Адлеркрейция
| Адлеркрейция | |
|---|---|
| Научная классификация | |
| Домен: | |
| Тип: | |
| Сорт: | |
| Заказ: | |
| Семья: | |
| Род: | Адлеркрейция Маруо и др. 2008 [1] [2] |
| Типовой вид | |
| Adlercreutzia equolifaciens Маруо и др. 2008 | |
| Разновидность | |
См. текст. | |
| Синонимы | |
| |
Adlercreutzia — род в типе Actinomycetota ( Бактерии ). [1]
Этимология
Родовое название происходит от имени профессора Хельсинкского университета в Финляндии Х. Адлеркрейца, который внес вклад в исследование влияния фитоэстрогенов на здоровье человека. [2]
Таксономия
В 2018 году Нуиуи и др. предложили объединить роды Asaccharobacter , Enterorhabdus и Parvibacter в род Adlercreutzia на основе наблюдаемой кластеризации этих родов в филогенетических деревьях. [3] Однако последующие филогенетические анализы показали, что Parvibacter caecicola демонстрирует гораздо более глубокое ветвление по сравнению с другими видами Adlercreutzia . [4] Кроме того, было выявлено, что пять консервативных сигнатурных инделей (CSI), присутствующих в белках эксинуклеазы ABC субъединицы UvrA, флаводоксин-зависимой (E)-4-гидрокси-3-метилбут-2-енил-дифосфатсинтазе, фосфорибозилформилглицинамидинсинтазе , валин-тРНК-лигазе и цистеин-тРНК-лигазе являются исключительно общими для всех видов Adlercreutzia , за исключением P. caecicola. [4] Таким образом, исправленное описание рода Adlercreutzia такое же, как и приведенное ранее, за исключением P. caecicola , который был перенесен обратно в род Parvibacter.
Филогения
Принятая в настоящее время таксономия основана на Списке названий прокариот, имеющих постоянное место в номенклатуре (LPSN) [2] и Национальном центре биотехнологической информации (NCBI). [5]
| LTP на основе 16S рРНК _08_2023 [6] [7] [8] | 120 маркерных белков на основе GTDB 08-RS214 [9] [10] [11] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
Определенные виды: [2]
- Adlercreutzia Rubneri Stoll et al. 2021 год
Смотрите также
Ссылки
- ^ Аб Маруо, Т.; Сакамото, М.; Ито, К.; Тода, Т.; Бенно, Ю. (2008). «Adlercreutzia equolifaciens gen. Nov., sp. Nov., бактерия, продуцирующая эквол, выделенная из человеческих фекалий, и исправленное описание рода Eggerthella». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 58 (5): 1221–1227 . doi : 10.1099/ijs.0.65404-0 . ПМИД 18450717.
- ^ abcd Euzéby JP, Parte AC. "Adlercreutzia". Список названий прокариот со стоянием в номенклатуре (LPSN) . Получено 23 июня 2021 г.
- ^ Nouioui, Imen; Carro, Lorena; García-López, Marina; Meier-Kolthoff, Jan P.; Woyke, Tanja; Kyrpides, Nikos C.; Pukall, Rüdiger; Klenk, Hans-Peter; Goodfellow, Michael; Göker, Markus (2018). "Genome-Based Taxonomic Classification of the Phylum Actinobacteria". Frontiers in Microbiology . 9 : 2007. doi : 10.3389/fmicb.2018.02007 . ISSN 1664-302X. PMC 6113628. PMID 30186281 .
- ^ ab Гупта, Рэдхи С. (2021), Карро, Лорена (ред.), «Eggerthellaceae», Руководство Берджи по систематике архей и бактерий , Американское онкологическое общество, стр. 1–11 , doi : 10.1002/9781118960608.fbm00384, ISBN 978-1-118-96060-8, S2CID 243126790 , получено 2021-07-05
- ^ Sayers; et al. "Adlercreutzia". База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Получено 20.03.2021 .
- ^ "The LTP" . Получено 20 ноября 2023 г. .
- ^ "Дерево LTP_all в формате newick" . Получено 20 ноября 2023 г. .
- ^ "LTP_08_2023 Release Notes" (PDF) . Получено 20 ноября 2023 г.
- ^ "GTDB release 08-RS214". База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 г.
- ^ "bac120_r214.sp_label". База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 г.
- ^ "История таксона". База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 г.
