Эбби Дернбург | |
---|---|
Альма-матер | Калифорнийский университет в Беркли , бакалавр Калифорнийский университет в Сан-Франциско , доктор философии |
Супруг | Гэри Карпен |
Научная карьера | |
Поля | Клеточная биология , Генетика |
Учреждения | Калифорнийский университет в Беркли Национальная лаборатория имени Лоуренса в Беркли Медицинский институт Говарда Хьюза |
Научные консультанты | Клейтон Хиткок Дэн Кошланд Джон Седат Энн Вильнёв |
Веб-сайт | Исследовательский сайт |
Эбби Ф. Дернбург — профессор клеточной и эволюционной биологии Калифорнийского университета в Беркли , исследователь Медицинского института Говарда Хьюза и старший научный сотрудник Национальной лаборатории Лоуренса в Беркли .
Дернбург получила степень бакалавра искусств по биохимии в 1987 году в Калифорнийском университете в Беркли . Там она провела полгода, работая в лаборатории органической химии, прежде чем присоединиться к лаборатории Дэна Кошланда , изучая бактериальный хемотаксис , или то, как клетки и организмы движутся в ответ на химический стимул. [1] После окончания университета она провела год, работая научным сотрудником в лаборатории Кошланда, где она была соавтором исследования, анализирующего структуру бактериального сенсорного рецептора. [2]
Затем Дернбург поступила в программу Tetrad в Калифорнийском университете в Сан-Франциско для своей докторской работы. Она получила докторскую степень в 1996 году, работая в лаборатории Джона Седата, изучая несколько аспектов организации и функционирования хромосом . Она разработала методы флуоресцентной гибридизации in situ (FISH) для изучения генетического содержимого клеток и исследования того, как хромосомы организованы в ядрах клеток. Используя эти инструменты, она исследовала, как организация хромосом в ядре может влиять на транскрипцию , и как хромосомы взаимодействуют, чтобы отделиться друг от друга в процессе мейоза , используя муху Drosophila в качестве модельного организма . [3] [4] В частности, она использовала FISH для мониторинга хромосомного положения областей гетерохроматина — плотно упакованной области ДНК, связанной с неэкспрессированными генами — и гена мухи, называемого brown , который кодирует красный пигмент, который дает мухам их красные глаза; когда ген brown выключен, у мух карие глаза. Гетерохроматиновые области хромосом имеют тенденцию объединяться вместе в определенном отсеке ядра. Дернбург обнаружила, что когда область гетерохроматина была вставлена рядом с геном brown , ген связывался с гетерохроматиновой областью ядра и, таким образом, был бы инактивирован, давая мухам с этой вставкой карие глаза. Исследование продемонстрировало влияние позиционирования хромосом на экспрессию генов. Дернбург также изучала роль гетерохроматина в сегрегации хромосом во время мейоза, обнаружив, что гетерохроматиновые области гомологичных хромосом остаются связанными друг с другом до метафазы I , или стадии, на которой хромосомы выстраиваются вдоль центра ядра перед первым раундом мейотического деления. [5] Эта ассоциация гарантирует, что полученные дочерние клетки будут иметь соответствующее количество хромосом. Она завершила свою диссертацию под названием « Ядерная архитектура у Drosophila melanogaster» , документируя эту работу в 1996 году. [6] Ее диссертация получила Мемориальную премию Ларри Сэндлера в 1997 году от Американского общества генетики , которая признает самую выдающуюся диссертацию в области генетики и биологии дрозофилы. [7]
