ARHGDIB
Ген, кодирующий белок у человека

ARHGDIB
Доступные структуры
ПДБПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыARHGDIB , D4, GDIA2, GDID4, LYGDI, Ly-GDI, RAP1GN1, RhoGDI2, Rho ингибитор диссоциации GDP бета
Внешние идентификаторыОМИМ : 602843; МГИ : 101940; гомологен : 20318; GeneCards : ARHGDIB; OMA :ARHGDIB — ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез

397

11857

Ансамбль

ENSG00000111348

ENSMUSG00000030220

UniProt

Р52566

Q61599

РефСек (мРНК)

NM_001175
NM_001321420
NM_001321421
NM_001321422
NM_001321423

RefSeq (белок)

NP_001166
NP_001308349
NP_001308350
NP_001308351
NP_001308352

Местоположение (UCSC)Хр 12: 14.94 – 14.96 МбХр 6: 136.9 – 136.92 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Ингибитор диссоциации Rho GDP 2 — это белок , который у людей кодируется геном ARHGDIB . [ 5] [6] [7] Псевдонимы этого гена включают RhoGDI2 , GDID4 , Rho GDI 2 и другие. [8]

Взаимодействия

Было показано, что ARHGDIB взаимодействует с VAV1 [9] и Src . [10]

Семейство генов

RhoGDI2 (ARHGDIB) является частью семейства из трех членов: RhoGDI1 , RhoGDI2 (также известный как RhoGDIB, D4-GDI или Ly-GDI) и RhoGDI3 . RhoGDI1 экспрессируется во многих органах и является наиболее изученным членом семейства. [11] [12] [13] Первоначально считалось, что RhoGDI2 экспрессируется конкретно в кроветворных клетках, [6] но впоследствии было обнаружено, что он также высоко экспрессируется в различных других типах клеток. [14] RhoGDI3 преимущественно экспрессируется в мозге, легких, почках, яичках и поджелудочной железе, [15] [16] и нацелен на определенные части клетки, такие как аппарат Гольджи, где он может играть роль в транспорте или белках в клетках. [17] [18]

Вовлечение в болезнь

Несмотря на высокую степень сходства последовательностей, RhoGDI1 и RhoGDI2 сильно различаются по своей связывающей способности со специфическими ГТФазами [ 19] и, что более важно, по своей роли в образовании опухолей и распространении опухоли на другие органы (процесс метастазирования ). [20] Например, RhoGDI2 функционирует как супрессор метастазов, но не как супрессор опухолей в клетках рака мочевого пузыря [14] [21], в то время как RhoGDI1 является повсеместным супрессором роста опухоли во всех участках, которые до сих пор исследовались в моделях рака мочевого пузыря), [ 22], что позволяет предположить, что их клеточные функции должны различаться, чтобы вызывать эти дифференциальные эффекты.

Хотя существуют четкие связи между изменением уровней белка RhoGDI2 и прогрессированием заболевания и/или метастазированием при нескольких типах рака, механистические основы способа действия RhoGDI2 в канцерогенных клеточных условиях только сейчас начинают пониматься. Доказательства показывают, что RhoGDI2 ингибирует ось эндотелина и перекрестные помехи с макрофагами в микрометастатической микросреде для ингибирования метастатического разрастания. [23] Таким образом, RhoGDI2 может оказаться важным в регуляции покоя опухоли. Нацеливание на эту ось с помощью перорально доступных антагонистов рецепторов эндотелина [24] может оказаться эффективным для имитации ингибирующей роли RhoGDI2 путем предотвращения инфильтрации макрофагов в микрометастатическую нишу. [25] Недавние исследования также определили, что генетическое и фармакологическое нацеливание на лиганд 2 хемокина (мотив CC) ( CCL2 ), также известный как моноцитарный хемотаксический белок-1 (MCP-1) или малый индуцируемый цитокин A2, его рецептор CCR2 и фармакологическая абляция макрофагов также могут фенокопировать эффект экспрессии RhoGDI2 для предотвращения метастатической колонизации легких67 и что RhoGDI2 является супрессором версикана , белка, который, как было показано, способствует миграции клеток [26] и метастазированию в нескольких моделях опухолей.

