ACADS

Ген, кодирующий белок у человека

ACADS
Доступные структуры
ПДБПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыACADS , ацил-КоА-дегидрогеназа, короткая цепь от C-2 до C-3, ACAD3, SCAD, ацил-КоА-дегидрогеназа короткая цепь
Внешние идентификаторыOMIM : 606885; MGI : 87868; HomoloGene : 20057; GeneCards : ACADS; OMA :ACADS - ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез
Ансамбль
UniProt
РефСек (мРНК)

NM_001302554
NM_000017

NM_007383

RefSeq (белок)

NP_000008
NP_001289483
NP_001289483.1

NP_031409

Местоположение (UCSC)Хр 12: 120,73 – 120,74 МбХр 5: 115.25 – 115.26 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Ацил-КоА-дегидрогеназа, короткая цепь от C-2 до C-3 , является ферментом , который у людей кодируется геном ACADS . [ 5] Этот ген кодирует тетрамерный митохондриальный флавопротеин , который является членом семейства ацил-КоА-дегидрогеназ . Этот фермент катализирует начальный этап митохондриального пути бета-окисления жирных кислот . Ген ACADS связан с дефицитом ацил-кофермента А-дегидрогеназы с короткой цепью . [6] [5]

Структура

Ген ACADS имеет длину около 13 кб и 10 экзонов. Кодирующая последовательность этого гена имеет длину 1239 п.н. [7] Кодируемый белок имеет 412 аминокислот, а его размер составляет 44,3 кДа (человек) или 44,9 кДа (мышь). [8] [9]

Функция

Фермент SCAD катализирует первую часть бета-окисления жирных кислот путем образования транс-двойной связи C2-C3 в жирной кислоте посредством дегидрогенизации флавофермента. SCAD специфичен для короткоцепочечных жирных кислот, между C2 и C3-ацил-КоА. Конечным результатом бета-окисления является ацетил-КоА. [10] Когда есть дефекты, которые приводят к неправильному сворачиванию SCAD, происходит повышенное производство активных форм кислорода (ROS); повышенное количество ROS заставляет митохондрии подвергаться делению, и митохондриальный ретикулум приобретает зернистую структуру. [11]

Клиническое значение

Мутации гена ACADS связаны с дефицитом белка короткоцепочечного ацил-кофермента А дегидрогеназы (SCADD); это также известно как дефицит бутирил-КоА дегидрогеназы. Было выявлено множество мутаций в определенных популяциях, и были проведены крупномасштабные исследования для определения аллельной и генотипической частоты дефектного гена. [12] [13] Поскольку короткоцепочечная ацил-КоА дегидрогеназа участвует в бета-окислении, дефицит этого фермента отмечается повышенным количеством жирных кислот. Этот дефицит характеризуется наличием повышенного бутирилкарнитина (C4) в плазме крови и повышенными концентрациями этилмалоновой кислоты (EMA) в моче. Генотипы людей с этим дефицитом имеют его в результате мутации, варианта или комбинации этих двух. [14] Среди одной популяции с этим заболеванием были выявлены три подгруппы: у одной группы наблюдается задержка роста, трудности с кормлением и гипотония; у другой группы были судороги; наконец, у одной группы была гипотония и не было судорог. [15] Другие исследования показали, что дефицит может быть бессимптомным у некоторых людей в нормальных условиях, с симптомами, проявляющимися в условиях физиологического стресса, таких как голодание или болезнь. [16] Лечение этого дефицита иногда может быть неясным, потому что иногда он может быть бессимптомным. Лечение этого заболевания похоже на лечение других нарушений окисления жирных кислот, путем попытки восстановить биохимический и физиологический гомеостаз, путем содействия анаболизму и предоставления альтернативных источников энергии. [14] Добавка флавинадениндинуклеотида также была определена как терапия этого дефицита, потому что она является необходимым кофактором для правильного функционирования SCAD. [17] Дефицит SCAD наследуется по аутосомно-рецессивному типу. Тестирование на носительство может быть проведено для членов семьи из группы риска, а также возможно пренатальное тестирование. [14]

Ген ACADS также участвует в задержке наступления синдрома Прадера-Вилли , который характеризуется гипотонией, задержкой роста и задержкой развития нервной системы в первые годы жизни, а также гиперфагией и ожирением гораздо позже. [18]

В исследовании ассоциаций по всему геному (GWAS) однонуклеотидный полиморфизм в ACADS был связан с уменьшением количества высвобождения инсулина, выявленного с помощью орального теста на толерантность к глюкозе (OGTT). [19]

