ARID4B

ARID4B
Идентификаторы
Псевдонимы	ARID4B , BCAA, BRCAA1, RBBP1L1, RBP1L1, SAP180, домен взаимодействия 4B, богатый AT
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 609696; МГИ : 2137512; гомологен : 12847; GeneCards : ARID4B; OMA :ARID4B — ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 1 (человек)
Конец	235,328,219 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 13 (мышь)
Конец	14,374,188 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верх выражен в
	Эпителий сосудистого сплетения; ; сперма; ; париетальная плевра; ; висцеральная плевра; ; эпителий носоглотки; ; большеберцовая кость; ; Ахиллово сухожилие; ; зародышевый эпителий; ; икроножный нерв; ; клетка слизистой оболочки щеки;
	Верх выражен в
	хвост эмбриона; ; восходящая аорта; ; аортальный клапан; ; собирательный проток мозгового вещества; ; супраоптическое ядро; ; генитальный бугорок; ; кучевые ячейки; ; тройничный ганглий; ; ганглионарное возвышение; ; кровь;
	Больше данных по справочным выражениям
	Больше данных по справочным выражениям
Генная онтология
Молекулярная функция	связывание ДНК; связывание белков; активность гистондеацетилазы; молекулярная функция; ДНК-связывающий фактор транскрипции активность, РНК-полимераза II-специфическая;
Клеточный компонент	цитоплазма; нуклеоплазма; ядро; клеточный компонент;
Биологический процесс	регуляция экспрессии генов путем генетического импринтинга; регуляция транскрипции, ДНК-шаблонная; установление барьера из клеток Сертоли; регуляция транскрипции РНК-полимеразой II; триметилирование гистона H4-K20; транскрипция, ДНК-шаблон; триметилирование гистона H3-K9; сперматогенез; положительная регуляция транскрипции РНК-полимеразой II; деацетилирование гистонов; биологический процесс; организация хроматина;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	51742
	94246
	ENSG00000054267
	ENSMUSG00000039219
	Q4LE39
	А2CG63
	НМ_001206794 ; НМ_016374 ; НМ_031371
	NM_194262 ; NM_198122
	НП_001193723 ; НП_057458 ; НП_112739
	NP_919238 ; NP_937755
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок

Белок 4B, содержащий интерактивный домен, богатый AT, представляет собой белок , который у людей кодируется геном ARID4B . ^[5]^[6]

Функция

Этот ген кодирует белок с последовательностью, схожей с ретинобластома -связывающим белком-1. Кодируемый белок является субъединицей транскрипционного корепрессорного комплекса SIN3A , зависимого от гистондеацетилазы , который функционирует в различных клеточных процессах, включая пролиферацию , дифференциацию , апоптоз , онкогенез и определение судьбы клетки . Продукт гена распознается антителом IgG , выделенным у пациента с раком молочной железы , и, по-видимому, является молекулярным маркером , связанным с широким спектром злокачественных новообразований человека. Были охарактеризованы альтернативные варианты транскрипционного сплайсинга , кодирующие различные изоформы . ^[6]

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000054267 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000039219 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Cao J, Gao T, Stanbridge EJ, Irie R (август 2001 г.). "RBP1L1, ген, связанный с белком, связывающим ретинобластому, кодирующий антигенный эпитоп, обильно экспрессируемый в человеческих карциномах и нормальных яичках". J Natl Cancer Inst . 93 (15): 1159– 65. doi : 10.1093/jnci/93.15.1159 . PMID 11481388.
^ ab "Ген Entrez: ARID4B AT богатый интерактивный домен 4B (подобный RBP1)".

Внешние ссылки

Расположение генома человека ARID4B и страница с подробностями гена ARID4B в браузере геномов UCSC .

Дальнейшее чтение

Andersen JS, Lyon CE, Fox AH, Leung AK, Lam YW, Steen H, Mann M, Lamond AI (2002). «Направленный протеомный анализ ядрышка человека». Curr. Biol . 12 (1): 1– 11. doi : 10.1016/S0960-9822(01)00650-9 . PMID 11790298. S2CID 14132033.
Bommel H, Xie G, Rossoll W, Wiese S, Jablonka S, Boehm T, Sendtner M (2003). «Миссенс-мутация в гене тубулин-специфического шаперона E (Tbce) у мутантной мышиной прогрессирующей моторной нейронопатии, модели заболевания мотонейронов человека». J. Cell Biol . 159 (4): 563– 9. doi :10.1083/jcb.200208001. PMC 2173089. PMID 12446740 .
Fleischer TC, Yun UJ, Ayer DE (2003). «Идентификация и характеристика трех новых компонентов комплекса корепрессора mSin3A». Mol. Cell. Biol . 23 (10): 3456– 67. doi :10.1128/MCB.23.10.3456-3467.2003. PMC 164750. PMID 12724404 .
Cui D, Jin G, Gao T, Sun T, Tian F, Estrada GG, Gao H, Sarai A (2004). «Характеристика BRCAA1 и идентификация его нового антигенного эпитопа». Cancer Epidemiol. Biomarkers Prev . 13 (7): 1136– 45. doi : 10.1158/1055-9965.1136.13.7 . PMID 15247124. S2CID 28408982.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP (2004). "Крупномасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa". Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 101 (33): 12130– 5. Bibcode : 2004PNAS..10112130B. doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC 514446. PMID 15302935 .
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Cell . 127 (3): 635– 48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983. S2CID 7827573.

Эта статья о гене на человеческой хромосоме 1 — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000054267 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000039219 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid11481388-5] Cao J, Gao T, Stanbridge EJ, Irie R (август 2001 г.). "RBP1L1, ген, связанный с белком, связывающим ретинобластому, кодирующий антигенный эпитоп, обильно экспрессируемый в человеческих карциномах и нормальных яичках". J Natl Cancer Inst . 93 (15): 1159– 65. doi : 10.1093/jnci/93.15.1159 . PMID 11481388.

[entrez-6] "Ген Entrez: ARID4B AT богатый интерактивный домен 4B (подобный RBP1)".