Мотив РНК анти-hemB
| анти-гемБ | |
|---|---|
 Консенсусная вторичная структура и сохранение последовательности РНК Burkholderia 7 (анти-hemB) | |
| Идентификаторы | |
| Символ | анти-гемБ |
| Рфам | РФ02837 |
| Другие данные | |
| Тип РНК | Ген ; мРНК |
| ИДТИ | GO:0005515,GO:0097311 |
| ТАК | SO:0000370 |
| Структуры PDB | ПДБе |
Мотив анти-hemB РНК представляет собой консервативную структуру РНК , которая была обнаружена во всех известных бактериях рода Burkholderia и во множестве других бетапротеобактерий . [1] Мотив анти-hemB РНК состоит в основном из двух стебель-петлей , за которыми следует предсказанная ро-независимая терминация транскрипции стебель-петля. Поскольку анти-hemB РНК, как правило, не расположены в 5' UTR , предполагается, что РНК являются некодирующими РНК . Терминатор стебель-петля подразумевает, что анти-hemB РНК транскрибируются как независимые молекулы.
Название «анти-гемБ» используется для того, чтобы отличить мотив от его обратного комплемента, который был назван мотивом «гемБ», мотивом, который часто находится в видимых 5'-нетранслируемых участках генов гемаБ . Считалось неоднозначным, какая из этих ориентаций является правильной, поскольку оба направления демонстрируют ковариацию (см. предсказание вторичной структуры ), и оба складываются в правдоподобные структуры РНК. Однако анти-гемБ была оценена как более вероятная ориентация, поскольку в ней было меньше пар оснований АС , которые не способствуют стабильности РНК. В обратном комплемента пара АС становится стабильной парой колебаний GU.
Ссылки
 | Эта статья по молекулярной или клеточной биологии — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее. |