В отличие от его роли в качестве супрессора метастазов при раке мочевого пузыря, в молочной железе экспрессия RhoGDI2, как сообщается, повышается при раке [27] и способствует инвазии клеток рака молочной железы [28] , в то время как в другом отчете обнаружен двухфазный паттерн экспрессии RhoGDI2 при раке молочной железы со сниженной экспрессией, коррелирующей с метастазами в лимфатические узлы. [29]

Антитела ARHGDIB могут быть маркером долгосрочной потери почечного трансплантата у реципиентов почек умершего донора. [30]

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000111348 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000030220 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Lelias JM, Adra CN, Wulf GM, Guillemot JC, Khagad M, Caput D и др. (февраль 1993 г.). «cDNA cloning of a human mRNA preferredly expressed in hematopoietic cells and with homology to a GDP-dissociation inhibition for the rho GTP-binding proteins». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 90 (4): 1479– 1483. Bibcode : 1993PNAS...90.1479L. doi : 10.1073 /pnas.90.4.1479 . PMC 45897. PMID  8434008. 
  6. ^ ab Scherle P, Behrens T, Staudt LM (август 1993 г.). "Ly-GDI, ингибитор GDP-диссоциации белка, связывающего RhoA GTP, экспрессируется преимущественно в лимфоцитах". Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 90 (16): 7568– 7572. Bibcode : 1993PNAS...90.7568S. doi : 10.1073 /pnas.90.16.7568 . PMC 47183. PMID  8356058. 
  7. ^ "Ген Entrez: ингибитор диссоциации GDP ARHGDIB Rho (GDI) бета".
  8. ^ «Генные карты: ARHGDIB».
  9. ^ Гройсман М, Рассек CS, Кацав С (февраль 2000). «Vav, фактор обмена нуклеотидов GDP/GTP, взаимодействует с GDI, белками, которые ингибируют диссоциацию GDP/GTP». FEBS Letters . 467 (1): 75– 80. Bibcode : 2000FEBSL.467...75G. doi : 10.1016/S0014-5793(00)01121-2 . PMID  10664460. S2CID  40103095.
  10. ^ Wu Y, Moissoglu K, Wang H, Wang X, Frierson HF, Schwartz MA и др. (апрель 2009 г.). «Src-фосфорилирование RhoGDI2 регулирует его функцию супрессора метастазов». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 106 (14): 5807– 5812. Bibcode : 2009PNAS..106.5807W. doi : 10.1073/pnas.0810094106 . PMC 2667073. PMID  19321744 . 
  11. ^ DerMardirossian C, Bokoch GM (июль 2005 г.). «GDI: центральные регуляторные молекулы в активации Rho GTPase». Trends in Cell Biology . 15 (7): 356–363 . doi :10.1016/j.tcb.2005.05.001. PMID  15921909. S2CID  12222421.
  12. ^ Dovas A, Couchman JR (август 2005 г.). «RhoGDI: множественные функции в регуляции активности ГТФазы семейства Rho». The Biochemical Journal . 390 (Pt 1): 1– 9. doi :10.1042/BJ20050104. PMC 1184558. PMID  16083425 . 
  13. ^ Garcia-Mata R, Boulter E, Burridge K (июль 2011 г.). «Невидимая рука»: регуляция RHO GTPases с помощью RHOGDI». Nature Reviews. Molecular Cell Biology . 12 (8): 493– 504. doi :10.1038/nrm3153. PMC 3260518. PMID  21779026 . 
  14. ^ ab Theodorescu D, Sapinoso LM, Conaway MR, Oxford G, Hampton GM, Frierson HF (июнь 2004 г.). «Сниженная экспрессия супрессора метастазов RhoGDI2 связана с пониженной выживаемостью пациентов с раком мочевого пузыря». Clinical Cancer Research . 10 (11): 3800–3806 . doi : 10.1158/1078-0432.CCR-03-0653 . PMID  15173088.
  15. ^ Adra CN, Manor D, Ko JL, Zhu S, Horiuchi T, Van Aelst L и др. (апрель 1997 г.). «RhoGDIgamma: ингибитор GDP-диссоциации для белков Rho с преимущественной экспрессией в мозге и поджелудочной железе». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 94 (9): 4279– 4284. Bibcode : 1997PNAS ...94.4279A. doi : 10.1073/pnas.94.9.4279 . PMC 20713. PMID  9113980. 
  16. ^ Zalcman G, Closson V, Camonis J, Honoré N, Rousseau-Merck MF, Tavitian A и др. (ноябрь 1996 г.). «RhoGDI-3 — новый ингибитор диссоциации GDP (GDI). Идентификация нецитозольного белка GDI, взаимодействующего с малыми белками, связывающими GTP, RhoB и RhoG». Журнал биологической химии . 271 (48): 30366– 30374. doi : 10.1074/jbc.271.48.30366 . PMID  8939998.
