ACVR1B

ACVR1B
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	3H9R, 3MTF, 3ООМ, 3Q4U, 4BGG, 4C02, 4ДИМ
Идентификаторы
Псевдонимы	ACVR1B , ACTRIB, ACVRLK4, ALK4, SKR2, рецептор активина А типа 1B
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 601300; МГИ : 1338944; гомологен : 20906; Генные карты : ACVR1B; OMA :ACVR1B — ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 12 (человек)
Конец	51,997,078 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 15 (мышь)
Конец	101,111,565 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верх выражен в
	вторичный ооцит; ; средняя височная извилина; ; протоковая клетка поджелудочной железы; ; мозговое вещество почки; ; Район Бродмана 23; ; бета-клетка; ; латеральная группа ядер таламуса; ; околоушная железа; ; почечный каналец; ; Район Бродмана 10;
	Верх выражен в
	переходный эпителий мочевого пузыря; ; эпителий желудка; ; волосяной фолликул; ; кожа наружного уха; ; обонятельный бугорок; ; префронтальная кора; ; Ячейка Панета; ; прилежащее ядро; ; вентромедиальное ядро; ; Ростральный миграционный поток;
	Больше данных по справочным выражениям
	н/д
Генная онтология
Молекулярная функция	трансферазная активность; связывание нуклеотидов; активность протеинкиназы; связывание фактора роста; связывание активина; связывание ионов металлов; активность киназы; трансмембранный рецептор белка серин/треонин киназная активность; связывание ингибина; связывание белков; Активность рецептора, активируемого активином; Связывание АТФ; связывание убиквитин-протеинлигазы; активность протеин серин/треонин киназы; Активность рецептора активина, тип I; Связывание SMAD; трансформирующий фактор роста бета-активируемая рецепторная активность; активность рецептора трансформирующего фактора роста бета, тип I;
Клеточный компонент	неотъемлемый компонент мембраны; мембрана; рецепторный комплекс; плазматическая мембрана; неотъемлемый компонент плазматической мембраны; комплекс рецепторов активина; поверхность клетки; цитозоль;
Биологический процесс	развитие волосяного фолликула; регуляция транскрипции, ДНК-шаблонная; позитивная регуляция дифференцировки эритроцитов; внешний апоптотический сигнальный путь; фосфорилирование; позитивная регуляция пути-ограниченного фосфорилирования белка SMAD; внутриутробное эмбриональное развитие; негативная регуляция экспрессии генов; узловой сигнальный путь; позитивная регуляция миграции клеток трофобласта; фосфорилирование белков; развитие центральной нервной системы; развитие первичных женских половых признаков; позитивная регуляция экспрессии генов; трансмембранный рецепторный белок серин/треонин киназный сигнальный путь; позитивная регуляция сигнального пути рецептора активина; регуляция передачи сигнала; негативная регуляция роста клеток; аутофосфорилирование белков; пептидил-треониновое фосфорилирование; передача сигнала; положительная регуляция транскрипции РНК-полимеразой II; сигнальный путь рецептора активина; Переход G1/S митотического клеточного цикла; сигнальный путь рецептора трансформирующего фактора роста бета; процесс спецификации шаблона;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	91
	11479
	ENSG00000135503
	ENSMUSG00000000532
	P36896
	Q61271
	NM_004302 ; NM_020327 ; NM_020328
	NM_007395
	NP_004293 ; NP_064732 ; NP_064733
	NP_031421
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ген, кодирующий белок у человека

Рецептор активина типа 1B — это белок , который у людей кодируется геном ACVR1B . ^[5]^[6]

ACVR1B или ALK-4 действует как трансдуктор сигналов активина или активин-подобных лигандов (например, ингибина ). Активин связывается либо с ACVR2A , либо с ACVR2B , а затем образует комплекс с ACVR1B. Они продолжают привлекать R-SMAD SMAD2 или SMAD3 . ^[7] ACVR1B также трансдуцирует сигналы узловых , GDF-1 и Vg1; однако, в отличие от активина, им требуются другие корецепторные молекулы, такие как белок Cripto . ^[8]