Для своего постдокторского исследования Дернбург присоединилась к лаборатории Анны Вильнёв в Стэнфордском университете , где она перешла к работе с нематодным червем Caenorhabditis elegans . [1] Там, сосредоточившись на процессе мейоза, который она продолжает изучать в своей собственной лаборатории, она адаптировала методы FISH для изучения цитологии спаривания хромосом у червя. [7] В 1998 году она опубликовала исследование, документирующее, чем мейоз у червя отличается от мейоза у многих других эукариотических организмов . У большинства эукариот двухцепочечные разрывы в ДНК необходимы для спаривания и синапсиса между гомологичными хромосомами во время мейоза. Дернбург обнаружила, что у Caenorhabditis elegans двухцепочечные разрывы необходимы для рекомбинации и сегрегации хромосом во время мейоза, но не для гомологичного спаривания и синапсиса. [8] Результаты исследования показали, что в механизмах мейоза может быть больше разнообразия, чем предполагалось ранее. [7]
В 2000 году Дернбург основала свою лабораторию в Национальной лаборатории Лоуренса в Беркли и Калифорнийском университете в Беркли, чтобы продолжить исследование организации и динамики хромосом, сосредоточившись на мейозе, используя нематодного червя Caenorhabditis elegans в качестве модельного организма . [9] Ее лаборатория внесла вклад в понимание сообществом того, как хромосомы находят и спариваются с соответствующим гомологом во время мейоза , что необходимо для правильной сегрегации хромосом и обеспечения соответствующего числа копий хромосом в дочерних клетках . Ее группа работала над пониманием того, как особые области хромосом, известные как центры спаривания, способствуют гомологичному спариванию хромосом, синапсису и сегрегации у червя. В 2005 году они опубликовали исследование, демонстрирующее, как центры спаривания выполняют две раздельные функции во время мейоза. [10] [11] Во-первых, они облегчают спаривание посредством стабилизации промежуточного комплекса, участвующего в процессе спаривания. Во-вторых, центры спаривания способствуют формированию синаптонемного комплекса , в котором белковый полимер действует как каркас для удержания гомологичных хромосом вместе во время рекомбинации. В связанном исследовании ее группа также обнаружила консервативную мейотическую контрольную точку , которая действует во время мейоза, чтобы распознавать непарные/несинапированные хромосомы. [11] [12] Клетки, идентифицированные как имеющие несинапированные хромосомы, подвергаются апоптозу или запрограммированной клеточной смерти, чтобы защититься от образования половых клеток с неправильным числом хромосом. [12]
Группа Дернбурга также обнаружила, что функции центров спаривания зависят от семейства из четырех ДНК-связывающих белков цинковых пальцев — называемых белками HIM или ZIM — которые распознают и связывают короткие повторяющиеся последовательности, которые являются отличительными признаками центров спаривания. [13] Каждый белок him или zim распознает определенную последовательность центра спаривания, чтобы помочь объединить гомологичные хромосомы. [13] [14] Группа Дернбурга впервые обнаружила ген him-8 , который кодирует белок, отвечающий за правильное мейотическое разделение X-хромосомы червя. [15] Эти белки облегчают взаимодействие между центрами спаривания и комплексом микротрубочек и моторным белком, называемым динеином , которые позволяют хромосомам перемещаться вдоль ядерной оболочки, пока они не встретят своего партнера. [1]
Дернбург также вышел за рамки изучения нематод и приступил к изучению механизмов мейоза у планарий , которые являются непаразитическими плоскими червями, а также у другого вида нематод, называемого Pristionchus pacificus, чтобы понять, как механизмы мейоза сохраняются — или расходятся — у разных видов. [1]
Лаборатория Дернбурга также разрабатывает методы микроскопии живых нематод. Используя визуализацию живых клеток, они обнаружили, что синаптонемный комплекс , особая структура, которая удерживает вместе гомологичные хромосомы и позволяет им проходить мейотическую рекомбинацию , представляет собой жидкий кристалл . [16] Это привело их к предложению механизма перекрестной интерференции, основанного на механизме реакции-диффузии . [17]
В 2008 году Дернбург стала исследователем в Медицинском институте Говарда Хьюза . [18] Она также занимает должность старшего научного сотрудника факультета в Национальной лаборатории Лоуренса в Беркли .