23S рРНК (урацил1939-C5)-метилтрансфераза
| 23S рРНК (урацил 1939 -C 5 )-метилтрансфераза | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||
| Номер ЕС | 2.1.1.190 | ||||||||
| Базы данных | |||||||||
| ИнтЭнз | IntEnz вид | ||||||||
| БРЕНДА | запись BRENDA | ||||||||
| ExPASy | NiceZyme вид | ||||||||
| КЕГГ | запись KEGG | ||||||||
| МетаЦик | метаболический путь | ||||||||
| ПРИАМ | профиль | ||||||||
| Структуры PDB | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| |||||||||
23S рРНК (урацил 1939 -C 5 )-метилтрансфераза ( EC 2.1.1.190, RumA , РНК уридин метилтрансфераза A , YgcA ) представляет собой фермент с систематическим названием S-аденозил-L-метионин:23S рРНК (урацил 1939 -C 5 )-метилтрансфераза . [1] [2] [3] [4] [5] [6] Этот фермент катализирует следующую химическую реакцию
- S-аденозил-L-метионин + урацил 1939 в 23S рРНК S-аденозил-L-гомоцистеин + 5-метилурацил 1939 в 23S рРНК
Фермент специфически метилирует урацил 1939 в положении C 5 в 23S рРНК.
Ссылки
- ^ Agarwalla S, Kealey JT, Santi DV, Stroud RM (март 2002 г.). «Характеристика 23 S рибосомальной РНК m5U1939 метилтрансферазы из Escherichia coli». Журнал биологической химии . 277 (11): 8835–40. doi : 10.1074/jbc.M111825200 . PMID 11779873.
- ^ Lee TT, Agarwalla S, Stroud RM (март 2004). "Кристаллическая структура RumA, железо-серного кластера, содержащего рибосомальную РНК 5-метилуридинметилтрансферазу E. coli". Структура . 12 (3): 397–407. doi : 10.1016/j.str.2004.02.009 . PMID 15016356.
- ^ Madsen CT, Mengel-Jørgensen J, Kirpekar F, Douthwaite S (август 2003 г.). «Идентификация метилтрансфераз для m(5)U747 и m(5)U1939 в 23S рРНК с использованием масс-спектрометрии MALDI». Nucleic Acids Research . 31 (16): 4738–46. doi :10.1093/nar/gkg657. PMC 169892. PMID 12907714 .
- ^ Персо С., Лу Ю., Вила-Санджурджо А., Кэмпбелл Дж. Л., Финли Дж., О'Коннор М. (февраль 2010 г.). «Мутагенез модифицированных оснований m (5) U1939 и psi2504 в 23S рРНК Escherichia coli». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 392 (2): 223–7. дои : 10.1016/j.bbrc.2010.01.021. ПМИД 20067766.
- ^ Agarwalla S, Stroud RM, Gaffney BJ (август 2004 г.). «Окислительно-восстановительные реакции кластера железа и серы в рибосомальной РНК-метилтрансферазе, RumA: оптические и ЭПР-исследования». Журнал биологической химии . 279 (33): 34123–9. doi : 10.1074/jbc.M405702200 . PMC 1237038. PMID 15181002 .
- ^ Lee TT, Agarwalla S, Stroud RM (март 2005 г.). «Уникальная складка РНК в тройном комплексе RumA-РНК-кофактор способствует селективности субстрата и ферментативной функции». Cell . 120 (5): 599–611. doi : 10.1016/j.cell.2004.12.037 . PMID 15766524.
Внешние ссылки
- 23S+рРНК+(урацил1939-C5)-метилтрансфераза в рубриках медицинских дисциплин Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)
