АНКС1А
Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

АНКС1А
Доступные структуры
ПДБПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыANKS1A , ANKS1, повтор анкирина и стерильный домен мотива альфа, содержащий 1A
Внешние идентификаторыОМИМ : 608994; МГИ : 2446180; гомологен : 9068; Генные карты : ANKS1A; ОМА :ANKS1A - ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез

23294

224650

Ансамбль

ENSG00000064999

ENSMUSG00000024219

UniProt

Q92625

Р59672

РефСек (мРНК)

NM_015245

NM_001286040
NM_001286041
NM_181413
NM_001374802

RefSeq (белок)

NP_056060

НП_001272969
НП_001272970
НП_852078

Местоположение (UCSC)Хр 6: 34.89 – 35.09 МбХр 17: 28.13 – 28.28 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Белок 1A, содержащий повтор анкирина и домен SAM (ANKS1A), также известный как ODIN, представляет собой белок , который у людей кодируется геном ANKS1A на хромосоме 6. [ 5] [6]

Он повсеместно экспрессируется во многих тканях и типах клеток. [7] Известно, что ODIN регулирует сигнальные пути рецептора эпидермального фактора роста (EGFR) и рецептора EphA . [8] Как целевая мишень киназы семейства Src , ODIN участвует в развитии рака . [9] Ген ANKS1A также содержит один из 27 однонуклеотидных полиморфизмов , связанных с повышенным риском ишемической болезни сердца . [10]

Структура

Ген

Ген ANKS1A находится на хромосоме 6 на участке 6p21.31 и включает 29 экзонов . [6] Этот ген образует 2 изоформы посредством альтернативного сплайсинга . [11]

Белок

ODIN является членом семейства повторов анкирина и доменов, содержащих стерильный альфа-мотив (ANKS), и содержит 6 повторов анкирина , 1 домен связывания фосфотирозина (PTD) и 2 тандемных стерильных альфа-мотивных домена (SAM). [11] [12] Первый домен SAM связывается с доменом SAM рецептора EphA2 , принимая конформацию средней петли/конца спирали, и может регулировать эндоцитоз EphA2 . [12] [13]

Функция

ODIN широко экспрессируется в тканях, включая сердце , мозг , плаценту , легкие , печень , скелетные мышцы , почки и поджелудочную железу . [14] ODIN был идентифицирован как один из фосфорилированных по тирозину белков, индуцируемых активацией эпидермального фактора роста или рецептора тирозинкиназ фактора роста тромбоцитов . [14] ODIN участвует в отрицательной регуляции сигнального пути EGFR . [8] Сообщается, что уровень ODIN коррелирует со степенью увеличения EGF-индуцированного трафика EGFR для рециркуляции эндосом и рециркуляции обратно на поверхность клетки , что предполагает роль в рециркуляции EGFR. [15] Кроме того, ODIN служит ключевым адаптерным белком, регулирующим сигнальный путь рецептора EphA, который имеет решающее значение для регуляции опосредованной EphA8 миграции клеток и роста нейритов . [16] [17] Было показано, что удаление домена связывания фосфотирозина в ODIN приведет к незрелому развитию субкомиссурального органа (SCO) с тяжелым фенотипом гидроцефалии среднего мозга , что означает, что ODIN также играет роль в правильном развитии SCO и эпендимальных клеток в водопроводе мозга . [18]

Клиническое значение

Как новая цель киназ семейства Src , которые участвуют в развитии некоторых видов колоректального рака, ODIN может быть вовлечен в механизмы сигнализации раковых клеток. [19] В исследовании 64 линии клеток колоректального рака были протестированы на экспрессию Lck. Масс-спектрометрический анализ очищенных Lck белков впоследствии идентифицировал несколько белков, известных как субстраты SFK-киназы, включая кортактин, Tom1L1 (SRCASM), GIT1, виментин и AFAP1L2 (XB130). Также были обнаружены дополнительные белки, ранее сообщавшиеся как субстраты других тирозинкиназ , включая ODIN. ODIN был дополнительно проанализирован и обнаружил, что содержит значительно меньше pY при ингибировании активности SFK в клетках SW620, что указывает на то, что это ранее неизвестная мишень SFK в клетках колоректальной карциномы. [19] Кроме того, было обнаружено, что ODIN регулирует опосредованный COPII антероградный транспорт рецепторных тирозинкиназ, что является критическим механизмом в процессе опухолевого генеза. [20]

