АПОА4

АПОА4
Идентификаторы
Псевдонимы	APOA4 , аполипопротеин А4
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 107690; МГИ : 88051; гомологен : 47927; Генные карты : APOA4; OMA :APOA4 – ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 11 (человек)
Конец	116,823,304 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 9 (мышь)
Конец	46,154,757 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верх выражен в
	слизистая оболочка тонкой кишки; ; слизистая оболочка подвздошной кишки; ; двенадцатиперстная кишка; ; правая доля печени; ; клетка слизистой оболочки щеки; ; полая вена; ; внутренний бледный шар; ; перикард; ; Понс; ; пилорус;
	Верх выражен в
	двенадцатиперстная кишка; ; тощая кишка; ; желточный мешок; ; мигрирующая энтеральная клетка нервного гребня; ; подвздошная кишка; ; кучевые ячейки; ; кишечный эпителий; ; левая доля печени; ; желудок; ; эпителий тонкой кишки;
	Больше данных по справочным выражениям
	Больше данных по справочным выражениям
Ортологи
	337
	11808
	ENSG00000110244
	ENSMUSG00000032080
	н ; а
	Р06728
	NM_000482
	NM_007468
	н/д
	NP_031494
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Аполипопротеин A-IV (также известный как apoA-IV, apoAIV или apoA4) — это плазменный белок, который является продуктом человеческого гена APOA4 . ^[5]^[6]

Ген

APOA4 находится на хромосоме 11 в тесной связи с APOA1 и APOC3 . APOA4 содержит 3 экзона, разделенных двумя интронами , и является полиморфным , хотя большинство зарегистрированных полиморфизмов последовательностей происходит в экзоне 3. Наиболее подтвержденными и изученными несинонимичными SNP являются замена глутамина → гистидина в кодоне 360 и замена треонина → серина в кодоне 347; полиморфизм последовательностей также был выявлен в 3'UTR третьего экзона. ^[7] Внутривидовой сравнительный анализ последовательностей генов предполагает, что ген APOA4 возник из APOA1 путем дупликации гена приблизительно 270 млн лет назад . ^[8]

Функция

Первичный продукт трансляции гена APOA4 — это препротеин из 396 остатков, который подвергается протеолитической обработке с образованием апо A-IV, зрелого O-связанного гликопротеина из 376 остатков. У большинства млекопитающих, включая людей, синтез апо A-IV ограничен кишечником ; однако у мышей и крыс синтез в печени также происходит. Апо A-IV секретируется в кровоток на поверхности вновь синтезированных частиц хиломикрона . Всасывание жира в кишечнике резко увеличивает синтез и секрецию апо A-IV. Хотя его основная функция в метаболизме липидов у человека не установлена, было обнаружено, что апо A-IV:

активировать лецитин-холестерин ацилтрансферазу и белок-переносчик холестеринэстера in vitro;
играют роль в регуляции аппетита и насыщения в моделях грызунов;
проявлять антиоксидантные и антиатерогенные свойства in vitro и в моделях на грызунах;
модулировать эффективность трансцеллюлярного транспорта липидов в энтероцитах и печени in vitro. ^[7]

Дефицит апо A-IV у человека не зарегистрирован.

Взаимодействия

Было показано, что APOA4 взаимодействует с GPLD1 . ^[9]

Интерактивная карта маршрутов

Нажмите на гены, белки и метаболиты ниже, чтобы перейти к соответствующим статьям. ^{[§ 1]}

^ Интерактивную карту путей можно редактировать на WikiPathways: «Statin_Pathway_WP430».

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000110244 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000032080 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Karathanasis SK, Oettgen P, Haddad IA, Antonarakis SE (ноябрь 1986 г.). «Структура, эволюция и полиморфизмы гена человеческого аполипопротеина A4 (APOA4)». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 83 (22): 8457– 61. Bibcode : 1986PNAS...83.8457K. doi : 10.1073 /pnas.83.22.8457 . PMC 386949. PMID 3095836.
^ Elshourbagy NA, Walker DW, Paik YK, Boguski MS, Freeman M, Gordon JI, Taylor JM (июнь 1987). «Структура и экспрессия гена человеческого аполипопротеина A-IV». J. Biol. Chem . 262 (17): 7973– 81. doi : 10.1016/S0021-9258(18)47513-8 . PMID 3036793.
^ ab «Ген Энтреза: аполипопротеин APOA4 A-IV».
^ Luo CC, Li WH, Moore MN, Chan L (февраль 1986). «Структура и эволюция мультигенного семейства аполипопротеинов». J. Mol. Biol . 187 (3): 325– 340. doi :10.1016/0022-2836(86)90436-5. PMID 3084795.
^ Deeg, MA; Bierman EL; Cheung MC (март 2001 г.). «GPI-специфическая фосфолипаза D ассоциируется с комплексом, содержащим apoA-I и apoA-IV». J. Lipid Res . 42 (3). Соединенные Штаты: 442–51 . doi : 10.1016/S0022-2275(20)31669-2 . ISSN 0022-2275. PMID 11254757.

