АТП6В1Ф

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
АТП6В1Ф
Идентификаторы
ПсевдонимыATP6V1F , ATP6S14, VATF, Vma7, АТФаза H+, транспортирующая субъединицу V1 F
Внешние идентификаторыOMIM : 607160; MGI : 1913394; HomoloGene : 3119; GeneCards : ATP6V1F; OMA : ATP6V1F - ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез
Ансамбль
UniProt
РефСек (мРНК)

NM_004231
NM_001198909

NM_025381

RefSeq (белок)

NP_001185838
NP_004222

NP_079657

Местоположение (UCSC)Хр 7: 128.86 – 128.87 МбХр 6: 29.47 – 29.47 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши
Семейство белков
АТФ-синтез_F
Идентификаторы
СимволАТФ-синтез_F
ПфамПФ01990
ИнтерПроIPR008218
Доступные структуры белков:
Пфам  структуры / ECOD  
ПДБRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsumрезюме структуры

Субъединица F протонной АТФазы V-типа — это фермент , который у человека кодируется геном ATP6V1F . [ 5] [6] [7]

Этот ген кодирует компонент вакуолярной АТФазы (V-АТФаза), мультисубъединичного фермента, который опосредует закисление эукариотических внутриклеточных органелл. Зависимое от V-АТФазы закисление органелл необходимо для таких внутриклеточных процессов, как сортировка белков, активация зимогена, рецептор-опосредованный эндоцитоз и генерация протонного градиента синаптических везикул. V-АТФаза состоит из цитозольного домена V1 и трансмембранного домена V0. Домен V1 состоит из трех субъединиц A и трех субъединиц B, двух субъединиц G плюс субъединицы C, D, E, F и H. Домен V1 содержит каталитический сайт АТФ. Домен V0 состоит из пяти различных субъединиц: a, c, c', c", и d. Дополнительные изоформы многих белков субъединиц V1 и V0 кодируются несколькими генами или альтернативно сплайсированными вариантами транскриптов. Этот кодируемый белок является белком субъединицы F домена V1. [7]

Субъединица F — это белок массой 16 кДа , который необходим для сборки и активности V-АТФазы и играет потенциальную роль в дифференциальном нацеливании и регуляции фермента для определенных органелл . Эта субъединица не является необходимой для вращения ротора АТФазы V1, но она способствует катализу. [8]

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000128524 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000004285 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Fujiwara T, Kawai A, Shimizu F, Hirano H, Okuno S, Takeda S, Ozaki K, Shimada Y, Nagata M, Watanabe T и др. (март 1996 г.). «Клонирование, секвенирование и экспрессия новой кДНК, кодирующей человеческую вакуолярную АТФазу (субъединица 14 кДа)». DNA Res . 2 (3): 107– 11. doi : 10.1093/dnares/2.3.107 . PMID  8581736.
  6. ^ Peng SB, Crider BP, Tsai SJ, Xie XS, Stone DK (июнь 1996 г.). «Идентификация субъединицы 14 кДа, связанной с каталитическим сектором везикул H+-АТФазы, покрытых клатрином». J Biol Chem . 271 (6): 3324– 7. doi : 10.1074/jbc.271.6.3324 . PMID  8621738.
  7. ^ ab "Ген Entrez: ATP6V1F АТФаза, транспортирующая H+, лизосомальная 14kDa, субъединица F V1".
  8. ^ Имамура Х., Икеда С., Йошида М., Йокояма К. (апрель 2004 г.). «Субъединица F АТФазы V1 Thermus thermophilus способствует активности АТФазы, но не является необходимой для вращения». J. Biol. Chem . 279 (17): 18085– 90. doi : 10.1074/jbc.M314204200 . PMID  14963028.

Дальнейшее чтение

  • Finbow ME, Harrison MA (1997). «Вакуолярная H+-АТФаза: универсальный протонный насос эукариот». Biochem. J . 324 (3): 697– 712. doi :10.1042/bj3240697. PMC  1218484 . PMID  9210392.
  • Stevens TH, Forgac M (1998). «Структура, функция и регуляция вакуолярной (H+)-АТФазы». Annu. Rev. Cell Dev. Biol . 13 : 779– 808. doi :10.1146/annurev.cellbio.13.1.779. PMID  9442887.
  • Nelson N, Harvey WR (1999). «Вакуолярные и плазматические мембранные протон-аденозинтрифосфатазы». Physiol. Rev. 79 ( 2): 361– 85. doi :10.1152/physrev.1999.79.2.361. PMID  10221984. S2CID  1477911.
  • Форгак М (1999). «Структура и свойства вакуолярных (H+)-АТФаз». J. Biol. Chem . 274 (19): 12951– 4. doi : 10.1074/jbc.274.19.12951 . PMID  10224039.
  • Kane PM (1999). "Введение: V-АТФазы 1992-1998". J. Bioenerg. Biomembr . 31 (1): 3– 5. doi :10.1023/A:1001884227654. PMID  10340843.
  • Wieczorek H, Brown D, Grinstein S и др. (1999). «Энергизация плазматической мембраны животных протон-движущими V-АТФазами». BioEssays . 21 (8): 637– 48. doi :10.1002/(SICI)1521-1878(199908)21:8<637::AID-BIES3>3.0.CO;2-W. PMID  10440860. S2CID  23505139.
  • Ниши Т., Форгак М. (2002). «Вакуолярные (H+)-АТФазы — самые универсальные протонные насосы природы». Nat. Rev. Mol. Cell Biol . 3 (2): 94– 103. doi :10.1038/nrm729. PMID  11836511. S2CID  21122465.
  • Кавасаки-Ниши С., Ниши Т., Форгач М. (2003). «Транслокация протонов, вызванная гидролизом АТФ в V-АТФазах». FEBS Lett . 545 (1): 76– 85. doi :10.1016/S0014-5793(03)00396-X. PMID  12788495. S2CID  10507213.
  • Morel N (2004). «Высвобождение нейротрансмиттера: темная сторона вакуолярной H+АТФазы». Biol. Cell . 95 (7): 453– 7. doi : 10.1016/S0248-4900(03)00075-3 . PMID  14597263. S2CID  17519696.
  • Cross SH, Charlton JA, Nan X, Bird AP (1994). «Очистка CpG-островков с использованием колонки для связывания метилированной ДНК». Nat. Genet . 6 (3): 236– 44. doi :10.1038/ng0394-236. PMID  8012384. S2CID  12847618.
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH и др. (2003). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241. PMID  12477932 .


В статье использован текст из общедоступных источников Pfam и InterPro : IPR008218


Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=ATP6V1F&oldid=1115840053"