  17. ^ Brunet N, Morin A, Olofsson B (май 2002 г.). «RhoGDI-3 регулирует RhoG и направляет этот белок в комплекс Гольджи через свой уникальный N-концевой домен». Traffic . 3 (5): 342– 357. doi : 10.1034/j.1600-0854.2002.30504.x . PMID  11967128. S2CID  19351109.
  18. ^ Dransart E, Morin A, Cherfils J, Olofsson B (февраль 2005 г.). «Разъединение ингибирующих и челночных функций ингибиторов диссоциации rho GDP». Журнал биологической химии . 280 (6): 4674– 4683. doi : 10.1074/jbc.M409741200 . PMID  15513926.
  19. ^ Gorvel JP, Chang TC, Boretto J, Azuma T, Chavrier P (январь 1998 г.). «Дифференциальные свойства D4/LyGDI по сравнению с RhoGDI: фосфорилирование и селективность rho GTPase». FEBS Letters . 422 (2): 269– 273. Bibcode : 1998FEBSL.422..269G. doi : 10.1016/S0014-5793(98)00020-9. PMID  9490022. S2CID  10817327.
  20. ^ Harding MA, Theodorescu D (май 2010). «Сигнализация RhoGDI обеспечивает цели для терапии рака». European Journal of Cancer . 46 (7): 1252– 1259. doi :10.1016/j.ejca.2010.02.025. PMC 11207191. PMID  20347589 . 
  21. ^ Gildea JJ, Seraj MJ, Oxford G, Harding MA, Hampton GM, Moskaluk CA и др. (ноябрь 2002 г.). «RhoGDI2 — ген-супрессор инвазии и метастазирования при раке человека». Cancer Research . 62 (22): 6418– 6423. PMID  12438227.
  22. ^ Moissoglu K, McRoberts KS, Meier JA, Theodorescu D, Schwartz MA (апрель 2009 г.). «Ингибитор диссоциации Rho GDP 2 подавляет метастазы посредством нетрадиционной регуляции RhoGTPases». Cancer Research . 69 (7): 2838– 2844. doi :10.1158/0008-5472.CAN-08-1397. PMC 2701105 . PMID  19276387. 
  23. ^ Саид Н., Смит С., Санчес-Карбайо М., Теодореску Д. (январь 2011 г.). «Опухолевый эндотелин-1 усиливает метастатическую колонизацию легких в мышиных моделях ксенотрансплантата рака мочевого пузыря». Журнал клинических исследований . 121 (1): 132– 147. doi :10.1172/JCI42912. PMC 3007145. PMID  21183790 . 
  24. ^ Nelson J, Bagnato A, Battistini B, Nisen P (февраль 2003 г.). «Ось эндотелина: новая роль в раке». Nature Reviews. Cancer . 3 (2): 110– 116. doi :10.1038/nrc990. PMID  12563310. S2CID  22954469.
  25. ^ Саид Н., Санчес-Карбайо М., Смит СК., Теодореску Д. (апрель 2012 г.). «RhoGDI2 подавляет метастазы в легких у мышей, снижая экспрессию версикана в опухоли и инфильтрацию макрофагов». Журнал клинических исследований . 122 (4): 1503–1518 . doi :10.1172/JCI61392. PMC 3314474. PMID 22406535  . 
  26. ^ Wu Y, Siadaty MS, Berens ME, Hampton GM, Theodorescu D (ноябрь 2008 г.). «Перекрывающиеся профили экспрессии генов миграции клеток и инвазии опухоли при раке мочевого пузыря человека идентифицируют металлотионеин 1E и никотинамид N-метилтрансферазу как новые регуляторы миграции клеток». Oncogene . 27 (52): 6679– 6689. doi :10.1038/onc.2008.264. PMC 5373842 . PMID  18724390. 
  27. ^ Moon HG, Jeong SH, Ju YT, Jeong CY, Lee JS, Lee YJ и др. (сентябрь 2010 г.). «Повышенная регуляция RhoGDI2 при раке груди у человека и ее прогностические последствия». Cancer Research and Treatment . 42 (3): 151– 156. doi :10.4143/crt.2010.42.3.151. PMC 2953778 . PMID  20948920. 
  28. ^ Чжан Y, Чжан B (июнь 2006 г.). «D4-GDI, регулятор Rho GTPase, способствует инвазивности клеток рака груди». Cancer Research . 66 (11): 5592– 5598. doi :10.1158/0008-5472.CAN-05-4004. PMID  16740694.
  29. ^ Hu LD, Zou HF, Zhan SX, Cao KM (июнь 2007 г.). «Двухфазная экспрессия RhoGDI2 при прогрессировании рака молочной железы и ее отрицательная связь с метастазами в лимфатические узлы». Oncology Reports . 17 (6): 1383– 1389. doi : 10.3892/or.17.6.1383 . PMID  17487395.
  30. ^ Камбурова Э.Г., Грюйтерс М.Л., Кардол-Хефнагель Т., Виссе Б.В., Йоостен И., Аллебес В.А. и др. (декабрь 2019 г.). «Антитела против ARHGDIB связаны с долгосрочной потерей почечного трансплантата». Американский журнал трансплантологии . 19 (12): 3335–3344 . doi :10.1111/ajt.15493. ПМК 6899679 . ПМИД  31194283. 

