ARHGAP29 — это ген , расположенный на хромосоме 1p22, который кодирует белок, активирующий Rho GTPase (GAP) 29, [5] белок , который опосредует циклическую регуляцию малых GTP-связывающих белков, таких как RhoA. [6]
Функция
ARHGAP29 экспрессируется в развивающемся лице и может действовать ниже IRF6 в краниофациальном развитии. [7]
Структура
ARHGAP29 содержит четыре домена, включая спиральную область, которая, как известно, взаимодействует с Rap2, [8] домен C1, домен Rho GTPase и небольшую C-концевую область, которая взаимодействует с PTPL1. [6]
Клиническое значение
Локус 1p22, содержащий ARHGAP29, был связан с несиндромной расщелиной губы/неба с помощью геномной ассоциации [9] и метаанализа. [10] Последующее исследование [7] выявило редкие варианты кодирования, включая нонсенс и вариант со сдвигом рамки считывания у пациентов с несиндромной расщелиной губы/неба . Открытие роли ARHGAP29 в краниофациальном развитии было сделано после того, как соседний ген ABCA4 не имел функциональных или экспрессионных данных, подтверждающих его как этиологический ген несиндромной расщелины губы/неба, хотя однонуклеотидные полиморфизмы в гене ABCA4 были связаны с расщелиной губы/неба.
Ссылки
^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000137962 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000039831 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Heasman SJ, Ridley AJ (сентябрь 2008 г.). «Rho GTPases млекопитающих: новые сведения об их функциях из исследований in vivo». Nature Reviews. Molecular Cell Biology . 9 (9): 690– 701. doi :10.1038/nrm2476. PMID 18719708. S2CID 16205866.
^ ab Saras J, Franzén P, Aspenström P, Hellman U, Gonez LJ, Heldin CH (сентябрь 1997 г.). «Новый белок, активирующий ГТФазу для Rho, взаимодействует с доменом PDZ протеин-тирозиновой фосфатазы PTPL1». Журнал биологической химии . 272 (39): 24333– 24338. doi : 10.1074/jbc.272.39.24333 . PMID 9305890.
^ ab Leslie EJ, Mansilla MA, Biggs LC, Schuette K, Bullard S, Cooper M и др. (ноябрь 2012 г.). «Анализ экспрессии и мутаций указывает на ARHGAP29 как на этиологический ген заячьей губы с локусом заячьей губы или без него, идентифицированный по геномной ассоциации на хромосоме 1p22». Birth Defects Research. Часть A, Клиническая и молекулярная тератология . 94 (11): 934– 942. doi :10.1002/bdra.23076. PMC 3501616. PMID 23008150 .
^ Мягмар Б.Е., Умикава М., Асато Т., Тайра К., Осиро М., Хино А. и др. (апрель 2005 г.). «PARG1, RhoGAP, связанный с протеин-тирозинфосфатазой, как предполагаемый эффектор Rap2». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 329 (3): 1046–1052 . doi :10.1016/j.bbrc.2005.02.069. ПМИД 15752761.
^ Beaty TH, Murray JC, Marazita ML, Munger RG, Ruczinski I, Hetmanski JB и др. (июнь 2010 г.). «Исследование ассоциаций генома расщелины губы с расщелиной неба и без нее выявляет варианты риска вблизи MAFB и ABCA4». Nature Genetics . 42 (6): 525– 529. doi :10.1038/ng.580. PMC 2941216 . PMID 20436469.
^ Ludwig KU, Mangold E, Herms S, Nowak S, Reutter H, Paul A и др. (сентябрь 2012 г.). «Геномный метаанализ несиндромной расщелины губы с расщелиной неба или без нее выявляет шесть новых локусов риска». Nature Genetics . 44 (9): 968– 971. doi :10.1038/ng.2360. PMC 3598617 . PMID 22863734.
