем лице, Chemistry World, май 2010 г.
  45. ^ Брэдли, Дж. К.; Ланкашир, Р. Дж.; Лэнг, А. С. Д.; Уильямс, А. Дж. (2009). «Спектральная игра: использование открытых данных и краудсорсинга для образования». Журнал химинформатики . 1 (1): 9. doi : 10.1186/1758-2946-1-9 . PMC 3225864. PMID  20298527 . 
  46. ^ Брэдли, Дж. К.; Оуэнс, К.; Уильямс, А. (2008). «Химический краудсорсинг и наука открытых блокнотов». Nature Precedings . doi : 10.1038/npre.2008.1505.1 .
  47. ^ Экинс, С.; Уильямс, А.Дж. (2010). «Доконкурентные доклинические данные ADME/Tox: выложите их в сеть, чтобы облегчить построение вычислительной модели и помочь в разработке лекарств». Lab on a Chip . 10 (1): 13– 22. doi : 10.1039/b917760b. PMID  20024044.
  48. ^ AJ Williams, V. Tkachenko, C. Lipinski, A. Tropsha и S. Ekins, Бесплатные онлайн-ресурсы, обеспечивающие краудсорсинг, Drug Discovery World, зима 2009/10, 33-39
  49. ^ Экинс, С.; Уильямс, А.Дж. (2010). «Когда фармацевтические компании публикуют большие наборы данных: изобилие богатств или золото дураков?». Drug Discovery Today . 15 ( 19–20 ): 812–815 . doi :10.1016/j.drudis.2010.08.010. PMID  20732447.
  50. ^ Экинс, С.; Уильямс, А.Дж. (2010). «Когда фармацевтические компании публикуют большие наборы данных: изобилие богатств или золото дураков?». Drug Discovery Today . 15 ( 19–20 ): 812–815 . doi :10.1016/j.drudis.2010.08.010. PMID  20732447.
  51. ^ Экинс, С.; Уильямс, А.Дж. (2010). «Метаанализ молекулярных моделей свойств и фильтрация общедоступных наборов данных по противомалярийным «хитам» и лекарствам». MedChemComm . 1 (5): 325. doi :10.1039/C0MD00129E.
  52. ^ Уильямс, А. Дж.; Харланд, Л.; Грот, П.; Петтифер, С .; Чичестер, К.; Виллигхаген, Э. Л.; Эвело, КТ; Бломберг, Н.; Экер, Г.; Гобл , К .; Монс, Б. (2012). «Открытые PHACTS: семантическая совместимость для открытия лекарств». Drug Discovery Today . 17 ( 21– 22): 1188– 1198. doi : 10.1016/j.drudis.2012.05.016 . PMID  22683805.
  53. ^ "» Почему порнозвезды более известны, чем ученые в Википедии? Блог ChemConnector".
  54. ^ "Почему порнозвезды более заметны, чем ученые в Википедии? | Wikimedian in Residence". Архивировано из оригинала 28 марта 2012 года . Получено 8 декабря 2011 года .
  55. ^ Премия Джима Грея в области электронной науки, Энтони Уильямс
  56. ^ Премия «Выдающийся оратор года» от NC ACS, Энтони Уильямс
  • Официальный сайт
  • Энтони Джон Уильямс в Twitter
В Scholia есть профиль Энтони Джона Уильямса (Q4777220).
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Энтони_Джон_Уильямс&oldid=1271920143"