Атаксин 3

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
ATXN3
Доступные структуры
ПДБПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыATXN3 , AT3, ATX3, JOS, MJD, MJD1, SCA3, атаксин 3
Внешние идентификаторыОМИМ : 607047; МГИ : 1099442; Гомологен : 3658; Генные карты : ATXN3; OMA :ATXN3 — ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез
Ансамбль
UniProt
РефСек (мРНК)

NM_001167914
NM_029705

RefSeq (белок)

NP_001161386
NP_083981

Местоположение (UCSC)Хр 14: 92.04 – 92.11 МбХр 12: 101.92 – 101.96 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Атаксин-3 — это белок , который у людей кодируется геном ATXN3 . [ 5] [6]

Клиническое значение

Болезнь Мачадо-Джозефа , также известная как спиноцеребеллярная атаксия-3, является аутосомно-доминантным неврологическим расстройством. Белок, кодируемый геном ATXN3 , содержит повторы CAG в кодирующей области, и расширение этих повторов от нормальных 13-36 до 68-79 является причиной болезни Мачадо-Джозефа. Таким образом, это расстройство является расстройством тринуклеотидных повторов типа I, известным как полиглутаминовая (PolyQ) болезнь . Существует обратная корреляция между возрастом начала и числом повторов CAG. Для этого гена были описаны альтернативно сплайсированные варианты транскриптов, кодирующие различные изоформы. [6]

Взаимодействия

Было показано, что атаксин 3 взаимодействует с:

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000066427 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000021189 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Takiyama Y, Nishizawa M, Tanaka H, ​​Kawashima S, Sakamoto H, Karube Y, Shimazaki H, Soutome M, Endo K, Ohta S (июль 1993 г.). «Ген болезни Мачадо-Джозефа картируется на хромосоме 14q человека». Nature Genetics . 4 (3): 300– 4. doi :10.1038/ng0793-300. PMID  8358439. S2CID  27424416.
  6. ^ ab "Ген Энтреза: ATXN3 атаксин 3".
  7. ^ ab Wang G, Sawai N, Kotliarova S, Kanazawa I, Nukina N (июль 2000 г.). «Атаксин-3, продукт гена MJD1, взаимодействует с двумя человеческими гомологами белка репарации ДНК дрожжей RAD23, HHR23A и ​​HHR23B». Human Molecular Genetics . 9 (12): 1795– 803. doi :10.1093/hmg/9.12.1795. PMID  10915768.
  8. ^ Doss-Pepe EW, Stenroos ES, Johnson WG, Madura K (сентябрь 2003 г.). «Взаимодействие Ataxin-3 с rad23 и белком, содержащим валозин, и его ассоциации с цепями убиквитина и протеасомой согласуются с ролью в протеолизе, опосредованном убиквитином». Молекулярная и клеточная биология . 23 (18): 6469– 83. doi :10.1128/MCB.23.18.6469-6483.2003. PMC 193705. PMID  12944474 . 
  9. ^ Wang Q, Li L, Ye Y (март 2008). «Ингибирование p97-зависимой деградации белка Eeyarestatin I». Журнал биологической химии . 283 (12): 7445–54 . doi : 10.1074/jbc.M708347200 . PMC 2276333. PMID  18199748 . 