Дальнейшее чтение

  • Aebersold R, Leavitt J (июль 1990 г.). «Анализ последовательности белков, разделенных электрофорезом в полиакриламидном геле: на пути к интегрированной базе данных белков». Электрофорез . 11 (7): 517– 527. doi :10.1002/elps.1150110702. PMID  2226408. S2CID  22226075.
  • Шишева А, Südhof TC, чешский депутат (май 1994 г.). «Клонирование, характеристика и экспрессия новой изоформы ингибитора диссоциации GDP из скелетных мышц». Молекулярная и клеточная биология . 14 (5): 3459– 3468. doi :10.1128/mcb.14.5.3459. PMC  358710. PMID  7513052 .
  • Adra CN, Kobayashi H, Rowley JD, Lim B (ноябрь 1994 г.). «Присвоение гена GDID4 человека, регулятора обмена GDP/GTP, хромосоме 12p12.3». Genomics . 24 (1): 188– 190. doi :10.1006/geno.1994.1601. PMID  7896279.
  • Leffers H, Nielsen MS, Andersen AH, Honoré B, Madsen P, Vandekerckhove J, et al. (Декабрь 1993). «Идентификация двух белков-ингибиторов диссоциации Rho GDP человека, избыточная экспрессия которых приводит к нарушению актинового цитоскелета». Experimental Cell Research . 209 (2): 165– 174. doi :10.1006/excr.1993.1298. PMID  8262133.
  • Adra CN, Manor D, Ko JL, Zhu S, Horiuchi T, Van Aelst L и др. (апрель 1997 г.). «RhoGDIgamma: ингибитор GDP-диссоциации для белков Rho с преимущественной экспрессией в мозге и поджелудочной железе». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 94 (9): 4279– 4284. Bibcode : 1997PNAS...94.4279A. doi : 10.1073 /pnas.94.9.4279 . PMC  20713. PMID  9113980.
  • Takahashi K, Sasaki T, Mammoto A, Takaishi K, Kameyama T, Tsukita S и др. (сентябрь 1997 г.). «Прямое взаимодействие ингибитора диссоциации Rho GDP с эзрином/радиксином/моэзином инициирует активацию малого белка Rho G». Журнал биологической химии . 272 ​​(37): 23371– 23375. doi : 10.1074/jbc.272.37.23371 . PMID  9287351.
  • Gorvel JP, Chang TC, Boretto J, Azuma T, Chavrier P (январь 1998 г.). «Дифференциальные свойства D4/LyGDI по сравнению с RhoGDI: фосфорилирование и селективность rho GTPase». FEBS Letters . 422 (2): 269– 273. Bibcode : 1998FEBSL.422..269G. doi : 10.1016/S0014-5793(98)00020-9. PMID  9490022. S2CID  10817327.
  • Illenberger D, Schwald F, Pimmer D, Binder W, Maier G, Dietrich A и др. (Ноябрь 1998 г.). "Стимуляция фосфолипазы C-бета2 Rho GTPases Cdc42Hs и Rac1". The EMBO Journal . 17 (21): 6241– 6249. doi :10.1093/emboj/17.21.6241. PMC  1170950. PMID  9799233 .
