Афифелла
| Афифелла | |
|---|---|
| Научная классификация | |
| Домен: | |
| Тип: | |
| Сорт: | |
| Заказ: | |
| Семья: | Афифелловые Хёрдт и др. 2020 [1] |
| Род: | Афифелла Урдиайн и др. 2009 [2] |
| Разновидность | |
| |
Afifella — род в типе Pseudomonadota ( Бактерии ). [4] [5] [6] Afifella встречаются в морских и эстуарных условиях, включая микробные маты. [5] [3] [6] Они являются анаэробами, один из культивируемых представителей способен к фотосинтезу.
Этимология
Родовое название Afifella происходит от имени С. Афифа, британского философа и художника, в знак признания его экспертных знаний и руководства в области философского направления структурализма, необходимого для развития и понимания таксономии как науки. [7]
Разновидность
Род включает три вида: [3] [6]
- A. marina ( лат. marina означает «морской»), ранее был известен как Rhodobium marinum , а до этого как Rhodopseudomonas marina . [5]
- A. pfennigii ( нео-лат. pfennigii , от Pfennig, назван в честь Норберта Пфеннига , немецкого микробиолога) ранее был известен как Rhodobium pfennigii. [6]
- A. aestuarii Buddhi et al. 2020 [3]
Морфология и физиология
A. marina — анаэроб, вырабатывающий водород. [5] A. pfennigii — подвижная, палочковидная, окрашенная по Граму клетка длиной 1–2 мкм и шириной 0,6 мкм. [6] A. aestuarii — подвижная, овальная или палочковидная, окрашенная по Граму, оксидазоположительная, каталазоотрицательная, розовая фототрофная бактерия. [3]
Изоляция
Три вида Afifella были выделены из прибрежных вод. A. marina был выделен из морских губок на побережье Адриатического моря. [5] A. pfennigii был выделен из бентического микробного мата из солоноватоводного пруда, расположенного на атолле Рангироа на островах Туамоту недалеко от Австралии. [6] A. aestuarii был выделен из эстуария недалеко от Паты, Гуджарат, Индия. [3]
Культура и рост
A. marina растет на среде rhodospirillaceae (среда DSMZ 27) при 25 °C с 3% NaCl и является анаэробным на свету. [5] A. pfennigii растет на среде (среда DSMZ 27) при 28 °C с добавлением 1% NaCl и 0,15% NaHCO3 и является анаэробным на свету. [6] A. aestuarii для роста требуется тиамин, и это единственный изолят Afifella, способный к фотолитоавтотрофному, фотоорганогетеротрофному и хемоорганогетеротрофному режимам роста. [3]
Секвенирование генома
A. marina обозначен как штамм DSM 2698 T и имеет содержание GC 63,8 мол.% [5] [3] A. pfennigii обозначен как штамм DSM17143 T и имеет содержание GC 63,8 мол . % [6] [3] A. aestuarii обозначен как штамм JA968 T и имеет содержание GC 63,5 мол.% Сравнение последовательностей генов 16rRNA показало, что штамм A. aestuarii JA968T был очень похож на штамм A. marina DSM 2698 T при 99,9% сходства и штамм A. pfennigii DSM17143 T при 98,4% сходства. [3]
Смотрите также
Ссылки
- ^ Hördt A, García López M, Meier-Kolthoff JP, Schleuning M, Weinhold LM, Tindall BJ, Gronow A, Kyrpides NC, Woyke T, Göker M (2020). «Анализ геномов более 1000 типов и штаммов существенно улучшает таксономическую классификацию альфапротеобактерий». Front. Microbiol . 11 : 468. doi : 10.3389/fmicb.2020.00468 . PMC 7179689. PMID 32373076 .
- ^ Урдиайн М., Лопес-Лопес А., Гонсало С., Буссе Х.Дж., Лангер С., Кемпфер П., Росселло-Мора Р. (2008). «Реклассификация Rhodobium marinum и Rhodobium pfennigii в Afifella marina gen. nov. com. nov. и Afifella pfennigii com. nov., новый род фотогетеротрофных альфапротеобактерий и исправленные описания Rhodobium , Rhodobium orientis и Rhodobium gokarnense ». Syst Appl Микробиол . 31 (5): 339–351 . doi :10.1016/j.syapm.2008.07.002. ПМИД 18774253.
- ^ abcdefghij Буддхи, Сайладжа; Г., Суреш; Гупта, Дипшиха; Ч., Сасикала; Ч. В., Рамана (2020). «Afifella aestuarii sp. nov., фототрофная бактерия». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 70 (1): 327–333 . doi : 10.1099/ijsem.0.003756 . ISSN 1466-5026. ПМИД 31592760.
- ^ Классификация родов AC в LPSN ; Parte, Aidan C.; Sardà Carbasse, Joaquim; Meier-Kolthoff, Jan P.; Reimer, Lorenz C.; Göker, Markus (1 ноября 2020 г.). «Список названий прокариот со стойкой в номенклатуре (LPSN) перемещается в DSMZ». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 70 (11): 5607– 5612. doi : 10.1099/ijsem.0.004332 .
- ^ abcdefg Reimer LC, Sarda Carbasse J, Podstawka A, Overmann J (29 ноября 2019 г.). "Afifella marina (Imhoff 1984) Urdiain et al. 2009". BacDive: Информация о бактериальном и архейном биоразнообразии, связанная со штаммами . DSMZ. doi : 10.13145/bacdive13874.20191129.4.1 . Получено 16 сентября 2020 г.
- ↑ abcdefgh Reimer LC, Сарда Карбасс Дж., Подставка А., Оверманн Дж. (29 ноября 2019 г.). «Afifella pfennigii (Caumette et al. 2007) Urdiain et al. 2009». BacDive: Связанная со штаммами информация о биоразнообразии бактерий и архей . ДСМЗ. дои : 10.13145/bacdive13876.20191129.4.1 . Проверено 16 сентября 2020 г.
- ^ Afifella в LPSN ; Parte, Aidan C.; Sardà Carbasse, Joaquim; Meier-Kolthoff, Jan P.; Reimer, Lorenz C.; Göker, Markus (1 ноября 2020 г.). «Список названий прокариот со стоянием в номенклатуре (LPSN) перемещается в DSMZ». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 70 (11): 5607– 5612. doi : 10.1099/ijsem.0.004332 .