Функция

Активины — это димерные факторы роста и дифференциации, которые принадлежат к суперсемейству структурно родственных сигнальных белков трансформирующего фактора роста бета (TGF-бета). Активины передают сигнал через гетеромерный комплекс рецепторных сериновых киназ, которые включают по крайней мере два рецептора типа I (I и IB) и два рецептора типа II (II и IIB). Все эти рецепторы являются трансмембранными белками, состоящими из лиганд-связывающего внеклеточного домена с богатой цистеином областью, трансмембранного домена и цитоплазматического домена с прогнозируемой серин/треониновой специфичностью. Рецепторы типа I необходимы для передачи сигнала, а рецепторы типа II требуются для связывания лигандов и экспрессии рецепторов типа I. Рецепторы типа I и II образуют стабильный комплекс после связывания лиганда, что приводит к фосфорилированию рецепторов типа I рецепторами типа II. Этот ген кодирует рецептор активина А типа IB, состоящий из 11 экзонов. Альтернативный сплайсинг и альтернативное полиаденилирование приводят к 3 полностью описанным вариантам транскриптов. Экспрессия мРНК вариантов 1, 2 и 3 подтверждена, а потенциальный четвертый вариант содержит альтернативный экзон 8 и не имеет экзонов 9–11, но его экспрессия мРНК не подтверждена. ^[6]

Взаимодействия

Было показано, что ACVR1B взаимодействует с

ACVR2A , ^[9]^[10] и ACVR2B ^[11]^[9]

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000135503 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000000532 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ ten Dijke P, Ichijo H, Franzén P, Schulz P, Saras J, Toyoshima H, Heldin CH, Miyazono K (октябрь 1993 г.). «Киназы, подобные рецепторам активина: новый подкласс рецепторов клеточной поверхности с прогнозируемой активностью серин/треонин киназы». Oncogene . 8 (10): 2879–87 . PMID 8397373.
^ ab "Ген Entrez: рецептор активина A ACVR1B, тип IB".
^ Inman GJ, Nicolás FJ, Callahan JF, Harling JD, Gaster LM, Reith AD, Laping NJ, Hill CS (2002). "SB-431542 является мощным и специфическим ингибитором рецепторов ALK4, ALK5 и ALK7 суперсемейства трансформирующего фактора роста бета активин-рецептор-подобной киназы (ALK) типа I". Mol. Pharmacol . 62 (1): 65– 74. doi :10.1124/mol.62.1.65. PMID 12065756. S2CID 15185199.
^ Harrison CA, Gray PC, Koerber SC, Fischer W, Vale W (2003). «Идентификация функционального сайта связывания для активина на рецепторе типа I ALK4». J. Biol. Chem . 278 (23): 21129– 35. doi : 10.1074/jbc.M302015200 . PMID 12665502.
^ ab De Winter JP, De Vries CJ, Van Achterberg TA, Ameerun RF, Feijen A, Sugino H, De Waele P, Huylebroeck D, Verschueren K, Van Den Eijden-Van Raaij AJ (май 1996 г.). «Укороченные рецепторы активина типа II ингибируют биологическую активность за счет образования гетеромерных комплексов с рецепторами активина типа I». Эксп. Сотовый Res . 224 (2): 323–34 . doi :10.1006/excr.1996.0142. ПМИД 8612709.
^ Lebrun JJ, Takabe K, Chen Y, Vale W (январь 1999). «Роли специфических для пути и ингибиторных Smad в сигнализации рецептора активина». Mol. Endocrinol . 13 (1): 15– 23. doi : 10.1210/mend.13.1.0218 . PMID 9892009. S2CID 26825706.
^ Аттисано Л., Врана Дж.Л., Монтальво Э., Массаге Дж. (март 1996 г.). «Активация передачи сигналов комплексом рецепторов активина». Мол. Клетка. Биол . 16 (3): 1066–73 . doi :10.1128/MCB.16.3.1066. ПМК 231089 . ПМИД 8622651.

Внешние ссылки

Расположение генома человека ACVR1B и страница с подробностями гена ACVR1B в браузере геномов UCSC .