Клинический маркер

Исследование оценки генетического риска по нескольким локусам, основанное на комбинации 27 локусов , включая ген ANKS1A, выявило лиц с повышенным риском как инцидентных, так и рецидивирующих событий ишемической болезни сердца , а также улучшенную клиническую пользу от терапии статинами . Исследование было основано на исследовании когорт сообщества (исследование диеты Мальмё и рака) и четырех дополнительных рандомизированных контролируемых испытаниях первичных профилактических когорт (JUPITER и ASCOT) и вторичных профилактических когорт (CARE и PROVE IT-TIMI 22). [10]

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000064999 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000024219 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Нагасе Т., Секи Н., Исикава К., Охира М., Каварабаяси Ю., Охара О., Танака А., Котани Х., Миядзима Н., Номура Н. (октябрь 1996 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. VI. Кодирующие последовательности 80 новых генов (KIAA0201-KIAA0280), выведенные путем анализа клонов кДНК из клеточной линии KG-1 и головного мозга». Исследования ДНК . 3 (5): 321–9, 341–54. дои : 10.1093/dnares/3.5.321 . ПМИД  9039502.
  6. ^ ab "Ген Entrez: анкириновый повтор ANKS1A и стерильный домен мотива альфа, содержащий 1A".
  7. ^ "BioGPS - ваша система генного портала". biogps.org . Получено 10 октября 2016 г.[ постоянная мертвая ссылка ]
  8. ^ ab Kristiansen TZ, Nielsen MM, Blagoev B, Pandey A, Mann M (август 2004 г.). «Мышиные эмбриональные фибробласты, полученные от мышей с дефицитом Odin, демонстрируют гиперпролиферативный фенотип». DNA Research . 11 (4): 285–92. PMID  15500253.
  9. ^ Эмадуддин М, Эдельманн МДж, Кесслер БМ, Феллер СМ (2008-01-01). "Odin (ANKS1A) является мишенью киназы семейства Src в клетках колоректального рака". Cell Communication and Signaling . 6 : 7. doi : 10.1186/1478-811X-6-7 . PMC 2584000. PMID  18844995 . 
  10. ^ ab Mega JL, Stitziel NO, Smith JG, Chasman DI, Caulfield MJ, Devlin JJ, Nordio F, Hyde CL, Cannon CP, Sacks FM, Poulter NR, Sever PS, Ridker PM, Braunwald E, Melander O, Kathiresan S, Sabatine MS (июнь 2015 г.). «Генетический риск, события ишемической болезни сердца и клиническая польза терапии статинами: анализ испытаний первичной и вторичной профилактики». Lancet . 385 (9984): 2264–71. doi :10.1016/S0140-6736(14)61730-X. PMC 4608367 . PMID  25748612. 
  11. ^ ab "ANKS1A - белок 1A, содержащий повтор анкирина и домен SAM - Homo sapiens (человек) - ген и белок ANKS1A". www.uniprot.org . Получено 10.10.2016 .
  12. ^ ab Mercurio FA, Marasco D, Pirone L, Pedone EM, Pellecchia M, Leone M (март 2012 г.). «Структура раствора первого домена Sam Odin и исследования связывания с рецептором EphA2». Биохимия . 51 (10): 2136–45. doi :10.1021/bi300141h. PMC 3319784 . PMID  22332920. 
  13. ^ Меркурио Ф.А., Ди Натале С., Пироне Л., Сконьямильо П.Л., Мараско Д., Педоне Э.М., Савиано М., Леоне М. (июль 2015 г.). «Пептидные фрагменты Odin-Sam1: конформационный анализ и исследования взаимодействия с EphA2-Sam». ХимБиоХим . 16 (11): 1629–36. дои : 10.1002/cbic.201500197. PMID  26120079. S2CID  24673174.
  14. ^ ab Pandey A, Blagoev B, Kratchmarova I, Fernandez M, Nielsen M, Kristiansen TZ, Ohara O, Podtelejnikov AV, Roche S, Lodish HF, Mann M (ноябрь 2002 г.). «Клонирование новой молекулы, содержащей связывающий домен фосфотирозина, Odin, вовлеченной в сигнализацию рецепторными тирозинкиназами». Oncogene . 21 (52): 8029–36. doi : 10.1038/sj.onc.1205988 . PMID  12439753.
  15. ^ Tong J, Sydorskyy Y, St-Germain JR, Taylor P, Tsao MS, Moran MF (2013-01-01). "Odin (ANKS1A) модулирует рециркуляцию и стабильность рецептора EGF". PLOS ONE . ​​8 (6): e64817. Bibcode :2013PLoSO...864817T. doi : 10.1371/journal.pone.0064817 . PMC 3692516 . PMID  23825523. 
  16. ^ Kim J, Lee H, Kim Y, Yoo S, Park E, Park S (апрель 2010 г.). «Домены SAM белков семейства Anks критически важны для модуляции деградации рецепторов EphA». Молекулярная и клеточная биология . 30 (7): 1582–92. doi :10.1128/MCB.01605-09. PMC 2838079. PMID  20100865 . 
  17. ^ Shin J, Gu C, Park E, Park S (декабрь 2007 г.). «Идентификация белков, содержащих домен связывания фосфотирозина, как новых нисходящих целей сигнальной функции EphA8». Молекулярная и клеточная биология . 27 (23): 8113–26. doi :10.1128/MCB.00794-07. PMC 2169194. PMID 17875921  . 
  18. ^ Park S, Lee H, Park S (май 2015 г.). «In Vivo Expression of the PTB-deleted Odin Mutant Results in Hydrocephalus». Molecules and Cells . 38 (5): 426–31. doi :10.14348/molcells.2015.2288. PMC 4443284 . PMID  26018557. 
  19. ^ ab Emaduddin M, Edelmann MJ, Kessler BM, Feller SM (октябрь 2008 г.). "Odin (ANKS1A) является мишенью киназы семейства Src в клетках колоректального рака". Cell Communication and Signaling . 6 : 7. doi : 10.1186/1478-811X-6-7 . PMC 2584000. PMID  18844995 . 
  20. ^ Lee H, Noh H, Mun J, Gu C, Sever S, Park S (сентябрь 2016 г.). «Anks1a регулирует опосредованный COPII антероградный транспорт рецепторных тирозинкиназ, критически важных для опухолеобразования». Nature Communications . 7 : 12799. Bibcode :2016NatCo...712799L. doi :10.1038/ncomms12799. PMC 5027278 . PMID  27619642. 
  • Расположение генома человека ANKS1A и страница с подробностями гена ANKS1A в браузере геномов UCSC .
  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q92625 (белок 1A, содержащий повтор анкирина и домен SAM человека) на сайте PDBe-KB .
  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P59672 (мышиный анкириновый повтор и белок 1A, содержащий домен SAM) на сайте PDBe-KB .

