Семейство актинобактериальных фагов холина
Семейство актинобактериальных фагов холинов (APH) (TC# 1.E.57) представляет собой довольно большое семейство белков длиной от 105 до 180 аминокислотных остатков, обычно демонстрирующих один трансмембранный сегмент (TMS) вблизи N-конца. Представительный список белков, принадлежащих к семейству APH, можно найти в базе данных классификации транспортеров. [1]
Одним из архетипических белков в этом семействе является холин Gp5 микобактериофага Ms6. Микобактериофаг Ms6 представляет собой двухцепочечный ДНК- бактериофаг (dsDNA) , который, в дополнение к предсказанной системе лизиса эндолизин (LysA)-холин (Gp4), кодирует три дополнительных белка в своем модуле лизиса: Gp1, LysB и Gp5. [2]
Ms6 Gp4 (TC# 1.E.18.1.2) ранее был описан как холиноподобный белок класса II. Второй предполагаемый ген холина ( gp5 ), кодирующий белок (Gp5) с предсказанным одиночным N-концевым TMS, был идентифицирован в конце литического оперона Ms6. Ни предполагаемый холин класса II, ни одиночный полипептид TMS не могли вызвать лизис в парных комбинациях с эндолизином LysA в Escherichia coli . Однако дальнейшие исследования показали, что Gp4 и Gp5 Ms6 взаимодействуют друг с другом. Это говорит о том, что при инфекции Ms6 правильное и запрограммированное время лизиса достигается совместным действием Gp4 и Gp5. [2]
Смотрите также
Дальнейшее чтение
- Петровски, Стив; Севьор, Роберт Дж.; Тиллетт, Дэниел (2011). «Характеристика генома поливалентного литического бактериофага GTE2, имеющего потенциал для биологического контроля пен, стабилизированных Gordonia, Rhodococcus и Nocardia, в установках с активированным илом». Прикладная и экологическая микробиология . 77 (12): 3923– 3929. Bibcode : 2011ApEnM..77.3923P. doi : 10.1128/AEM.00025-11. PMC 3131622. PMID 21498753 .
- Редди, Бхаскара Л.; Сайер-младший, Милтон Х. (2013). «Топологический и филогенетический анализ семейств и суперсемейств бактериальных холинов». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) – Биомембраны . 1828 (11): 2654–2671 . doi :10.1016/j.bbamem.2013.07.004. ПМЦ 3788059 . ПМИД 23856191.
- Saier, Milton H.; Reddy, Bhaskara L. (2015). «Холины в бактериях, эукариотах и археях: многофункциональные ксенологи с потенциальными биотехнологическими и биомедицинскими применениями». Журнал бактериологии . 197 (1): 7– 17. doi :10.1128 / JB.02046-14. PMC 4288690. PMID 25157079.
- Ван, ИН; Смит, ДЛ; Янг, Р. (2000). «Холины: белковые часы бактериофаговых инфекций». Annual Review of Microbiology . 54 : 799– 825. doi : 10.1146/annurev.micro.54.1.799. PMID 11018145.
Ссылки
- ^ "1.E.57. Семейство актинобактериальных фагов Холин (APH)". TCDB . Получено 29.03.2016 .
- ^ аб Каталан, Мария Жуан; Гил, Филиппа; Мониш-Перейра, Хосе; Пиментель, Мадалена (1 июня 2011 г.). «Функциональный анализ холиноподобных белков микобактериофага Ms6». Журнал бактериологии . 193 (11): 2793–2803 . doi :10.1128/JB.01519-10. ISSN 1098-5530. ПМК 3133122 . ПМИД 21441511.
На момент редактирования эта статья использует контент из "1.E.57. The Actinobacterial Phage Holin (APH) Family" , который лицензирован таким образом, что позволяет повторное использование в соответствии с Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Unported License , но не в соответствии с GFDL . Все соответствующие условия должны быть соблюдены.