Дальнейшее чтение

Welt CK (2002). «Физиология и патофизиология ингибина, активина и фоллистатина в женской репродукции». Curr. Opin. Obstet. Gynecol . 14 (3): 317– 23. doi :10.1097/00001703-200206000-00012. PMID 12032389. S2CID 44327401.
Liu F, Ventura F, Doody J, Massagué J (1995). "Человеческий рецептор II типа для костных морфогенетических белков (BMP): расширение модели двухкиназного рецептора на BMP". Mol. Cell. Biol . 15 (7): 3479– 86. doi :10.1128/mcb.15.7.3479. PMC 230584. PMID 7791754 .
Xu J, Matsuzaki K, McKeehan K, Wang F, Kan M, McKeehan WL (1994). «Геномная структура и клонированные кДНК предсказывают, что четыре варианта в домене киназы рецепторов серин/треонин киназы возникают путем альтернативного сплайсинга и присоединения поли(А)». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 91 (17): 7957– 61. Bibcode :1994PNAS...91.7957X. doi : 10.1073/pnas.91.17.7957 . PMC 44523 . PMID 8058741.
Cárcamo J, Weis FM, Ventura F, Wieser R, Wrana JL, Attisano L, Massagué J (1994). «Рецепторы типа I определяют ингибирующие рост и транскрипционные ответы на трансформирующий фактор роста бета и активин». Mol. Cell. Biol . 14 (6): 3810– 21. doi :10.1128/MCB.14.6.3810. PMC 358748. PMID 8196624 .
Де Винтер Дж.П., Де Врис С.Дж., Ван Ахтерберг Т.А., Амерун Р.Ф., Фейен А., Сугино Х., Де Ваеле П., Хайлебрук Д., Вершуерен К., Ван Ден Эйден-Ван Раай Эй.Дж. (1996). «Укороченные рецепторы активина типа II ингибируют биологическую активность за счет образования гетеромерных комплексов с рецепторами активина типа I». Эксп. Сотовый Res . 224 (2): 323–34 . doi :10.1006/excr.1996.0142. ПМИД 8612709.
Attisano L, Wrana JL, Montalvo E, Massagué J (1996). «Активация сигнализации комплексом рецептора активина». Mol. Cell. Biol . 16 (3): 1066– 73. doi :10.1128/MCB.16.3.1066. PMC 231089. PMID 8622651 .
Lebrun JJ, Vale WW (1997). «Активин и ингибин оказывают антагонистическое действие на лиганд-зависимую гетеромеризацию рецепторов активина типа I и типа II и дифференцировку эритроидных клеток человека». Mol. Cell. Biol . 17 (3): 1682– 91. doi :10.1128/MCB.17.3.1682. PMC 231893. PMID 9032295 .
Röijer E, Miyazono K, Aström AK, Geurts van Kessel A, ten Dijke P, Stenman G (1998). «Хромосомная локализация трех человеческих генов, кодирующих членов суперсемейства TGF-beta рецепторов серин/треонин киназы типа I». Mamm. Genome . 9 (3): 266– 8. doi :10.1007/s003359900745. PMID 9501322. S2CID 21839781.
Souchelnytskyi S, Nakayama T, Nakao A, Morén A, Heldin CH, Christian JL, ten Dijke P (1998). "Физическое и функциональное взаимодействие мышиного и Xenopus Smad7 с рецепторами костного морфогенетических белков и рецепторами трансформирующего фактора роста-бета". J. Biol. Chem . 273 (39): 25364– 70. doi : 10.1074/jbc.273.39.25364 . PMID 9738003.
Hashimoto O, Yamato K, Koseki T, Ohguchi M, Ishisaki A, Shoji H, Nakamura T, Hayashi Y, Sugino H, Nishihara T (1998). "Роль рецепторов активина типа I в остановке роста, вызванной активином А, и апоптозе в клетках мышиной гибридомы B-клеток". Cell. Signal . 10 (10): 743– 9. doi :10.1016/S0898-6568(98)00021-7. PMID 9884026.
Lebrun JJ, Takabe K, Chen Y, Vale W (1999). «Роли специфических для пути и ингибиторных Smad в сигнализации рецептора активина». Mol. Endocrinol . 13 (1): 15– 23. doi : 10.1210/mend.13.1.0218 . PMID 9892009. S2CID 26825706.
Gray PC, Greenwald J, Blount AL, Kunitake KS, Donaldson CJ, Choe S, Vale W (2000). «Идентификация сайта связывания на рецепторе активина типа II для активина и ингибина». J. Biol. Chem . 275 (5): 3206– 12. doi : 10.1074/jbc.275.5.3206 . PMID 10652306.
Zhou Y, Sun H, Danila DC, Johnson SR, Sigai DP, Zhang X, Klibanski A (2000). «Усеченные изоформы Alk4 рецептора активина I типа являются доминирующими негативными рецепторами, ингибирующими сигнализацию активина». Mol. Endocrinol . 14 (12): 2066– 75. doi : 10.1210/mend.14.12.0570 . PMID 11117535.
Su GH, Bansal R, Murphy KM, Montgomery E, Yeo CJ, Hruban RH, Kern SE (2001). "Мутации гена ACVR1B (ALK4, рецептор активина типа 1B) при карциноме поджелудочной железы". Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 98 (6): 3254– 7. Bibcode : 2001PNAS...98.3254S. doi : 10.1073/pnas.051484398 . PMC 30640. PMID 11248065 .
Chapman SC, Woodruff TK (2001). «Модуляция передачи сигнала активина ингибином B и ингибин-связывающим белком (INhBP)». Mol. Endocrinol . 15 (4): 668–79 . doi : 10.1210/mend.15.4.0616 . PMID 11266516.
Wurthner JU, Frank DB, Felici A, Green HM, Cao Z, Schneider MD, McNally JG, Lechleider RJ, Roberts AB (2001). "Трансформирующий фактор роста-бета-рецептор-ассоциированный белок 1 является шапероном Smad4". J. Biol. Chem . 276 (22): 19495– 502. doi : 10.1074/jbc.M006473200 . PMID 11278302.
Parks WT, Frank DB, Huff C, Renfrew Haft C, Martin J, Meng X, de Caestecker MP, McNally JG, Reddi A, Taylor SI, Roberts AB, Wang T, Lechleider RJ (2001). «Сортировочный нексин 6, новый SNX, взаимодействует с семейством трансформирующих факторов роста бета рецепторных серин-треониновых киназ». J. Biol. Chem . 276 (22): 19332– 9. doi : 10.1074/jbc.M100606200 . PMID 11279102.
Birkey Reffey S, Wurthner JU, Parks WT, Roberts AB, Duckett CS (2001). "X-связанный ингибитор белка апоптоза функционирует как кофактор в трансформирующей передаче сигнала фактора роста-бета". J. Biol. Chem . 276 (28): 26542– 9. doi : 10.1074/jbc.M100331200 . PMID 11356828.
Bianco C, Adkins HB, Wechselberger C, Seno M, Normanno N, De Luca A, Sun Y, Khan N, Kenney N, Ebert A, Williams KP, Sanicola M, Salomon DS (2002). "Cripto-1 активирует узловые и ALK4-зависимые и -независимые сигнальные пути в эпителиальных клетках молочной железы". Mol. Cell. Biol . 22 (8): 2586– 97. doi :10.1128/MCB.22.8.2586-2597.2002. PMC 133714. PMID 11909953 .