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000122971 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000029545 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ ab "Ген Энтреза: Ацил-КоА-дегидрогеназа, короткая цепь от С-2 до С-3".
  6. ^ Tein I, Elpeleg O, Ben-Zeev B, Korman SH, Lossos A, Lev D и др. (февраль 2008 г.). «Мутация гена короткоцепочечной ацил-КоА-дегидрогеназы (c.319C>T) характеризуется клинической гетерогенностью и является кандидатом на роль мутации-основателя у лиц еврейского происхождения ашкенази». Молекулярная генетика и метаболизм . 93 (2): 179– 189. doi :10.1016/j.ymgme.2007.09.021. PMID  18054510.
  7. ^ Corydon MJ, Andresen BS, Bross P, Kjeldsen M, Andreasen PH, Eiberg H, et al. (декабрь 1997 г.). «Структурная организация гена короткоцепочечной ацил-КоА-дегидрогеназы человека». Mammalian Genome . 8 (12): 922– 926. doi :10.1007/s003359900612. PMID  9383286. S2CID  9157185.
  8. ^ "Информация о белках: P16219". Cardiac Organellar Protein Atlas Knowledgebase (COPaKB) . Архивировано из оригинала 14 августа 2016 года . Получено 23 июля 2016 года .
  9. ^ "Информация о белках: Q07417". Cardiac Organellar Protein Atlas Knowledgebase (COPaKB) . Архивировано из оригинала 14 августа 2016 года . Получено 23 июля 2016 года .
  10. ^ Voet DJ, Voet JG, Pratt CW (2010). "Глава 18, Митохондриальный синтез АТФ". Principles of Biochemistry (4-е изд.). Wiley. стр. 667. ISBN 978-0-470-23396-2.
  11. ^ Schmidt SP, Corydon TJ, Pedersen CB, Bross P, Gregersen N (июнь 2010 г.). «Неправильное сворачивание короткоцепочечной ацил-КоА-дегидрогеназы приводит к делению митохондрий и окислительному стрессу». Молекулярная генетика и метаболизм . 100 (2): 155– 162. doi :10.1016/j.ymgme.2010.03.009. PMID  20371198.
  12. ^ Jethva R, Bennett MJ, Vockley J (декабрь 2008 г.). «Дефицит короткоцепочечной ацил-коэнзим А дегидрогеназы». Молекулярная генетика и метаболизм . 95 (4): 195–200 . doi :10.1016/j.ymgme.2008.09.007. PMC 2720545. PMID  18977676 . 
  13. ^ Окуяз С., Эзгю Ф.С., Бибероглу Г., Зевиани М., Тиранти В., Йилгор Э. (июнь 2008 г.). «Тяжелая детская гипотония с этилмалоновой ацидурией: клинический случай». Журнал детской неврологии . 23 (6): 703–705 . doi : 10.1177/0883073807313048. PMID  18539996. S2CID  46624539.
  14. ^ abc Wolfe L, Jethva R, Oglesbee D, Vockley J (1993). «Дефицит ацил-КоА-дегидрогеназы с короткой цепью». В Adam MP, Feldman J, Mirzaa GM, Pagon RA, Wallace SE, Bean LJ, Gripp KW, Amemiya A (ред.). GeneReviews® [Интернет] . Сиэтл (WA): Университет Вашингтона, Сиэтл. PMID  21938826.
  15. ^ Pedersen CB, Kølvraa S, Kølvraa A, Stenbroen V, Kjeldsen M, Ensenauer R и др. (август 2008 г.). «В спектре вариаций гена ACADS у 114 пациентов с дефицитом короткоцепочечной ацил-КоА-дегидрогеназы (SCAD) доминируют миссенс-вариации, приводящие к неправильному сворачиванию белка на клеточном уровне». Human Genetics . 124 (1): 43– 56. doi :10.1007/s00439-008-0521-9. PMID  18523805. S2CID  25491212.
  16. ^ Bok LA, Vreken P, Wijburg FA, Wanders RJ, Gregersen N, Corydon MJ и др. (ноябрь 2003 г.). «Дефицит короткоцепочечной ацил-КоА-дегидрогеназы: исследования в большой семье, усложняющие расстройство» (PDF) . Педиатрия . 112 (5): 1152– 1155. doi :10.1542/peds.112.5.1152. PMID  14595061.
  17. ^ van Maldegem BT, Duran M, Wanders RJ, Waterham HR, Wijburg FA (март 2010 г.). «Статус флавинадениндинуклеотида и эффекты лечения рибофлавином в высоких дозах при дефиците короткоцепочечной ацил-КоА-дегидрогеназы». Pediatric Research . 67 (3): 304–308 . doi : 10.1203/PDR.0b013e3181cbd57b . PMID  19952864.
  18. ^ Giurgiutiu DV, Espinoza LM, Wood TC, DuPont BR, Holden KR (январь 2008 г.). «Стойкая задержка роста при синдроме Прадера-Вилли, связанная с вариантом гена короткоцепочечной ацил-КоА-дегидрогеназы». Журнал детской неврологии . 23 (1): 112– 117. doi :10.1177/0883073807307979. PMID  18184946. S2CID  31888136.
  19. ^ Hornbak M, Banasik K, Justesen JM, Krarup NT, Sandholt CH, Andersson Å и др. (январь 2011 г.). «Минорный C-аллель rs2014355 при ACADS связан с пониженным высвобождением инсулина после пероральной нагрузки глюкозой». BMC Medical Genetics . 12 : 4. doi : 10.1186/1471-2350-12-4 . PMC 3022800 . PMID  21211036. 
  • Запись GeneReviews/NCBI/NIH/UW о дефиците короткоцепочечной ацил-КоА-дегидрогеназы
  • Расположение генома человека ACADS и страница с подробностями гена ACADS в браузере геномов UCSC .

В данной статье использован текст из Национальной медицинской библиотеки США , являющийся общественным достоянием .

Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=ACADS&oldid=1204336163"