AdoMet МТаза
| Суперсемейство SAM-зависимых МТаз | |
|---|---|
 Карикатурное изображение молекулярной структуры кристаллической структуры SAM-зависимой метилтрансферазы из Agrobacterium tumefaciens ( PDB : 2igt ) | |
| Идентификаторы | |
| Символ | SAM-зависимые_MTases |
| ЭКОД | 2003.1.5 |
| ИнтерПро | IPR029063 |
| AdoMet_MTase | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | AdoMet_MTase | ||||||||
| Пфам | ПФ07757 | ||||||||
| Клан ПФАМ | CL0063 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR011671 | ||||||||
| |||||||||
S-аденозилметионин-зависимая метилтрансфераза ( SAM-MTase или AdoMet-MTase ) — это консервативный белковый домен и суперсемейство белков . [1] Белки SAM-MTase являются метилтрансферазами . [2] В SAM-MTase есть пять семейств белков ,
SAM-MTases используют S-аденозил-L-метионин в качестве субстрата для метилирования , создавая продукт S-аденозил-L-гомоцистеин. [3]
Структура и подгруппы
Все SAM-MTases содержат структурно консервативный домен связывания SAM, состоящий из центрального семицепочечного бета-слоя, окруженного тремя альфа-спиралями с каждой стороны слоя. [4]
Обзор, опубликованный в 2003 году, делит все метилтрансферазы на 5 основных классов на основе структуры их каталитического домена (складки): [5]
- класс I: α/β типа Россмана, самая большая подгруппа. [3]
- класс II: ТИМ β/α-ствол α/β
- класс III: тетрапирролметилаза α/β
- класс IV: СНИЗУ α/β
- класс V: домен SET все β
Ссылки
- ^ Ван, Цзияо; Читсаз, Фариде; Дербишир, Майра К.; Гонсалес, Норин Р.; Гвадз, Марк; Лу, Шеннан; Марчлер, Габриэль Х.; Сонг, Джеймс С.; Танки, Нармада; Ямашита, Роксанна А.; Ян, Минчжан; Чжан, Дачуань; Чжэн, Чанжуань; Ланчицки, Кристофер Дж.; Марчлер-Бауэр, Арон (2023-01-06). "База данных консервативных доменов в 2023 году". Nucleic Acids Research . 51 (D1): D384 – D388 . doi :10.1093/nar/gkac1096. ISSN 1362-4962. PMC 9825596 . PMID 36477806.
- ^ Книзевски Л., Джинальски К. (июль 2006 г.). «DUF1613 — новое семейство эукариотических AdoMet-зависимых метилтрансфераз». Cell Cycle . 5 (14): 1580– 2. doi : 10.4161/cc.5.14.2978 . PMID 16861910.
- ^ ab "Семейство доменов консервативных белков CDD: AdoMet_MTases". www.ncbi.nlm.nih.gov . Получено 07.12.2023 .
- ^ Мартин, Дженнифер Л.; Макмиллан, Фиона М. (2002-12-01). «SAM (зависимый) I AM: складка S-аденозилметионин-зависимой метилтрансферазы». Current Opinion in Structural Biology . 12 (6): 783– 793. doi :10.1016/s0959-440x(02)00391-3. ISSN 1879-033X. PMID 12504684.
- ^ Шуберт, Хайди Л.; Блюменталь, Роберт М.; Чэн, Сяодун (2003-06-01). «Множество путей к метилпереносу: хроника конвергенции». Тенденции в биохимических науках . 28 (6): 329– 335. doi :10.1016/s0968-0004(03)00090-2. ISSN 0968-0004. PMC 2758044. PMID 12826405 .