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000135503 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000000532 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8397373-5] ten Dijke P, Ichijo H, Franzén P, Schulz P, Saras J, Toyoshima H, Heldin CH, Miyazono K (октябрь 1993 г.). «Киназы, подобные рецепторам активина: новый подкласс рецепторов клеточной поверхности с прогнозируемой активностью серин/треонин киназы». Oncogene . 8 (10): 2879–87 . PMID 8397373.

[entrez-6] "Ген Entrez: рецептор активина A ACVR1B, тип IB".

[pmid12065756-7] Inman GJ, Nicolás FJ, Callahan JF, Harling JD, Gaster LM, Reith AD, Laping NJ, Hill CS (2002). "SB-431542 является мощным и специфическим ингибитором рецепторов ALK4, ALK5 и ALK7 суперсемейства трансформирующего фактора роста бета активин-рецептор-подобной киназы (ALK) типа I". Mol. Pharmacol . 62 (1): 65– 74. doi :10.1124/mol.62.1.65. PMID 12065756. S2CID 15185199.

[pmid12665502-8] Harrison CA, Gray PC, Koerber SC, Fischer W, Vale W (2003). «Идентификация функционального сайта связывания для активина на рецепторе типа I ALK4». J. Biol. Chem . 278 (23): 21129– 35. doi : 10.1074/jbc.M302015200 . PMID 12665502.

[pmid8612709-9] De Winter JP, De Vries CJ, Van Achterberg TA, Ameerun RF, Feijen A, Sugino H, De Waele P, Huylebroeck D, Verschueren K, Van Den Eijden-Van Raaij AJ (май 1996 г.). «Укороченные рецепторы активина типа II ингибируют биологическую активность за счет образования гетеромерных комплексов с рецепторами активина типа I». Эксп. Сотовый Res . 224 (2): 323–34 . doi :10.1006/excr.1996.0142. ПМИД 8612709.

[pmid9892009-10] Lebrun JJ, Takabe K, Chen Y, Vale W (январь 1999). «Роли специфических для пути и ингибиторных Smad в сигнализации рецептора активина». Mol. Endocrinol . 13 (1): 15– 23. doi : 10.1210/mend.13.1.0218 . PMID 9892009. S2CID 26825706.

[pmid8622651-11] Аттисано Л., Врана Дж.Л., Монтальво Э., Массаге Дж. (март 1996 г.). «Активация передачи сигналов комплексом рецепторов активина». Мол. Клетка. Биол . 16 (3): 1066–73 . doi :10.1128/MCB.16.3.1066. ПМК 231089 . ПМИД 8622651.