Дальнейшее чтение

von Eckardstein A, Funke H, Schulte M и др. (1992). «Несинонимичные полиморфные сайты в гене аполипопротеина (апо) A-IV связаны с изменениями концентрации липопротеинов, содержащих апо B и апо AI, в нормальной популяции». American Journal of Human Genetics . 50 (5): 1115– 28. PMC 1682587 . PMID 1349197.
Kamboh MI, Williams ER, Law JC и др. (1993). «Молекулярная основа уникального африканского варианта (A-IV 5) человеческого аполипопротеина A-IV и его значение в липидном метаболизме». Genet. Epidemiol . 9 (6): 379–88 . doi :10.1002/gepi.1370090602. PMID 1487136. S2CID 40107026.
Lohse P, Kindt MR, Rader DJ, Brewer HB (1991). "Три генетических варианта человеческого плазменного аполипопротеина A-IV. apoA-IV-1(Thr347----Ser), apoA-IV-0(Lys167----Glu,Gln360----His) и apoA-IV-3(Glu165----Lys)". J. Biol. Chem . 266 (21): 13513– 8. doi : 10.1016/S0021-9258(18)92728-6 . PMID 1677358.
Tenkanen H, Koskinen P, Metso J, et al. (1992). "Новый полиморфизм аполипопротеина A-IV является результатом замены аспарагина на серин в остатке 127". Biochim. Biophys. Acta . 1138 (1): 27– 33. doi :10.1016/0925-4439(92)90147-f. PMID 1737067.
Lohse P, Kindt MR, Rader DJ, Brewer HB (1990). "Аполипопротеины плазмы человека A-IV-0 и A-IV-3. Молекулярная основа двух редких вариантов аполипопротеина A-IV-1". J. Biol. Chem . 265 (21): 12734– 9. doi : 10.1016/S0021-9258(19)38406-6 . PMID 1973689.
Tenkanen H, Lukka M, Jauhiainen M и др. (1991). «Мутация, вызывающая полиморфизм общего аполипопротеина A-IV, представляет собой замену глутамина на гистидин аминокислоты 360». Arterioscler. Thromb . 11 (4): 851– 6. doi : 10.1161/01.atv.11.4.851 . PMID 2065039.
de Temmerman P, Visvikis S, Boerwinkle E, Siest G (1990). "Изучение сайта с маркировкой последовательности (STS) в начале области гена человеческого апо A4". Nucleic Acids Res . 18 (18): 5576. doi :10.1093/nar/18.18.5576. PMC 332267. PMID 2216752 .
Вэй С., Рокки М., Арчидиаконо Н. и др. (1990). «Физическое картирование области хромосомы человека 11q23, содержащей локус атаксии-телеангиэктазии». Рак Генет. Цитогенет . 46 (1): 1–8 . doi :10.1016/0165-4608(90)90002-R. ПМИД 2331673.
Lohse P, Kindt MR, Rader DJ, Brewer HB (1990). «Генетический полиморфизм человеческого плазменного аполипопротеина A-IV обусловлен заменами нуклеотидов в гене аполипопротеина A-IV». J. Biol. Chem . 265 (17): 10061– 4. doi : 10.1016/S0021-9258(19)38779-4 . PMID 2351649.
Yang CY, Gu ZW, Chong IS и др. (1989). «Первичная структура человеческого аполипопротеина A-IV». Biochim. Biophys. Acta . 1002 (2): 231– 7. doi :10.1016/0005-2760(89)90292-0. PMID 2930771.
Elshourbagy NA, Walker DW, Boguski MS и др. (1986). "Нуклеотидная и производная аминокислотная последовательность мРНК человеческого аполипопротеина A-IV и тесная связь его гена с генами аполипопротеинов AI и C-III". J. Biol. Chem . 261 (5): 1998–2002 . doi : 10.1016/S0021-9258(17)35888-X . PMID 3080432.
Bisgaier CL, Sachdev OP, Lee ES и др. (1987). «Влияние лецитин:холестерин ацилтрансферазы на распределение аполипопротеина A-IV среди липопротеинов плазмы человека». J. Lipid Res . 28 (6): 693–703 . doi : 10.1016/S0022-2275(20)38666-1 . PMID 3611972.
Каратанасис СК, Юнис И, Заннис ВИ (1986). «Структура, эволюция и тканеспецифический синтез человеческого аполипопротеина AIV». Биохимия . 25 (13): 3962–70 . doi :10.1021/bi00361a034. PMID 3755616.
Karathanasis SK (1985). "Семейство мультигенов аполипопротеина: тандемная организация генов человеческого аполипопротеина AI, CIII и AIV". Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 82 (19): 6374– 8. Bibcode : 1985PNAS...82.6374K. doi : 10.1073/pnas.82.19.6374 . PMC 390718. PMID 3931073.
Gordon JI, Bisgaier CL, Sims HF и др. (1984). «Биосинтез человеческого преаполипопротеина A-IV». J. Biol. Chem . 259 (1): 468–74 . doi : 10.1016/S0021-9258(17)43684-2 . PMID 6706947.
Menzel HJ, Dieplinger H, Sandholzer C, et al. (1995). "Полиморфизм аполипопротеина A-IV в венгерской популяции: частоты генов, влияние на уровни липидов и последовательность двух новых вариантов". Hum. Mutat . 5 (1): 58– 65. doi : 10.1002/humu.1380050108 . PMID 7728150. S2CID 3063305.
Duverger N, Tremp G, Caillaud JM и др. (1996). «Защита от атерогенеза у мышей, опосредованная человеческим аполипопротеином A-IV». Science . 273 (5277): 966– 8. Bibcode :1996Sci...273..966D. doi :10.1126/science.273.5277.966. PMID 8688083. S2CID 30484255.
Deeb SS, Nevin DN, Iwasaki L, Brunzell JD (1997). "Два новых варианта аполипопротеина A-IV у лиц с семейной комбинированной гиперлипидемией и сниженным уровнем активности липопротеинлипазы". Hum. Mutat . 8 (4): 319– 25. doi :10.1002/(SICI)1098-1004(1996)8:4<319::AID-HUMU4>3.0.CO;2-2. PMID 8956036. S2CID 19100488.