  • Scheffzek K, Stephan I, Jensen ON, Illenberger D, Gierschik P (февраль 2000 г.). «Комплекс Rac-RhoGDI и структурная основа регуляции белков Rho с помощью RhoGDI». Nature Structural Biology . 7 (2): 122– 126. doi :10.1038/72392. PMID  10655614. S2CID  6759163.
  • Гройсман М, Рассек ЧС, Кацав С (февраль 2000 г.). «Vav, фактор обмена нуклеотидов GDP/GTP, взаимодействует с GDI, белками, которые ингибируют диссоциацию GDP/GTP». FEBS Letters . 467 (1): 75– 80. Bibcode : 2000FEBSL.467...75G. doi : 10.1016/S0014-5793(00)01121-2 . PMID  10664460. S2CID  40103095.
  • Kasper B, Tidow N, Grothues D, Welte K (май 2000 г.). «Дифференциальная экспрессия и регуляция GTPases (RhoA и Rac2) и GDI (LyGDI и RhoGDI) в нейтрофилах пациентов с тяжелой врожденной нейтропенией». Blood . 95 (9): 2947– 2953. doi :10.1182/blood.V95.9.2947.009k10_2947_2953. PMID  10779444.
  • Fauré J, Dagher MC (май 2001). "Взаимодействие между Rho GTPases и ингибитором диссоциации Rho GDP (Rho-GDI)". Biochimie . 83 (5): 409– 414. doi :10.1016/S0300-9084(01)01263-9. PMID  11368848.
  • Li X, Bu X, Lu B, Avraham H, Flavell RA, Lim B (февраль 2002 г.). «Гемопоэз-специфический GTP-связывающий белок RhoH является дефицитным по GTPase и модулирует активность других Rho GTPases с помощью ингибирующей функции». Молекулярная и клеточная биология . 22 (4): 1158– 1171. doi :10.1128/MCB.22.4.1158-1171.2002. PMC  134637. PMID  11809807 .
  • Kwon KB, Park EK, Ryu DG, Park BH (март 2002 г.). «D4-GDI расщепляется каспазой-3 во время апоптоза, вызванного даунорубицином, в клетках HL-60». Experimental & Molecular Medicine . 34 (1): 32– 37. doi : 10.1038/emm.2002.5 . PMID  11989976.
  • Thiede B, Siejak F, Dimmler C, Rudel T (август 2002 г.). «Прогнозирование транслокации и расщепления гетерогенных рибонуклеарных белков и ингибитора диссоциации нуклеотидов Rho-гуанина 2 во время апоптоза с помощью субклеточного протеомного анализа». Proteomics . 2 (8): 996– 1006. doi :10.1002/1615-9861(200208)2:8<996::AID-PROT996>3.0.CO;2-3. PMID  12203895. S2CID  43679806.
  • Гройсман М., Хорнштейн И., Альковер А., Кацав С. (декабрь 2002 г.). «Vav1 и Ly-GDI — два регулятора Rho ГТФаз, функционируют совместно как передатчики сигналов в путях, индуцированных рецепторами антигенов Т-клеток». Журнал биологической химии . 277 (51): 50121– 50130. doi : 10.1074/jbc.M204299200 . PMID  12386169.
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=ARHGDIB&oldid=1248025955"