Семейство холина А2

Предполагаемое семейство Archaeal 2 TMS Holin (A2-Hol) (TC# 9.B.109) состоит из нескольких предполагаемых холинов из Nitrososphaerota размером от 130 до 165 аминокислотных остатков (aas) и демонстрирующих 2 трансмембранных сегмента (TMS). Представительный список белков, принадлежащих к семейству A2-Hol, можно найти в Базе данных классификации транспортеров. Археон , Candidatus Nitrosoarchaeum limnia , кодирует смежные гены, обозначенные как Toxin Secretion/Lysis Holin. Ген «токсина» кодирует растворимый белок из 325 aa, как указано, принадлежащий к «Суперсемейству GBT-типа гликозилтрансфераз». Этот белок выводит другие гликозилтрансферазы в поиске NCBI BLAST. Смежный ген кодирует небольшой белок из 132 аминокислот и 2 TMS (TC# 9.B.109.1.1), который может быть холином, исходя из его размера и топологии. Этот белок имеет номер доступа UniProt S2E3C4. Паралоги обнаружены в этом же организме (Candidatus Nitrosoarchaeum koreensis ) и других близкородственных видах. ^[1]

• Холин
• Лизин
• База данных классификации транспортеров

• Saier, Milton H.; Reddy, Bhaskara L. (2015-01-01). «Холины в бактериях, эукариотах и ​​археях: многофункциональные ксенологи с потенциальными биотехнологическими и биомедицинскими применениями». Журнал бактериологии 197 (1): 7–17. doi :10.1128/JB.02046-14. ISSN  0021-9193. PMC  4288690. PMID  25157079.
• Ван, ИН; Смит, ДЛ; Янг, Р. (2000-01-01). «Холины: белковые часы бактериофаговых инфекций». Annual Review of Microbiology 54 : 799–825. doi :10.1146/annurev.micro.54.1.799. ISSN  0066-4227. PMID  11018145.

На момент редактирования эта статья использует контент из "9.B.109. The Putative Archaeal 2 TMS Holin (A2-Hol) Family" , который лицензирован таким образом, что позволяет повторное использование в соответствии с Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Unported License , но не в соответствии с GFDL . Все соответствующие условия должны быть соблюдены.