Внешние ссылки

Аполипопротеин+A-IV в рубриках медицинских предметов Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)
Расположение генома человека APOA4 и страница с подробностями гена APOA4 в браузере геномов UCSC .

Эта статья о гене на человеческой хромосоме 11 — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[WikiPathways-10] Интерактивную карту путей можно редактировать на WikiPathways: «Statin_Pathway_WP430».

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000110244 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000032080 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid3095836-5] Karathanasis SK, Oettgen P, Haddad IA, Antonarakis SE (ноябрь 1986 г.). «Структура, эволюция и полиморфизмы гена человеческого аполипопротеина A4 (APOA4)». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 83 (22): 8457– 61. Bibcode : 1986PNAS...83.8457K. doi : 10.1073 /pnas.83.22.8457 . PMC 386949. PMID 3095836.

[pmid3036793-6] Elshourbagy NA, Walker DW, Paik YK, Boguski MS, Freeman M, Gordon JI, Taylor JM (июнь 1987). «Структура и экспрессия гена человеческого аполипопротеина A-IV». J. Biol. Chem . 262 (17): 7973– 81. doi : 10.1016/S0021-9258(18)47513-8 . PMID 3036793.

[entrez-7] «Ген Энтреза: аполипопротеин APOA4 A-IV».

[pmid3084795-8] Luo CC, Li WH, Moore MN, Chan L (февраль 1986). «Структура и эволюция мультигенного семейства аполипопротеинов». J. Mol. Biol . 187 (3): 325– 340. doi :10.1016/0022-2836(86)90436-5. PMID 3084795.

[pmid11254757-9] Deeg, MA; Bierman EL; Cheung MC (март 2001 г.). «GPI-специфическая фосфолипаза D ассоциируется с комплексом, содержащим apoA-I и apoA-IV». J. Lipid Res . 42 (3). Соединенные Штаты: 442–51 . doi : 10.1016/S0022-2275(20)31669-2 . ISSN 0022-2275. PMID 11254757.