Дальнейшее чтение

  • Гото Дж., Ватанабэ М., Итикава Ю., Йи С.Б., Ихара Н., Эндо К., Игараси С., Такаяма Ю., Гаспар С., Масиэль П., Цудзи С., Руло Г.А., Канадзава I (август 1997 г.). «Продукты гена болезни Мачадо-Джозефа, несущие разные карбоксильные концы». Неврологические исследования . 28 (4): 373–7 . doi :10.1016/S0168-0102(97)00056-4. PMID  9274833. S2CID  27241785.
  • Schöls L, Vieira-Saecker AM, Schöls S, Przuntek H, Epplen JT, Riess O (июнь 1995 г.). «Расширение тринуклеотидов в гене MJD1 клинически проявляется как спиноцеребеллярная атаксия и чаще всего встречается у немецких пациентов с SCA». Human Molecular Genetics . 4 (6): 1001– 5. doi :10.1093/hmg/4.6.1001. PMID  7655453.
  • Stevanin G, Cancel G, Dürr A, Chneiweiss H, Dubourg O, Weissenbach J, Cann HM, Agid Y, Brice A (январь 1995 г.). «Ген спинальной мозжечковой атаксии 3 (SCA3) расположен в области примерно 3 сМ на хромосоме 14q24.3-q32.2». American Journal of Human Genetics . 56 (1): 193– 201. PMC  1801316 . PMID  7825578.
  • Кавагути Ю, Окамото Т, Таниваки М, Айзава М, Иноуэ М, Катаяма С, Каваками Х, Накамура С, Нисимура М, Акигути И (ноябрь 1994 г.). «Расширения CAG в новом гене болезни Мачадо-Джозефа на хромосоме 14q32.1». Природная генетика . 8 (3): 221–8 . doi : 10.1038/ng1194-221. PMID  7874163. S2CID  29188685.
  • Маруяма К, Сугано С (январь 1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Gene . 138 ( 1– 2): 171– 4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
  • Икеда Х., Ямагути М., Сугай С., Азе Ю., Нарумия С., Какизука А. (июнь 1996 г.). «Расширенный полиглутамин в белке болезни Мачадо-Джозефа вызывает гибель клеток in vitro и in vivo». Природная генетика . 13 (2): 196–202 . doi : 10.1038/ng0696-196. PMID  8640226. S2CID  21966287.
  • Paulson HL, Das SS, Crino PB, Perez MK, Patel SC, Gotsdiner D, Fischbeck KH, Pittman RN (апрель 1997 г.). «Продукт гена болезни Мачадо-Джозефа — это цитоплазматический белок, широко экспрессируемый в мозге». Annals of Neurology . 41 (4): 453– 62. doi :10.1002/ana.410410408. PMID  9124802. S2CID  43460483.
  • Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (октябрь 1997 г.). «Конструирование и характеристика библиотеки ДНК с полной длиной и обогащенной 5'-концом». Gene . 200 ( 1– 2): 149– 56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID  9373149.
  • Wellington CL, Ellerby LM, Hackam AS, Margolis RL, Trifiro MA, Singaraja R, McCutcheon K, Salvesen GS, Propp SS, Bromm M, Rowland KJ, Zhang T, Rasper D, Roy S, Thornberry N, Pinsky L, Kakizuka A, Ross CA, Nicholson DW, Bredesen DE, Hayden MR (апрель 1998 г.). «Расщепление каспазой продуктов генов, связанных с нарушениями расширения триплетов, приводит к образованию усеченных фрагментов, содержащих полиглутаминовый тракт». Журнал биологической химии . 273 (15): 9158– 67. doi : 10.1074/jbc.273.15.9158 . PMID  9535906.
  • Tait D, Riccio M, Sittler A, Scherzinger E, Santi S, Ognibene A, Maraldi NM, Lehrach H, Wanker EE (июнь 1998 г.). «Атаксин-3 транспортируется в ядро ​​и связывается с ядерным матриксом». Human Molecular Genetics . 7 (6): 991– 7. CiteSeerX  10.1.1.588.3970 . doi : 10.1093/hmg/7.6.991 . PMID  9580663.
  • Wang G, Sawai N, Kotliarova S, Kanazawa I, Nukina N (июль 2000 г.). «Атаксин-3, продукт гена MJD1, взаимодействует с двумя человеческими гомологами белка репарации ДНК дрожжей RAD23, HHR23A и ​​HHR23B». Human Molecular Genetics . 9 (12): 1795– 803. doi :10.1093/hmg/9.12.1795. PMID  10915768.
  • Итикава Ю, Гото Дж, Хаттори М, Тойода А, Исии К, Чон СЮ, Хашида Х, Масуда Н, Огата К, Касаи Ф, Хираи М, Масиэль П, Руло Г.А., Сакаки Ю, Канадзава И (2001). «Геномная структура и экспрессия MJD, гена болезни Мачадо-Джозефа». Журнал генетики человека . 46 (7): 413–22 . doi : 10.1007/s100380170060 . ПМИД  11450850.
  • Chai Y, Shao J, Miller VM, Williams A, Paulson HL (июль 2002 г.). «Визуализация живых клеток выявляет расходящиеся внутриклеточные динамики белков полиглутаминовых заболеваний и поддерживает секвестрированную модель патогенеза». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 99 (14): 9310– 5. Bibcode : 2002PNAS...99.9310C. doi : 10.1073 /pnas.152101299 . PMC  123137. PMID  12084819.
  • Yoshida H, Yoshizawa T, Shibasaki F, Shoji S, Kanazawa I (июль 2002 г.). «Химические шапероны уменьшают образование агрегатов и гибель клеток, вызванную укороченным продуктом гена болезни Мачадо-Джозефа с расширенным полиглутаминовым участком». Neurobiology of Disease . 10 (2): 88–99 . doi : 10.1006/nbdi.2002.0502 . PMID  12127147. S2CID  25183307.
  • Li F, Macfarlan T, Pittman RN, Chakravarti D (ноябрь 2002 г.). «Атаксин-3 — это связывающий гистон белок с двумя независимыми транскрипционными корепрессорными активностями». Журнал биологической химии . 277 (47): 45004– 12. doi : 10.1074/jbc.M205259200 . PMID  12297501.
  • Albrecht M, Hoffmann D, Evert BO, Schmitt I, Wüllner U, Lengauer T (февраль 2003 г.). «Структурное моделирование атаксина-3 выявляет отдаленную гомологию с адаптинами». Proteins . 50 (2): 355– 70. doi :10.1002/prot.10280. PMID  12486728. S2CID  25660172.
  • Marchal S, Shehi E, Harricane MC, Fusi P, Heitz F, Tortora P, Lange R (август 2003 г.). «Структурная нестабильность и фибриллярная агрегация нерасширенного человеческого атаксина-3, выявленная при высоком давлении и температуре». Журнал биологической химии . 278 (34): 31554– 63. doi : 10.1074/jbc.M304205200 . PMID  12766160.
  • Запись GeneReviews/NCBI/NIH/UW о спиноцеребеллярной атаксии типа 3
  • Расположение генома человека ATXN3 и страница с подробностями гена ATXN3 в браузере геномов UCSC .
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Атаксин_3&oldid=1192246798"