Субъединица С АТФ-синтазы
 Натриевая АТФаза V-типа из Enterococcus hirae . Рассчитанные углеводородные границы липидного бислоя показаны красными и синими точками. | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Символ | АТФ-синтез_С | ||||||||
| Пфам | ПФ00137 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR002379 | ||||||||
| ПРОСИТ | PDOC00526 | ||||||||
| СКОП2 | 1aty / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
| суперсемейство OPM | 5 | ||||||||
| белок ОПМ | 2бл2 | ||||||||
| |||||||||
АТФаза, субъединица C комплекса Fo/Vo является основной трансмембранной субъединицей АТФ-синтаз V-типа, A-типа и F-типа . Субъединица C (также называемая субъединицей 9 или протеолипидом в F-АТФазах или протеолипидом 16 кДа в V-АТФазах) была обнаружена в комплексе Fo или Vo F- и V-АТФаз соответственно. Субъединицы образуют олигомерное кольцо c , которое составляет ротор Fo/Vo/Ao, где фактическое количество субъединиц сильно различается среди конкретных ферментов. [1]
АТФазы (или АТФ-синтазы) — это связанные с мембраной ферментные комплексы/переносчики ионов, которые объединяют синтез и/или гидролиз АТФ с транспортом протонов через мембрану. АТФазы могут использовать энергию из протонного градиента, используя поток ионов через мембрану через протонный канал АТФазы для управления синтезом АТФ. Некоторые АТФазы работают в обратном направлении, используя энергию гидролиза АТФ для создания протонного градиента. Существуют различные типы АТФаз, которые могут различаться по функции (синтез и/или гидролиз АТФ), структуре (F-, V- и A-АТФазы содержат вращающиеся двигатели) и по типу ионов, которые они транспортируют. [2] [3]
F-АТФазы (или F1Fo АТФазы) и V-АТФазы (или V1Vo АТФазы) состоят из двух связанных комплексов: комплекс F1 или V1 содержит каталитическое ядро, которое синтезирует/гидролизует АТФ, и комплекс Fo или Vo, который формирует мембрано-проникающую пору. F- и V-АТФазы все содержат вращающиеся двигатели, один из которых управляет транслокацией протонов через мембрану, а другой управляет синтезом/гидролизом АТФ. [4] [5]
В F-АТФазах поток протонов через канал АТФазы приводит во вращение кольцо субъединицы C, которое, в свою очередь, сопряжено с вращением ротора субъединицы гамма-комплекса F1 из-за постоянной связи между субъединицами гамма и эпсилон F1 и кольцом субъединицы C Fo. Последовательное протонирование и депротонирование Asp61 субъединицы C сопряжено с пошаговым движением ротора. [6]
В V-АТФазах есть три протеолипидные субъединицы (c, c′ и c′′), которые образуют часть протонпроводящей поры, каждая из которых содержит скрытый остаток глутаминовой кислоты, необходимый для транспорта протонов. [7] [8]
В недавнем исследовании с-субъединица была указана как критический компонент митохондриальной поры перехода проницаемости. [9]
Подсемейства
- АТФаза, комплекс Vo, протеолипидная субъединица C, InterPro : IPR000245
- АТФаза, комплекс Fo, субъединица C InterPro : IPR000454
Белки человека, содержащие этот домен
ATP5MC1 ; ATP5G2 ; ATP5G3 ; ATP6V0B ; ATP6V0C ;
Смотрите также
Ссылки
- ^ Kühlbrandt W, Davies KM (январь 2016 г.). «Вращающиеся АТФазы: новый поворот в древней машине». Trends in Biochemical Sciences . 41 (1): 106– 116. doi :10.1016/j.tibs.2015.10.006. PMID 26671611.
- ^ Muller V, Cross RL (2004). «Эволюция АТФ-синтаз и АТФаз A-, F- и V-типа: инверсии функций и изменения в соотношении связей H+/АТФ». FEBS Lett . 576 (1): 1– 4. doi : 10.1016/j.febslet.2004.08.065 . PMID 15473999. S2CID 25800744.
- ^ Чжан X, Нива Х, Раппас М (2004). «Механизмы АТФаз — многопрофильный подход». Curr Protein Pept Sci . 5 (2): 89– 105. doi :10.2174/1389203043486874. PMID 15078220.
- ^ Itoh H, Yoshida M, Yasuda R, Noji H, Kinosita K (2001). «Разрешение отдельных вращательных подшагов с помощью субмиллисекундного кинетического анализа F1-АТФазы». Nature . 410 (6831): 898– 904. Bibcode :2001Natur.410..898Y. doi :10.1038/35073513. PMID 11309608. S2CID 3274681.
- ^ Wilkens S, Zheng Y, Zhang Z (2005). «Структурная модель вакуолярной АТФазы с помощью просвечивающей электронной микроскопии». Micron . 36 (2): 109– 126. doi :10.1016/j.micron.2004.10.002. PMID 15629643.
- ^ Fillingame RH, Angevine CM, Дмитриев OY (2003). "Механика сопряжения движений протонов с вращением c-кольца в АТФ-синтазе". FEBS Lett . 555 (1): 29– 34. doi : 10.1016/S0014-5793(03)01101-3 . PMID 14630314. S2CID 38896804.
- ^ Inoue T, Forgac M (2005). «Цистеин-опосредованное перекрестное связывание указывает на то, что субъединица C V-АТФазы находится в непосредственной близости от субъединиц E и G домена V1 и субъединицы a домена V0». J. Biol. Chem . 280 (30): 27896– 27903. doi : 10.1074/jbc.M504890200 . PMID 15951435.
- ^ Jones R, Findlay JB, Harrison M, Durose L, Song CF, Barratt E, Trinick J (2003). «Структура и функция вакуолярной H+-АТФазы: переход от моделей с низким разрешением к структурам с высоким разрешением». J. Bioenerg. Biomembr . 35 (4): 337– 345. doi :10.1023/A:1025728915565. PMID 14635779. S2CID 43788207.
- ^ Бонора, М; Бонони, А; Де Марки, Э; Георгий, К; Лебедзинская, М; Марки, С; Патерньяни, С; Римесси, А; Суски, Дж. М.; Войтала, А; Вецковски, MR; Кремер, Г; Галлуцци, Л; Пинтон, П. (15 февраля 2013 г.). «Роль субъединицы c FO АТФ-синтазы в переходе проницаемости митохондрий». Клеточный цикл . 12 (4): 674–83 . doi : 10.4161/cc.23599. ПМЦ 3594268 . ПМИД 23343770.