Дальнейшее чтение

  • Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (сентябрь 1996 г.). «Нормализация и вычитание: два подхода к облегчению открытия генов». Genome Research . 6 (9): 791–806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID  8889548.
  • Pandey A, Blagoev B, Kratchmarova I, Fernandez M, Nielsen M, Kristiansen TZ, Ohara O, Podtelejnikov AV, Roche S, Lodish HF, Mann M (ноябрь 2002 г.). «Клонирование новой молекулы, содержащей связывающий домен фосфотирозина, Odin, участвующей в передаче сигналов рецепторными тирозинкиназами». Oncogene . 21 (52): 8029–36. doi : 10.1038/sj.onc.1205988 . PMID  12439753.
  • Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP (август 2004 г.). «Масштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 101 (33): 12130–5. Bibcode : 2004PNAS..10112130B. doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC  514446. PMID  15302935 .
  • Jin J, Smith FD, Stark C, Wells CD, Fawcett JP, Kulkarni S, Metalnikov P, O'Donnell P, Taylor P, Taylor L, Zougman A, Woodgett JR, Langeberg LK, Scott JD, Pawson T (август 2004 г.). «Протеомный, функциональный и основанный на доменах анализ in vivo 14-3-3-связывающих белков, участвующих в регуляции цитоскелета и клеточной организации». Current Biology . 14 (16): 1436–50. Bibcode :2004CBio...14.1436J. doi : 10.1016/j.cub.2004.07.051 . PMID  15324660. S2CID  2371325.
  • Ballif BA, Villén J, Beausoleil SA, Schwartz D, Gygi SP (ноябрь 2004 г.). «Фосфопротеомный анализ развивающегося мозга мыши». Молекулярная и клеточная протеомика . 3 (11): 1093–101. doi : 10.1074/mcp.M400085-MCP200 . PMID  15345747.
  • Кристиансен ТЗ, Нильсен ММ, Благоев Б, Пандей А, Манн М (август 2004 г.). «Мышиные эмбриональные фибробласты, полученные от мышей с дефицитом Одина, демонстрируют гиперпролиферативный фенотип». DNA Research . 11 (4): 285–92. PMID  15500253.
  • Benzinger A, Muster N, Koch HB, Yates JR, Hermeking H (июнь 2005 г.). «Целевой протеомный анализ 14-3-3 сигма, эффектора p53, который обычно подавляется при раке». Молекулярная и клеточная протеомика . 4 (6): 785–95. doi : 10.1074/mcp.M500021-MCP200 . PMID  15778465.
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=ANKS1A&oldid=1211699813"